extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/libprep/pool_protocol2.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1911 19 Mar 13 nicklas 1 <%@ page
1911 19 Mar 13 nicklas 2   pageEncoding="UTF-8"
1911 19 Mar 13 nicklas 3   session="false"
1911 19 Mar 13 nicklas 4   import="net.sf.basedb.core.User"
1911 19 Mar 13 nicklas 5   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1911 19 Mar 13 nicklas 6   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1911 19 Mar 13 nicklas 7   import="net.sf.basedb.core.Application"
1911 19 Mar 13 nicklas 8   import="net.sf.basedb.core.Extract"
1911 19 Mar 13 nicklas 9   import="net.sf.basedb.core.BioMaterial"
1911 19 Mar 13 nicklas 10   import="net.sf.basedb.core.MeasuredBioMaterial"
1911 19 Mar 13 nicklas 11   import="net.sf.basedb.core.BioMaterialEventSource"
1911 19 Mar 13 nicklas 12   import="net.sf.basedb.core.BioPlate"
1911 19 Mar 13 nicklas 13   import="net.sf.basedb.core.BioWell"
1911 19 Mar 13 nicklas 14   import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
1911 19 Mar 13 nicklas 15   import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
1911 19 Mar 13 nicklas 16   import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
1911 19 Mar 13 nicklas 17   import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
1959 03 May 13 nicklas 18   import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
1911 19 Mar 13 nicklas 19   import="net.sf.basedb.util.Values"
1911 19 Mar 13 nicklas 20   import="net.sf.basedb.util.formatter.WellCoordinateFormatter"
1911 19 Mar 13 nicklas 21   import="net.sf.basedb.util.extensions.Extension"
1911 19 Mar 13 nicklas 22   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"  
1911 19 Mar 13 nicklas 23   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
1911 19 Mar 13 nicklas 24   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
2662 12 Sep 14 nicklas 25   import="java.util.Arrays"
1911 19 Mar 13 nicklas 26 %>
2662 12 Sep 14 nicklas 27 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1911 19 Mar 13 nicklas 28 <%
3976 26 May 16 nicklas 29 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
1911 19 Mar 13 nicklas 30 final String ID = sc.getId();
1911 19 Mar 13 nicklas 31 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
1911 19 Mar 13 nicklas 32 final String root = request.getContextPath();
1911 19 Mar 13 nicklas 33 DbControl dc = null;
1911 19 Mar 13 nicklas 34 try
1911 19 Mar 13 nicklas 35 {
1911 19 Mar 13 nicklas 36   dc = sc.newDbControl();
1911 19 Mar 13 nicklas 37   final Extension reggie = ExtensionsControl.get(dc).getExtension("net.sf.basedb.reggie");
1911 19 Mar 13 nicklas 38   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
1959 03 May 13 nicklas 39   
1959 03 May 13 nicklas 40   Integer[] pools = Values.getInt(request.getParameterValues("pools"));
1959 03 May 13 nicklas 41   
1911 19 Mar 13 nicklas 42   int libPlateId = Values.getInt(request.getParameter("bioplate"));
1959 03 May 13 nicklas 43   BioPlate libPlate = libPlateId == 0 ? null : BioPlate.getById(dc, libPlateId);
1911 19 Mar 13 nicklas 44   String view = Values.getString(request.getParameter("view"), "list");
