extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/libprep/pool_protocol.jsp

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1911 19 Mar 13 nicklas 13 <%
3976 26 May 16 nicklas 14 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
1911 19 Mar 13 nicklas 15 final String ID = sc.getId();
1911 19 Mar 13 nicklas 16 final float scale = Base.getScale(sc);
1911 19 Mar 13 nicklas 17 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
1911 19 Mar 13 nicklas 18 DbControl dc = null;
1911 19 Mar 13 nicklas 19 try
1911 19 Mar 13 nicklas 20 {
1911 19 Mar 13 nicklas 21   dc = sc.newDbControl();
1911 19 Mar 13 nicklas 22   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
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1911 19 Mar 13 nicklas 32     title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
1911 19 Mar 13 nicklas 33     /><p:pathelement title="Lab protocols for library pooling" 
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2662 12 Sep 14 nicklas 43     <div class="step-no">1</div>
2662 12 Sep 14 nicklas 44     <div class="step-title">Select pools</div>
2662 12 Sep 14 nicklas 45     <div class="step-content">
2662 12 Sep 14 nicklas 46       <table class="step-form">
2662 12 Sep 14 nicklas 47       <tr>
1959 03 May 13 nicklas 48         <td class="prompt">Library plate</td>
1959 03 May 13 nicklas 49         <td class="input">
2662 12 Sep 14 nicklas 50           <select name="bioplate" id="bioplate">
2141 18 Nov 13 nicklas 51             <option value="0">- manual pools -
1959 03 May 13 nicklas 52           </select>
1911 19 Mar 13 nicklas 53         </td>
1911 19 Mar 13 nicklas 54         <td class="status" id="bioplate.status"></td>
2662 12 Sep 14 nicklas 55         <td class="help">
2662 12 Sep 14 nicklas 56           <span id="bioplate.message" class="message"></span>
1959 03 May 13 nicklas 57           Select the library bioplate that should be pooled in this step. The list contains
1959 03 May 13 nicklas 58           all plates with pools that has not yet been created (determined by abscense of creation date).
2141 18 Nov 13 nicklas 59           Use the <b>manual pools</b> option to select pools that has been manually created.
1911 19 Mar 13 nicklas 60         </td>
1911 19 Mar 13 nicklas 61       </tr>
2662 12 Sep 14 nicklas 62       <tr class="align-top">
1959 03 May 13 nicklas 63         <td class="prompt">Pools</td>
2662 12 Sep 14 nicklas 64         <td class="input">
2662 12 Sep 14 nicklas 65           <select name="pools" id="pools" size="6" multiple></select>
1959 03 May 13 nicklas 66         </td>
1959 03 May 13 nicklas 67         <td class="status" id="pools.status"></td>
2662 12 Sep 14 nicklas 68         <td class="help">
2662 12 Sep 14 nicklas 69           <span id="pools.message" class="message"></span>
1965 07 May 13 nicklas 70           Select the pools to work with. If a plate has been selected no changes can be made.
1959 03 May 13 nicklas 71         </td>
1911 19 Mar 13 nicklas 72       </tr>
2662 12 Sep 14 nicklas 73       <tr class="align-top">
1911 19 Mar 13 nicklas 74         <td class="prompt">Lab protocols</td>
2662 12 Sep 14 nicklas 75         <td class="input">
2662 12 Sep 14 nicklas 76           <span id="listview" class="link" data-protocol-type="list"><img src="../images/listview.png">&nbsp;List layout</span><br>
2662 12 Sep 14 nicklas 77           <span id="plateview" class="link" data-protocol-type="plate"><img src="../images/plateview.png">&nbsp;Plate layout</span><br>
1911 19 Mar 13 nicklas 78         </td>
1911 19 Mar 13 nicklas 79         <td class="status" id="protocol.status"></td>
2662 12 Sep 14 nicklas 80         <td class="help">
2662 12 Sep 14 nicklas 81           <span id="protocol.message" class="message"></span>
1911 19 Mar 13 nicklas 82           The 'list layout' generates a table with one row for each well on the work plate.
1911 19 Mar 13 nicklas 83           The 'plate layout' generates a grid with wells arranged according to row and column coordinates.
1911 19 Mar 13 nicklas 84         </td>
1911 19 Mar 13 nicklas 85       </tr>
1959 03 May 13 nicklas 86       </table>
2662 12 Sep 14 nicklas 87     </div>
1973 14 May 13 nicklas 88   </div>
1911 19 Mar 13 nicklas 89   
2662 12 Sep 14 nicklas 90   <div id="wizard-status"></div>
1911 19 Mar 13 nicklas 91   
1911 19 Mar 13 nicklas 92   </form>
1911 19 Mar 13 nicklas 93   </div>
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1911 19 Mar 13 nicklas 98 }
1911 19 Mar 13 nicklas 99 finally
1911 19 Mar 13 nicklas 100 {
1911 19 Mar 13 nicklas 101   if (dc != null) dc.close();
1911 19 Mar 13 nicklas 102 }
1911 19 Mar 13 nicklas 103 %>

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