extensions/net.sf.basedb.genepattern/trunk/META-INF/extensions.xml

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1102 29 May 09 nicklas 1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
1102 29 May 09 nicklas 2 <extensions xmlns="http://base.thep.lu.se/extensions.xsd">
1102 29 May 09 nicklas 3   <about>
1102 29 May 09 nicklas 4     <name>GenePattern integration package</name>
1102 29 May 09 nicklas 5     <description>
1102 29 May 09 nicklas 6       This package adds the possibility to use a GenePattern
1102 29 May 09 nicklas 7       server for analysis of data in BASE. BASE plug-ins are
1102 29 May 09 nicklas 8       used to send data to the GenePattern server and the
1102 29 May 09 nicklas 9       result files are imported back into BASE.
1102 29 May 09 nicklas 10     </description>
1102 29 May 09 nicklas 11     <version>1.0</version>
1102 29 May 09 nicklas 12     <url>http://baseplugins.thep.lu.se/wiki/net.sf.basedb.genepattern</url>
1102 29 May 09 nicklas 13   </about>
1102 29 May 09 nicklas 14   <extension
1102 29 May 09 nicklas 15     id="net.sf.basedb.genepattern.options"
1102 29 May 09 nicklas 16     extends="net.sf.basedb.clients.web.menu.extensions"
1102 29 May 09 nicklas 17     >
1102 29 May 09 nicklas 18     <index>2</index>
1102 29 May 09 nicklas 19     <about>
1102 29 May 09 nicklas 20       <name>GenePattern options</name>
1102 29 May 09 nicklas 21       <description>
1102 29 May 09 nicklas 22         Opens a dialog where a user can specify which GenePattern server
1102 29 May 09 nicklas 23         to use and their login and password.
1102 29 May 09 nicklas 24       </description>
1102 29 May 09 nicklas 25     </about>
1102 29 May 09 nicklas 26     <action-factory>
1102 29 May 09 nicklas 27       <factory-class>
1102 29 May 09 nicklas 28         net.sf.basedb.clients.web.extensions.menu.FixedMenuItemFactory
1102 29 May 09 nicklas 29       </factory-class>
1102 29 May 09 nicklas 30       <parameters>
1102 29 May 09 nicklas 31         <title>GenePattern options&amp;hellip;</title>
1102 29 May 09 nicklas 32         <tooltip>Specify the GenePattern server and login/password.</tooltip>
1102 29 May 09 nicklas 33         <onClick>Main.openPopup('$HOME$/options.jsp?ID='+getSessionId(), 'GenePatternOptions', 500, 400)</onClick>
1102 29 May 09 nicklas 34         <icon>~/images/genepattern.gif</icon>
1102 29 May 09 nicklas 35       </parameters>
1102 29 May 09 nicklas 36     </action-factory>
1102 29 May 09 nicklas 37   </extension>
1107 03 Jun 09 nicklas 38   <extension
1107 03 Jun 09 nicklas 39     id="net.sf.basedb.genepattern.test"
1107 03 Jun 09 nicklas 40     extends="net.sf.basedb.clients.web.menu.extensions"
1107 03 Jun 09 nicklas 41     >
1107 03 Jun 09 nicklas 42     <index>3</index>
1107 03 Jun 09 nicklas 43     <about>
1107 03 Jun 09 nicklas 44       <name>GenePattern test</name>
1107 03 Jun 09 nicklas 45       <description>
1107 03 Jun 09 nicklas 46         A simple test
1107 03 Jun 09 nicklas 47       </description>
1107 03 Jun 09 nicklas 48     </about>
1107 03 Jun 09 nicklas 49     <action-factory>
1107 03 Jun 09 nicklas 50       <factory-class>
1107 03 Jun 09 nicklas 51         net.sf.basedb.clients.web.extensions.menu.FixedMenuItemFactory
1107 03 Jun 09 nicklas 52       </factory-class>
1107 03 Jun 09 nicklas 53       <parameters>
1107 03 Jun 09 nicklas 54         <title>GenePattern test&amp;hellip;</title>
1107 03 Jun 09 nicklas 55         <tooltip>Specify the GenePattern server and login/password.</tooltip>
1107 03 Jun 09 nicklas 56         <onClick>Main.openPopup('$HOME$/Test.servlet?ID='+getSessionId(), 'GenePatternTest', 500, 400)</onClick>
1107 03 Jun 09 nicklas 57         <icon>~/images/genepattern.gif</icon>
1107 03 Jun 09 nicklas 58       </parameters>
1107 03 Jun 09 nicklas 59     </action-factory>
1107 03 Jun 09 nicklas 60   </extension>
1132 18 Jun 09 nicklas 61   <extension
1132 18 Jun 09 nicklas 62     id="net.sf.basedb.genepattern.visualizer"
1134 22 Jun 09 nicklas 63     extends="net.sf.basedb.clients.web.toolbar.item.bioassayset"
1132 18 Jun 09 nicklas 64     >
1134 22 Jun 09 nicklas 65     <index>1</index>
1132 18 Jun 09 nicklas 66     <about>
1134 22 Jun 09 nicklas 67       <name>GenePattern Visualizer</name>
1132 18 Jun 09 nicklas 68       <description>
1134 22 Jun 09 nicklas 69         Runs a GenePattern visualizer module.
1132 18 Jun 09 nicklas 70       </description>
1132 18 Jun 09 nicklas 71     </about>
1132 18 Jun 09 nicklas 72     <action-factory>
1132 18 Jun 09 nicklas 73       <factory-class>
1134 22 Jun 09 nicklas 74         net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.FixedButtonFactory
1132 18 Jun 09 nicklas 75       </factory-class>
1132 18 Jun 09 nicklas 76       <parameters>
1134 22 Jun 09 nicklas 77         <title>GenePattern visualizer&amp;hellip;</title>
1134 22 Jun 09 nicklas 78         <onClick>Main.openPopup('$HOME$/run_visualizer.jsp?ID='+getSessionId(), 'GPVisualizer', 800, 600)</onClick>
1132 18 Jun 09 nicklas 79         <icon>~/images/genepattern.gif</icon>
1134 22 Jun 09 nicklas 80         <tooltip>Runs a GenePattern visualizer module with data from this bioassay set</tooltip>
1132 18 Jun 09 nicklas 81       </parameters>
1132 18 Jun 09 nicklas 82     </action-factory>
1132 18 Jun 09 nicklas 83   </extension>
1102 29 May 09 nicklas 84 </extensions>

Generated on Tue Nov 21 03:24:26 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)