2662 12 Sep 14 nicklas 45
2662 12 Sep 14 nicklas 46   String title;
1965 07 May 13 nicklas 47   if (libPlate != null)
1965 07 May 13 nicklas 48   {
2662 12 Sep 14 nicklas 49     title = "Lab protocol for pooling "+ HTML.encodeTags(libPlate.getName()) + " - " + view;
1965 07 May 13 nicklas 50   }
1965 07 May 13 nicklas 51   else
1965 07 May 13 nicklas 52   {
2662 12 Sep 14 nicklas 53     title = "Lab protocol for pooling - " + view;
1965 07 May 13 nicklas 54   }
1911 19 Mar 13 nicklas 55   
2662 12 Sep 14 nicklas 56 %>
3026 11 Dec 14 nicklas 57 <base:page id="protocol" type="iframe" favicon="<%=home+"/images/flowcell.png"%>" title="<%=title%>" noskin="true">
2662 12 Sep 14 nicklas 58 <base:head
2662 12 Sep 14 nicklas 59   scripts="~../reggie-2.js,~pools.js,~plate.js,~pool_protocol.js" 
2662 12 Sep 14 nicklas 60   styles="~../css/reggie-2.css,~../css/printable.css,~../css/plate.css"
2662 12 Sep 14 nicklas 61   >
1911 19 Mar 13 nicklas 62   <style>
1911 19 Mar 13 nicklas 63   table.protocolheader
1911 19 Mar 13 nicklas 64   {
1911 19 Mar 13 nicklas 65     width: 100%;
2003 29 May 13 nicklas 66     border: 1px solid #000000;
2003 29 May 13 nicklas 67     margin-bottom: 1em;
2003 29 May 13 nicklas 68     border-collapse: collapse;
1911 19 Mar 13 nicklas 69   }
1911 19 Mar 13 nicklas 70
1911 19 Mar 13 nicklas 71   table.protocolheader > tbody > tr
1911 19 Mar 13 nicklas 72   {
2003 29 May 13 nicklas 73     vertical-align: top;
1911 19 Mar 13 nicklas 74     height: 1.25em;
1911 19 Mar 13 nicklas 75   }
1911 19 Mar 13 nicklas 76
1911 19 Mar 13 nicklas 77   table.protocolheader > tbody > tr > th
1911 19 Mar 13 nicklas 78   {
1911 19 Mar 13 nicklas 79     text-align: left;
1911 19 Mar 13 nicklas 80     font-size: 1em;
2003 29 May 13 nicklas 81     background-color: #F0F0F0;
2003 29 May 13 nicklas 82     padding: 2px;
1911 19 Mar 13 nicklas 83   }
2003 29 May 13 nicklas 84   
2003 29 May 13 nicklas 85   table.protocolheader > tbody > tr > td
2003 29 May 13 nicklas 86   {
2003 29 May 13 nicklas 87     text-align: left;
2003 29 May 13 nicklas 88     font-size: 1em;
2003 29 May 13 nicklas 89     padding: 2px;
2003 29 May 13 nicklas 90   }
1959 03 May 13 nicklas 91
1965 07 May 13 nicklas 92   .pool-section
1965 07 May 13 nicklas 93   {
1965 07 May 13 nicklas 94     page-break-inside: avoid;
1965 07 May 13 nicklas 95   }
1965 07 May 13 nicklas 96
1959 03 May 13 nicklas 97   table.poolheader
1959 03 May 13 nicklas 98   {
1959 03 May 13 nicklas 99     margin-top: 1em;
1959 03 May 13 nicklas 100     width: 100%;
1965 07 May 13 nicklas 101     border: 1px solid #000000;
1965 07 May 13 nicklas 102     border-bottom: 0px;
1965 07 May 13 nicklas 103     border-collapse: collapse;
1959 03 May 13 nicklas 104   }
1959 03 May 13 nicklas 105
1959 03 May 13 nicklas 106   table.poolheader > tbody > tr
1959 03 May 13 nicklas 107   {
1959 03 May 13 nicklas 108     height: 1.25em;
1959 03 May 13 nicklas 109   }
1959 03 May 13 nicklas 110
1959 03 May 13 nicklas 111   table.poolheader > tbody > tr > th
1959 03 May 13 nicklas 112   {
1959 03 May 13 nicklas 113     text-align: left;
2053 09 Oct 13 nicklas 114     font-size: 1.25em;
1965 07 May 13 nicklas 115     padding: 1px;
