mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/script/scriptGUI/ScriptExperimentViewer.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2003, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4  */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: ScriptExperimentViewer.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.3 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2005/03/10 15:39:55 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: braistedj $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 package org.tigr.microarray.mev.script.scriptGUI;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import java.awt.Color;
2 26 Feb 07 jari 15 import java.awt.Frame;
2 26 Feb 07 jari 16 import java.awt.event.ActionEvent;
2 26 Feb 07 jari 17 import java.awt.event.ActionListener;
2 26 Feb 07 jari 18 import java.awt.event.MouseAdapter;
2 26 Feb 07 jari 19 import java.awt.event.MouseEvent;
2 26 Feb 07 jari 20
2 26 Feb 07 jari 21 import javax.swing.JColorChooser;
2 26 Feb 07 jari 22 import javax.swing.JOptionPane;
2 26 Feb 07 jari 23 import javax.swing.JPopupMenu;
2 26 Feb 07 jari 24
2 26 Feb 07 jari 25 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.Experiment;
2 26 Feb 07 jari 26 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.CentroidViewer;
2 26 Feb 07 jari 27 import org.tigr.microarray.mev.cluster.gui.helpers.ExperimentViewer;
2 26 Feb 07 jari 28
2 26 Feb 07 jari 29 public class ScriptExperimentViewer extends ExperimentViewer {
2 26 Feb 07 jari 30     
2 26 Feb 07 jari 31     private JPopupMenu popup; 
2 26 Feb 07 jari 32     
2 26 Feb 07 jari 33     /**
2 26 Feb 07 jari 34      * Constructs a <code>KMCExperimentViewer</code> with specified
2 26 Feb 07 jari 35      * experiment and clusters.
2 26 Feb 07 jari 36      */
2 26 Feb 07 jari 37     public ScriptExperimentViewer(Experiment experiment, int[][] clusters) {
2 26 Feb 07 jari 38         super(experiment, clusters);
2 26 Feb 07 jari 39         Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 40         this.popup = createJPopupMenu(listener);
2 26 Feb 07 jari 41         getContentComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 42         getHeaderComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 43     }
2 26 Feb 07 jari 44     
2 26 Feb 07 jari 45     private void readObject(java.io.ObjectInputStream ois) throws java.io.IOException, ClassNotFoundException {
2 26 Feb 07 jari 46         Listener listener = new Listener();
2 26 Feb 07 jari 47         this.popup = createJPopupMenu(listener);
2 26 Feb 07 jari 48         getContentComponent().addMouseListener(listener);
2 26 Feb 07 jari 49         getHeaderComponent().addMouseListener(listener);        
2 26 Feb 07 jari 50     }
2 26 Feb 07 jari 51     
2 26 Feb 07 jari 52     private void writeObject(java.io.ObjectOutputStream oos) throws java.io.IOException { }
2 26 Feb 07 jari 53     
2 26 Feb 07 jari 54     /**
2 26 Feb 07 jari 55      * Creates a popup menu.
2 26 Feb 07 jari 56      */
2 26 Feb 07 jari 57     private JPopupMenu createJPopupMenu(Listener listener) {
2 26 Feb 07 jari 58         JPopupMenu popup = new JPopupMenu();
2 26 Feb 07 jari 59         addMenuItems(popup, listener);
2 26 Feb 07 jari 60         return popup;
2 26 Feb 07 jari 61     }
2 26 Feb 07 jari 62     
2 26 Feb 07 jari 63     /**
2 26 Feb 07 jari 64      * Saves clusters.
2 26 Feb 07 jari 65      */
2 26 Feb 07 jari 66     private void onSaveClusters() {
2 26 Feb 07 jari 67         Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 68         try {
2 26 Feb 07 jari 69             saveClusters(frame);
2 26 Feb 07 jari 70         } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 71             JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save clusters!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 72             e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 73         }
2 26 Feb 07 jari 74     }
2 26 Feb 07 jari 75     
2 26 Feb 07 jari 76     /**
2 26 Feb 07 jari 77      * Save the viewer cluster.
