extensions/net.sf.basedb.genepattern/trunk/resources/options.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1102 29 May 09 nicklas 1 <%-- $Id$
1102 29 May 09 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
1102 29 May 09 nicklas 3   Copyright (C) 2009 Nicklas Nordborg
1102 29 May 09 nicklas 4
1102 29 May 09 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
1102 29 May 09 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
1102 29 May 09 nicklas 7
1102 29 May 09 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
1102 29 May 09 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
1102 29 May 09 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 2
1102 29 May 09 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
1102 29 May 09 nicklas 12
1102 29 May 09 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
1102 29 May 09 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
1102 29 May 09 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
1102 29 May 09 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
1102 29 May 09 nicklas 17
1102 29 May 09 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
1102 29 May 09 nicklas 19   along with this program; if not, write to the Free Software
1102 29 May 09 nicklas 20   Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330,
1102 29 May 09 nicklas 21   Boston, MA  02111-1307, USA.
1102 29 May 09 nicklas 22   ------------------------------------------------------------------
1102 29 May 09 nicklas 23
1102 29 May 09 nicklas 24   @author Jari, Nicklas
1102 29 May 09 nicklas 25 --%>
1102 29 May 09 nicklas 26 <%@ page
1102 29 May 09 nicklas 27   pageEncoding="UTF-8"
1102 29 May 09 nicklas 28   session="false"
1102 29 May 09 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.Application"
1102 29 May 09 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.BioAssaySet"
1102 29 May 09 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.Experiment"
1102 29 May 09 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.Directory"
1102 29 May 09 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.User"
1102 29 May 09 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1102 29 May 09 nicklas 35   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1102 29 May 09 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.Path"
1102 29 May 09 nicklas 37   import="net.sf.basedb.core.Presets"
1102 29 May 09 nicklas 38   import="net.sf.basedb.core.Presets.Preset"
1102 29 May 09 nicklas 39   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
1102 29 May 09 nicklas 40   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
1102 29 May 09 nicklas 41   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
1102 29 May 09 nicklas 42   import="net.sf.basedb.util.Values"
1102 29 May 09 nicklas 43 %>
1102 29 May 09 nicklas 44 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1102 29 May 09 nicklas 45 <%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
1102 29 May 09 nicklas 46
1102 29 May 09 nicklas 47 <%
1102 29 May 09 nicklas 48 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, true);
1102 29 May 09 nicklas 49 final String ID = sc.getId();
1102 29 May 09 nicklas 50 final float scale = Base.getScale(sc);
1102 29 May 09 nicklas 51 DbControl dc = null;
1102 29 May 09 nicklas 52 try
1102 29 May 09 nicklas 53 {
1102 29 May 09 nicklas 54   dc = sc.newDbControl();
1102 29 May 09 nicklas 55   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
1108 04 Jun 09 nicklas 56   String presetsXml = sc.getUserDefaultSetting("net.sf.basedb.genepattern.options");
1102 29 May 09 nicklas 57   Presets presets = new Presets();
1102 29 May 09 nicklas 58   if (presetsXml != null) presets.loadFrom(presetsXml);
1102 29 May 09 nicklas 59 %>
1102 29 May 09 nicklas 60 <base:page type="popup" title="<%="GenePattern options for "+HTML.encodeTags(user.getName())%>">
1102 29 May 09 nicklas 61 <base:head scripts="tabcontrol.js" styles="tabcontrol.css">
1102 29 May 09 nicklas 62   <script language="JavaScript">
1102 29 May 09 nicklas 63   function saveSettings()
1102 29 May 09 nicklas 64   {
1102 29 May 09 nicklas 65     document.forms['options'].submit();
1102 29 May 09 nicklas 66   }
1102 29 May 09 nicklas 67   function addServer()
1102 29 May 09 nicklas 68   {
1106 02 Jun 09 nicklas 69     Main.openPopup('edit_server.jsp?ID=<%=ID%>&gpServer=', 'EditGPServer', 600, 400);
1102 29 May 09 nicklas 70   }
1102 29 May 09 nicklas 71   function editServer()