1959 03 May 13 nicklas 116   }
1911 19 Mar 13 nicklas 117   
1959 03 May 13 nicklas 118   .listview
1911 19 Mar 13 nicklas 119   {
1911 19 Mar 13 nicklas 120     width: 100%;
1911 19 Mar 13 nicklas 121     font-size: 85%;
1911 19 Mar 13 nicklas 122     border-collapse: collapse;
1911 19 Mar 13 nicklas 123     border: 1px solid #000000;
1911 19 Mar 13 nicklas 124   }
1911 19 Mar 13 nicklas 125   
1959 03 May 13 nicklas 126   .listview tr.oddcol
1911 19 Mar 13 nicklas 127   {
1911 19 Mar 13 nicklas 128     background-color: #F0F0F0;
1911 19 Mar 13 nicklas 129   }
1911 19 Mar 13 nicklas 130   
1959 03 May 13 nicklas 131   .listview thead
1911 19 Mar 13 nicklas 132   {
1911 19 Mar 13 nicklas 133     border: 1px solid #000000;
1911 19 Mar 13 nicklas 134     background-color: #F0F0F0;
1911 19 Mar 13 nicklas 135   }
1911 19 Mar 13 nicklas 136   
1959 03 May 13 nicklas 137   .listview th
1911 19 Mar 13 nicklas 138   {
1911 19 Mar 13 nicklas 139     border-left: 1px solid #000000;
1911 19 Mar 13 nicklas 140   }
1911 19 Mar 13 nicklas 141   
1959 03 May 13 nicklas 142   .listview td
1911 19 Mar 13 nicklas 143   {
1911 19 Mar 13 nicklas 144     border-left: 1px solid #000000;
1911 19 Mar 13 nicklas 145     border-top: 1px dotted #666666;
1911 19 Mar 13 nicklas 146     vertical-align: middle;
2053 09 Oct 13 nicklas 147     padding: 2px;
1911 19 Mar 13 nicklas 148   }
1911 19 Mar 13 nicklas 149   
2040 03 Oct 13 nicklas 150   .listview .summary
2040 03 Oct 13 nicklas 151   {
2040 03 Oct 13 nicklas 152     border-top: 1px solid #000000;
2040 03 Oct 13 nicklas 153   }
2040 03 Oct 13 nicklas 154   
1959 03 May 13 nicklas 155   .listview .col-num
1911 19 Mar 13 nicklas 156   {
1911 19 Mar 13 nicklas 157     width: 1.75em;
1911 19 Mar 13 nicklas 158     text-align: center;
1911 19 Mar 13 nicklas 159     font-size: 125%;
1911 19 Mar 13 nicklas 160     font-weight: bold;
1911 19 Mar 13 nicklas 161     vertical-align: top;
1911 19 Mar 13 nicklas 162   }
1911 19 Mar 13 nicklas 163   
1959 03 May 13 nicklas 164   .listview .lib
1911 19 Mar 13 nicklas 165   {
1911 19 Mar 13 nicklas 166     width: 15em;
1911 19 Mar 13 nicklas 167     text-align: center;
1911 19 Mar 13 nicklas 168   }
1911 19 Mar 13 nicklas 169   
1959 03 May 13 nicklas 170   .listview .empty .lib
1911 19 Mar 13 nicklas 171   {
1911 19 Mar 13 nicklas 172     font-style: italic;
1911 19 Mar 13 nicklas 173     color: #666666;
1911 19 Mar 13 nicklas 174     text-align: center;
1911 19 Mar 13 nicklas 175   }
1911 19 Mar 13 nicklas 176   
1959 03 May 13 nicklas 177   .listview .workplate
1911 19 Mar 13 nicklas 178   {
1959 03 May 13 nicklas 179   
1959 03 May 13 nicklas 180     width: <%=libPlate==null ? "14em" : "7em"%>;
1911 19 Mar 13 nicklas 181     text-align: center;
1911 19 Mar 13 nicklas 182   }
1911 19 Mar 13 nicklas 183   
1959 03 May 13 nicklas 184   .listview .pool
1911 19 Mar 13 nicklas 185   {
1911 19 Mar 13 nicklas 186     width: 7em;
1911 19 Mar 13 nicklas 187     text-align: center;
1911 19 Mar 13 nicklas 188   }
1911 19 Mar 13 nicklas 189   
1959 03 May 13 nicklas 190   .listview .remain, .listview .molarity
1911 19 Mar 13 nicklas 191   {
