extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/batch/linked-specimen.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
3394 12 Jun 15 nicklas 1 <%@ page
3394 12 Jun 15 nicklas 2   pageEncoding="UTF-8"
3394 12 Jun 15 nicklas 3   session="false"
3394 12 Jun 15 nicklas 4   import="net.sf.basedb.core.Application"
3394 12 Jun 15 nicklas 5   import="net.sf.basedb.core.User"
3394 12 Jun 15 nicklas 6   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
3394 12 Jun 15 nicklas 7   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
3394 12 Jun 15 nicklas 8   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
3394 12 Jun 15 nicklas 9   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
3394 12 Jun 15 nicklas 10   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
3394 12 Jun 15 nicklas 11   import="net.sf.basedb.util.Values"
3394 12 Jun 15 nicklas 12 %>
3394 12 Jun 15 nicklas 13 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
3394 12 Jun 15 nicklas 14 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
3394 12 Jun 15 nicklas 15 <%
3976 26 May 16 nicklas 16 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
3394 12 Jun 15 nicklas 17 final String ID = sc.getId();
3394 12 Jun 15 nicklas 18 final float scale = Base.getScale(sc);
3394 12 Jun 15 nicklas 19 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
3394 12 Jun 15 nicklas 20
3394 12 Jun 15 nicklas 21 DbControl dc = null;
3394 12 Jun 15 nicklas 22 try
3394 12 Jun 15 nicklas 23 {
3394 12 Jun 15 nicklas 24   dc = sc.newDbControl();
3394 12 Jun 15 nicklas 25   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
3394 12 Jun 15 nicklas 26 %>
3394 12 Jun 15 nicklas 27 <base:page type="default" >
3394 12 Jun 15 nicklas 28 <base:head 
3394 12 Jun 15 nicklas 29   scripts="~../reggie-2.js,~linked-specimen.js" 
3394 12 Jun 15 nicklas 30   styles="path.css,~../css/reggie-2.css"
3394 12 Jun 15 nicklas 31 >
3394 12 Jun 15 nicklas 32 <style>
3394 12 Jun 15 nicklas 33
3394 12 Jun 15 nicklas 34 #update-results
3394 12 Jun 15 nicklas 35 {
3394 12 Jun 15 nicklas 36   width: 40em; 
3394 12 Jun 15 nicklas 37   border-width: 1px; 
3394 12 Jun 15 nicklas 38   margin-left: 2em;
3394 12 Jun 15 nicklas 39 }
3394 12 Jun 15 nicklas 40
3394 12 Jun 15 nicklas 41 #update-results th, #update-results td
3394 12 Jun 15 nicklas 42 {
3394 12 Jun 15 nicklas 43   text-align: left;
3394 12 Jun 15 nicklas 44   padding: 2px;
3394 12 Jun 15 nicklas 45 }
3394 12 Jun 15 nicklas 46
3394 12 Jun 15 nicklas 47 </style>
3394 12 Jun 15 nicklas 48 </base:head>
3394 12 Jun 15 nicklas 49 <base:body>
3394 12 Jun 15 nicklas 50
3394 12 Jun 15 nicklas 51   <p:path><p:pathelement 
3394 12 Jun 15 nicklas 52     title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
3394 12 Jun 15 nicklas 53     /><p:pathelement title="Linked specimen batch update" 
3394 12 Jun 15 nicklas 54     /></p:path>
3394 12 Jun 15 nicklas 55
3394 12 Jun 15 nicklas 56   <div class="content">
3394 12 Jun 15 nicklas 57   <form name="reggie" id="wizard" class="wizard">
3394 12 Jun 15 nicklas 58   
3394 12 Jun 15 nicklas 59   <div class="step" id="step-1">
3394 12 Jun 15 nicklas 60     <div class="step-no">1</div>
3394 12 Jun 15 nicklas 61     <div class="step-title">Linked specimen</div>
3394 12 Jun 15 nicklas 62     <div class="step-content">
3394 12 Jun 15 nicklas 63
3394 12 Jun 15 nicklas 64       <div style="padding: 1em;">
3394 12 Jun 15 nicklas 65       This wizard will update the <b>LinkedSpecimen</b> annotation on
6153 26 Feb 21 nicklas 66       <b>Specimen/NoSpecimen/FutureSpecimen</b> items.<br>
3394 12 Jun 15 nicklas 67       The date used for comparison is the
3394 12 Jun 15 nicklas 68       creation date of the specimen.
