extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/mipsprep/mips_protocol.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
5424 13 May 19 nicklas 1 <%@ page
5424 13 May 19 nicklas 2   pageEncoding="UTF-8"
5424 13 May 19 nicklas 3   session="false"
5424 13 May 19 nicklas 4   import="net.sf.basedb.core.User"
5424 13 May 19 nicklas 5   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
5424 13 May 19 nicklas 6   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
5424 13 May 19 nicklas 7   import="net.sf.basedb.core.Application"
5424 13 May 19 nicklas 8   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"  
5424 13 May 19 nicklas 9   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
5424 13 May 19 nicklas 10 %>
5424 13 May 19 nicklas 11 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
5424 13 May 19 nicklas 12 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
5424 13 May 19 nicklas 13 <%
5424 13 May 19 nicklas 14 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
5424 13 May 19 nicklas 15 final String ID = sc.getId();
5424 13 May 19 nicklas 16 final float scale = Base.getScale(sc);
5424 13 May 19 nicklas 17 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
5424 13 May 19 nicklas 18 DbControl dc = null;
5424 13 May 19 nicklas 19 try
5424 13 May 19 nicklas 20 {
5424 13 May 19 nicklas 21   dc = sc.newDbControl();
5424 13 May 19 nicklas 22   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
5424 13 May 19 nicklas 23 %>
5424 13 May 19 nicklas 24 <base:page type="default" >
5424 13 May 19 nicklas 25 <base:head 
5424 13 May 19 nicklas 26   scripts="~../reggie-2.js,~mips_protocol.js" 
5424 13 May 19 nicklas 27   styles="path.css,~../css/reggie-2.css"
5424 13 May 19 nicklas 28 />
5424 13 May 19 nicklas 29 <base:body>
5424 13 May 19 nicklas 30
5424 13 May 19 nicklas 31   <p:path><p:pathelement 
5424 13 May 19 nicklas 32     title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
5424 13 May 19 nicklas 33     /><p:pathelement title="Lab protocols for MIPs library preparation" 
5424 13 May 19 nicklas 34     /></p:path>
5424 13 May 19 nicklas 35
5424 13 May 19 nicklas 36   <div class="content">
5424 13 May 19 nicklas 37
5424 13 May 19 nicklas 38   <form name="reggie" action="mips_protocol2.jsp" method="post" target="_blank" id="wizard" class="wizard">
5424 13 May 19 nicklas 39   <input type="hidden" name="ID" value="<%=ID%>">
5424 13 May 19 nicklas 40   <input type="hidden" name="view" value="list">
5424 13 May 19 nicklas 41   
5424 13 May 19 nicklas 42   <div class="step" id="step-1">
5424 13 May 19 nicklas 43     <div class="step-no">1</div>
5424 13 May 19 nicklas 44     <div class="step-title">Select MIPs work plate</div>
5424 13 May 19 nicklas 45     <div class="step-content">
5424 13 May 19 nicklas 46
5424 13 May 19 nicklas 47       <table class="step-form">
5424 13 May 19 nicklas 48       <tr>
5424 13 May 19 nicklas 49         <td class="prompt">MIPs plate</td>
5424 13 May 19 nicklas 50         <td class="input">
5424 13 May 19 nicklas 51           <select name="bioplate" id="bioplate"></select>
5424 13 May 19 nicklas 52         </td>
5424 13 May 19 nicklas 53         <td class="status" id="bioplate.status"></td>
5424 13 May 19 nicklas 54         <td class="help" rowspan="2">
5424 13 May 19 nicklas 55           <span id="bioplate.message" class="message"></span>
5424 13 May 19 nicklas 56           Select an existing MIPs work plate bioplate. The list contain all MIPs plates that
5424 13 May 19 nicklas 57           has not yet been processed (determined by the absence of a 'creation' date).
5424 13 May 19 nicklas 58         </td>
5424 13 May 19 nicklas 59       </tr>
5424 13 May 19 nicklas 60       <tbody class="info-section">
5424 13 May 19 nicklas 61       <tr>
5424 13 May 19 nicklas 62         <td class="prompt">Comments</td>
5424 13 May 19 nicklas 63         <td class="info" id="comments"></td>
5424 13 May 19 nicklas 64         <td class="status"></td>
5424 13 May 19 nicklas 65         <td class="help"></td>
5424 13 May 19 nicklas 66       </tr>
5424 13 May 19 nicklas 67       </tbody>
5424 13 May 19 nicklas 68       <tr class="align-top">
5424 13 May 19 nicklas 69         <td class="prompt">Lab protocols</td>
5424 13 May 19 nicklas 70         <td class="input">
5424 13 May 19 nicklas 71           <span id="listview" class="link" data-protocol-type="list"><img src="../images/listview.png">&nbsp;List layout</span><br>
5424 13 May 19 nicklas 72           <span id="plateview" class="link" data-protocol-type="plate"><img src="../images/plateview.png">&nbsp;Plate layout</span><br>
5424 13 May 19 nicklas 73         </td>
5424 13 May 19 nicklas 74         <td class="status" id="protocol.status"></td>
5424 13 May 19 nicklas 75         <td class="help">
5424 13 May 19 nicklas 76           <span id="protocol.message" class="message"></span>
5424 13 May 19 nicklas 77           The 'list layout' generates a table with one row for each well on the work plate.
5424 13 May 19 nicklas 78           The 'plate layout' generates a grid with wells arranged according to row and column coordinates.
5424 13 May 19 nicklas 79         </td>
5424 13 May 19 nicklas 80       </tr>
5424 13 May 19 nicklas 81       </table>
5424 13 May 19 nicklas 82     </div>
5424 13 May 19 nicklas 83   </div>
5424 13 May 19 nicklas 84   
5424 13 May 19 nicklas 85   <div id="wizard-status"></div>
5424 13 May 19 nicklas 86   
5424 13 May 19 nicklas 87   </form>
5424 13 May 19 nicklas 88   </div>
5424 13 May 19 nicklas 89   
5424 13 May 19 nicklas 90 </base:body>
5424 13 May 19 nicklas 91 </base:page>
5424 13 May 19 nicklas 92 <%
5424 13 May 19 nicklas 93 }
5424 13 May 19 nicklas 94 finally
5424 13 May 19 nicklas 95 {
5424 13 May 19 nicklas 96   if (dc != null) dc.close();
5424 13 May 19 nicklas 97 }
5424 13 May 19 nicklas 98 %>

Generated on Tue Nov 21 03:31:17 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)