mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/cluster/gui/impl/usc/USCTest.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1  /*
2 26 Feb 07 jari 2  * Created on Feb 17, 2005
2 26 Feb 07 jari 3  */
2 26 Feb 07 jari 4 package org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.impl.usc;
2 26 Feb 07 jari 5
2 26 Feb 07 jari 6 import org.tigr.microarray.mev.r.REXP;
2 26 Feb 07 jari 7 import org.tigr.microarray.mev.r.RSrvException;
2 26 Feb 07 jari 8 import org.tigr.microarray.mev.r.Rconnection;
2 26 Feb 07 jari 9
2 26 Feb 07 jari 10 /**
2 26 Feb 07 jari 11  * @author vu
2 26 Feb 07 jari 12  */
2 26 Feb 07 jari 13 public class USCTest {
2 26 Feb 07 jari 14   //
2 26 Feb 07 jari 15   public USCTest() {
2 26 Feb 07 jari 16     try {
2 26 Feb 07 jari 17       Rconnection rc = new Rconnection();
2 26 Feb 07 jari 18       REXP x = rc.eval("R.version.string");
2 26 Feb 07 jari 19       System.out.println(x.asString());
2 26 Feb 07 jari 20       
2 26 Feb 07 jari 21     } catch( RSrvException e ) {
2 26 Feb 07 jari 22       e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 23     }
2 26 Feb 07 jari 24   }
2 26 Feb 07 jari 25   
2 26 Feb 07 jari 26   
2 26 Feb 07 jari 27   public static void main( String[] args ) {
2 26 Feb 07 jari 28     USCTest u = new USCTest();
2 26 Feb 07 jari 29   }
2 26 Feb 07 jari 30   
2 26 Feb 07 jari 31   
2 26 Feb 07 jari 32   private int computeCombinations( int n, int c ) {
2 26 Feb 07 jari 33     int toReturn = 0;
2 26 Feb 07 jari 34     
2 26 Feb 07 jari 35     int nFactorial = n;
2 26 Feb 07 jari 36     for( int i = n - 1; i > 0; i -- ) {
2 26 Feb 07 jari 37       nFactorial = nFactorial * i;
2 26 Feb 07 jari 38     }
2 26 Feb 07 jari 39     
2 26 Feb 07 jari 40     int cFactorial = c;
2 26 Feb 07 jari 41     for( int i = ( c - 1 ); i > 0; i -- ) {
2 26 Feb 07 jari 42       cFactorial = cFactorial * i;
2 26 Feb 07 jari 43     }
2 26 Feb 07 jari 44     
2 26 Feb 07 jari 45     int diff = ( n - c );
2 26 Feb 07 jari 46     int diffFactorial = diff;
2 26 Feb 07 jari 47     for( int i = ( diff - 1 ); i > 0; i -- ) {
2 26 Feb 07 jari 48       diffFactorial = diffFactorial * i;
2 26 Feb 07 jari 49     }
2 26 Feb 07 jari 50     
2 26 Feb 07 jari 51     toReturn = ( nFactorial / ( cFactorial * diffFactorial ) );
2 26 Feb 07 jari 52     System.out.println( toReturn + " combinations of " + n );
2 26 Feb 07 jari 53     
2 26 Feb 07 jari 54     return toReturn;
2 26 Feb 07 jari 55   }//computeCombinations
2 26 Feb 07 jari 56 }

Generated on Thu Jul 20 09:29:30 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)