extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/containers/def/rockylinux9.0_with_miniconda.def

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
6795 10 Aug 22 nicklas 1 Bootstrap: library
6795 10 Aug 22 nicklas 2 From: library/default/rockylinux:9.0
6795 10 Aug 22 nicklas 3
6795 10 Aug 22 nicklas 4 %post
6795 10 Aug 22 nicklas 5 yum -y install glibc-langpack-en libxcrypt-compat 
7103 11 Apr 23 nicklas 6 yum -y install findutils wget unzip tar bzip2 hostname which
6795 10 Aug 22 nicklas 7
7103 11 Apr 23 nicklas 8 ## Minconda 23.1 with Python 3.10
6795 10 Aug 22 nicklas 9 mkdir -p /download
7272 30 Jun 23 nicklas 10 wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py310_23.3.1-0-Linux-x86_64.sh -O /download/miniconda.sh
6795 10 Aug 22 nicklas 11
6795 10 Aug 22 nicklas 12 bash /download/miniconda.sh -b -p /miniconda
6795 10 Aug 22 nicklas 13 PATH=/miniconda/bin:$PATH
6795 10 Aug 22 nicklas 14 conda config --add channels defaults
6795 10 Aug 22 nicklas 15 conda config --add channels bioconda
6795 10 Aug 22 nicklas 16 conda config --add channels conda-forge
6795 10 Aug 22 nicklas 17
6795 10 Aug 22 nicklas 18
6795 10 Aug 22 nicklas 19 %environment
6795 10 Aug 22 nicklas 20 export PATH=/miniconda/bin:$PATH
6795 10 Aug 22 nicklas 21
6795 10 Aug 22 nicklas 22 %test
6795 10 Aug 22 nicklas 23 echo "Host      : `hostname 2>&1`"
6795 10 Aug 22 nicklas 24 echo "OS        : `cat /etc/os-release | grep PRETTY_NAME | cut -d '"' -f 2`"
6795 10 Aug 22 nicklas 25 echo "Miniconda : `conda --version 2>&1`"
6795 10 Aug 22 nicklas 26 echo "Python    : `python --version 2>&1`"
6795 10 Aug 22 nicklas 27
6795 10 Aug 22 nicklas 28 %labels
6795 10 Aug 22 nicklas 29 Author Nicklas Nordborg
6795 10 Aug 22 nicklas 30
6795 10 Aug 22 nicklas 31 %help
7272 30 Jun 23 nicklas 32 A Rocky 9.0 installation with Miniconda 23.3.
6795 10 Aug 22 nicklas 33

Generated on Tue Nov 21 03:29:28 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)