extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/config/reggie-extended-properties.xml

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2747 07 Oct 14 nicklas 1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
2747 07 Oct 14 nicklas 2 <!DOCTYPE extended-properties SYSTEM "extended-properties.dtd" >
2747 07 Oct 14 nicklas 3 <!--
2747 07 Oct 14 nicklas 4   Extended properties file with definitions for reporter annotations
2747 07 Oct 14 nicklas 5   that are specific to the SCANB sequencing platform. You should place a 
2747 07 Oct 14 nicklas 6   copy this file into your
2747 07 Oct 14 nicklas 7   [base2home]/www/WEB-INF/classes/extended-properties/ directory
2747 07 Oct 14 nicklas 8   
2747 07 Oct 14 nicklas 9   NOTE!!! Check your default extended-properties.xml file if you need
2747 07 Oct 14 nicklas 10   to uncomment the 'chromosome' property below or not!
2747 07 Oct 14 nicklas 11 -->
2747 07 Oct 14 nicklas 12 <extended-properties>
2747 07 Oct 14 nicklas 13   <class name="ReporterData">
2747 07 Oct 14 nicklas 14     <property
2747 07 Oct 14 nicklas 15       name="refseq"
2747 07 Oct 14 nicklas 16       title="Refseq"
2747 07 Oct 14 nicklas 17       description=""
2747 07 Oct 14 nicklas 18       column="refseq"
2747 07 Oct 14 nicklas 19       type="string"
2747 07 Oct 14 nicklas 20       length="255"
2747 07 Oct 14 nicklas 21     />
2747 07 Oct 14 nicklas 22     <property
2747 07 Oct 14 nicklas 23       name="protAcc"
2747 07 Oct 14 nicklas 24       title="ProtAcc"
2747 07 Oct 14 nicklas 25       description=""
2747 07 Oct 14 nicklas 26       column="protAcc"
2747 07 Oct 14 nicklas 27       type="string"
2747 07 Oct 14 nicklas 28       length="255"
2747 07 Oct 14 nicklas 29     />
2747 07 Oct 14 nicklas 30     <!-- 
2851 22 Oct 14 nicklas 31     This property is required, and is normally defined by BASE core. 
2851 22 Oct 14 nicklas 32     If you get an error when running updatedb.sh this property should
2851 22 Oct 14 nicklas 33     be removed from this file.
2851 22 Oct 14 nicklas 34     -->
2747 07 Oct 14 nicklas 35     <property
2747 07 Oct 14 nicklas 36       name="chromosome"
2747 07 Oct 14 nicklas 37       title="Chromosome"
2747 07 Oct 14 nicklas 38       description="The chromosome from which the reporter is derived"
2747 07 Oct 14 nicklas 39       column="chromosome"
2747 07 Oct 14 nicklas 40       type="string"
2747 07 Oct 14 nicklas 41       length="255"
2747 07 Oct 14 nicklas 42     />
2851 22 Oct 14 nicklas 43
2747 07 Oct 14 nicklas 44   </class>
2747 07 Oct 14 nicklas 45 </extended-properties>