2 26 Feb 07 jari 78      */
2 26 Feb 07 jari 79     private void onSaveCluster() {
2 26 Feb 07 jari 80         Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 81         try {
2 26 Feb 07 jari 82             saveCluster(frame);
2 26 Feb 07 jari 83         } catch (Exception e) {
2 26 Feb 07 jari 84             JOptionPane.showMessageDialog(frame, "Can not save cluster!", e.toString(), JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
2 26 Feb 07 jari 85             e.printStackTrace();
2 26 Feb 07 jari 86         }
2 26 Feb 07 jari 87     }
2 26 Feb 07 jari 88     
2 26 Feb 07 jari 89     /**
2 26 Feb 07 jari 90      * Sets a public color.
2 26 Feb 07 jari 91      */
2 26 Feb 07 jari 92     private void onSetColor() {
2 26 Feb 07 jari 93         Frame frame = JOptionPane.getFrameForComponent(getContentComponent());
2 26 Feb 07 jari 94         Color newColor = JColorChooser.showDialog(frame, "Choose color", CentroidViewer.DEF_CLUSTER_COLOR);
2 26 Feb 07 jari 95         if (newColor != null) {
2 26 Feb 07 jari 96             setClusterColor(newColor);
2 26 Feb 07 jari 97         }
2 26 Feb 07 jari 98     }
2 26 Feb 07 jari 99     
2 26 Feb 07 jari 100     /**
2 26 Feb 07 jari 101      * Removes a public color.
2 26 Feb 07 jari 102      */
2 26 Feb 07 jari 103     private void onSetDefaultColor() {
2 26 Feb 07 jari 104         setClusterColor(null);
2 26 Feb 07 jari 105     }
2 26 Feb 07 jari 106     
2 26 Feb 07 jari 107     /**
2 26 Feb 07 jari 108      * The class to listen to mouse and action events.
2 26 Feb 07 jari 109      */
2 26 Feb 07 jari 110     private class Listener extends MouseAdapter implements ActionListener {
2 26 Feb 07 jari 111         
2 26 Feb 07 jari 112         public void actionPerformed(ActionEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 113             String command = e.getActionCommand();
2 26 Feb 07 jari 114             if (command.equals(SAVE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 115                 onSaveCluster();
2 26 Feb 07 jari 116             } else if (command.equals(SAVE_ALL_CLUSTERS_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 117                 onSaveClusters();
2 26 Feb 07 jari 118             } else if (command.equals(STORE_CLUSTER_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 119                 storeCluster();
2 26 Feb 07 jari 120             } else if (command.equals(SET_DEF_COLOR_CMD)) {
2 26 Feb 07 jari 121                 onSetDefaultColor();
2 26 Feb 07 jari 122             } else if(command.equals(LAUNCH_NEW_SESSION_CMD)){
2 26 Feb 07 jari 123                 launchNewSession();
2 26 Feb 07 jari 124             }
2 26 Feb 07 jari 125         }
2 26 Feb 07 jari 126         
2 26 Feb 07 jari 127         public void mouseReleased(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 128             maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 129         }
2 26 Feb 07 jari 130         
2 26 Feb 07 jari 131         public void mousePressed(MouseEvent event) {
2 26 Feb 07 jari 132             maybeShowPopup(event);
2 26 Feb 07 jari 133         }
2 26 Feb 07 jari 134         
2 26 Feb 07 jari 135         private void maybeShowPopup(MouseEvent e) {
2 26 Feb 07 jari 136             
2 26 Feb 07 jari 137             if (!e.isPopupTrigger() || getCluster() == null || getCluster().length == 0) {
2 26 Feb 07 jari 138                 return;
2 26 Feb 07 jari 139             }
2 26 Feb 07 jari 140             popup.show(e.getComponent(), e.getX(), e.getY());
2 26 Feb 07 jari 141         }
2 26 Feb 07 jari 142     }
2 26 Feb 07 jari 143 }

Generated on Thu Jul 20 09:30:33 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)