mev-4.0.01/source/org/tigr/microarray/mev/script/util/mev_script_dtd.dtd

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 <!--<?xml encoding="UTF-8" ?> -->
2 26 Feb 07 jari 2
2 26 Feb 07 jari 3 <!ELEMENT tm4 (midas?, dbi_controller?, mev?)>
2 26 Feb 07 jari 4 <!ATTLIST tm4 version CDATA #REQUIRED>
2 26 Feb 07 jari 5
2 26 Feb 07 jari 6 <!-- midas and dbiController place holders -->
2 26 Feb 07 jari 7 <!ELEMENT midas EMPTY>
2 26 Feb 07 jari 8 <!ELEMENT dbi_controller EMPTY>
2 26 Feb 07 jari 9
2 26 Feb 07 jari 10
2 26 Feb 07 jari 11 <!ELEMENT mev (analysis, primary_data)>
2 26 Feb 07 jari 12 <!ATTLIST mev version CDATA #REQUIRED>
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 <!ELEMENT analysis (alg_set+)>
2 26 Feb 07 jari 15
2 26 Feb 07 jari 16 <!ELEMENT alg_set (algorithm+)>
2 26 Feb 07 jari 17 <!ATTLIST alg_set set_id ID #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 18                   input_data_ref IDREF #REQUIRED>
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20 <!ELEMENT algorithm (plist, mlist, output_data)>
2 26 Feb 07 jari 21 <!ATTLIST algorithm ser_number_id ID #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 22               input_data_ref IDREF #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 23                     alg_name CDATA #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 24                     alg_type CDATA #REQUIRED>
2 26 Feb 07 jari 25
2 26 Feb 07 jari 26 <!ELEMENT plist (param*)>
2 26 Feb 07 jari 27
2 26 Feb 07 jari 28 <!ELEMENT param (key, value)>
2 26 Feb 07 jari 29 <!ATTLIST param key CDATA #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 30     value CDATA #REQUIRED>
2 26 Feb 07 jari 31                 
2 26 Feb 07 jari 32 <!ELEMENT mlist (matrix*)>
2 26 Feb 07 jari 33 <!ELEMENT matrix (element+)>
2 26 Feb 07 jari 34 <!ATTLIST matrix name ID #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 35                  type CDATA #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 36                  row_dim CDATA #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 37                  col_dim CDATA #REQUIRED>
2 26 Feb 07 jari 38                  
2 26 Feb 07 jari 39 <!ELEMENT element EMPTY>
2 26 Feb 07 jari 40 <!ATTLIST element row CDATA #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 41                   col CDATA #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 42                   value CDATA #REQUIRED>
2 26 Feb 07 jari 43
2 26 Feb 07 jari 44 <!ELEMENT output_data (data_node+)>
2 26 Feb 07 jari 45
2 26 Feb 07 jari 46 <!ELEMENT data_node EMPTY>
2 26 Feb 07 jari 47 <!ATTLIST data_node data_node_id ID #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 48               name CDATA #REQUIRED>
2 26 Feb 07 jari 49                                         
2 26 Feb 07 jari 50 <!ELEMENT primary_data (file_list)>
2 26 Feb 07 jari 51 <!ATTLIST primary_data id ID #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 52                        data_type CDATA #REQUIRED>            
2 26 Feb 07 jari 53 <!-- want an enumeration of data types (mev|tav|stanford|affy|gpr) -->
2 26 Feb 07 jari 54 <!ELEMENT file_list (file+)>
2 26 Feb 07 jari 55 <!ELEMENT file EMPTY>
2 26 Feb 07 jari 56 <!ATTLIST file file_path CDATA #REQUIRED
2 26 Feb 07 jari 57                file_type CDATA #REQUIRED>   
2 26 Feb 07 jari 58 <!-- want an enumeration of file types (‘data’|’annot’|’preference’|’ref’) -->
2 26 Feb 07 jari 59

Generated on Thu Jul 20 09:30:43 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)