extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/reports/scanbquartermonthreportgenerator.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1820 06 Feb 13 olle 1 <%@ page
1820 06 Feb 13 olle 2   pageEncoding="UTF-8"
1820 06 Feb 13 olle 3   session="false"
1820 06 Feb 13 olle 4   import="net.sf.basedb.core.User"
1820 06 Feb 13 olle 5   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
1820 06 Feb 13 olle 6   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
1820 06 Feb 13 olle 7   import="net.sf.basedb.core.Application"
1820 06 Feb 13 olle 8   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"  
1820 06 Feb 13 olle 9   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
1820 06 Feb 13 olle 10 %>
1820 06 Feb 13 olle 11 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
1820 06 Feb 13 olle 12 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
1820 06 Feb 13 olle 13 <%
3976 26 May 16 nicklas 14 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
1820 06 Feb 13 olle 15 final String ID = sc.getId();
1820 06 Feb 13 olle 16 final float scale = Base.getScale(sc);
1820 06 Feb 13 olle 17 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
1820 06 Feb 13 olle 18 DbControl dc = null;
1820 06 Feb 13 olle 19 try
1820 06 Feb 13 olle 20 {
1820 06 Feb 13 olle 21   dc = sc.newDbControl();
1820 06 Feb 13 olle 22   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
1820 06 Feb 13 olle 23   %>
1820 06 Feb 13 olle 24 <base:page type="default" >
2608 28 Aug 14 nicklas 25 <base:head 
2608 28 Aug 14 nicklas 26   scripts="~../reggie-2.js,~boxplot.js,~scanbquartermonthreportgenerator.js" 
2608 28 Aug 14 nicklas 27   styles="path.css,~../css/reggie-2.css,~../css/report.css">
2608 28 Aug 14 nicklas 28   <style>
2608 28 Aug 14 nicklas 29   canvas
1820 06 Feb 13 olle 30   {
2608 28 Aug 14 nicklas 31     width: 700px;
2608 28 Aug 14 nicklas 32     height: 550px;
2611 29 Aug 14 nicklas 33   }  
2608 28 Aug 14 nicklas 34   .guide
1820 06 Feb 13 olle 35   {
2608 28 Aug 14 nicklas 36     position: absolute; 
2608 28 Aug 14 nicklas 37     z-index: 99; 
2608 28 Aug 14 nicklas 38     display: none; 
2608 28 Aug 14 nicklas 39     background-color: #224488;
1853 18 Feb 13 nicklas 40   }
1880 22 Feb 13 nicklas 41   </style>
1820 06 Feb 13 olle 42   </base:head>
2608 28 Aug 14 nicklas 43   <base:body>
1820 06 Feb 13 olle 44     <p:path><p:pathelement 
1915 21 Mar 13 nicklas 45       title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
1849 18 Feb 13 nicklas 46       /><p:pathelement title="Sample processing statistics" 
1820 06 Feb 13 olle 47       /></p:path>
2608 28 Aug 14 nicklas 48       
2608 28 Aug 14 nicklas 49     <div id="x-guide" class="guide" style="width: 1px;"></div>
2608 28 Aug 14 nicklas 50     <div id="y-guide" class="guide" style="height: 1px;"></div>
2608 28 Aug 14 nicklas 51
1820 06 Feb 13 olle 52     <div class="content">
2608 28 Aug 14 nicklas 53     <form name="reggie" id="wizard" class="wizard">
2608 28 Aug 14 nicklas 54
2608 28 Aug 14 nicklas 55       <div class="step" id="step-1">
2608 28 Aug 14 nicklas 56         <div class="step-no">1</div>
2608 28 Aug 14 nicklas 57         <div class="step-title">Report parameters</div>
2608 28 Aug 14 nicklas 58         <div class="step-content">
2608 28 Aug 14 nicklas 59
2608 28 Aug 14 nicklas 60           <table class="step-form" id="report-type-scanbquartermonthreport">            
2608 28 Aug 14 nicklas 61           <tr>
2608 28 Aug 14 nicklas 62             <td class="prompt">Report period</td>
2608 28 Aug 14 nicklas 63             <td valign="top" class="input">
2608 28 Aug 14 nicklas 64               From <input type="text" name="fromdate" id="fromdate" 
2608 28 Aug 14 nicklas 65                 style="width: 8em;" maxlength="8">&nbsp;
2608 28 Aug 14 nicklas 66               To <input type="text" name="todate" id="todate" 
2608 28 Aug 14 nicklas 67                 style="width: 8em;" maxlength="8">
2608 28 Aug 14 nicklas 68             </td>
2608 28 Aug 14 nicklas 69             <td class="status" id="period.status"></td>
2608 28 Aug 14 nicklas 70             <td class="help">
2608 28 Aug 14 nicklas 71               <span id="period.message" class="message"></span>
2608 28 Aug 14 nicklas 72               [YY]YYMMDD. Define which period the report should cover. 
