extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/resources/sampleproc/lysate_reextraction.jsp

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4089 08 Sep 16 nicklas 18 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(request, "net.sf.basedb.reggie", true);
4089 08 Sep 16 nicklas 19 final String ID = sc.getId();
4089 08 Sep 16 nicklas 20 final float scale = Base.getScale(sc);
4089 08 Sep 16 nicklas 21 final String home = ExtensionsControl.getHomeUrl("net.sf.basedb.reggie");
4089 08 Sep 16 nicklas 22 DbControl dc = null;
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4089 08 Sep 16 nicklas 25   dc = sc.newDbControl();
4089 08 Sep 16 nicklas 26   final Extension reggie = ExtensionsControl.get(dc).getExtension("net.sf.basedb.reggie");
4089 08 Sep 16 nicklas 27   final User user = User.getById(dc, sc.getLoggedInUserId());
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4089 08 Sep 16 nicklas 66   <p:path><p:pathelement 
4089 08 Sep 16 nicklas 67     title="Reggie" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" 
4089 08 Sep 16 nicklas 68     /><p:pathelement title="Pick lysate for re-extraction" 
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4089 08 Sep 16 nicklas 71   <div class="content">
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4089 08 Sep 16 nicklas 73   <div id="page-data" class="datacontainer"
4089 08 Sep 16 nicklas 74     data-home-url="<%=home%>"
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4089 08 Sep 16 nicklas 77   <form name="reggie" id="wizard" class="wizard">
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4089 08 Sep 16 nicklas 79   <div class="step auto-hide" id="step-1">
4089 08 Sep 16 nicklas 80     <div class="step-no">1</div>
4089 08 Sep 16 nicklas 81     <div class="step-title">Select lysates that should be picked</div>
4089 08 Sep 16 nicklas 82     <div class="step-content">
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4089 08 Sep 16 nicklas 84       <table class="step-form">
4089 08 Sep 16 nicklas 85       <tr class="align-top">
4089 08 Sep 16 nicklas 86         <td class="prompt">Lysates</td>
4089 08 Sep 16 nicklas 87         <td class="input">
4089 08 Sep 16 nicklas 88           <select name="lysates" id="lysates" class="yellow-label-support" multiple size="15""></select>
4089 08 Sep 16 nicklas 89         </td>
4089 08 Sep 16 nicklas 90         <td class="status" id="lysates.status"></td>
4089 08 Sep 16 nicklas 91         <td class="help">
4089 08 Sep 16 nicklas 92           <span id="lysates.message" class="message" ></span>
4089 08 Sep 16 nicklas 93           The list contain Lysate items that has been selected for
4089 08 Sep 16 nicklas 94           re-extraction (determined by 'AutoProcessing' annotation).<br>
4089 08 Sep 16 nicklas 95           <base:icon image="<%=home+"/images/yellow-label.png"%>" /> = YellowLabel specimen
4089 08 Sep 16 nicklas 96         </td>
4089 08 Sep 16 nicklas 97       </tr>
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4089 08 Sep 16 nicklas 99     </div>
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4089 08 Sep 16 nicklas 101   
4089 08 Sep 16 nicklas 102   <div class="step" id="step-2">
4089 08 Sep 16 nicklas 103     <div class="step-no">2</div>
4089 08 Sep 16 nicklas 104     <div class="step-title">Lysate pick-list protocol</div>
4089 08 Sep 16 nicklas 105     <div class="step-content">
4089 08 Sep 16 nicklas 106       <div class="messagecontainer note" style="margin: 2em; width: 50%; padding: 1em; font-weight: bold;">
4089 08 Sep 16 nicklas 107         It is important that this protocol is printed before 
4089 08 Sep 16 nicklas 108         registration, since the storage locations are replaced 
4089 08 Sep 16 nicklas 109         with the new locations.
4089 08 Sep 16 nicklas 110       </div>
4089 08 Sep 16 nicklas 111       <div id="full-protocol" class="topborder">
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4089 08 Sep 16 nicklas 113         <div id="protocol-header">
4089 08 Sep 16 nicklas 114         <h1>Pick list protocol for lysate re-extraction <span class="reggie">Reggie <%=reggie.getAbout().getVersion() %></span></h1>
4089 08 Sep 16 nicklas 115         </div>
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6722 04 May 22 nicklas 117         <div id="protocol-table" class="nolabels">
6722 04 May 22 nicklas 118           <table id="lysateTable">
6722 04 May 22 nicklas 119           <thead class="bg-filled-100">
6722 04 May 22 nicklas 120             <tr>
6722 04 May 22 nicklas 121             <th>Lysate</th>
6722 04 May 22 nicklas 122             <th class="label">Label¹</th>
6722 04 May 22 nicklas 123             <th>Freezer</th>
6722 04 May 22 nicklas 124             <th>Box</th>
6722 04 May 22 nicklas 125             <th>New box</th>
6722 04 May 22 nicklas 126             <th>Remaing quantity</th>
6722 04 May 22 nicklas 127             <th>Remark</th>
6722 04 May 22 nicklas 128             </tr>
6722 04 May 22 nicklas 129           </thead>
6722 04 May 22 nicklas 130           <tbody id="lysateList"></tbody>
6722 04 May 22 nicklas 131           </table>
6722 04 May 22 nicklas 132           
6722 04 May 22 nicklas 133           <div id="protocol-footer" class="label">
6722 04 May 22 nicklas 134             ¹ Some SCAN-B tubes have a non-standard label.
6722 04 May 22 nicklas 135           </div>
6722 04 May 22 nicklas 136         </div>
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4089 08 Sep 16 nicklas 138     </div>
4089 08 Sep 16 nicklas 139   </div>
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4089 08 Sep 16 nicklas 142   <table class="navigation" id="navigation">
4089 08 Sep 16 nicklas 143   <tr>
4089 08 Sep 16 nicklas 144     <td><base:button id="gocancel" title="Cancel" /></td>
4089 08 Sep 16 nicklas 145     <td><base:button id="gonext" title="Next" image="<%=home+"/images/gonext.png"%>" /></td>
4089 08 Sep 16 nicklas 146     <td><base:button id="goregister" title="Register" image="<%=home+"/images/import.png"%>"  /></td>
4089 08 Sep 16 nicklas 147     <td><base:button id="goprint" title="Print&hellip;" image="<%=home+"/images/print.png"%>" /></td>
4089 08 Sep 16 nicklas 148     <td><base:button id="gorestart" title="Restart" image="<%=home+"/images/goback.png"%>" /></td>
4089 08 Sep 16 nicklas 149     <td id="gonext-message" class="message"></td>
4089 08 Sep 16 nicklas 150   </tr>
4089 08 Sep 16 nicklas 151   </table>
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