1911 19 Mar 13 nicklas 192     width: 4.5em;
1911 19 Mar 13 nicklas 193     padding-right: 0.5em;
1911 19 Mar 13 nicklas 194     text-align: right;
1911 19 Mar 13 nicklas 195   }
1911 19 Mar 13 nicklas 196
1975 15 May 13 nicklas 197   .listview .volume
1911 19 Mar 13 nicklas 198   {
1975 15 May 13 nicklas 199     width: 3.5em;
1911 19 Mar 13 nicklas 200     padding-right: 0.5em;
1911 19 Mar 13 nicklas 201     text-align: right;
1911 19 Mar 13 nicklas 202     color: #C80000;
1911 19 Mar 13 nicklas 203   }
1911 19 Mar 13 nicklas 204   
1959 03 May 13 nicklas 205   .listview .eb
1911 19 Mar 13 nicklas 206   {
1975 15 May 13 nicklas 207     width: 3.5em;
1975 15 May 13 nicklas 208     padding-right: 0.5em;
1975 15 May 13 nicklas 209     text-align: right;
1911 19 Mar 13 nicklas 210     color: #0000C8;
1911 19 Mar 13 nicklas 211   }
1911 19 Mar 13 nicklas 212   
1959 03 May 13 nicklas 213   .listview .remarks
1911 19 Mar 13 nicklas 214   {
1911 19 Mar 13 nicklas 215     vertical-align: top;
1911 19 Mar 13 nicklas 216     padding-left: 0.25em;
1911 19 Mar 13 nicklas 217   }
1911 19 Mar 13 nicklas 218   
2053 09 Oct 13 nicklas 219   .mix-remark .volume, .mix-remark .eb
2053 09 Oct 13 nicklas 220   {
2053 09 Oct 13 nicklas 221     padding: 0;
2053 09 Oct 13 nicklas 222     text-align: inherit;
2053 09 Oct 13 nicklas 223     width: inherit;
2053 09 Oct 13 nicklas 224     font-weight: bold;
2053 09 Oct 13 nicklas 225   }
2053 09 Oct 13 nicklas 226
1911 19 Mar 13 nicklas 227   #plateview .well
1911 19 Mar 13 nicklas 228   {
3310 07 May 15 nicklas 229     width: auto;
3310 07 May 15 nicklas 230     xwidth: 8.2%;
3310 07 May 15 nicklas 231     xmax-width: 8.2%;
3310 07 May 15 nicklas 232     xmin-width: 8.2%;
1925 11 Apr 13 nicklas 233     padding: 4px;
1911 19 Mar 13 nicklas 234   }
1925 11 Apr 13 nicklas 235   
1925 11 Apr 13 nicklas 236   #plateview .well:hover
1925 11 Apr 13 nicklas 237   {
1925 11 Apr 13 nicklas 238     padding: 3px;
1925 11 Apr 13 nicklas 239   }
1925 11 Apr 13 nicklas 240   
1911 19 Mar 13 nicklas 241   #plateview .rowheader
1911 19 Mar 13 nicklas 242   {
1911 19 Mar 13 nicklas 243     width: 2em;
1911 19 Mar 13 nicklas 244   }
1911 19 Mar 13 nicklas 245   
1911 19 Mar 13 nicklas 246   #plateview .lib
1911 19 Mar 13 nicklas 247   {
1911 19 Mar 13 nicklas 248     font-weight: bold;
1925 11 Apr 13 nicklas 249     margin-bottom: 0.25em;
1911 19 Mar 13 nicklas 250   }
1911 19 Mar 13 nicklas 251   #plateview .volume
1911 19 Mar 13 nicklas 252   {
1911 19 Mar 13 nicklas 253     color: #C80000;
1911 19 Mar 13 nicklas 254   }
1911 19 Mar 13 nicklas 255   #plateview .eb
1911 19 Mar 13 nicklas 256   {
1911 19 Mar 13 nicklas 257     color: #0000C8;
1925 11 Apr 13 nicklas 258     float: right;
1911 19 Mar 13 nicklas 259   }
1911 19 Mar 13 nicklas 260   
1911 19 Mar 13 nicklas 261   #plateview .remarks
1911 19 Mar 13 nicklas 262   {
1911 19 Mar 13 nicklas 263     color: #C80000;
1911 19 Mar 13 nicklas 264     font-style: italic;
1911 19 Mar 13 nicklas 265   }
2040 03 Oct 13 nicklas 266   
2053 09 Oct 13 nicklas 267   #plateview .mix-remark
2053 09 Oct 13 nicklas 268   {
2053 09 Oct 13 nicklas 269     display: none;
