extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/reports/case_summary.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1821 06 Feb 13 nicklas 1 <%@ page
1821 06 Feb 13 nicklas 2   pageEncoding="UTF-8"
1821 06 Feb 13 nicklas 3   session="false"
1821 06 Feb 13 nicklas 4   import="net.sf.basedb.core.Application"
1821 06 Feb 13 nicklas 5   import="net.sf.basedb.core.User"
1821 06 Feb 13 nicklas 6   import="net.sf.basedb.core.Role"
1821 06 Feb 13 nicklas 7   import="net.sf.basedb.core.Group"
1821 06 Feb 13 nicklas 8   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1821 06 Feb 13 nicklas 9   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1821 06 Feb 13 nicklas 10   import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
1821 06 Feb 13 nicklas 11   import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
1821 06 Feb 13 nicklas 12   import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
1821 06 Feb 13 nicklas 13   import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
1821 06 Feb 13 nicklas 14   import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
1821 06 Feb 13 nicklas 15   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
1821 06 Feb 13 nicklas 16   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
1821 06 Feb 13 nicklas 17   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
1821 06 Feb 13 nicklas 18   import="net.sf.basedb.util.Values"
1821 06 Feb 13 nicklas 19   import="java.util.List"
1821 06 Feb 13 nicklas 20 %>
1821 06 Feb 13 nicklas 21 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1821 06 Feb 13 nicklas 22 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
1821 06 Feb 13 nicklas 23 <%
3976 26 May 16 nicklas 24 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
1821 06 Feb 13 nicklas 25 final String ID = sc.getId();
1821 06 Feb 13 nicklas 26 final float scale = Base.getScale(sc);
1821 06 Feb 13 nicklas 27 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
2501 12 Jun 14 olle 28 final String homeLabEnv = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.labenv.service");
1821 06 Feb 13 nicklas 29 DbControl dc = null;
1821 06 Feb 13 nicklas 30 try
1821 06 Feb 13 nicklas 31 {
1821 06 Feb 13 nicklas 32   dc = sc.newDbControl();
1821 06 Feb 13 nicklas 33   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
1821 06 Feb 13 nicklas 34   
1821 06 Feb 13 nicklas 35   boolean isAdmin = user.getId() == SystemItems.getId(User.ROOT);
1821 06 Feb 13 nicklas 36   boolean isPatientCurator = false;
1821 06 Feb 13 nicklas 37   if (!isAdmin)
1821 06 Feb 13 nicklas 38   {
1821 06 Feb 13 nicklas 39     try
1821 06 Feb 13 nicklas 40     {
1821 06 Feb 13 nicklas 41       Role admin = Role.getById(dc, SystemItems.getId(Role.ADMINISTRATOR));
1821 06 Feb 13 nicklas 42       isAdmin = sc.isMemberOf(admin);
1821 06 Feb 13 nicklas 43     }
1821 06 Feb 13 nicklas 44     catch (RuntimeException ex)
1821 06 Feb 13 nicklas 45     {}
1821 06 Feb 13 nicklas 46   }
1821 06 Feb 13 nicklas 47   try
1821 06 Feb 13 nicklas 48   {
1821 06 Feb 13 nicklas 49     ItemQuery<Group> query = Group.getQuery();
1821 06 Feb 13 nicklas 50     query.restrict(Restrictions.eq(Hql.property("name"), Expressions.string("PatientCurator")));
1821 06 Feb 13 nicklas 51     List<Group> result = query.list(dc);
1821 06 Feb 13 nicklas 52     if (result.size() == 1)
1821 06 Feb 13 nicklas 53     {
1821 06 Feb 13 nicklas 54       isPatientCurator = sc.isMemberOf(result.get(0));
1821 06 Feb 13 nicklas 55     }
1821 06 Feb 13 nicklas 56   }
1821 06 Feb 13 nicklas 57   catch (RuntimeException ex)
1821 06 Feb 13 nicklas 58   {}
1821 06 Feb 13 nicklas 59   
1821 06 Feb 13 nicklas 60   final String caseName = request.getParameter("caseName");
5019 10 Oct 18 nicklas 61   final String highlight = request.getParameter("highlight");
1824 06 Feb 13 nicklas 62   final String pageType = Values.getString(request.getParameter("pageType"), "default");
1951 24 Apr 13 nicklas 63   
1951 24 Apr 13 nicklas 64   boolean iframe = "iframe".equals(pageType);
1951 24 Apr 13 nicklas 65   boolean popup = "popup".equals(pageType);
1951 24 Apr 13 nicklas 66   boolean fullPage = !iframe && !popup;
1821 06 Feb 13 nicklas 67 %>
1824 06 Feb 13 nicklas 68 <base:page type="<%=pageType %>" >
2370 22 Apr 14 nicklas 69 <base:head 
2610 28 Aug 14 nicklas 70   scripts="~case-summary.js,~../reggie-2.js" 
2610 28 Aug 14 nicklas 71   styles="path.css,~../css/reggie-2.css,~../css/case_summary.css" 
2370 22 Apr 14 nicklas 72 />
2610 28 Aug 14 nicklas 73 <base:body data-read-only="1">
2370 22 Apr 14 nicklas 74   <div id="page-data" class="datacontainer"
2370 22 Apr 14 nicklas 75     data-case-name="<%=HTML.encodeTags(caseName)%>"
6801 11 Aug 22 nicklas 76     data-original-case-name="<%=HTML.encodeTags(caseName)%>"
5019 10 Oct 18 nicklas 77     data-highlight="<%=HTML.encodeTags(highlight)%>"
2370 22 Apr 14 nicklas 78     data-admin="<%=isAdmin ? 1 : 0%>"
2370 22 Apr 14 nicklas 79     data-patient-curator="<%=isPatientCurator ? 1 : 0%>"
2370 22 Apr 14 nicklas 80     data-page-type="<%=pageType%>"
2919 11 Nov 14 nicklas 81     data-home-reggie="<%=HTML.encodeTags(home) %>"
2501 12 Jun 14 olle 82     data-home-labenv="<%=HTML.encodeTags(homeLabEnv)%>"
2370 22 Apr 14 nicklas 83   ></div>
1912 20 Mar 13 nicklas 84   <div id="all-content">
1951 24 Apr 13 nicklas 85   <%
1951 24 Apr 13 nicklas 86   if (fullPage)
1951 24 Apr 13 nicklas 87   {
1951 24 Apr 13 nicklas 88     %>
2943 17 Nov 14 nicklas 89     <p:path><p:pathelement id="path-reggie" subclass="noprint"
1951 24 Apr 13 nicklas 90       title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>"
1951 24 Apr 13 nicklas 91       /><p:pathelement id="path-case-summary" title="<%="Case summary - " + HTML.encodeTags(caseName)%>" 
1951 24 Apr 13 nicklas 92       /></p:path>
1951 24 Apr 13 nicklas 93     <%
1951 24 Apr 13 nicklas 94   }
1951 24 Apr 13 nicklas 95   else if (popup)
1951 24 Apr 13 nicklas 96   {
1951 24 Apr 13 nicklas 97     %>
2370 22 Apr 14 nicklas 98     <h1 id="path-case-summary">Case summary - <%= HTML.encodeTags(caseName)%></h1>
1951 24 Apr 13 nicklas 99     <%
1951 24 Apr 13 nicklas 100   }
1951 24 Apr 13 nicklas 101   %>
1821 06 Feb 13 nicklas 102   <div class="content">
2610 28 Aug 14 nicklas 103   <form name="reggie" id="wizard" class="wizard">
1824 06 Feb 13 nicklas 104   <%
1951 24 Apr 13 nicklas 105   if (fullPage || popup)
1824 06 Feb 13 nicklas 106   {
1824 06 Feb 13 nicklas 107     %>
3026 11 Dec 14 nicklas 108     <div class="bg-filled-100 noprint" id="toolbar">
1912 20 Mar 13 nicklas 109       <table>
1824 06 Feb 13 nicklas 110       <tr>
1824 06 Feb 13 nicklas 111         <th style="padding: 0.5em 0.75em 0.5em 0.75em;">Find another case</th>
2370 22 Apr 14 nicklas 112         <td><input type="text" class="text auto-init" data-auto-init="focus" style="width: 25em;"
2370 22 Apr 14 nicklas 113           name="caseName" id="caseName" title="Please enter a 7-digit case id"></td>
3026 11 Dec 14 nicklas 114         <td class="dottedright" style="padding-left: 0.5em; padding-right: 0.5em;"><base:icon id="btnCaseSummary" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
1836 13 Feb 13 nicklas 115         <%
1836 13 Feb 13 nicklas 116         if (isAdmin || isPatientCurator)
1836 13 Feb 13 nicklas 117         {
1836 13 Feb 13 nicklas 118           %>
3026 11 Dec 14 nicklas 119           <th class="dottedright" style="padding-left: 0.5em; padding-right: 0.5em;">
1836 13 Feb 13 nicklas 120             <label for="showConfidential">Show confidential information</label>
2370 22 Apr 14 nicklas 121             <input type="checkbox" id="showConfidential" name="showConfidential">
1836 13 Feb 13 nicklas 122           </th>
1836 13 Feb 13 nicklas 123           <%
1836 13 Feb 13 nicklas 124         }
1836 13 Feb 13 nicklas 125         %>
3026 11 Dec 14 nicklas 126         <th class="dottedright" style="padding-left: 0.5em; padding-right: 0.5em;">
2370 22 Apr 14 nicklas 127           <span id="printButton" class="link"><img src="../images/print.png" style="padding-right: 0.5em;">Print version&hellip;</span>
1912 20 Mar 13 nicklas 128         </th>
5022 11 Oct 18 nicklas 129         <td id="columnBalanceOptions" class="dottedright" style="padding-left: 0.5em; padding-right: 0.5em;">
5022 11 Oct 18 nicklas 130           LEFT
6882 22 Nov 22 nicklas 131           <input id="columnBalance" type="range" min="1" max="5" value="3" step="1" style="cursor: pointer;"
5022 11 Oct 18 nicklas 132             title="Slide LEFT to show more of the LEFT column and RIGHT to show more of the RIGHT column">
5022 11 Oct 18 nicklas 133           RIGHT
5022 11 Oct 18 nicklas 134         </td>
2106 25 Oct 13 nicklas 135         <th style="width: 90%;"></th>
1824 06 Feb 13 nicklas 136       </tr>
1824 06 Feb 13 nicklas 137       </table>
1824 06 Feb 13 nicklas 138     </div>
1824 06 Feb 13 nicklas 139     <%
1824 06 Feb 13 nicklas 140   }
1824 06 Feb 13 nicklas 141   %>
1912 20 Mar 13 nicklas 142   <div class="hide-confidential" id="all-info" style="display: none;">
1912 20 Mar 13 nicklas 143     <div id="left-column">
1912 20 Mar 13 nicklas 144       <div>
3026 11 Dec 14 nicklas 145         <div class="info-section bg-filled-100" id="case-info">
1828 07 Feb 13 nicklas 146           <div>
1828 07 Feb 13 nicklas 147           <table class="info-table">
1821 06 Feb 13 nicklas 148           <thead>
1844 15 Feb 13 nicklas 149             <tr id="case.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 150               <th id="case-header">Case</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 151             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 152           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 153           <tbody id="case-details" class="info-details">
1844 15 Feb 13 nicklas 154             <tr id="case.registrationDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 155               <th>Registration date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 156             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 157             <tr id="case.site">
1821 06 Feb 13 nicklas 158               <th>Site</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 159             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 160             <tr id="case.laterality" class="dynamic-column">
1821 06 Feb 13 nicklas 161               <th>Laterality</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 162             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 163             <tr id="case.consent">
1821 06 Feb 13 nicklas 164               <th>Consent</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 165             </tr>
