extensions/net.sf.basedb.meludi/trunk/resources/admin/update_start_list_with_lot_numbers_from_extract.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
3501 21 Sep 15 olle 1 <%@ page
3501 21 Sep 15 olle 2   pageEncoding="UTF-8"
3501 21 Sep 15 olle 3   session="false"
3501 21 Sep 15 olle 4   import="net.sf.basedb.core.Application"
3501 21 Sep 15 olle 5   import="net.sf.basedb.core.User"
3501 21 Sep 15 olle 6   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
3501 21 Sep 15 olle 7   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
3501 21 Sep 15 olle 8   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
3501 21 Sep 15 olle 9   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
3501 21 Sep 15 olle 10   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
3501 21 Sep 15 olle 11   import="net.sf.basedb.util.Values"
3501 21 Sep 15 olle 12   import="net.sf.basedb.util.formatter.WellCoordinateFormatter"
3501 21 Sep 15 olle 13 %>
3501 21 Sep 15 olle 14 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
3501 21 Sep 15 olle 15 <%@ taglib prefix="m" uri="/WEB-INF/menu.tld" %>
3501 21 Sep 15 olle 16 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
3501 21 Sep 15 olle 17 <%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
3501 21 Sep 15 olle 18 <%
3501 21 Sep 15 olle 19 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, true);
3501 21 Sep 15 olle 20 final String ID = sc.getId();
3501 21 Sep 15 olle 21 final float scale = Base.getScale(sc);
3501 21 Sep 15 olle 22 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.meludi");
3501 21 Sep 15 olle 23 DbControl dc = null;
3501 21 Sep 15 olle 24 try
3501 21 Sep 15 olle 25 {
3501 21 Sep 15 olle 26   dc = sc.newDbControl();
3501 21 Sep 15 olle 27   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
3501 21 Sep 15 olle 28 %>
3501 21 Sep 15 olle 29 <base:page type="default">
3501 21 Sep 15 olle 30 <base:head 
3501 21 Sep 15 olle 31   scripts="~../meludi-2.js,~update_start_list_with_lot_numbers_from_extract.js,js-draw.js" 
3501 21 Sep 15 olle 32   styles="path.css,toolbar.css,~../css/meludi-2.css"
3501 21 Sep 15 olle 33   >
3501 21 Sep 15 olle 34
3501 21 Sep 15 olle 35 </base:head>
3501 21 Sep 15 olle 36 <base:body>
3501 21 Sep 15 olle 37   <p:path><p:pathelement 
3501 21 Sep 15 olle 38     title="MeLuDI" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
3501 21 Sep 15 olle 39     /><p:pathelement title="Update processed start lists with lot numbers from extracts"
3501 21 Sep 15 olle 40     /></p:path>
3501 21 Sep 15 olle 41   
3501 21 Sep 15 olle 42   <div class="content">
3501 21 Sep 15 olle 43   
3501 21 Sep 15 olle 44   <form name="meludi" id="wizard" class="wizard">
3501 21 Sep 15 olle 45   
3501 21 Sep 15 olle 46   <div class="step auto-hide" id="step-1">
3501 21 Sep 15 olle 47     <div class="step-no">1</div>
3501 21 Sep 15 olle 48     <div class="step-title">Select start item list[s] to update</div>
3501 21 Sep 15 olle 49     <div class="step-content">
3501 21 Sep 15 olle 50   
3501 21 Sep 15 olle 51       <div class="bg-filled-50" style="padding: 2px;">
3501 21 Sep 15 olle 52         This wizard is intended for updating processed start lists created prior to MeLuDI v1.3.2<br>
3501 21 Sep 15 olle 53         with lot numbers stored in their first DNA member item. This is needed in order to make<br>
3501 21 Sep 15 olle 54         the values appear in step two of the "Lab tracking protocol/report copy" wizard, and in the<br>
3501 21 Sep 15 olle 55         optional created protocol/report.<br>
3501 21 Sep 15 olle 56         <br>
3501 21 Sep 15 olle 57         Each processed start item list will be updated as follows:<br>
3501 21 Sep 15 olle 58         <br>
3501 21 Sep 15 olle 59         a. New start list lot number annotations will be set to values of the corresponding annotations for the first DNA extract.<br>
3501 21 Sep 15 olle 60         b. The new extraction operator annotation will not be set, as it was not defined for extracts prior to MeLuDI v1.3.2.<br>
3501 21 Sep 15 olle 61         <br>
3501 21 Sep 15 olle 62         The updated start lists can now be checked in the "Lab tracking protocol/report copy" wizard.<br>
3501 21 Sep 15 olle 63         <br>
3501 21 Sep 15 olle 64       </div>
3501 21 Sep 15 olle 65
3501 21 Sep 15 olle 66       <table class="step-form">
3501 21 Sep 15 olle 67       <tr class="align-top">
3501 21 Sep 15 olle 68         <td class="prompt">Start item lists</td>
3501 21 Sep 15 olle 69         <td class="input">
3501 21 Sep 15 olle 70           <select name="startItemList" id="startItemList" multiple size="30"></select>
3501 21 Sep 15 olle 71         </td>
3501 21 Sep 15 olle 72         <td class="status" id="startItemList.status"></td>
3501 21 Sep 15 olle 73         <td class="help">
3501 21 Sep 15 olle 74           <span id="startItemList.message" class="message" ></span>
3501 21 Sep 15 olle 75           Select processed start item list[s] to update.
3501 21 Sep 15 olle 76         </td>
3501 21 Sep 15 olle 77       </tr>
3501 21 Sep 15 olle 78       </table>
3501 21 Sep 15 olle 79       <select name="extractSourceItems" id="extractSourceItems" multiple size="30"></select>
3501 21 Sep 15 olle 80     </div>
3501 21 Sep 15 olle 81   </div>
3501 21 Sep 15 olle 82
3501 21 Sep 15 olle 83   <div id="wizard-status"></div>
3501 21 Sep 15 olle 84   
3501 21 Sep 15 olle 85   <table class="navigation" id="navigation">
3501 21 Sep 15 olle 86   <tr>
3501 21 Sep 15 olle 87     <td><base:button id="gocancel" title="Cancel" /></td>
3501 21 Sep 15 olle 88     <td><base:button id="gonext" title="Next" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
3501 21 Sep 15 olle 89     <td><base:button id="goregister" title="Register" image="<%=home+"/images/import.png"%>"  /></td>
3501 21 Sep 15 olle 90     <td><base:button id="gorestart" title="Restart" image="<%=home+"/images/goback.png"%>" /></td>
3501 21 Sep 15 olle 91     <td id="gonext-message" class="message"></td>
3501 21 Sep 15 olle 92   </tr>
3501 21 Sep 15 olle 93   </table>
3501 21 Sep 15 olle 94
3501 21 Sep 15 olle 95   </form>
3501 21 Sep 15 olle 96   </div>
3501 21 Sep 15 olle 97 </base:body>
3501 21 Sep 15 olle 98 </base:page>
3501 21 Sep 15 olle 99 <%
3501 21 Sep 15 olle 100 }
3501 21 Sep 15 olle 101 finally
3501 21 Sep 15 olle 102 {
3501 21 Sep 15 olle 103   if (dc != null) dc.close();
3501 21 Sep 15 olle 104 }
3501 21 Sep 15 olle 105 %>

Generated on Tue Nov 21 03:25:44 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)