extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/libprep/show_flagged_rna.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1803 18 Jan 13 nicklas 1 <%@ page
1803 18 Jan 13 nicklas 2   pageEncoding="UTF-8"
1803 18 Jan 13 nicklas 3   session="false"
1803 18 Jan 13 nicklas 4   import="net.sf.basedb.core.Application"
1803 18 Jan 13 nicklas 5   import="net.sf.basedb.core.User"
1803 18 Jan 13 nicklas 6   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1803 18 Jan 13 nicklas 7   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1803 18 Jan 13 nicklas 8   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
1803 18 Jan 13 nicklas 9   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
1803 18 Jan 13 nicklas 10   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
1803 18 Jan 13 nicklas 11   import="net.sf.basedb.util.Values"
1803 18 Jan 13 nicklas 12 %>
1803 18 Jan 13 nicklas 13 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1803 18 Jan 13 nicklas 14 <%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
1803 18 Jan 13 nicklas 15
1803 18 Jan 13 nicklas 16 <%
3976 26 May 16 nicklas 17 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
1803 18 Jan 13 nicklas 18 final String ID = sc.getId();
1803 18 Jan 13 nicklas 19 final float scale = Base.getScale(sc);
1803 18 Jan 13 nicklas 20 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
1803 18 Jan 13 nicklas 21 DbControl dc = null;
1803 18 Jan 13 nicklas 22 try
1803 18 Jan 13 nicklas 23 {
1803 18 Jan 13 nicklas 24   dc = sc.newDbControl();
1803 18 Jan 13 nicklas 25   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
1803 18 Jan 13 nicklas 26   final String title = "Flagged RNA items";
1803 18 Jan 13 nicklas 27   final int numFlagged = Values.getInt(request.getParameter("numFlagged"));
1881 26 Feb 13 nicklas 28   final int numSelected = Values.getInt(request.getParameter("numSelected"));
1803 18 Jan 13 nicklas 29 %>
1803 18 Jan 13 nicklas 30 <base:page type="popup" title="<%=title%>">
2803 14 Oct 14 nicklas 31 <base:head 
2803 14 Oct 14 nicklas 32   scripts="table.js,~show_flagged_rna.js,~../reggie-2.js" 
3759 19 Feb 16 nicklas 33   styles="table.css,~../css/reggie-2.css"
2803 14 Oct 14 nicklas 34   >
1940 18 Apr 13 nicklas 35 <style>
1940 18 Apr 13 nicklas 36 .bold
1940 18 Apr 13 nicklas 37 {
1940 18 Apr 13 nicklas 38   color: #C80000;
1940 18 Apr 13 nicklas 39   font-weight: bold;
1940 18 Apr 13 nicklas 40 }
1951 24 Apr 13 nicklas 41
1951 24 Apr 13 nicklas 42 .case-summary
1951 24 Apr 13 nicklas 43 {
1951 24 Apr 13 nicklas 44   padding-left: 4px;
1951 24 Apr 13 nicklas 45 }
1940 18 Apr 13 nicklas 46 </style>
1803 18 Jan 13 nicklas 47 </base:head>
2803 14 Oct 14 nicklas 48 <base:body>
1803 18 Jan 13 nicklas 49   <h1><%=title %></h1>
1803 18 Jan 13 nicklas 50
1803 18 Jan 13 nicklas 51   <div class="content">
1803 18 Jan 13 nicklas 52   <tbl:table id="flaggedRna" subclass="fulltable">
1803 18 Jan 13 nicklas 53     <tbl:columndef id="rna" title="RNA" />
1803 18 Jan 13 nicklas 54     <tbl:columndef id="location" title="Bioplate" />
1940 18 Apr 13 nicklas 55     <tbl:columndef id="remainingQuanity" title="Remaining (µg)" />