4798 08 May 18 nicklas 166             <tr id="case.frozenTissueDate">
4798 08 May 18 nicklas 167               <th>Frozen tissue date</th>
4798 08 May 18 nicklas 168             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 169             <tr id="case.comment" class="comment dynamic-column">
1844 15 Feb 13 nicklas 170               <th>Comment</th>
1844 15 Feb 13 nicklas 171             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 172           </tbody>
1821 06 Feb 13 nicklas 173           </table>
1828 07 Feb 13 nicklas 174           </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 175         </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 176
3026 11 Dec 14 nicklas 177         <div class="info-section bg-filled-100 bg-filled-100" id="patient-info">
1828 07 Feb 13 nicklas 178           <div>
1828 07 Feb 13 nicklas 179           <table class="info-table">
1821 06 Feb 13 nicklas 180           <thead>
1844 15 Feb 13 nicklas 181             <tr id="patient.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 182               <th id="patient-header">Patient</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 183             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 184           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 185           <tbody id="patient-details" class="info-details">
1844 15 Feb 13 nicklas 186             <tr id="patient.registrationDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 187               <th>Registration date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 188             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 189             <tr id="patient.personalNumber" class="confidential">
1821 06 Feb 13 nicklas 190               <th>Personal number</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 191             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 192             <tr id="patient.allFirstNames" class="confidential">
1821 06 Feb 13 nicklas 193               <th>All first names</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 194             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 195             <tr id="patient.familyName" class="confidential">
1821 06 Feb 13 nicklas 196               <th>Family name</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 197             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 198             <tr id="patient.gender">
1821 06 Feb 13 nicklas 199               <th>Gender</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 200             </tr>
1907 18 Mar 13 nicklas 201             <tr id="patient.allCases" class="dynamic-column">
1907 18 Mar 13 nicklas 202               <th>All cases</th>
1907 18 Mar 13 nicklas 203             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 204           </tbody>
1821 06 Feb 13 nicklas 205           </table>
1828 07 Feb 13 nicklas 206           </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 207         </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 208
3026 11 Dec 14 nicklas 209         <div class="info-section bg-filled-100" id="blood-info">
1828 07 Feb 13 nicklas 210           <div>
1828 07 Feb 13 nicklas 211           <table class="info-table">
1821 06 Feb 13 nicklas 212           <thead>
1821 06 Feb 13 nicklas 213             <tr id="blood.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 214               <th id="blood-header">Blood</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 215             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 216           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 217           <tbody id="blood-details" class="info-details">
1821 06 Feb 13 nicklas 218             <tr id="blood.registrationDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 219               <th>Registration date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 220             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 221             <tr id="blood.consent">
1821 06 Feb 13 nicklas 222               <th>Consent</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 223             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 224             <tr id="blood.bloodSample">
1821 06 Feb 13 nicklas 225               <th>Blood sample</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 226             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 227             <tr id="blood.samplingDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 228               <th>Sampling date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 229             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 230             <tr id="blood.freezerDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 231               <th>Freezer date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 232             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 233             <tr id="blood.serum">
1821 06 Feb 13 nicklas 234               <th>Serum</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 235             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 236             <tr id="blood.comment" class="comment dynamic-column">
1844 15 Feb 13 nicklas 237               <th>Comment</th>
1844 15 Feb 13 nicklas 238             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 239           </tbody>
1821 06 Feb 13 nicklas 240           </table>
1828 07 Feb 13 nicklas 241           </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 242         </div>
6479 09 Nov 21 nicklas 243                 
3026 11 Dec 14 nicklas 244         <div class="info-section bg-filled-100" id="specimen-info">
1828 07 Feb 13 nicklas 245           <div>
1828 07 Feb 13 nicklas 246           <table class="info-table">
1821 06 Feb 13 nicklas 247           <thead>
1821 06 Feb 13 nicklas 248             <tr id="specimen.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 249               <th id="specimen-header">Specimen</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 250             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 251           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 252           <tbody id="specimen-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 253             <tr id="specimen.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 254               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 255             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 256             <tr id="specimen.registrationDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 257               <th>Registration date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 258             </tr>
7152 09 May 23 nicklas 259             <tr id="specimen.externalRef" class="dynamic-column">
7146 08 May 23 nicklas 260               <th>External Ref</th>
7146 08 May 23 nicklas 261             </tr>
1826 07 Feb 13 nicklas 262             <tr id="specimen.storageBox">
1826 07 Feb 13 nicklas 263               <th>Storage box</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 264             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 265             <tr id="specimen.laterality">
1821 06 Feb 13 nicklas 266               <th>Laterality</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 267             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 268             <tr id="specimen.samplingDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 269               <th>Sampling date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 270             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 271             <tr id="specimen.rnaLaterDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 272               <th>RNA later date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 273             </tr>
2159 06 Dec 13 nicklas 274             <tr id="specimen.pad" class="confidential">
1821 06 Feb 13 nicklas 275               <th>PAD</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 276             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 277             <tr id="specimen.biopsyType">
1821 06 Feb 13 nicklas 278               <th>Biopsy type</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 279             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 280             <tr id="specimen.remainingQuantity">
1821 06 Feb 13 nicklas 281               <th>Remaining quantity</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 282             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 283             <tr id="specimen.originalQuantity">
1821 06 Feb 13 nicklas 284               <th>Original quantity</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 285             </tr>
1828 07 Feb 13 nicklas 286             <tr id="specimen.nofPieces">
1828 07 Feb 13 nicklas 287               <th>No. pieces</th>
1828 07 Feb 13 nicklas 288             </tr>
7146 08 May 23 nicklas 289             <tr id="specimen.pathNote">
7152 09 May 23 nicklas 290               <th>Other path. note</th>
7146 08 May 23 nicklas 291             </tr>
1828 07 Feb 13 nicklas 292             <tr id="specimen.partitionComment">
1828 07 Feb 13 nicklas 293               <th>Partition comment</th>
1828 07 Feb 13 nicklas 294             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 295             <tr id="specimen.comment" class="comment dynamic-column">
1844 15 Feb 13 nicklas 296               <th>Comment</th>
1844 15 Feb 13 nicklas 297             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 298           </tbody>
1821 06 Feb 13 nicklas 299           </table>
1828 07 Feb 13 nicklas 300           </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 301         </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 302         
3026 11 Dec 14 nicklas 303         <div class="info-section bg-filled-100" id="nospecimen-info">
1828 07 Feb 13 nicklas 304           <div>
1828 07 Feb 13 nicklas 305           <table class="info-table">
1821 06 Feb 13 nicklas 306           <thead>
1821 06 Feb 13 nicklas 307             <tr id="nospecimen.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 308               <th id="nospecimen-header">NoSpecimen</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 309             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 310           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 311           <tbody id="nospecimen-details" class="info-details">
6579 10 Feb 22 nicklas 312             <tr id="nospecimen.externalSpecimenExists" class="dynamic-column specimen-exists">
6579 10 Feb 22 nicklas 313               <th>Specimen exists</th>
6579 10 Feb 22 nicklas 314             </tr>
