mev-4.0.01/source/org/tigr/remote/protocol/parser/XMLMAGEParser.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 26 Feb 07 jari 1 /*
2 26 Feb 07 jari 2 Copyright @ 1999-2003, The Institute for Genomic Research (TIGR).
2 26 Feb 07 jari 3 All rights reserved.
2 26 Feb 07 jari 4 */
2 26 Feb 07 jari 5 /*
2 26 Feb 07 jari 6  * $RCSfile: XMLMAGEParser.java,v $
2 26 Feb 07 jari 7  * $Revision: 1.3 $
2 26 Feb 07 jari 8  * $Date: 2005/03/10 15:28:22 $
2 26 Feb 07 jari 9  * $Author: braistedj $
2 26 Feb 07 jari 10  * $State: Exp $
2 26 Feb 07 jari 11  */
2 26 Feb 07 jari 12 package org.tigr.remote.protocol.parser;
2 26 Feb 07 jari 13
2 26 Feb 07 jari 14 import org.tigr.microarray.mev.cluster.algorithm.AlgorithmData;
2 26 Feb 07 jari 15 import org.tigr.util.ConfMap;
2 26 Feb 07 jari 16 import org.xml.sax.XMLReader;
2 26 Feb 07 jari 17
2 26 Feb 07 jari 18 class XMLMAGEParser {
2 26 Feb 07 jari 19
2 26 Feb 07 jari 20     /**
2 26 Feb 07 jari 21      * Constructs a <code>XMLMAGEParser</code> with specified configuration.
2 26 Feb 07 jari 22      */
2 26 Feb 07 jari 23     public XMLMAGEParser( ConfMap cfg ) {
2 26 Feb 07 jari 24         this.m_config = cfg;
2 26 Feb 07 jari 25     }
2 26 Feb 07 jari 26
2 26 Feb 07 jari 27     /**
2 26 Feb 07 jari 28      * Parse a resource with specified id.
2 26 Feb 07 jari 29      */
2 26 Feb 07 jari 30     public void parse( String id ) throws Exception {
2 26 Feb 07 jari 31         XMLReader reader = ParserUtil.createReader( m_config );
2 26 Feb 07 jari 32         m_handler = new MAGEResponseHandler( m_config );
2 26 Feb 07 jari 33
2 26 Feb 07 jari 34         reader.setContentHandler( m_handler );
2 26 Feb 07 jari 35         reader.setErrorHandler( m_handler );
2 26 Feb 07 jari 36         reader.parse( id );
2 26 Feb 07 jari 37     }
2 26 Feb 07 jari 38
2 26 Feb 07 jari 39     /**
2 26 Feb 07 jari 40      * Returns parse result as an <code>AlgorithmData</code>.
2 26 Feb 07 jari 41      */
2 26 Feb 07 jari 42     public AlgorithmData getResult() { return m_handler.getResult() ;}
2 26 Feb 07 jari 43
2 26 Feb 07 jari 44     private MAGEResponseHandler m_handler;
2 26 Feb 07 jari 45     private ConfMap m_config;
2 26 Feb 07 jari 46 }
2 26 Feb 07 jari 47