2608 28 Aug 14 nicklas 73               Empty fields will include all items.
2608 28 Aug 14 nicklas 74             </td>
2608 28 Aug 14 nicklas 75           </tr>  
2608 28 Aug 14 nicklas 76           <tr>
2608 28 Aug 14 nicklas 77             <td class="prompt">View type</td>
1820 06 Feb 13 olle 78             <td class="input">
2608 28 Aug 14 nicklas 79               <select name="viewtype" id="viewtype" style="width: 15em;">
2608 28 Aug 14 nicklas 80                 <option value="QUARTERMONTH" selected="yes">Quarter + Month</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 81                 <option value="AUTO">Auto</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 82                 <option value="WEEK">Week</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 83                 <option value="MONTH">Month</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 84                 <option value="QUARTER">Quarter</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 85                 <option value="YEAR">Year</option>
1820 06 Feb 13 olle 86               </select>
1820 06 Feb 13 olle 87             </td>
2608 28 Aug 14 nicklas 88             <td class="status" id="viewtype.status"></td>
1820 06 Feb 13 olle 89             <td class="help">
2608 28 Aug 14 nicklas 90               <span id="viewtype.message" class="message"></span>
2608 28 Aug 14 nicklas 91               Auto will adjust the report depending on the size of the period.
2608 28 Aug 14 nicklas 92               <ul>
2608 28 Aug 14 nicklas 93                 <li>Period shorter than 13 months - samples per month</li>
2608 28 Aug 14 nicklas 94                 <li>Period shorter than 3 years - samples per quarter</li>
2608 28 Aug 14 nicklas 95                 <li>Period is 3 years or greater - samples per year</li>
2608 28 Aug 14 nicklas 96               </ul>
1820 06 Feb 13 olle 97             </td>
1820 06 Feb 13 olle 98           </tr>
2608 28 Aug 14 nicklas 99           
2608 28 Aug 14 nicklas 100           <tr>
2608 28 Aug 14 nicklas 101             <td class="prompt">Chart site</td>
2608 28 Aug 14 nicklas 102             <td class="input">
2608 28 Aug 14 nicklas 103               <select id="sites" name="sites" style="width: 15em;"></select>
2608 28 Aug 14 nicklas 104             </td>
2608 28 Aug 14 nicklas 105             <td class="status" id="sites.status"></td>
2608 28 Aug 14 nicklas 106             <td class="help">
2608 28 Aug 14 nicklas 107               <span id="sites.message" class="message"></span>
2608 28 Aug 14 nicklas 108               Select what site to take input data from.