6579 10 Feb 22 nicklas 315             <tr id="nospecimen.liasonComment" class="comment dynamic-column specimen-exists">
6579 10 Feb 22 nicklas 316               <th>LiasonComment</th>
6579 10 Feb 22 nicklas 317             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 318             <tr id="nospecimen.registrationDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 319               <th>Registration date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 320             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 321             <tr id="nospecimen.laterality">
1821 06 Feb 13 nicklas 322               <th>Laterality</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 323             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 324             <tr id="nospecimen.samplingDate">
1821 06 Feb 13 nicklas 325               <th>Sampling date</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 326             </tr>
2159 06 Dec 13 nicklas 327             <tr id="nospecimen.pad" class="confidential">
1821 06 Feb 13 nicklas 328               <th>PAD</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 329             </tr>
6579 10 Feb 22 nicklas 330             <tr id="nospecimen.reasonIfNoSpecimen" class="comment dynamic-column">
1821 06 Feb 13 nicklas 331               <th>Reason</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 332             </tr>
7146 08 May 23 nicklas 333             <tr id="nospecimen.pathNote">
7152 09 May 23 nicklas 334               <th>Other path. note</th>
7146 08 May 23 nicklas 335             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 336             <tr id="nospecimen.comment" class="comment dynamic-column">
1844 15 Feb 13 nicklas 337               <th>Comment</th>
1844 15 Feb 13 nicklas 338             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 339           </tbody>
1821 06 Feb 13 nicklas 340           </table>
1828 07 Feb 13 nicklas 341           </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 342         </div>
2099 23 Oct 13 nicklas 343         
3026 11 Dec 14 nicklas 344         <div class="info-section bg-filled-100" id="histology-info">
1828 07 Feb 13 nicklas 345           <div>
1828 07 Feb 13 nicklas 346           <table class="info-table">
1821 06 Feb 13 nicklas 347           <thead>
1821 06 Feb 13 nicklas 348             <tr id="histology.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 349               <th id="histology-header">Histology</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 350             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 351           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 352           <tbody id="histology-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 353             <tr id="histology.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 354               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 355             </tr>
1826 07 Feb 13 nicklas 356             <tr id="histology.registrationDate">
1826 07 Feb 13 nicklas 357               <th>Registration date</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 358             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 359             <tr id="histology.storageBox" class="dynamic-column">
1826 07 Feb 13 nicklas 360               <th>Storage box</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 361             </tr>
1826 07 Feb 13 nicklas 362             <tr id="histology.partitionDate">
1826 07 Feb 13 nicklas 363               <th>Partition date</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 364             </tr>
1826 07 Feb 13 nicklas 365             <tr id="histology.usedQuantity">
1826 07 Feb 13 nicklas 366               <th>Used quantity</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 367             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 368             <tr id="histology.embedded" class="subtitle">
1826 07 Feb 13 nicklas 369               <th>Embedded</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 370             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 371             <tr id="histology.paraffinBlock" class="dynamic-column">
1826 07 Feb 13 nicklas 372               <th>Paraffin block</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 373             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 374             <tr id="histology.embedProtocol" class="dynamic-column">
1826 07 Feb 13 nicklas 375               <th>Protocol</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 376             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 377             <tr id="histology.stained" class="subtitle">
1826 07 Feb 13 nicklas 378               <th>Stained</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 379             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 380             <tr id="histology.nofSlides" class="dynamic-column">
1826 07 Feb 13 nicklas 381               <th>No. slides</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 382             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 383             <tr id="histology.heGlass" class="dynamic-column">
1826 07 Feb 13 nicklas 384               <th>Best slide</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 385             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 386             <tr id="histology.stainProtocol" class="dynamic-column">
1826 07 Feb 13 nicklas 387               <th>Protocol</th>
1826 07 Feb 13 nicklas 388             </tr>
2134 11 Nov 13 nicklas 389             <tr id="histology.scored" class="subtitle">
2134 11 Nov 13 nicklas 390               <th>Scored</th>
2134 11 Nov 13 nicklas 391             </tr>
2134 11 Nov 13 nicklas 392             <tr id="histology.scoreInvasiveCancer" class="dynamic-column">
2134 11 Nov 13 nicklas 393               <th>Invasive cancer</th>
2134 11 Nov 13 nicklas 394             </tr>
2134 11 Nov 13 nicklas 395             <tr id="histology.scoreInsituCancer" class="dynamic-column">
2134 11 Nov 13 nicklas 396               <th>Insitu cancer</th>
2134 11 Nov 13 nicklas 397             </tr>
2134 11 Nov 13 nicklas 398             <tr id="histology.scoreLymphocytes" class="dynamic-column">
2134 11 Nov 13 nicklas 399               <th>Lymphocytes</th>
2134 11 Nov 13 nicklas 400             </tr>
2134 11 Nov 13 nicklas 401             <tr id="histology.scoreNormal" class="dynamic-column">
2134 11 Nov 13 nicklas 402               <th>Normal</th>
2134 11 Nov 13 nicklas 403             </tr>
2134 11 Nov 13 nicklas 404             <tr id="histology.scoreStroma" class="dynamic-column">
2134 11 Nov 13 nicklas 405               <th>Stroma</th>
2134 11 Nov 13 nicklas 406             </tr>
2134 11 Nov 13 nicklas 407             <tr id="histology.scoreFat" class="dynamic-column">
2134 11 Nov 13 nicklas 408               <th>Fat</th>
2134 11 Nov 13 nicklas 409             </tr>
2134 11 Nov 13 nicklas 410             <tr id="histology.scoreComments" class="comment dynamic-column">
2134 11 Nov 13 nicklas 411               <th>Comments</th>
2134 11 Nov 13 nicklas 412             </tr>
1826 07 Feb 13 nicklas 413           </tbody>
1821 06 Feb 13 nicklas 414           </table>
1828 07 Feb 13 nicklas 415           </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 416         </div>
6479 09 Nov 21 nicklas 417         
6479 09 Nov 21 nicklas 418         <div class="info-section bg-filled-100" id="bdna-info">
6479 09 Nov 21 nicklas 419           <div>
6479 09 Nov 21 nicklas 420           <table class="info-table dynamic-columns">
6479 09 Nov 21 nicklas 421           <thead>
6479 09 Nov 21 nicklas 422             <tr id="bdna.name">
6479 09 Nov 21 nicklas 423               <th id="bdna-header">Blood DNA</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 424             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 425           </thead>
6479 09 Nov 21 nicklas 426           <tbody id="bdna-details" class="info-details">
6479 09 Nov 21 nicklas 427             <tr id="bdna.registrationDate">
6479 09 Nov 21 nicklas 428               <th>Registration date</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 429             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 430             <tr id="bdna.storageBox">
6479 09 Nov 21 nicklas 431               <th>Storage box</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 432             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 433             <tr id="bdna.remainingQuantity">
6479 09 Nov 21 nicklas 434               <th>Remaining quantity</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 435             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 436             <tr id="bdna.originalQuantity">
6479 09 Nov 21 nicklas 437               <th>Original quantity</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 438             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 439             <tr id="bdna.ndConc" class="dynamic-column">
6479 09 Nov 21 nicklas 440               <th>ND Conc.</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 441             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 442             <tr id="bdna.comment" class="comment dynamic-column">
6479 09 Nov 21 nicklas 443               <th>Comment</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 444             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 445           </tbody>
6479 09 Nov 21 nicklas 446           </table>
6479 09 Nov 21 nicklas 447           </div>
6479 09 Nov 21 nicklas 448         </div>
2099 23 Oct 13 nicklas 449       
6479 09 Nov 21 nicklas 450         <div class="info-section bg-filled-100" id="genotypecall-info">
6479 09 Nov 21 nicklas 451           <div>
6479 09 Nov 21 nicklas 452           <table class="info-table dynamic-columns">
6479 09 Nov 21 nicklas 453           <thead>
6479 09 Nov 21 nicklas 454             <tr id="genotypecall.name">
6479 09 Nov 21 nicklas 455               <th id="genotypecall-header">GenotypeCall</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 456             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 457           </thead>
6479 09 Nov 21 nicklas 458           <tbody id="genotypecall-details" class="info-details">
6479 09 Nov 21 nicklas 459             <tr id="genotypecall.chip">
6479 09 Nov 21 nicklas 460               <th>BeadChip</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 461             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 462             <tr id="genotypecall.chipType">