1940 18 Apr 13 nicklas 56     <tbl:columndef id="qualityScore" title="RQS/RIN" />
1946 19 Apr 13 nicklas 57     <tbl:columndef id="comment" title="Comment" />
1881 26 Feb 13 nicklas 58     <tbl:columndef id="flag" title="Flag" />
1803 18 Jan 13 nicklas 59   
2803 14 Oct 14 nicklas 60     <tbl:data style="top: 0; margin-top: 0;">
1803 18 Jan 13 nicklas 61       <tbl:headers>
1803 18 Jan 13 nicklas 62         <tbl:headerrow>
1881 26 Feb 13 nicklas 63           <th></th>
1803 18 Jan 13 nicklas 64           <tbl:columnheaders />
1803 18 Jan 13 nicklas 65         </tbl:headerrow>
1803 18 Jan 13 nicklas 66       </tbl:headers>
1803 18 Jan 13 nicklas 67       <tbl:rows>
1803 18 Jan 13 nicklas 68       <%
1803 18 Jan 13 nicklas 69       for (int i = 0; i < numFlagged; ++i)
1803 18 Jan 13 nicklas 70       {
1803 18 Jan 13 nicklas 71         %>
3759 19 Feb 16 nicklas 72         <tbl:row id="<%="row."+i%>">
1947 22 Apr 13 nicklas 73           <td style="text-align: center; width: 20px;"><input type="checkbox" name="use.<%=i%>"></td>
3759 19 Feb 16 nicklas 74           <tbl:cell column="rna" id="<%="rna."+i%>" clazz="if-yellow"><%=i%></tbl:cell>
1803 18 Jan 13 nicklas 75           <tbl:cell column="location" id="<%="location."+i%>"></tbl:cell>
1803 18 Jan 13 nicklas 76           <tbl:cell column="remainingQuanity" id="<%="remainingQuantity."+i%>"></tbl:cell>
1940 18 Apr 13 nicklas 77           <tbl:cell column="qualityScore" id="<%="qualityScore."+i%>"></tbl:cell>
1946 19 Apr 13 nicklas 78           <tbl:cell column="comment" id="<%="comment."+i%>"></tbl:cell>
1803 18 Jan 13 nicklas 79           <tbl:cell column="flag" id="<%="flag."+i%>"></tbl:cell>
1803 18 Jan 13 nicklas 80         </tbl:row>
1803 18 Jan 13 nicklas 81         <%
1803 18 Jan 13 nicklas 82       }
1803 18 Jan 13 nicklas 83       %>
1803 18 Jan 13 nicklas 84       </tbl:rows>
1803 18 Jan 13 nicklas 85     </tbl:data>
1803 18 Jan 13 nicklas 86   </tbl:table>
1803 18 Jan 13 nicklas 87   </div>
1803 18 Jan 13 nicklas 88
1803 18 Jan 13 nicklas 89   <base:buttongroup subclass="dialogbuttons" id="dialogbuttons">
2803 14 Oct 14 nicklas 90     <base:button 
2803 14 Oct 14 nicklas 91       id="btnUseSelected"
2803 14 Oct 14 nicklas 92       title="Use selected" 
1947 22 Apr 13 nicklas 93       disabled="<%=numSelected == 0%>" tooltip="Use the RNA and ignore the flag"
1881 26 Feb 13 nicklas 94       image="<%=home + "/images/manual_rna.png"%>" />
2803 14 Oct 14 nicklas 95     <base:button 
2803 14 Oct 14 nicklas 96       id="btnUnflagSelected"
2803 14 Oct 14 nicklas 97       title="Unflag" 
1947 22 Apr 13 nicklas 98       image="<%=home+"/images/unflag.png"%>" tooltip="Do not flag the selected RNA" />
2803 14 Oct 14 nicklas 99     <base:button id="close" title="Close" />
1803 18 Jan 13 nicklas 100   </base:buttongroup>
1803 18 Jan 13 nicklas 101 </base:body>
1803 18 Jan 13 nicklas 102 </base:page>
1803 18 Jan 13 nicklas 103 <%
1803 18 Jan 13 nicklas 104 }
1803 18 Jan 13 nicklas 105 finally
1803 18 Jan 13 nicklas 106 {
1803 18 Jan 13 nicklas 107   if (dc != null) dc.close();
1803 18 Jan 13 nicklas 108 }
1803 18 Jan 13 nicklas 109 %>

Generated on Tue Nov 21 03:31:05 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)