extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/mipsprep/pool_registration.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
5428 15 May 19 nicklas 1 <%@ page
5428 15 May 19 nicklas 2   pageEncoding="UTF-8"
5428 15 May 19 nicklas 3   session="false"
5428 15 May 19 nicklas 4   import="net.sf.basedb.core.User"
5428 15 May 19 nicklas 5   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
5428 15 May 19 nicklas 6   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
5428 15 May 19 nicklas 7   import="net.sf.basedb.core.Application"
5428 15 May 19 nicklas 8   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"  
5428 15 May 19 nicklas 9   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"  
5428 15 May 19 nicklas 10   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
5428 15 May 19 nicklas 11 %>
5428 15 May 19 nicklas 12 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
5428 15 May 19 nicklas 13 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
5428 15 May 19 nicklas 14 <%
5428 15 May 19 nicklas 15 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
5428 15 May 19 nicklas 16 final String ID = sc.getId();
5428 15 May 19 nicklas 17 final float scale = Base.getScale(sc);
5428 15 May 19 nicklas 18 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
5428 15 May 19 nicklas 19 DbControl dc = null;
5428 15 May 19 nicklas 20 try
5428 15 May 19 nicklas 21 {
5428 15 May 19 nicklas 22   dc = sc.newDbControl();
5428 15 May 19 nicklas 23   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
5428 15 May 19 nicklas 24 %>
5428 15 May 19 nicklas 25 <base:page type="default" >
5428 15 May 19 nicklas 26 <base:head 
5428 15 May 19 nicklas 27   scripts="~../reggie-2.js,~pool_registration.js" 
5428 15 May 19 nicklas 28   styles="path.css,~../css/reggie-2.css"
5428 15 May 19 nicklas 29 />
5428 15 May 19 nicklas 30 <base:body>
5428 15 May 19 nicklas 31
5428 15 May 19 nicklas 32   <p:path><p:pathelement 
5428 15 May 19 nicklas 33     title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
5428 15 May 19 nicklas 34     /><p:pathelement title="Register MIPs pools" 
5428 15 May 19 nicklas 35     /></p:path>
5428 15 May 19 nicklas 36
5428 15 May 19 nicklas 37   <div class="content">
5428 15 May 19 nicklas 38
5428 15 May 19 nicklas 39   <form name="reggie" id="wizard" class="wizard">
5428 15 May 19 nicklas 40   
5428 15 May 19 nicklas 41   <div class="step" id="step-1">
5428 15 May 19 nicklas 42     <div class="step-no">1</div>
5428 15 May 19 nicklas 43     <div class="step-title">Select MIPs plates</div>
5428 15 May 19 nicklas 44     <div class="step-content">
5428 15 May 19 nicklas 45     
5428 15 May 19 nicklas 46       <table class="step-form">
5428 15 May 19 nicklas 47       <tr class="align-top">
5428 15 May 19 nicklas 48         <td class="prompt">Library plates</td>
5428 15 May 19 nicklas 49         <td class="input">
5428 15 May 19 nicklas 50           <select name="bioplate" id="bioplate" size="6" multiple></select>
5428 15 May 19 nicklas 51         </td>
5428 15 May 19 nicklas 52         <td class="status" id="bioplate.status"></td>
5428 15 May 19 nicklas 53         <td class="help">
5428 15 May 19 nicklas 54           <span id="bioplate.message" class="message"></span>
5428 15 May 19 nicklas 55           Select the MIPs plates that should be pooled in this step. The list contains
5428 15 May 19 nicklas 56           all plates that has not yet been pooled. The selected plates must have
5428 15 May 19 nicklas 57           different set of barcodes.
5428 15 May 19 nicklas 58         </td>
5428 15 May 19 nicklas 59       </tr>
5428 15 May 19 nicklas 60       </table>
5428 15 May 19 nicklas 61     </div>
5428 15 May 19 nicklas 62   </div>
5428 15 May 19 nicklas 63   
5428 15 May 19 nicklas 64   <div class="step" id="step-2">
5428 15 May 19 nicklas 65     <div class="step-no">2</div>
5428 15 May 19 nicklas 66     <div class="step-title">Pooling results</div>
5428 15 May 19 nicklas 67     <div class="step-content">
5428 15 May 19 nicklas 68
5428 15 May 19 nicklas 69       <table class="step-form">
5428 15 May 19 nicklas 70       <tr>
5428 15 May 19 nicklas 71         <td class="prompt">Pool name</td>
5428 15 May 19 nicklas 72         <td class="input" id="poolName"></td>
5428 15 May 19 nicklas 73         <td class="status"></td>
5428 15 May 19 nicklas 74         <td class="help"></td>
5428 15 May 19 nicklas 75       </tr>
5428 15 May 19 nicklas 76       <tr>
5428 15 May 19 nicklas 77         <td class="prompt">Pool date</td>
5428 15 May 19 nicklas 78         <td class="input">
5428 15 May 19 nicklas 79           <input type="text" name="poolDate" id="poolDate"
5428 15 May 19 nicklas 80             class="required auto-init" data-auto-init="focus-on-enter" data-next-focus="poolProtocol"
5428 15 May 19 nicklas 81             style="width: 12em;" maxlength="10">
