extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/batch/reference-date.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
4478 05 May 17 nicklas 1 <%@ page
4478 05 May 17 nicklas 2   pageEncoding="UTF-8"
4478 05 May 17 nicklas 3   session="false"
4478 05 May 17 nicklas 4   import="net.sf.basedb.core.Application"
4478 05 May 17 nicklas 5   import="net.sf.basedb.core.User"
4478 05 May 17 nicklas 6   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
4478 05 May 17 nicklas 7   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
4478 05 May 17 nicklas 8   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
4478 05 May 17 nicklas 9   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
4478 05 May 17 nicklas 10   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
4478 05 May 17 nicklas 11   import="net.sf.basedb.util.Values"
4478 05 May 17 nicklas 12 %>
4478 05 May 17 nicklas 13 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
4478 05 May 17 nicklas 14 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
4478 05 May 17 nicklas 15 <%
4478 05 May 17 nicklas 16 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
4478 05 May 17 nicklas 17 final String ID = sc.getId();
4478 05 May 17 nicklas 18 final float scale = Base.getScale(sc);
4478 05 May 17 nicklas 19 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
4478 05 May 17 nicklas 20
4478 05 May 17 nicklas 21 DbControl dc = null;
4478 05 May 17 nicklas 22 try
4478 05 May 17 nicklas 23 {
4478 05 May 17 nicklas 24   dc = sc.newDbControl();
4478 05 May 17 nicklas 25   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
4478 05 May 17 nicklas 26 %>
4478 05 May 17 nicklas 27 <base:page type="default" >
4478 05 May 17 nicklas 28 <base:head 
4478 05 May 17 nicklas 29   scripts="~../reggie-2.js,~reference-date.js" 
4478 05 May 17 nicklas 30   styles="path.css,~../css/reggie-2.css"
4478 05 May 17 nicklas 31 >
4478 05 May 17 nicklas 32 <style>
4478 05 May 17 nicklas 33
4478 05 May 17 nicklas 34 #update-results
4478 05 May 17 nicklas 35 {
4478 05 May 17 nicklas 36   width: 40em; 
4478 05 May 17 nicklas 37   border-width: 1px; 
4478 05 May 17 nicklas 38   margin-left: 2em;
4478 05 May 17 nicklas 39 }
4478 05 May 17 nicklas 40
4478 05 May 17 nicklas 41 #update-results th, #update-results td
4478 05 May 17 nicklas 42 {
4478 05 May 17 nicklas 43   text-align: left;
4478 05 May 17 nicklas 44   padding: 2px;
4478 05 May 17 nicklas 45 }
4478 05 May 17 nicklas 46
4478 05 May 17 nicklas 47 </style>
4478 05 May 17 nicklas 48 </base:head>
4478 05 May 17 nicklas 49 <base:body>
4478 05 May 17 nicklas 50
4478 05 May 17 nicklas 51   <p:path><p:pathelement 
4478 05 May 17 nicklas 52     title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
6098 11 Jan 21 nicklas 53     /><p:pathelement title="Reference date and linked cases batch update" 
4478 05 May 17 nicklas 54     /></p:path>
4478 05 May 17 nicklas 55
4478 05 May 17 nicklas 56   <div class="content">
4478 05 May 17 nicklas 57   <form name="reggie" id="wizard" class="wizard">
4478 05 May 17 nicklas 58   
4478 05 May 17 nicklas 59   <div class="step" id="step-1">
4478 05 May 17 nicklas 60     <div class="step-no">1</div>
4478 05 May 17 nicklas 61     <div class="step-title">Reference date</div>
4478 05 May 17 nicklas 62     <div class="step-content">
4478 05 May 17 nicklas 63
4478 05 May 17 nicklas 64       <div style="padding: 1em;">
6098 11 Jan 21 nicklas 65       This wizard will update the <b>ReferenceDateSource</b> and <b>ReferenceDate</b> 
4478 05 May 17 nicklas 66       annotations on <b>Case</b> items as follows:<br>
4478 05 May 17 nicklas 67       <ol>
4701 16 Mar 18 nicklas 68         <li><b>IncaDiagnosisDate</b>: If a case has a value for the <b>INCA2_a_diag_dat</b> annotation, 
4478 05 May 17 nicklas 69           that date is copied  to the <b>ReferenceDate</b> annotation.
6153 26 Feb 21 nicklas 70         <li><b>SamplingDate</b>: If a case has at least one child <b>Specimen</b>, <b>NoSpecimen</b>
6153 26 Feb 21 nicklas 71           or <b>FutureSpecimen</b> that has a <b>Created</b> date, the earliest date is copied to the 
6153 26 Feb 21 nicklas 72           <b>ReferenceDate</b> annotation.
4478 05 May 17 nicklas 73         <li><b>ConsentDate</b>: If a case has a value for the <b>ConsentDate</b> annotation, that date is copied
4478 05 May 17 nicklas 74           to the <b>ReferenceDate</b> annotation.
