extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/analysis/vcall_import.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
5877 24 Mar 20 nicklas 1 <%@ page
5877 24 Mar 20 nicklas 2   pageEncoding="UTF-8"
5877 24 Mar 20 nicklas 3   session="false"
5877 24 Mar 20 nicklas 4   import="net.sf.basedb.core.User"
5877 24 Mar 20 nicklas 5   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
5877 24 Mar 20 nicklas 6   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
5877 24 Mar 20 nicklas 7   import="net.sf.basedb.core.Application"
5877 24 Mar 20 nicklas 8   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"  
5877 24 Mar 20 nicklas 9   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"  
5877 24 Mar 20 nicklas 10   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
5877 24 Mar 20 nicklas 11 %>
5877 24 Mar 20 nicklas 12 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
5877 24 Mar 20 nicklas 13 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
5877 24 Mar 20 nicklas 14 <%
5877 24 Mar 20 nicklas 15 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
5877 24 Mar 20 nicklas 16 final String ID = sc.getId();
5877 24 Mar 20 nicklas 17 final float scale = Base.getScale(sc);
5877 24 Mar 20 nicklas 18 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
5877 24 Mar 20 nicklas 19 DbControl dc = null;
5877 24 Mar 20 nicklas 20 try
5877 24 Mar 20 nicklas 21 {
5877 24 Mar 20 nicklas 22   dc = sc.newDbControl();
5877 24 Mar 20 nicklas 23   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
5877 24 Mar 20 nicklas 24 %>
5877 24 Mar 20 nicklas 25 <base:page type="default" >
5877 24 Mar 20 nicklas 26 <base:head 
5877 24 Mar 20 nicklas 27   scripts="~../reggie-2.js,~vcall_import.js" 
5877 24 Mar 20 nicklas 28   styles="path.css,~../css/reggie-2.css"
5877 24 Mar 20 nicklas 29 />
5877 24 Mar 20 nicklas 30 <base:body>
5877 24 Mar 20 nicklas 31
5877 24 Mar 20 nicklas 32   <p:path><p:pathelement 
5877 24 Mar 20 nicklas 33     title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
5877 24 Mar 20 nicklas 34     /><p:pathelement title="Import variants to existing raw bioassays" 
5877 24 Mar 20 nicklas 35     /></p:path>
5877 24 Mar 20 nicklas 36
5877 24 Mar 20 nicklas 37   <div class="content">
5877 24 Mar 20 nicklas 38   <form name="reggie" id="wizard" class="wizard">
5877 24 Mar 20 nicklas 39   
5877 24 Mar 20 nicklas 40   <div class="step" id="step-1">
5877 24 Mar 20 nicklas 41     <div class="step-no">1</div>
5877 24 Mar 20 nicklas 42     <div class="step-title">Variant call raw bioassays</div>
5877 24 Mar 20 nicklas 43     <div class="step-content" style="padding: 0.5em;">
5877 24 Mar 20 nicklas 44
5877 24 Mar 20 nicklas 45       This wizard will look for existing variant call raw bioassays
5877 24 Mar 20 nicklas 46       that has not yet imported variants from the filtered
5877 24 Mar 20 nicklas 47       variants file.
5877 24 Mar 20 nicklas 48       <br><br>
5877 24 Mar 20 nicklas 49       There are currently <b><span id="countRawBioAssays"></span></b> raw bioassays.
5877 24 Mar 20 nicklas 50     </div>
5877 24 Mar 20 nicklas 51   </div>
5877 24 Mar 20 nicklas 52
5877 24 Mar 20 nicklas 53
5877 24 Mar 20 nicklas 54   <div id="wizard-status"></div>
5877 24 Mar 20 nicklas 55   <div id="wizard-progress"></div>
5877 24 Mar 20 nicklas 56
5877 24 Mar 20 nicklas 57     <table class="navigation" id="navigation">
5877 24 Mar 20 nicklas 58     <tr>
5877 24 Mar 20 nicklas 59       <td><base:button id="gocancel" title="Cancel" /></td>
5877 24 Mar 20 nicklas 60       <td><base:button id="goregister" title="Import" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
5877 24 Mar 20 nicklas 61       <td id="gonext-message" class="message"></td>
5877 24 Mar 20 nicklas 62     </tr>
5877 24 Mar 20 nicklas 63     </table>
5877 24 Mar 20 nicklas 64   </form>
5877 24 Mar 20 nicklas 65   </div>
5877 24 Mar 20 nicklas 66   
5877 24 Mar 20 nicklas 67 </base:body>
5877 24 Mar 20 nicklas 68 </base:page>
5877 24 Mar 20 nicklas 69 <%
5877 24 Mar 20 nicklas 70 }
5877 24 Mar 20 nicklas 71 finally
5877 24 Mar 20 nicklas 72 {
5877 24 Mar 20 nicklas 73   if (dc != null) dc.close();
5877 24 Mar 20 nicklas 74 }
5877 24 Mar 20 nicklas 75 %>

Generated on Tue Nov 21 03:30:11 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)