2053 09 Oct 13 nicklas 270   }
2053 09 Oct 13 nicklas 271   
2053 09 Oct 13 nicklas 272   .pool-eb
2053 09 Oct 13 nicklas 273   {
2053 09 Oct 13 nicklas 274     color: #0000C8;
2053 09 Oct 13 nicklas 275   }
2053 09 Oct 13 nicklas 276   
2184 09 Jan 14 nicklas 277   #pool-row th
2040 03 Oct 13 nicklas 278   {
2184 09 Jan 14 nicklas 279     border-top: 0;
2184 09 Jan 14 nicklas 280     border-bottom: 1px solid #808080;
2040 03 Oct 13 nicklas 281     vertical-align: top;
2184 09 Jan 14 nicklas 282     padding: 0;
2040 03 Oct 13 nicklas 283   }
2040 03 Oct 13 nicklas 284   
1975 15 May 13 nicklas 285   #plateview .pool-data
1975 15 May 13 nicklas 286   {
1975 15 May 13 nicklas 287     font-weight: normal;
1975 15 May 13 nicklas 288   }
2040 03 Oct 13 nicklas 289   #plateview .comments
2040 03 Oct 13 nicklas 290   {
2040 03 Oct 13 nicklas 291     font-style: italic;
2040 03 Oct 13 nicklas 292   }
2040 03 Oct 13 nicklas 293   
3762 19 Feb 16 nicklas 294   .yellow-specimen .if-yellow
3762 19 Feb 16 nicklas 295   {
3762 19 Feb 16 nicklas 296     background-image: url('../images/yellow-label-small.png');
3762 19 Feb 16 nicklas 297     background-position: 1px 50%;
3762 19 Feb 16 nicklas 298     background-repeat: no-repeat;
3762 19 Feb 16 nicklas 299     /* Grow background without shifting text position veritcally, move to right to make room for icon*/
3762 19 Feb 16 nicklas 300     padding: 4px 4px 3px 14px;
3762 19 Feb 16 nicklas 301     margin: -4px -4px -1px -4px;
3762 19 Feb 16 nicklas 302   }
3762 19 Feb 16 nicklas 303     
1911 19 Mar 13 nicklas 304   </style>
2662 12 Sep 14 nicklas 305 </base:head>
2662 12 Sep 14 nicklas 306 <base:body>
2662 12 Sep 14 nicklas 307   
1911 19 Mar 13 nicklas 308   <div class="paper <%=view.equals("list") ? "" : "landscape"%>">
2662 12 Sep 14 nicklas 309   
2662 12 Sep 14 nicklas 310   <form name="reggie" id="wizard">
2662 12 Sep 14 nicklas 311   
2662 12 Sep 14 nicklas 312   <div id="page-data" class="datacontainer"
2662 12 Sep 14 nicklas 313     data-libplate="<%=libPlateId%>"
2662 12 Sep 14 nicklas 314     data-pools="<%=Values.getString(Arrays.asList(pools), ",", true)%>"
2662 12 Sep 14 nicklas 315     data-view="<%=view%>"
3762 19 Feb 16 nicklas 316     data-home-url="<%=home%>"
2662 12 Sep 14 nicklas 317   ></div>
2662 12 Sep 14 nicklas 318   
2662 12 Sep 14 nicklas 319   <div id="wizard-status"></div>
2662 12 Sep 14 nicklas 320   
2662 12 Sep 14 nicklas 321   <div id="all-protocol" style="display: none;">
2662 12 Sep 14 nicklas 322   <div id="print-instructions" class="noprint fullwidth">
2970 24 Nov 14 nicklas 323     <base:button id="print-button" image="<%=home+"/images/print.png"%>" title="Print&hellip;" />
2970 24 Nov 14 nicklas 324     <span id="printNote">
1911 19 Mar 13 nicklas 325     <b>Note!</b> 
1911 19 Mar 13 nicklas 326     <%
1911 19 Mar 13 nicklas 327     if (view.equals("list"))
1911 19 Mar 13 nicklas 328     {
1911 19 Mar 13 nicklas 329       %>
1911 19 Mar 13 nicklas 330       For better printing reduce margins to about <i>5mm</i> and set page orientation
1911 19 Mar 13 nicklas 331       to <i>portrait</i>. To fit everything on a single page, scale down to <i>60-70%</i>.