6479 09 Nov 21 nicklas 463               <th>Chip type</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 464             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 465             <tr id="genotypecall.scanDate">
6479 09 Nov 21 nicklas 466               <th>Scan date</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 467             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 468             <tr id="genotypecall.callDate">
6479 09 Nov 21 nicklas 469               <th>Call date</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 470             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 471             <tr id="genotypecall.numCalls">
6479 09 Nov 21 nicklas 472               <th>Calls</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 473             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 474             <tr id="genotypecall.callRate">
6479 09 Nov 21 nicklas 475               <th>Call rate</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 476             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 477             <tr id="genotypecall.gcScore">
6479 09 Nov 21 nicklas 478               <th>GC50/GC10</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 479             </tr>
6517 07 Dec 21 nicklas 480             <tr id="genotypecall.genotypeQc">
6517 07 Dec 21 nicklas 481               <th>Genotype QC</th>
6517 07 Dec 21 nicklas 482             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 483             <tr id="genotypecall.comment" class="comment dynamic-column">
6479 09 Nov 21 nicklas 484               <th>Comment</th>
6479 09 Nov 21 nicklas 485             </tr>
6479 09 Nov 21 nicklas 486           </tbody>
6479 09 Nov 21 nicklas 487           </table>
6479 09 Nov 21 nicklas 488           </div>
6479 09 Nov 21 nicklas 489         </div>
6479 09 Nov 21 nicklas 490       
6882 22 Nov 22 nicklas 491         <div class="info-section bg-filled-100" id="methylation-info">
6882 22 Nov 22 nicklas 492           <div>
6882 22 Nov 22 nicklas 493           <table class="info-table dynamic-columns">
6882 22 Nov 22 nicklas 494           <thead>
6882 22 Nov 22 nicklas 495             <tr id="methylation.name">
6882 22 Nov 22 nicklas 496               <th id="methylation-header">Methylation</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 497             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 498           </thead>
6882 22 Nov 22 nicklas 499           <tbody id="methylation-details" class="info-details">
6882 22 Nov 22 nicklas 500             <tr id="methylation.donotuse" class="dynamic-column">
6882 22 Nov 22 nicklas 501               <th>DoNotUse</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 502             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 503             <tr id="methylation.chip">
6882 22 Nov 22 nicklas 504               <th>BeadChip</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 505             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 506             <tr id="methylation.chipType">
6882 22 Nov 22 nicklas 507               <th>Chip type</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 508             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 509             <tr id="methylation.scanDate">
6882 22 Nov 22 nicklas 510               <th>Scan date</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 511             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 512             <tr id="methylation.date">
6882 22 Nov 22 nicklas 513               <th>Date</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 514             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 515             <tr id="methylation.probes">
6882 22 Nov 22 nicklas 516               <th>Probes</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 517             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 518             <tr id="methylation.warnings" class="dynamic-column">
6882 22 Nov 22 nicklas 519               <th>Warnings</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 520             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 521             <tr id="methylation.adjustmentPlots">
6882 22 Nov 22 nicklas 522               <th>Density plots</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 523             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 524             <tr id="methylation.comment" class="comment dynamic-column">
6882 22 Nov 22 nicklas 525               <th>Comment</th>
6882 22 Nov 22 nicklas 526             </tr>
6882 22 Nov 22 nicklas 527           </tbody>
6882 22 Nov 22 nicklas 528           </table>
6882 22 Nov 22 nicklas 529           </div>
6882 22 Nov 22 nicklas 530         </div>
6882 22 Nov 22 nicklas 531       
2099 23 Oct 13 nicklas 532       </div>
2099 23 Oct 13 nicklas 533     </div>
2099 23 Oct 13 nicklas 534     <div id="right-column">
2099 23 Oct 13 nicklas 535       <div>
3026 11 Dec 14 nicklas 536         <div class="info-section bg-filled-100" id="lysate-info">
1828 07 Feb 13 nicklas 537           <div>
1844 15 Feb 13 nicklas 538           <table class="info-table dynamic-columns">
1821 06 Feb 13 nicklas 539           <thead>
1821 06 Feb 13 nicklas 540             <tr id="lysate.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 541               <th id="lysate-header">Lysate</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 542             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 543           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 544           <tbody id="lysate-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 545             <tr id="lysate.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 546               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 547             </tr>
1831 08 Feb 13 nicklas 548             <tr id="lysate.registrationDate">
1831 08 Feb 13 nicklas 549               <th>Registration date</th>
1831 08 Feb 13 nicklas 550             </tr>
1831 08 Feb 13 nicklas 551             <tr id="lysate.partitionDate">
1831 08 Feb 13 nicklas 552               <th>Partition date</th>
1831 08 Feb 13 nicklas 553             </tr>
1831 08 Feb 13 nicklas 554             <tr id="lysate.usedQuantity">
1831 08 Feb 13 nicklas 555               <th>Used quantity</th>
1831 08 Feb 13 nicklas 556             </tr>
1833 08 Feb 13 nicklas 557             <tr id="lysate.multiplePieces">
1833 08 Feb 13 nicklas 558               <th>Multiple pieces</th>
1833 08 Feb 13 nicklas 559             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 560             <tr id="lysate.lysisDate" class="subtitle">
1831 08 Feb 13 nicklas 561               <th>Lysis date</th>
1831 08 Feb 13 nicklas 562             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 563             <tr id="lysate.storageBox" class="dynamic-column">
1831 08 Feb 13 nicklas 564               <th>Storage box</th>
1831 08 Feb 13 nicklas 565             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 566             <tr id="lysate.lysisProtocol" class="dynamic-column">
1831 08 Feb 13 nicklas 567               <th>Protocol</th>
1831 08 Feb 13 nicklas 568             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 569             <tr id="lysate.remainingQuantity" class="dynamic-column">
1831 08 Feb 13 nicklas 570               <th>Remaining quantity</th>
1831 08 Feb 13 nicklas 571             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 572             <tr id="lysate.originalQuantity" class="dynamic-column">
1831 08 Feb 13 nicklas 573               <th>Original quantity</th>
1831 08 Feb 13 nicklas 574             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 575             <tr id="lysate.comment" class="comment dynamic-column">
1844 15 Feb 13 nicklas 576               <th>Comment</th>
1844 15 Feb 13 nicklas 577             </tr>
1831 08 Feb 13 nicklas 578           </tbody>
1821 06 Feb 13 nicklas 579           </table>
1828 07 Feb 13 nicklas 580           </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 581         </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 582           
3026 11 Dec 14 nicklas 583         <div class="info-section bg-filled-100" id="rna-info">
1828 07 Feb 13 nicklas 584           <div>
1844 15 Feb 13 nicklas 585           <table class="info-table dynamic-columns">
1821 06 Feb 13 nicklas 586           <thead>
1821 06 Feb 13 nicklas 587             <tr id="rna.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 588               <th id="rna-header">RNA</th>
1821 06 Feb 13 nicklas 589             </tr>
1821 06 Feb 13 nicklas 590           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 591           <tbody id="rna-details" class="info-details">
2081 17 Oct 13 olle 592             <tr id="rna.flag" class="dynamic-column">
2081 17 Oct 13 olle 593               <th>Flag</th>
2081 17 Oct 13 olle 594             </tr>
5009 04 Oct 18 nicklas 595             <tr id="rna.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 596               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 597             </tr>
1832 08 Feb 13 nicklas 598             <tr id="rna.registrationDate">
1832 08 Feb 13 nicklas 599               <th>Registration date</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 600             </tr>
1832 08 Feb 13 nicklas 601             <tr id="rna.storageBox">
1832 08 Feb 13 nicklas 602               <th>Storage box</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 603             </tr>
1841 14 Feb 13 nicklas 604             <tr id="rna.extractionDate">
1841 14 Feb 13 nicklas 605               <th>Extraction date</th>
1841 14 Feb 13 nicklas 606             </tr>
1832 08 Feb 13 nicklas 607             <tr id="rna.usedQuantity">
1832 08 Feb 13 nicklas 608               <th>Used quantity</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 609             </tr>
1832 08 Feb 13 nicklas 610             <tr id="rna.extractionProtocol">
1832 08 Feb 13 nicklas 611               <th>Protocol</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 612             </tr>
1832 08 Feb 13 nicklas 613             <tr id="rna.remainingQuantity">
1832 08 Feb 13 nicklas 614               <th>Remaining quantity</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 615             </tr>
1832 08 Feb 13 nicklas 616             <tr id="rna.originalQuantity">
1832 08 Feb 13 nicklas 617               <th>Original quantity</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 618             </tr>
6220 20 Apr 21 nicklas 619             <tr id="rna.conc">
6220 20 Apr 21 nicklas 620               <th>Conc.</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 621             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 622             <tr id="rna.comment" class="comment dynamic-column">