1102 29 May 09 nicklas 72   {
1102 29 May 09 nicklas 73     var frm = document.forms['options'];
1102 29 May 09 nicklas 74     if (frm.servers.selectedIndex < 0)
1102 29 May 09 nicklas 75     {
1102 29 May 09 nicklas 76       alert('No server has been selected');
1102 29 May 09 nicklas 77       return;
1102 29 May 09 nicklas 78     }
1102 29 May 09 nicklas 79     var gpServer = frm.servers[frm.servers.selectedIndex].text;
1106 02 Jun 09 nicklas 80     Main.openPopup('edit_server.jsp?ID=<%=ID%>&gpServer=' + encodeURIComponent(gpServer), 'EditGPServer', 600, 400);
1102 29 May 09 nicklas 81   }
1102 29 May 09 nicklas 82   function removeServer()
1102 29 May 09 nicklas 83   {
1102 29 May 09 nicklas 84     var frm = document.forms['options'];
1102 29 May 09 nicklas 85     if (frm.servers.selectedIndex < 0)
1102 29 May 09 nicklas 86     {
1102 29 May 09 nicklas 87       alert('No server has been selected');
1102 29 May 09 nicklas 88       return;
1102 29 May 09 nicklas 89     }
1102 29 May 09 nicklas 90     var gpServer = frm.servers[frm.servers.selectedIndex].text;
1102 29 May 09 nicklas 91     Main.openPopup('submit.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=RemoveServer&gpServer=' + encodeURIComponent(gpServer), 'RemoveGPServer', 300, 200);
1102 29 May 09 nicklas 92   }
1102 29 May 09 nicklas 93   </script>
1102 29 May 09 nicklas 94 </base:head>
1102 29 May 09 nicklas 95 <base:body>
1102 29 May 09 nicklas 96   <form action="submit.jsp?ID=<%=ID%>" method="post" name="options" onsubmit="return false;">
1102 29 May 09 nicklas 97   <input type=hidden name="cmd" value="SaveOptions">
1102 29 May 09 nicklas 98   
1102 29 May 09 nicklas 99   <h3 class="docked">GenePattern options for <%=HTML.encodeTags(user.getName())%></h3>
1102 29 May 09 nicklas 100   <t:tabcontrol id="options" 
1102 29 May 09 nicklas 101     contentstyle="<%="height: "+(int)(scale*280)+"px;"%>" 
1102 29 May 09 nicklas 102     position="bottom">
1102 29 May 09 nicklas 103   
1102 29 May 09 nicklas 104   <t:tab id="option" title="GenePattern servers">
1102 29 May 09 nicklas 105     <table class="form" cellspacing=0>
1102 29 May 09 nicklas 106     <tr>
1102 29 May 09 nicklas 107       <td class="prompt">GenePattern servers</td>
1102 29 May 09 nicklas 108     <tr>
1102 29 May 09 nicklas 109       <td>
1102 29 May 09 nicklas 110       <select name="servers" multiple="multiple" size="10" style="width: 25em;">
1102 29 May 09 nicklas 111       <%
1106 02 Jun 09 nicklas 112       String selected = "selected";
1102 29 May 09 nicklas 113       for (Presets.Preset server : presets)
1102 29 May 09 nicklas 114       {
1102 29 May 09 nicklas 115         %>
1106 02 Jun 09 nicklas 116         <option <%=selected%>><%=HTML.encodeTags(server.getName())%>
1102 29 May 09 nicklas 117         <%
1106 02 Jun 09 nicklas 118         selected = "";
1102 29 May 09 nicklas 119       }
1102 29 May 09 nicklas 120       %>
1102 29 May 09 nicklas 121       </select>
1102 29 May 09 nicklas 122       </td>
1102 29 May 09 nicklas 123       <td>
1102 29 May 09 nicklas 124         <table width="100">
1102 29 May 09 nicklas 125         <tr><td><base:button title="Edit&hellip;&nbsp;&nbsp;&nbsp;" image="configure.png" onclick="editServer()" /></td></tr>
1102 29 May 09 nicklas 126         <tr><td><base:button title="Add&hellip;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;" onclick="addServer()" /></td></tr>
1102 29 May 09 nicklas 127         <tr><td><base:button title="Remove&hellip;" onclick="removeServer()" /></td></tr>
1102 29 May 09 nicklas 128         </table>
1102 29 May 09 nicklas 129       </td>
1102 29 May 09 nicklas 130     </tr>
1102 29 May 09 nicklas 131     </table>
1102 29 May 09 nicklas 132     
1102 29 May 09 nicklas 133   </t:tab>
1102 29 May 09 nicklas 134   </t:tabcontrol>
1102 29 May 09 nicklas 135   <p>
1102 29 May 09 nicklas 136   <table align="center">
1102 29 May 09 nicklas 137   <tr>
1102 29 May 09 nicklas 138     <td><base:button onclick="window.close();" title="Close" /></td>
1102 29 May 09 nicklas 139   </tr>
1102 29 May 09 nicklas 140   </table>
1102 29 May 09 nicklas 141 </base:body>
1102 29 May 09 nicklas 142 </base:page>
1102 29 May 09 nicklas 143 <%
1102 29 May 09 nicklas 144 }
1102 29 May 09 nicklas 145 finally
1102 29 May 09 nicklas 146 {
1102 29 May 09 nicklas 147   if (dc != null) dc.close();
1102 29 May 09 nicklas 148 }
1102 29 May 09 nicklas 149 %>

Generated on Tue Nov 21 03:24:34 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)