1911 19 Mar 13 nicklas 332       <%
1911 19 Mar 13 nicklas 333     }
1911 19 Mar 13 nicklas 334     else
1911 19 Mar 13 nicklas 335     {
1911 19 Mar 13 nicklas 336       %>
1911 19 Mar 13 nicklas 337       For better printing reduce margins to about <i>5mm</i> and set page orientation
1911 19 Mar 13 nicklas 338       to <i>landscape</i>. The recommended scale is <i>100%</i>.
1911 19 Mar 13 nicklas 339       <%
1911 19 Mar 13 nicklas 340     }
1911 19 Mar 13 nicklas 341     %>
2970 24 Nov 14 nicklas 342     </span>
1911 19 Mar 13 nicklas 343     <br clear="all">
1911 19 Mar 13 nicklas 344   </div>
1911 19 Mar 13 nicklas 345   
1911 19 Mar 13 nicklas 346   <h1>Lab protocol for library pooling <span class="reggie">Reggie <%=reggie.getAbout().getVersion() %></span></h1>
1911 19 Mar 13 nicklas 347
2003 29 May 13 nicklas 348   <table style="width: 100%;" class="protocolheader">
2003 29 May 13 nicklas 349   <tr style="border-bottom: 1px solid #000000;">
2003 29 May 13 nicklas 350     <th style="width: 15%;">Library plate</th>
2003 29 May 13 nicklas 351     <td style="width: 30%; border-right: 1px solid #000000;"><%=libPlate == null ? "Multiple" : HTML.encodeTags(libPlate.getName())%></td>
2003 29 May 13 nicklas 352     <th style="width: 15%;"></th>
2003 29 May 13 nicklas 353     <th style="width: 20%;">Date</th>
2003 29 May 13 nicklas 354     <th style="width: 20%;">Operator</th>
2003 29 May 13 nicklas 355   </tr>
2003 29 May 13 nicklas 356   <tr>
2003 29 May 13 nicklas 357     <td rowspan="1" colspan="2" style="width: 50%; border-right: 1px solid #000000;"><%=libPlate != null ? HTML.niceFormat(libPlate.getDescription()) : ""%></td>
2003 29 May 13 nicklas 358     <td style="border-right: 1px solid #000000;">Pooling</td>
2003 29 May 13 nicklas 359     <td style="border-right: 1px solid #000000;"></td>
1959 03 May 13 nicklas 360     <td></td>
1911 19 Mar 13 nicklas 361   </tr>
1911 19 Mar 13 nicklas 362   </table>
1911 19 Mar 13 nicklas 363
1911 19 Mar 13 nicklas 364   <%
1911 19 Mar 13 nicklas 365   if (view.equals("list"))
1911 19 Mar 13 nicklas 366   {
1959 03 May 13 nicklas 367     for (Integer poolId :pools)
1959 03 May 13 nicklas 368     {
1959 03 May 13 nicklas 369       Extract pool = Extract.getById(dc, poolId);
1959 03 May 13 nicklas 370       %>
1965 07 May 13 nicklas 371       <div id="pool.<%=poolId%>" style="display: none;" class="pool-section">
1965 07 May 13 nicklas 372       <table style="width: 100%;" class="poolheader">
1959 03 May 13 nicklas 373       <tr valign="top">
2040 03 Oct 13 nicklas 374         <th style="width: 25%;"><%=HTML.encodeTags(pool.getName())%></th>
2040 03 Oct 13 nicklas 375         <th style="width: 75%; border-left: 1px solid #000000;">Comments:</th>
1911 19 Mar 13 nicklas 376       </tr>
1959 03 May 13 nicklas 377       <tr valign="top">
2040 03 Oct 13 nicklas 378         <td style="width: 25%;"><span id="molarity.<%=poolId%>"></span></td>
2040 03 Oct 13 nicklas 379         <td style="border-left: 1px solid #000000;"><%=HTML.niceFormat(pool.getDescription()) %></td>
1911 19 Mar 13 nicklas 380       </tr>
1959 03 May 13 nicklas 381       </table>