1844 15 Feb 13 nicklas 623               <th>Comment</th>
1844 15 Feb 13 nicklas 624             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 625             <tr id="rna.qc" class="subtitle">
1832 08 Feb 13 nicklas 626               <th>QC (last)</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 627             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 628             <tr id="rna.nofQc" class="dynamic-column">
1832 08 Feb 13 nicklas 629               <th>No. QC</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 630             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 631             <tr id="rna.qcProtocol" class="dynamic-column">
1832 08 Feb 13 nicklas 632               <th>Protocol</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 633             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 634             <tr id="rna.qcPlate" class="dynamic-column">
1832 08 Feb 13 nicklas 635               <th>Plate</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 636             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 637             <tr id="rna.qcRqs" class="dynamic-column">
1832 08 Feb 13 nicklas 638               <th>RQS</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 639             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 640             <tr id="rna.qcRin" class="dynamic-column">
1832 08 Feb 13 nicklas 641               <th>RIN</th>
1832 08 Feb 13 nicklas 642             </tr>
1844 15 Feb 13 nicklas 643             <tr id="rna.qcComment" class="comment dynamic-column">
1844 15 Feb 13 nicklas 644               <th>Comment</th>
1844 15 Feb 13 nicklas 645             </tr>
1832 08 Feb 13 nicklas 646           </tbody>
1821 06 Feb 13 nicklas 647           </table>
1828 07 Feb 13 nicklas 648           </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 649         </div>
2098 23 Oct 13 nicklas 650
3026 11 Dec 14 nicklas 651         <div class="info-section bg-filled-100" id="dna-info">
2098 23 Oct 13 nicklas 652           <div>
2098 23 Oct 13 nicklas 653           <table class="info-table dynamic-columns">
2098 23 Oct 13 nicklas 654           <thead>
2098 23 Oct 13 nicklas 655             <tr id="dna.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 656               <th id="dna-header">DNA</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 657             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 658           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 659           <tbody id="dna-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 660             <tr id="dna.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 661               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 662             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 663             <tr id="dna.registrationDate">
2098 23 Oct 13 nicklas 664               <th>Registration date</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 665             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 666             <tr id="dna.storageBox">
2098 23 Oct 13 nicklas 667               <th>Storage box</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 668             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 669             <tr id="dna.extractionDate">
2098 23 Oct 13 nicklas 670               <th>Extraction date</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 671             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 672             <tr id="dna.extractionProtocol">
2098 23 Oct 13 nicklas 673               <th>Protocol</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 674             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 675             <tr id="dna.remainingQuantity">
2098 23 Oct 13 nicklas 676               <th>Remaining quantity</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 677             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 678             <tr id="dna.originalQuantity">
2098 23 Oct 13 nicklas 679               <th>Original quantity</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 680             </tr>
6220 20 Apr 21 nicklas 681             <tr id="dna.conc">
6220 20 Apr 21 nicklas 682               <th>Conc.</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 683             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 684             <tr id="dna.comment" class="comment dynamic-column">
2098 23 Oct 13 nicklas 685               <th>Comment</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 686             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 687           </tbody>
2098 23 Oct 13 nicklas 688           </table>
2098 23 Oct 13 nicklas 689           </div>
2098 23 Oct 13 nicklas 690         </div>
2098 23 Oct 13 nicklas 691
3026 11 Dec 14 nicklas 692         <div class="info-section bg-filled-100" id="ft-info">
2098 23 Oct 13 nicklas 693           <div>
2098 23 Oct 13 nicklas 694           <table class="info-table dynamic-columns">
2098 23 Oct 13 nicklas 695           <thead>
2098 23 Oct 13 nicklas 696             <tr id="ft.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 697               <th id="ft-header">FlowThrough</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 698             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 699           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 700           <tbody id="ft-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 701             <tr id="ft.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 702               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 703             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 704             <tr id="ft.registrationDate">
2098 23 Oct 13 nicklas 705               <th>Registration date</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 706             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 707             <tr id="ft.storageBox">
2098 23 Oct 13 nicklas 708               <th>Storage box</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 709             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 710             <tr id="ft.extractionDate">
2098 23 Oct 13 nicklas 711               <th>Extraction date</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 712             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 713             <tr id="ft.extractionProtocol">
2098 23 Oct 13 nicklas 714               <th>Protocol</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 715             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 716             <tr id="ft.remainingQuantity">
2098 23 Oct 13 nicklas 717               <th>Remaining quantity</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 718             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 719             <tr id="ft.originalQuantity">
2098 23 Oct 13 nicklas 720               <th>Original quantity</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 721             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 722             <tr id="ft.comment" class="comment dynamic-column">
2098 23 Oct 13 nicklas 723               <th>Comment</th>
2098 23 Oct 13 nicklas 724             </tr>
2098 23 Oct 13 nicklas 725           </tbody>
2098 23 Oct 13 nicklas 726           </table>
2098 23 Oct 13 nicklas 727           </div>
2098 23 Oct 13 nicklas 728         </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 729         
3026 11 Dec 14 nicklas 730         <div class="info-section bg-filled-100" id="mrna-info">
2050 07 Oct 13 olle 731           <div>
2050 07 Oct 13 olle 732           <table class="info-table dynamic-columns">
2050 07 Oct 13 olle 733           <thead>
2050 07 Oct 13 olle 734             <tr id="mrna.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 735               <th id="mrna-header">mRNA</th>
2050 07 Oct 13 olle 736             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 737           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 738           <tbody id="mrna-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 739             <tr id="mrna.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 740               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 741             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 742             <tr id="mrna.registrationDate">
2050 07 Oct 13 olle 743               <th>Registration date</th>
2050 07 Oct 13 olle 744             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 745             <tr id="mrna.storageBox">
2050 07 Oct 13 olle 746               <th>Work plate</th>
2050 07 Oct 13 olle 747             </tr>
2083 18 Oct 13 olle 748             <tr id="mrna.result" class="dynamic-column">
2083 18 Oct 13 olle 749               <th>Plate result</th>
2083 18 Oct 13 olle 750             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 751             <tr id="mrna.cleanupDate">
2065 15 Oct 13 olle 752               <th>Cleanup date</th>
2051 09 Oct 13 olle 753             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 754             <tr id="mrna.usedQuantity">
2050 07 Oct 13 olle 755               <th>Used quantity</th>
2050 07 Oct 13 olle 756             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 757             <tr id="mrna.comment" class="comment dynamic-column">
2101 25 Oct 13 nicklas 758               <th>Comment</th>
2101 25 Oct 13 nicklas 759             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 760           </tbody>
2050 07 Oct 13 olle 761           </table>
2050 07 Oct 13 olle 762           </div>
2050 07 Oct 13 olle 763         </div>
2050 07 Oct 13 olle 764         
3026 11 Dec 14 nicklas 765         <div class="info-section bg-filled-100" id="cdna-info">
2050 07 Oct 13 olle 766           <div>
2050 07 Oct 13 olle 767           <table class="info-table dynamic-columns">
2050 07 Oct 13 olle 768           <thead>
2050 07 Oct 13 olle 769             <tr id="cdna.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 770               <th id="cdna-header">cDNA</th>
2050 07 Oct 13 olle 771             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 772           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 773           <tbody id="cdna-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 774             <tr id="cdna.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 775               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 776             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 777             <tr id="cdna.registrationDate">