3394 12 Jun 15 nicklas 69       <ol>
3481 09 Sep 15 nicklas 70         <li>If the patient has any specimen without date: <b>MissingDate</b>
3394 12 Jun 15 nicklas 71         <li>If the same case has a prior core biopsy: <b>IpsilateralCoreBiopsy</b>
3394 12 Jun 15 nicklas 72         <li>If the other case (opposite laterality) has a prior core biopsy: <b>ContralateralCoreBiopsy</b>
3394 12 Jun 15 nicklas 73         <li>If the same case has a prior specimen: <b>IpsilateralSample</b>
3394 12 Jun 15 nicklas 74         <li>If the other case (opposite laterality) has a prior specimen: <b>ContralateralSample</b>
3394 12 Jun 15 nicklas 75         <li>If none of the above: <b>No value</b>
3394 12 Jun 15 nicklas 76       </ol>
3394 12 Jun 15 nicklas 77       </div>
3394 12 Jun 15 nicklas 78     </div>
3394 12 Jun 15 nicklas 79   </div>
3394 12 Jun 15 nicklas 80
3481 09 Sep 15 nicklas 81
3481 09 Sep 15 nicklas 82   <div id="wizard-status"></div>
3905 29 Apr 16 nicklas 83   <div id="wizard-progress"></div>
3481 09 Sep 15 nicklas 84
3481 09 Sep 15 nicklas 85   <table id="update-results" style="display: none; margin-top: 1em;">
3481 09 Sep 15 nicklas 86     <tr class="bg-filled-100 bottomborder">
3394 12 Jun 15 nicklas 87       <th style="width: 20em;">LinkedSpecimen</th>
3394 12 Jun 15 nicklas 88       <th style="width: 10em;">Before</th>
3394 12 Jun 15 nicklas 89       <th style="width: 10em;">After</th>
3394 12 Jun 15 nicklas 90     </tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 91     <tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 92       <th class="bg-filled-100 rightborder">No value</th>
3394 12 Jun 15 nicklas 93       <td id="novalue-before">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 94       <td id="novalue-after">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 95     </tr>
3481 09 Sep 15 nicklas 96     <tr class="bottomborder" style="border-bottom-style: dotted;">
3481 09 Sep 15 nicklas 97       <th class="bg-filled-100 rightborder">MissingDate</th>
3481 09 Sep 15 nicklas 98       <td id="MissingDate-before">?</td>
3481 09 Sep 15 nicklas 99       <td id="MissingDate-after">?</td>
3481 09 Sep 15 nicklas 100     </tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 101     <tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 102       <th class="bg-filled-100 rightborder">IpsilateralCoreBiopsy</th>
3394 12 Jun 15 nicklas 103       <td id="IpsilateralCoreBiopsy-before">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 104       <td id="IpsilateralCoreBiopsy-after">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 105     </tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 106     <tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 107       <th class="bg-filled-100 rightborder">ContralateralCoreBiopsy</th>
3394 12 Jun 15 nicklas 108       <td id="ContralateralCoreBiopsy-before">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 109       <td id="ContralateralCoreBiopsy-after">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 110     </tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 111     <tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 112       <th class="bg-filled-100 rightborder">IpsilateralSample</th>
3394 12 Jun 15 nicklas 113       <td id="IpsilateralSample-before">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 114       <td id="IpsilateralSample-after">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 115     </tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 116     <tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 117       <th class="bg-filled-100 rightborder">ContralateralSample</th>
3394 12 Jun 15 nicklas 118       <td id="ContralateralSample-before">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 119       <td id="ContralateralSample-after">?</td>
3394 12 Jun 15 nicklas 120     </tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 121   </table>
3394 12 Jun 15 nicklas 122     
3394 12 Jun 15 nicklas 123
3394 12 Jun 15 nicklas 124     <table class="navigation" id="navigation">
3394 12 Jun 15 nicklas 125     <tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 126       <td><base:button id="gocancel" title="Cancel" /></td>
3394 12 Jun 15 nicklas 127       <td><base:button id="gonext" title="Next" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
3394 12 Jun 15 nicklas 128       <td><base:button id="goregister" title="Register" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
3394 12 Jun 15 nicklas 129       <td><base:button id="goupdate" title="Update" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
3394 12 Jun 15 nicklas 130       <td><base:button id="gorestart" title="Restart" image="<%=home+"/images/goback.png"%>" /></td>
3394 12 Jun 15 nicklas 131       <td id="gonext-message" class="message"></td>
3394 12 Jun 15 nicklas 132     </tr>
3394 12 Jun 15 nicklas 133     </table>
3394 12 Jun 15 nicklas 134   </form>
3394 12 Jun 15 nicklas 135   </div>
3394 12 Jun 15 nicklas 136   
3394 12 Jun 15 nicklas 137 </base:body>
3394 12 Jun 15 nicklas 138 </base:page>
3394 12 Jun 15 nicklas 139 <%
3394 12 Jun 15 nicklas 140 }
3394 12 Jun 15 nicklas 141 finally
3394 12 Jun 15 nicklas 142 {
3394 12 Jun 15 nicklas 143   if (dc != null) dc.close();
3394 12 Jun 15 nicklas 144 }
3394 12 Jun 15 nicklas 145 %>

Generated on Tue Nov 21 03:30:19 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)