1959 03 May 13 nicklas 382       <table style="width: 100%;" class="listview" id="listview.<%=poolId%>">
1959 03 May 13 nicklas 383       <thead>
1959 03 May 13 nicklas 384         <tr class="toprow">
1959 03 May 13 nicklas 385           <th class="lib"></th>
1959 03 May 13 nicklas 386           <th>Remain</th>
1959 03 May 13 nicklas 387           <th>DNA</th>
1959 03 May 13 nicklas 388           <th class="workplate">Work</th>
2027 30 Sep 13 nicklas 389           <th>Lib</th>
2027 30 Sep 13 nicklas 390           <th>EB</th>
1959 03 May 13 nicklas 391           <th></th>
1911 19 Mar 13 nicklas 392         </tr>
1959 03 May 13 nicklas 393         <tr>
1959 03 May 13 nicklas 394           <th class="lib">Library</th>
2140 18 Nov 13 nicklas 395           <th>(µl)</th>
1959 03 May 13 nicklas 396           <th>(nM)</th>
1959 03 May 13 nicklas 397           <th class="workplate">plate</th>
1959 03 May 13 nicklas 398           <th>(µl)</th>
2027 30 Sep 13 nicklas 399           <th>(µl)</th>
1959 03 May 13 nicklas 400           <th>Remarks</th>
1959 03 May 13 nicklas 401         </tr>
1959 03 May 13 nicklas 402       </thead>
1959 03 May 13 nicklas 403       <tbody id="listview.<%=poolId%>.body">
1911 19 Mar 13 nicklas 404       </tbody>
2040 03 Oct 13 nicklas 405       <tbody>
2040 03 Oct 13 nicklas 406         <tr class="summary">
2053 09 Oct 13 nicklas 407           <td colspan="5" style="text-align: right; font-weight: bold; padding-right: 0.5em; font-size: 120%;">EB volume to add</td>
2053 09 Oct 13 nicklas 408           <td id="eb-volume.<%=poolId%>" class="eb">eb</td>
2040 03 Oct 13 nicklas 409           <td></td>
2040 03 Oct 13 nicklas 410         </tr>
2040 03 Oct 13 nicklas 411       </tbody>
1959 03 May 13 nicklas 412       </table>
1959 03 May 13 nicklas 413       </div>
1911 19 Mar 13 nicklas 414       <%
1911 19 Mar 13 nicklas 415     }
1911 19 Mar 13 nicklas 416   }
1959 03 May 13 nicklas 417   %>
1959 03 May 13 nicklas 418   <%
1959 03 May 13 nicklas 419   if (view.equals("plate"))
1911 19 Mar 13 nicklas 420   {
1911 19 Mar 13 nicklas 421     %>
3310 07 May 15 nicklas 422     <table class="plate" style="margin: 1em auto 1em auto;" id="plateview">
1911 19 Mar 13 nicklas 423     </table>
2053 09 Oct 13 nicklas 424     <div style="margin: 1em;">
2053 09 Oct 13 nicklas 425       For each pool: <i>Number of libraries</i> • <i>Final molarity</i> • <i>Total volume</i> • <i>EB volume (dynamic mixing only)</i>
2053 09 Oct 13 nicklas 426     </div>
1911 19 Mar 13 nicklas 427     <%
1911 19 Mar 13 nicklas 428   }
1911 19 Mar 13 nicklas 429   %>
1911 19 Mar 13 nicklas 430   </div>
2662 12 Sep 14 nicklas 431   </form>
2662 12 Sep 14 nicklas 432   </div>
2662 12 Sep 14 nicklas 433   
2662 12 Sep 14 nicklas 434 </base:body>
2662 12 Sep 14 nicklas 435 </base:page>
1911 19 Mar 13 nicklas 436 <%
1911 19 Mar 13 nicklas 437 }
1911 19 Mar 13 nicklas 438 finally
1911 19 Mar 13 nicklas 439 {
1911 19 Mar 13 nicklas 440   if (dc != null) dc.close();
1911 19 Mar 13 nicklas 441 }
1911 19 Mar 13 nicklas 442 %>

Generated on Tue Nov 21 03:31:01 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)