2050 07 Oct 13 olle 778               <th>Registration date</th>
2050 07 Oct 13 olle 779             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 780             <tr id="cdna.storageBox">
2050 07 Oct 13 olle 781               <th>Work plate</th>
2050 07 Oct 13 olle 782             </tr>
2083 18 Oct 13 olle 783             <tr id="cdna.result" class="dynamic-column">
2083 18 Oct 13 olle 784               <th>Plate result</th>
2083 18 Oct 13 olle 785             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 786             <tr id="cdna.synthesisDate">
2065 15 Oct 13 olle 787               <th>Synthesis date</th>
2051 09 Oct 13 olle 788             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 789             <tr id="cdna.comment" class="comment dynamic-column">
2101 25 Oct 13 nicklas 790               <th>Comment</th>
2101 25 Oct 13 nicklas 791             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 792           </tbody>
2050 07 Oct 13 olle 793           </table>
2050 07 Oct 13 olle 794           </div>
2050 07 Oct 13 olle 795         </div>
2050 07 Oct 13 olle 796         
3026 11 Dec 14 nicklas 797         <div class="info-section bg-filled-100" id="lib-info">
2050 07 Oct 13 olle 798           <div>
2050 07 Oct 13 olle 799           <table class="info-table dynamic-columns">
2050 07 Oct 13 olle 800           <thead>
2050 07 Oct 13 olle 801             <tr id="lib.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 802               <th id="lib-header">Library</th>
2050 07 Oct 13 olle 803             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 804           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 805           <tbody id="lib-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 806             <tr id="lib.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 807               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 808             </tr>
5522 24 Jun 19 nicklas 809             <tr id="lib.pipeline">
5522 24 Jun 19 nicklas 810               <th>Pipeline</th>
5522 24 Jun 19 nicklas 811             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 812             <tr id="lib.registrationDate">
2050 07 Oct 13 olle 813               <th>Registration date</th>
2050 07 Oct 13 olle 814             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 815             <tr id="lib.storageBox">
2054 09 Oct 13 olle 816               <th>Library plate</th>
2050 07 Oct 13 olle 817             </tr>
2083 18 Oct 13 olle 818             <tr id="lib.result" class="dynamic-column">
2083 18 Oct 13 olle 819               <th>Plate result</th>
2083 18 Oct 13 olle 820             </tr>
3321 11 May 15 nicklas 821             <tr id="lib.libDate">
5895 14 Apr 20 nicklas 822               <th title="CleanupDate if available, otherwise NeoPrepDate or creation date">Date</th>
2051 09 Oct 13 olle 823             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 824             <tr id="lib.remainingQuantity">
2050 07 Oct 13 olle 825               <th>Remaining quantity</th>
2050 07 Oct 13 olle 826             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 827             <tr id="lib.originalQuantity">
2050 07 Oct 13 olle 828               <th>Original quantity</th>
2050 07 Oct 13 olle 829             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 830             <tr id="lib.barcode.name">
2050 07 Oct 13 olle 831               <th>Tag</th>
2050 07 Oct 13 olle 832             </tr>
3320 11 May 15 nicklas 833             <tr id="lib.size">
3320 11 May 15 nicklas 834               <th title="CA_Size if available, otherwise LIBRARY_SIZE_EST">Size</th>
2050 07 Oct 13 olle 835             </tr>
2454 23 May 14 nicklas 836             <tr id="lib.molarity">
2454 23 May 14 nicklas 837               <th>Molarity</th>
2050 07 Oct 13 olle 838             </tr>
3320 11 May 15 nicklas 839             <tr id="lib.conc">
3320 11 May 15 nicklas 840               <th title="QubitConc if available, otherwise LIBRARY_CONC_EST">Concentration</th>
3320 11 May 15 nicklas 841             </tr>
2454 23 May 14 nicklas 842             <tr id="lib.adapterFrac">
2454 23 May 14 nicklas 843               <th>Adapter fraction</th>
2454 23 May 14 nicklas 844             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 845             <tr id="lib.comment" class="comment dynamic-column">
2101 25 Oct 13 nicklas 846               <th>Comment</th>
2101 25 Oct 13 nicklas 847             </tr>
2050 07 Oct 13 olle 848           </tbody>
2050 07 Oct 13 olle 849           </table>
2050 07 Oct 13 olle 850           </div>
2050 07 Oct 13 olle 851         </div>
2050 07 Oct 13 olle 852         
3026 11 Dec 14 nicklas 853         <div class="info-section bg-filled-100" id="pooledlib-info">
2052 09 Oct 13 olle 854           <div>
2052 09 Oct 13 olle 855           <table class="info-table dynamic-columns">
2052 09 Oct 13 olle 856           <thead>
2052 09 Oct 13 olle 857             <tr id="pooledlib.name">
2100 24 Oct 13 nicklas 858               <th id="pooledlib-header">Pooled Library</th>
2052 09 Oct 13 olle 859             </tr>
2052 09 Oct 13 olle 860           </thead>
2100 24 Oct 13 nicklas 861           <tbody id="pooledlib-details" class="info-details">
5522 24 Jun 19 nicklas 862             <tr id="pooledlib.pipeline">
5522 24 Jun 19 nicklas 863               <th>Pipeline</th>
5522 24 Jun 19 nicklas 864             </tr>
2052 09 Oct 13 olle 865             <tr id="pooledlib.registrationDate">
2052 09 Oct 13 olle 866               <th>Registration date</th>
2052 09 Oct 13 olle 867             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 868             <tr id="pooledlib.poolDate">
2065 15 Oct 13 olle 869               <th>Pool date</th>
2052 09 Oct 13 olle 870             </tr>
2052 09 Oct 13 olle 871             <tr id="pooledlib.remainingQuantity">
2052 09 Oct 13 olle 872               <th>Remaining quantity</th>
2052 09 Oct 13 olle 873             </tr>
2052 09 Oct 13 olle 874             <tr id="pooledlib.originalQuantity">
2052 09 Oct 13 olle 875               <th>Original quantity</th>
2052 09 Oct 13 olle 876             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 877             <tr id="pooledlib.poolMolarity">
2052 09 Oct 13 olle 878               <th>PoolMolarity</th>
2052 09 Oct 13 olle 879             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 880             <tr id="pooledlib.poolConc">
2052 09 Oct 13 olle 881               <th>PoolConc</th>
2052 09 Oct 13 olle 882             </tr>
2101 25 Oct 13 nicklas 883             <tr id="pooledlib.comment" class="comment dynamic-column">
2101 25 Oct 13 nicklas 884               <th>Comment</th>
2101 25 Oct 13 nicklas 885             </tr>
2052 09 Oct 13 olle 886           </tbody>
2052 09 Oct 13 olle 887           </table>
2052 09 Oct 13 olle 888           </div>
2052 09 Oct 13 olle 889         </div>
2232 17 Feb 14 nicklas 890   
3026 11 Dec 14 nicklas 891         <div class="info-section bg-filled-100" id="sequencingRun-info">
2232 17 Feb 14 nicklas 892           <div>
2232 17 Feb 14 nicklas 893           <table class="info-table dynamic-columns">
2232 17 Feb 14 nicklas 894           <thead>
2232 17 Feb 14 nicklas 895             <tr id="sequencingRun.name">
2232 17 Feb 14 nicklas 896               <th id="sequencingRun-header">Sequencing runs</th>
2232 17 Feb 14 nicklas 897             </tr>
2232 17 Feb 14 nicklas 898           </thead>
2232 17 Feb 14 nicklas 899           <tbody id="sequencingRun-details" class="info-details">
2232 17 Feb 14 nicklas 900             <tr id="sequencingRun.flowCell">
2232 17 Feb 14 nicklas 901               <th>Flow cell</th>
2232 17 Feb 14 nicklas 902             </tr>
5522 24 Jun 19 nicklas 903             <tr id="sequencingRun.pipeline">
5522 24 Jun 19 nicklas 904               <th>Pipeline</th>
5522 24 Jun 19 nicklas 905             </tr>
2232 17 Feb 14 nicklas 906             <tr id="sequencingRun.clusterDate">
2232 17 Feb 14 nicklas 907               <th>Cluster date</th>
2232 17 Feb 14 nicklas 908             </tr>
2232 17 Feb 14 nicklas 909             <tr id="sequencingRun.startDate">
2232 17 Feb 14 nicklas 910               <th>Start date</th>
2232 17 Feb 14 nicklas 911             </tr>
2232 17 Feb 14 nicklas 912             <tr id="sequencingRun.endDate">
2232 17 Feb 14 nicklas 913               <th>End date</th>
2232 17 Feb 14 nicklas 914             </tr>
2232 17 Feb 14 nicklas 915             <tr id="sequencingRun.result" class="dynamic-column">
2232 17 Feb 14 nicklas 916               <th>Sequencing result</th>
2232 17 Feb 14 nicklas 917             </tr>
2232 17 Feb 14 nicklas 918             <tr id="sequencingRun.comment" class="comment dynamic-column">
2232 17 Feb 14 nicklas 919               <th>Comment</th>
2232 17 Feb 14 nicklas 920             </tr>
2232 17 Feb 14 nicklas 921           </tbody>
2232 17 Feb 14 nicklas 922           </table>
2232 17 Feb 14 nicklas 923           </div>
2232 17 Feb 14 nicklas 924         </div>
2914 11 Nov 14 nicklas 925
7308 28 Aug 23 nicklas 926         <div class="info-section bg-filled-100" id="mergedSequencesRNA-info">
2914 11 Nov 14 nicklas 927           <div>
2914 11 Nov 14 nicklas 928           <table class="info-table dynamic-columns">
2914 11 Nov 14 nicklas 929           <thead>
7308 28 Aug 23 nicklas 930             <tr id="mergedSequencesRNA.name">
7308 28 Aug 23 nicklas 931               <th id="mergedSequencesRNA-header">Demux+merge (RNA)</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 932             </tr>
2914 11 Nov 14 nicklas 933           </thead>
7308 28 Aug 23 nicklas 934           <tbody id="mergedSequencesRNA-details" class="info-details">
7308 28 Aug 23 nicklas 935             <tr id="mergedSequencesRNA.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 936               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 937             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 938             <tr id="mergedSequencesRNA.pipeline">
5522 24 Jun 19 nicklas 939               <th>Pipeline</th>
5522 24 Jun 19 nicklas 940             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 941             <tr id="mergedSequencesRNA.date">
2916 11 Nov 14 nicklas 942               <th>End date</th>
2916 11 Nov 14 nicklas 943             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 944             <tr id="mergedSequencesRNA.pfReads">
2914 11 Nov 14 nicklas 945               <th>Passed filter</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 946             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 947             <tr id="mergedSequencesRNA.ptReads">