4478 05 May 17 nicklas 75         <li><b>RegistrationDate</b>: All remaining cases have the <b>Registered</b> date copied to 
4478 05 May 17 nicklas 76           the <b>ReferenceDate</b> annotation.
4478 05 May 17 nicklas 77       </ol>
6098 11 Jan 21 nicklas 78       <p style="margin-top: 1em;">
6098 11 Jan 21 nicklas 79       The wizard will also update the <b>LinkedCase</b> annotation on bilateral cases. 
6098 11 Jan 21 nicklas 80       The value is set to the number of days between the reference dates on the two cases:
6098 11 Jan 21 nicklas 81       <ul>
6098 11 Jan 21 nicklas 82       <li>If the value is 0, both cases have the same reference date.
6098 11 Jan 21 nicklas 83       <li>If the value is &gt;0, the other case is later than the current case.
6098 11 Jan 21 nicklas 84       <li>If the value is &lt;0, the other case is before the current case.
6098 11 Jan 21 nicklas 85       </ul>
4478 05 May 17 nicklas 86       </div>
4478 05 May 17 nicklas 87     </div>
4478 05 May 17 nicklas 88   </div>
4478 05 May 17 nicklas 89
4478 05 May 17 nicklas 90   <div id="wizard-status"></div>
4478 05 May 17 nicklas 91   <div id="wizard-progress"></div>
4478 05 May 17 nicklas 92
4478 05 May 17 nicklas 93   <table id="update-results" style="display: none; margin-top: 1em;">
4478 05 May 17 nicklas 94     <tr class="bg-filled-100 bottomborder">
4478 05 May 17 nicklas 95       <th style="width: 20em;">ReferenceDateSource</th>
4478 05 May 17 nicklas 96       <th style="width: 10em;">Before</th>
4478 05 May 17 nicklas 97       <th style="width: 10em;">After</th>
4478 05 May 17 nicklas 98     </tr>
4478 05 May 17 nicklas 99     <tr class="bottomborder" style="border-bottom-style: dotted;">
4478 05 May 17 nicklas 100       <th class="bg-filled-100 rightborder">No value</th>
4478 05 May 17 nicklas 101       <td id="novalue-before">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 102       <td id="novalue-after">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 103     </tr>
4478 05 May 17 nicklas 104     <tr>
4478 05 May 17 nicklas 105       <th class="bg-filled-100 rightborder">IncaDiagnosisDate</th>
4478 05 May 17 nicklas 106       <td id="IncaDiagnosisDate-before">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 107       <td id="IncaDiagnosisDate-after">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 108     </tr>
4478 05 May 17 nicklas 109     <tr>
4478 05 May 17 nicklas 110       <th class="bg-filled-100 rightborder">SamplingDate</th>
4478 05 May 17 nicklas 111       <td id="SamplingDate-before">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 112       <td id="SamplingDate-after">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 113     </tr>
4478 05 May 17 nicklas 114     <tr>
4478 05 May 17 nicklas 115       <th class="bg-filled-100 rightborder">ConsentDate</th>
4478 05 May 17 nicklas 116       <td id="ConsentDate-before">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 117       <td id="ConsentDate-after">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 118     </tr>
4478 05 May 17 nicklas 119     <tr>
4478 05 May 17 nicklas 120       <th class="bg-filled-100 rightborder">RegistrationDate</th>
4478 05 May 17 nicklas 121       <td id="RegistrationDate-before">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 122       <td id="RegistrationDate-after">?</td>
4478 05 May 17 nicklas 123     </tr>
4478 05 May 17 nicklas 124   </table>
4478 05 May 17 nicklas 125     
4478 05 May 17 nicklas 126
4478 05 May 17 nicklas 127     <table class="navigation" id="navigation">
4478 05 May 17 nicklas 128     <tr>
4478 05 May 17 nicklas 129       <td><base:button id="gocancel" title="Cancel" /></td>
4478 05 May 17 nicklas 130       <td><base:button id="gonext" title="Next" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
4478 05 May 17 nicklas 131       <td><base:button id="goregister" title="Register" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
4478 05 May 17 nicklas 132       <td><base:button id="goupdate" title="Update" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
4478 05 May 17 nicklas 133       <td><base:button id="gorestart" title="Restart" image="<%=home+"/images/goback.png"%>" /></td>
4478 05 May 17 nicklas 134       <td id="gonext-message" class="message"></td>
4478 05 May 17 nicklas 135     </tr>
4478 05 May 17 nicklas 136     </table>
4478 05 May 17 nicklas 137   </form>
4478 05 May 17 nicklas 138   </div>
4478 05 May 17 nicklas 139   
4478 05 May 17 nicklas 140 </base:body>
4478 05 May 17 nicklas 141 </base:page>
4478 05 May 17 nicklas 142 <%
4478 05 May 17 nicklas 143 }
4478 05 May 17 nicklas 144 finally
4478 05 May 17 nicklas 145 {
4478 05 May 17 nicklas 146   if (dc != null) dc.close();
4478 05 May 17 nicklas 147 }
4478 05 May 17 nicklas 148 %>

Generated on Tue Nov 21 03:30:20 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)