5428 15 May 19 nicklas 82             <base:icon 
5428 15 May 19 nicklas 83               id="poolDateCalendar"
5428 15 May 19 nicklas 84               subclass="auto-init"
5428 15 May 19 nicklas 85               data-auto-init="calendar"
5428 15 May 19 nicklas 86               data-textarea-id="poolDate"
5428 15 May 19 nicklas 87               data-date-format="yyyyMMdd"
5428 15 May 19 nicklas 88               image="calendar.png" 
5428 15 May 19 nicklas 89               tooltip="Select a date from a calendar" 
5428 15 May 19 nicklas 90               tabindex="-1"
5428 15 May 19 nicklas 91             />
5428 15 May 19 nicklas 92         </td>
5428 15 May 19 nicklas 93         <td class="status" id="poolDate.status"></td>
5428 15 May 19 nicklas 94         <td class="help">
5428 15 May 19 nicklas 95           <span id="poolDate.message" class="message"></span>
5428 15 May 19 nicklas 96           (YYYYMMDD or MMDD)
5428 15 May 19 nicklas 97         </td>
5428 15 May 19 nicklas 98       </tr>
5428 15 May 19 nicklas 99       <tr>
5428 15 May 19 nicklas 100         <td class="prompt">Protocol</td>
5428 15 May 19 nicklas 101         <td class="input">
5428 15 May 19 nicklas 102           <select name="poolProtocol" id="poolProtocol" 
5428 15 May 19 nicklas 103             class="auto-init" data-auto-init="focus-on-enter" data-next-focus="poolOperator"
5428 15 May 19 nicklas 104           ></select>
5428 15 May 19 nicklas 105         </td>
5428 15 May 19 nicklas 106         <td class="status" id="poolProtocol.status"></td>
5428 15 May 19 nicklas 107         <td class="help">
5428 15 May 19 nicklas 108           <span id="poolProtocol.message" class="message"></span>
5428 15 May 19 nicklas 109           Select the protocol which was used when pooling.
5428 15 May 19 nicklas 110         </td>
5428 15 May 19 nicklas 111       </tr>
5428 15 May 19 nicklas 112       <tr valign="top">
5428 15 May 19 nicklas 113         <td class="prompt">Operator</td>
5428 15 May 19 nicklas 114         <td class="input">
5428 15 May 19 nicklas 115           <input type="text" name="poolOperator" value="<%=HTML.encodeTags(user.getName()) %>" 
5428 15 May 19 nicklas 116             class="auto-init" data-auto-init="focus-on-enter" data-next-focus="comments"
5428 15 May 19 nicklas 117           >
5428 15 May 19 nicklas 118         </td>
5428 15 May 19 nicklas 119         <td class="status" id="poolOperator.status"></td>
5428 15 May 19 nicklas 120         <td class="help">
5428 15 May 19 nicklas 121           <span id="poolOperator.message" class="message"></span>
5428 15 May 19 nicklas 122         </td>
5428 15 May 19 nicklas 123       </tr>
5428 15 May 19 nicklas 124       <tr valign="top">
5428 15 May 19 nicklas 125         <td class="prompt">Comments</td>
5428 15 May 19 nicklas 126         <td class="input"></td>
5428 15 May 19 nicklas 127         <td class="status" id="comments.status"></td>
5428 15 May 19 nicklas 128         <td class="help">
5428 15 May 19 nicklas 129           <span id="comments.message" class="message"></span>
5428 15 May 19 nicklas 130           Comments about the pooling.
5428 15 May 19 nicklas 131         </td>
5428 15 May 19 nicklas 132       </tr>
5428 15 May 19 nicklas 133       
5428 15 May 19 nicklas 134       <tbody id="pool-comments"></tbody>
5428 15 May 19 nicklas 135       </table>
5428 15 May 19 nicklas 136     </div>
5428 15 May 19 nicklas 137   </div>
5428 15 May 19 nicklas 138   
5428 15 May 19 nicklas 139   <div id="wizard-status"></div>
5428 15 May 19 nicklas 140   
5428 15 May 19 nicklas 141   <table class="navigation" id="navigation">
5428 15 May 19 nicklas 142   <tr>
5428 15 May 19 nicklas 143     <td><base:button id="gocancel" title="Cancel" /></td>
5428 15 May 19 nicklas 144     <td><base:button id="gonext" title="Next" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
5428 15 May 19 nicklas 145     <td><base:button id="goregister" title="Register" image="<%=home+"/images/import.png"%>"  /></td>
5428 15 May 19 nicklas 146     <td><base:button id="gorestart" title="Restart" image="<%=home+"/images/goback.png"%>" /></td>
5428 15 May 19 nicklas 147     <td id="gonext-message" class="message"></td>
5428 15 May 19 nicklas 148   </tr>
5428 15 May 19 nicklas 149   </table>
5428 15 May 19 nicklas 150   
5428 15 May 19 nicklas 151   </form>
5428 15 May 19 nicklas 152   </div>
5428 15 May 19 nicklas 153   
5428 15 May 19 nicklas 154 </base:body>
5428 15 May 19 nicklas 155 </base:page>
5428 15 May 19 nicklas 156 <%
5428 15 May 19 nicklas 157 }
5428 15 May 19 nicklas 158 finally
5428 15 May 19 nicklas 159 {
5428 15 May 19 nicklas 160   if (dc != null) dc.close();
5428 15 May 19 nicklas 161 }
5428 15 May 19 nicklas 162 %>

Generated on Tue Nov 21 03:31:19 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)