2914 11 Nov 14 nicklas 948               <th>Passed Trimmomatic</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 949             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 950             <tr id="mergedSequencesRNA.adapterReads">
2914 11 Nov 14 nicklas 951               <th>Adapter reads</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 952             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 953             <tr id="mergedSequencesRNA.result" class="dynamic-column">
2914 11 Nov 14 nicklas 954               <th>Result</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 955             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 956             <tr id="mergedSequencesRNA.comment" class="comment dynamic-column">
2914 11 Nov 14 nicklas 957               <th>Comment</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 958             </tr>
2914 11 Nov 14 nicklas 959           </tbody>
2914 11 Nov 14 nicklas 960           </table>
2914 11 Nov 14 nicklas 961           </div>
2914 11 Nov 14 nicklas 962         </div>
2914 11 Nov 14 nicklas 963
7308 28 Aug 23 nicklas 964         <div class="info-section bg-filled-100" id="alignedSequencesRNA-info">
2914 11 Nov 14 nicklas 965           <div>
2914 11 Nov 14 nicklas 966           <table class="info-table dynamic-columns">
2914 11 Nov 14 nicklas 967           <thead>
7308 28 Aug 23 nicklas 968             <tr id="alignedSequencesRNA.name">
7308 28 Aug 23 nicklas 969               <th id="alignedSequences-header">Mask+align (RNA)</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 970             </tr>
2914 11 Nov 14 nicklas 971           </thead>
7308 28 Aug 23 nicklas 972           <tbody id="alignedSequencesRNA-details" class="info-details">
7308 28 Aug 23 nicklas 973             <tr id="alignedSequencesRNA.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 974               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 975             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 976             <tr id="alignedSequencesRNA.pipeline">
5548 08 Aug 19 nicklas 977               <th>Pipeline</th>
5548 08 Aug 19 nicklas 978             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 979             <tr id="alignedSequencesRNA.software">
4603 02 Oct 17 nicklas 980               <th>Software</th>
4603 02 Oct 17 nicklas 981             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 982             <tr id="alignedSequencesRNA.date">
2916 11 Nov 14 nicklas 983               <th>End date</th>
2916 11 Nov 14 nicklas 984             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 985             <tr id="alignedSequencesRNA.alignedPairs">
2914 11 Nov 14 nicklas 986               <th>Aligned pairs</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 987             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 988             <tr id="alignedSequencesRNA.fractionDuplication">
2914 11 Nov 14 nicklas 989               <th>Duplication</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 990             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 991             <tr id="alignedSequencesRNA.genotypeQc" class="dynamic-column">
4621 16 Nov 17 nicklas 992               <th>Genotype QC</th>
4621 16 Nov 17 nicklas 993             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 994             <tr id="alignedSequencesRNA.result" class="dynamic-column">
2914 11 Nov 14 nicklas 995               <th>Result</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 996             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 997             <tr id="alignedSequencesRNA.comment" class="comment dynamic-column">
2914 11 Nov 14 nicklas 998               <th>Comment</th>
2914 11 Nov 14 nicklas 999             </tr>
2914 11 Nov 14 nicklas 1000           </tbody>
2914 11 Nov 14 nicklas 1001           </table>
2914 11 Nov 14 nicklas 1002           </div>
2914 11 Nov 14 nicklas 1003         </div>
2914 11 Nov 14 nicklas 1004
3026 11 Dec 14 nicklas 1005         <div class="info-section bg-filled-100" id="rawBioAssays-info">
2918 11 Nov 14 nicklas 1006           <div>
2918 11 Nov 14 nicklas 1007           <table class="info-table dynamic-columns">
2918 11 Nov 14 nicklas 1008           <thead>
2918 11 Nov 14 nicklas 1009             <tr id="rawBioAssays.name">
5731 19 Nov 19 nicklas 1010               <th id="rawBioAssays-header">Expression profiles</th>
2918 11 Nov 14 nicklas 1011             </tr>
2918 11 Nov 14 nicklas 1012           </thead>
2918 11 Nov 14 nicklas 1013           <tbody id="rawBioAssays-details" class="info-details">
5009 04 Oct 18 nicklas 1014             <tr id="rawBioAssays.donotuse" class="dynamic-column">
5009 04 Oct 18 nicklas 1015               <th>DoNotUse</th>
5009 04 Oct 18 nicklas 1016             </tr>
5548 08 Aug 19 nicklas 1017             <tr id="rawBioAssays.pipeline">
5548 08 Aug 19 nicklas 1018               <th>Pipeline</th>
5548 08 Aug 19 nicklas 1019             </tr>
4674 08 Feb 18 nicklas 1020             <tr id="rawBioAssays.type">
4674 08 Feb 18 nicklas 1021               <th>Type</th>
4674 08 Feb 18 nicklas 1022             </tr>
2918 11 Nov 14 nicklas 1023             <tr id="rawBioAssays.date">
2918 11 Nov 14 nicklas 1024               <th>Date</th>
2918 11 Nov 14 nicklas 1025             </tr>
2918 11 Nov 14 nicklas 1026             <tr id="rawBioAssays.result" class="dynamic-column">
2918 11 Nov 14 nicklas 1027               <th>Result</th>
2918 11 Nov 14 nicklas 1028             </tr>
2918 11 Nov 14 nicklas 1029             <tr id="rawBioAssays.geneReport">
2918 11 Nov 14 nicklas 1030               <th>Gene report</th>
2918 11 Nov 14 nicklas 1031             </tr>
3534 08 Oct 15 nicklas 1032             <tr id="rawBioAssays.pilotReport">
3534 08 Oct 15 nicklas 1033               <th>Pilot report</th>
3534 08 Oct 15 nicklas 1034             </tr>
6094 14 Dec 20 nicklas 1035             <tr id="rawBioAssays.scanbReport">
6094 14 Dec 20 nicklas 1036               <th>SCAN-B report</th>
6094 14 Dec 20 nicklas 1037             </tr>
2918 11 Nov 14 nicklas 1038             <tr id="rawBioAssays.comment" class="comment dynamic-column">
2918 11 Nov 14 nicklas 1039               <th>Comment</th>
2918 11 Nov 14 nicklas 1040             </tr>
2918 11 Nov 14 nicklas 1041           </tbody>
2918 11 Nov 14 nicklas 1042           </table>
2918 11 Nov 14 nicklas 1043           </div>
2918 11 Nov 14 nicklas 1044         </div>
5731 19 Nov 19 nicklas 1045
7411 10 Nov 23 nicklas 1046         <div class="info-section bg-filled-100" id="variantCallingRNA-info">
5731 19 Nov 19 nicklas 1047           <div>
5731 19 Nov 19 nicklas 1048           <table class="info-table dynamic-columns">
5731 19 Nov 19 nicklas 1049           <thead>
7411 10 Nov 23 nicklas 1050             <tr id="variantCallingRNA.name">
7411 10 Nov 23 nicklas 1051               <th id="variantCalling-header">Variant calling (RNA)</th>
5731 19 Nov 19 nicklas 1052             </tr>
5731 19 Nov 19 nicklas 1053           </thead>
7411 10 Nov 23 nicklas 1054           <tbody id="variantCallingRNA-details" class="info-details">
7411 10 Nov 23 nicklas 1055             <tr id="variantCallingRNA.donotuse" class="dynamic-column">
5731 19 Nov 19 nicklas 1056               <th>DoNotUse</th>
5731 19 Nov 19 nicklas 1057             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1058             <tr id="variantCallingRNA.pipeline">
5731 19 Nov 19 nicklas 1059               <th>Pipeline</th>
5731 19 Nov 19 nicklas 1060             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1061             <tr id="variantCallingRNA.date">
5731 19 Nov 19 nicklas 1062               <th>Date</th>
5731 19 Nov 19 nicklas 1063             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1064             <tr id="variantCallingRNA.result" class="dynamic-column">
5731 19 Nov 19 nicklas 1065               <th>Result</th>
5731 19 Nov 19 nicklas 1066             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1067             <tr id="variantCallingRNA.variants">
5731 19 Nov 19 nicklas 1068               <th>Variants</th>
5731 19 Nov 19 nicklas 1069             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1070             <tr id="variantCallingRNA.genotyping">
6393 16 Sep 21 nicklas 1071               <th>Genotyping</th>
6393 16 Sep 21 nicklas 1072             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1073             <tr id="variantCallingRNA.comment" class="comment dynamic-column">
5731 19 Nov 19 nicklas 1074               <th>Comment</th>
5731 19 Nov 19 nicklas 1075             </tr>
5731 19 Nov 19 nicklas 1076           </tbody>
5731 19 Nov 19 nicklas 1077           </table>
5731 19 Nov 19 nicklas 1078           </div>
7296 23 Aug 23 nicklas 1079         </div>
7296 23 Aug 23 nicklas 1080         
7308 28 Aug 23 nicklas 1081         <div class="info-section bg-filled-100" id="mergedSequencesDNA-info">
7308 28 Aug 23 nicklas 1082           <div>
7308 28 Aug 23 nicklas 1083           <table class="info-table dynamic-columns">
7308 28 Aug 23 nicklas 1084           <thead>
7308 28 Aug 23 nicklas 1085             <tr id="mergedSequencesDNA.name">
7308 28 Aug 23 nicklas 1086               <th id="mergedSequencesDNA-header">Demux+merge (DNA)</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1087             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1088           </thead>
7308 28 Aug 23 nicklas 1089           <tbody id="mergedSequencesDNA-details" class="info-details">
7308 28 Aug 23 nicklas 1090             <tr id="mergedSequencesDNA.donotuse" class="dynamic-column">
7308 28 Aug 23 nicklas 1091               <th>DoNotUse</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1092             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1093             <tr id="mergedSequencesDNA.pipeline">
7308 28 Aug 23 nicklas 1094               <th>Pipeline</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1095             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1096             <tr id="mergedSequencesDNA.date">
7308 28 Aug 23 nicklas 1097               <th>End date</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1098             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1099             <tr id="mergedSequencesDNA.reads">
7308 28 Aug 23 nicklas 1100               <th>Reads</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1101             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1102             <tr id="mergedSequencesDNA.result" class="dynamic-column">