2608 28 Aug 14 nicklas 109             </td>
2608 28 Aug 14 nicklas 110           </tr>
2608 28 Aug 14 nicklas 111           
2608 28 Aug 14 nicklas 112           <tr>
2608 28 Aug 14 nicklas 113             <td class="prompt">Chart data</td>
2608 28 Aug 14 nicklas 114             <td class="input">
2608 28 Aug 14 nicklas 115               <select name="chartvariant">
2608 28 Aug 14 nicklas 116                 <option value="allcharts" selected="yes">All</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 117                 <option value="originalquantitytissue">Original quantity tissue</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 118                 <option value="quantitytissueused">Quantity tissue used for SCAN-B specimens</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 119                 <option value="histologypiecequantity">Histology piece quantity</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 120                 <option value="remainingquantityforscanbspecimen">Remaining quantity for SCAN-B specimens</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 121                 <option value="originalquantitydna">Original quantity DNA for SCAN-B extractions</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 122                 <option value="originalquantityrna">Original quantity RNA for SCAN-B extractions</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 123                 <option value="dnayield">DNA yield</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 124                 <option value="rnayield">RNA yield</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 125                 <option value="dnayieldcorrected">DNA yield (corrected for only processing half of the lysate volume)</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 126                 <option value="rnayieldcorrected">RNA yield (corrected for only processing half of the lysate volume)</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 127                 <option value="rnaqc">RNA QC</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 128                 <option value="minutestornalater">Min to RNAlater</option>
2608 28 Aug 14 nicklas 129               </select>
2608 28 Aug 14 nicklas 130             </td>
2608 28 Aug 14 nicklas 131             <td valign="top" class="status" id="chartvariant.status"></td>
2608 28 Aug 14 nicklas 132             <td class="help">
2608 28 Aug 14 nicklas 133               <span id="chartvariant.message" class="message"></span>
2608 28 Aug 14 nicklas 134               Select what data to report.
2608 28 Aug 14 nicklas 135             </td>
2608 28 Aug 14 nicklas 136           </tr>
1820 06 Feb 13 olle 137           </table>
2608 28 Aug 14 nicklas 138         </div>
2608 28 Aug 14 nicklas 139       </div>
1820 06 Feb 13 olle 140       
2608 28 Aug 14 nicklas 141       <div class="step" id="step-2">
2608 28 Aug 14 nicklas 142         <div class="step-no">2</div>
2608 28 Aug 14 nicklas 143         <div class="step-title">Generated report
2608 28 Aug 14 nicklas 144           <span id="printButton" class="link"><img src="../images/print.png">Print version&hellip;</span>
2608 28 Aug 14 nicklas 145         </div>
2608 28 Aug 14 nicklas 146         <div class="step-content" id="step-2-content">
2608 28 Aug 14 nicklas 147           <div id="reportdiv" style="text-align: center;"></div>
2608 28 Aug 14 nicklas 148         </div>
1820 06 Feb 13 olle 149       </div>
1820 06 Feb 13 olle 150       
2608 28 Aug 14 nicklas 151     
2608 28 Aug 14 nicklas 152     <div id="wizard-status"></div>
3907 29 Apr 16 nicklas 153     <div id="wizard-progress"></div>
2608 28 Aug 14 nicklas 154
2608 28 Aug 14 nicklas 155     <table class="navigation" id="navigation">
2608 28 Aug 14 nicklas 156     <tr>
2608 28 Aug 14 nicklas 157       <td><base:button id="gocancel" title="Cancel" /></td>
2608 28 Aug 14 nicklas 158       <td><base:button id="gonext" title="Next" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
2608 28 Aug 14 nicklas 159       <td><base:button id="gocreate" title="Generate" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
2608 28 Aug 14 nicklas 160       <td><base:button id="gorestart" title="Restart" image="<%=home+"/images/goback.png"%>" /></td>
2608 28 Aug 14 nicklas 161       <td id="gonext-message" class="message"></td>
2608 28 Aug 14 nicklas 162     </tr>
2608 28 Aug 14 nicklas 163     </table>
2608 28 Aug 14 nicklas 164   
2608 28 Aug 14 nicklas 165     
1820 06 Feb 13 olle 166     </form>
1820 06 Feb 13 olle 167     </div>
1820 06 Feb 13 olle 168     
1820 06 Feb 13 olle 169   </base:body>
1820 06 Feb 13 olle 170   </base:page>
1820 06 Feb 13 olle 171   <%
1820 06 Feb 13 olle 172 }
1820 06 Feb 13 olle 173 finally
1820 06 Feb 13 olle 174 {
1820 06 Feb 13 olle 175   if (dc != null) dc.close();
1820 06 Feb 13 olle 176 }
1820 06 Feb 13 olle 177 %>

Generated on Tue Nov 21 03:31:46 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)