7308 28 Aug 23 nicklas 1103               <th>Result</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1104             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1105             <tr id="mergedSequencesDNA.comment" class="comment dynamic-column">
7308 28 Aug 23 nicklas 1106               <th>Comment</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1107             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1108           </tbody>
7308 28 Aug 23 nicklas 1109           </table>
7308 28 Aug 23 nicklas 1110           </div>
7308 28 Aug 23 nicklas 1111         </div>
7308 28 Aug 23 nicklas 1112         
7308 28 Aug 23 nicklas 1113         <div class="info-section bg-filled-100" id="alignedSequencesDNA-info">
7308 28 Aug 23 nicklas 1114           <div>
7308 28 Aug 23 nicklas 1115           <table class="info-table dynamic-columns">
7308 28 Aug 23 nicklas 1116           <thead>
7308 28 Aug 23 nicklas 1117             <tr id="alignedSequencesDNA.name">
7308 28 Aug 23 nicklas 1118               <th id="alignedSequences-header">Alignment (DNA)</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1119             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1120           </thead>
7308 28 Aug 23 nicklas 1121           <tbody id="alignedSequencesDNA-details" class="info-details">
7308 28 Aug 23 nicklas 1122             <tr id="alignedSequencesDNA.donotuse" class="dynamic-column">
7308 28 Aug 23 nicklas 1123               <th>DoNotUse</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1124             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1125             <tr id="alignedSequencesDNA.pipeline">
7308 28 Aug 23 nicklas 1126               <th>Pipeline</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1127             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1128             <tr id="alignedSequencesDNA.software">
7308 28 Aug 23 nicklas 1129               <th>Software</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1130             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1131             <tr id="alignedSequencesDNA.date">
7308 28 Aug 23 nicklas 1132               <th>End date</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1133             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1134             <tr id="alignedSequencesDNA.alignedPairs">
7308 28 Aug 23 nicklas 1135               <th>Aligned pairs</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1136             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1137             <tr id="alignedSequencesDNA.coverage">
7308 28 Aug 23 nicklas 1138               <th>Coverage</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1139             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1140             <tr id="alignedSequencesDNA.fractionDuplication">
7308 28 Aug 23 nicklas 1141               <th>Duplication</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1142             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1143             <tr id="alignedSequencesDNA.genotypeQc" class="dynamic-column">
7308 28 Aug 23 nicklas 1144               <th>Genotype QC</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1145             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1146             <tr id="alignedSequencesDNA.result" class="dynamic-column">
7308 28 Aug 23 nicklas 1147               <th>Result</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1148             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1149             <tr id="alignedSequencesDNA.comment" class="comment dynamic-column">
7308 28 Aug 23 nicklas 1150               <th>Comment</th>
7308 28 Aug 23 nicklas 1151             </tr>
7308 28 Aug 23 nicklas 1152           </tbody>
7308 28 Aug 23 nicklas 1153           </table>
7308 28 Aug 23 nicklas 1154           </div>
7308 28 Aug 23 nicklas 1155         </div>
7308 28 Aug 23 nicklas 1156         
7296 23 Aug 23 nicklas 1157         <div class="info-section bg-filled-100" id="copyNumber-info">
7296 23 Aug 23 nicklas 1158           <div>
7296 23 Aug 23 nicklas 1159           <table class="info-table dynamic-columns">
7296 23 Aug 23 nicklas 1160           <thead>
7296 23 Aug 23 nicklas 1161             <tr id="copyNumber.name">
7296 23 Aug 23 nicklas 1162               <th id="copyNumber-header">Copy number</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1163             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1164           </thead>
7296 23 Aug 23 nicklas 1165           <tbody id="copyNumber-details" class="info-details">
7296 23 Aug 23 nicklas 1166             <tr id="copyNumber.donotuse" class="dynamic-column">
7296 23 Aug 23 nicklas 1167               <th>DoNotUse</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1168             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1169             <tr id="copyNumber.pipeline">
7296 23 Aug 23 nicklas 1170               <th>Pipeline</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1171             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1172             <tr id="copyNumber.date">
7296 23 Aug 23 nicklas 1173               <th>Date</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1174             </tr>
7298 24 Aug 23 nicklas 1175             <tr id="copyNumber.parameters" class="dynamic-column">
7298 24 Aug 23 nicklas 1176               <th>Parameters</th>
7298 24 Aug 23 nicklas 1177             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1178             <tr id="copyNumber.result" class="dynamic-column">
7296 23 Aug 23 nicklas 1179               <th>Result</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1180             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1181             <tr id="copyNumber.ploidy">
7296 23 Aug 23 nicklas 1182               <th>Ploidy</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1183             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1184             <tr id="copyNumber.purity">
7296 23 Aug 23 nicklas 1185               <th>Purity</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1186             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1187             <tr id="copyNumber.gof">
7296 23 Aug 23 nicklas 1188               <th>Goodness of fit</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1189             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1190             <tr id="copyNumber.plots">
7296 23 Aug 23 nicklas 1191               <th>Plots</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1192             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1193             <tr id="copyNumber.comment" class="comment dynamic-column">
7296 23 Aug 23 nicklas 1194               <th>Comment</th>
7296 23 Aug 23 nicklas 1195             </tr>
7296 23 Aug 23 nicklas 1196           </tbody>
7296 23 Aug 23 nicklas 1197           </table>
7296 23 Aug 23 nicklas 1198           </div>
7411 10 Nov 23 nicklas 1199         </div>
7296 23 Aug 23 nicklas 1200         
7411 10 Nov 23 nicklas 1201         <div class="info-section bg-filled-100" id="variantCallingDNA-info">
7411 10 Nov 23 nicklas 1202           <div>
7411 10 Nov 23 nicklas 1203           <table class="info-table dynamic-columns">
7411 10 Nov 23 nicklas 1204           <thead>
7411 10 Nov 23 nicklas 1205             <tr id="variantCallingDNA.name">
7411 10 Nov 23 nicklas 1206               <th id="variantCalling-header">Variant calling (DNA)</th>
7411 10 Nov 23 nicklas 1207             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1208           </thead>
7411 10 Nov 23 nicklas 1209           <tbody id="variantCallingDNA-details" class="info-details">
7411 10 Nov 23 nicklas 1210             <tr id="variantCallingDNA.donotuse" class="dynamic-column">
7411 10 Nov 23 nicklas 1211               <th>DoNotUse</th>
7411 10 Nov 23 nicklas 1212             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1213             <tr id="variantCallingDNA.pipeline">
7411 10 Nov 23 nicklas 1214               <th>Pipeline</th>
7411 10 Nov 23 nicklas 1215             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1216             <tr id="variantCallingDNA.date">
7411 10 Nov 23 nicklas 1217               <th>Date</th>
7411 10 Nov 23 nicklas 1218             </tr>
7440 16 Nov 23 nicklas 1219             <tr id="variantCallingDNA.pon">
7440 16 Nov 23 nicklas 1220               <th>Panel-of-normals</th>
7440 16 Nov 23 nicklas 1221             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1222             <tr id="variantCallingDNA.result" class="dynamic-column">
7411 10 Nov 23 nicklas 1223               <th>Result</th>
7411 10 Nov 23 nicklas 1224             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1225             <tr id="variantCallingDNA.variants">
7411 10 Nov 23 nicklas 1226               <th>Variants</th>
7411 10 Nov 23 nicklas 1227             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1228             <tr id="variantCallingDNA.callableBases">
7411 10 Nov 23 nicklas 1229               <th>Callable bases</th>
7411 10 Nov 23 nicklas 1230             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1231             <tr id="variantCallingDNA.comment" class="comment dynamic-column">
7411 10 Nov 23 nicklas 1232               <th>Comment</th>
7411 10 Nov 23 nicklas 1233             </tr>
7411 10 Nov 23 nicklas 1234           </tbody>
7411 10 Nov 23 nicklas 1235           </table>
7411 10 Nov 23 nicklas 1236           </div>
7411 10 Nov 23 nicklas 1237         </div>
7411 10 Nov 23 nicklas 1238         
7411 10 Nov 23 nicklas 1239         
1821 06 Feb 13 nicklas 1240       </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 1241     </div>
1821 06 Feb 13 nicklas 1242   </div>
2610 28 Aug 14 nicklas 1243
2610 28 Aug 14 nicklas 1244   <div id="wizard-status"></div>
2610 28 Aug 14 nicklas 1245   
1824 06 Feb 13 nicklas 1246   </form>
1821 06 Feb 13 nicklas 1247   </div>
1951 24 Apr 13 nicklas 1248   <%
1951 24 Apr 13 nicklas 1249   if (popup)
1951 24 Apr 13 nicklas 1250   {
1951 24 Apr 13 nicklas 1251     %>
1951 24 Apr 13 nicklas 1252     <base:buttongroup subclass="dialogbuttons topborder" id="dialogbuttons">
2370 22 Apr 14 nicklas 1253       <base:button id="close" title="Close" />
1951 24 Apr 13 nicklas 1254     </base:buttongroup>
1951 24 Apr 13 nicklas 1255     <%
1951 24 Apr 13 nicklas 1256   }
1951 24 Apr 13 nicklas 1257   %>
1821 06 Feb 13 nicklas 1258 </base:body>
1821 06 Feb 13 nicklas 1259 </base:page>
1821 06 Feb 13 nicklas 1260 <%
1821 06 Feb 13 nicklas 1261 }
1821 06 Feb 13 nicklas 1262 finally
1821 06 Feb 13 nicklas 1263 {
1821 06 Feb 13 nicklas 1264   if (dc != null) dc.close();
1821 06 Feb 13 nicklas 1265 }
1821 06 Feb 13 nicklas 1266 %>