extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/src/net/sf/basedb/reggie/dao/Consent.java

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1524 25 Jan 12 nicklas 1 package net.sf.basedb.reggie.dao;
1524 25 Jan 12 nicklas 2
1524 25 Jan 12 nicklas 3 import net.sf.basedb.core.DbControl;
1524 25 Jan 12 nicklas 4 import net.sf.basedb.core.Sample;
1524 25 Jan 12 nicklas 5 import net.sf.basedb.reggie.Reggie;
3845 14 Apr 16 nicklas 6 import net.sf.basedb.reggie.projectarchive.ProjectArchiveService;
1524 25 Jan 12 nicklas 7
1524 25 Jan 12 nicklas 8 /**
1524 25 Jan 12 nicklas 9   Class for handling information related to consent information.
1524 25 Jan 12 nicklas 10   
1524 25 Jan 12 nicklas 11   @author nicklas
1524 25 Jan 12 nicklas 12   @since 2.2
1524 25 Jan 12 nicklas 13 */
1524 25 Jan 12 nicklas 14 public class Consent 
1524 25 Jan 12 nicklas 15 {
1524 25 Jan 12 nicklas 16
1524 25 Jan 12 nicklas 17   /**
1524 25 Jan 12 nicklas 18     Load all consent-related annotations for the given item.
1524 25 Jan 12 nicklas 19   */
3572 02 Nov 15 nicklas 20   public static void loadConsentAnnotations(DbControl dc, ReggieItem<?> item)
1524 25 Jan 12 nicklas 21   {
1610 23 Apr 12 nicklas 22     item.loadAnnotations(dc, "consent", Annotationtype.CONSENT, null);
1610 23 Apr 12 nicklas 23     item.loadAnnotations(dc, "consentDate", Annotationtype.CONSENT_DATE, Reggie.CONVERTER_DATE_TO_STRING);
1524 25 Jan 12 nicklas 24   }
1524 25 Jan 12 nicklas 25
1524 25 Jan 12 nicklas 26   
1524 25 Jan 12 nicklas 27   /**
1524 25 Jan 12 nicklas 28     Copy all consent-related annotations from one item to the other.
5277 05 Feb 19 nicklas 29      @param force TRUE to overwrite existing annotations, FALSE to not
5277 05 Feb 19 nicklas 30      @return TRUE if any of the consent information was changed, FALSE if no
1524 25 Jan 12 nicklas 31   */
5277 05 Feb 19 nicklas 32   public static boolean copyConsentAnnotations(DbControl dc, Sample from, Sample to, boolean force)
1524 25 Jan 12 nicklas 33   {
5277 05 Feb 19 nicklas 34     boolean copiedConsent = Annotationtype.CONSENT.copyAnnotationValues(dc, from, to, force);
5277 05 Feb 19 nicklas 35     boolean copiedDate = Annotationtype.CONSENT_DATE.copyAnnotationValues(dc, from, to, force);
3845 14 Apr 16 nicklas 36     ProjectArchiveService.getInstance().setForceCheck();
5277 05 Feb 19 nicklas 37     return copiedConsent || copiedDate;
1524 25 Jan 12 nicklas 38   }
1524 25 Jan 12 nicklas 39   
2839 20 Oct 14 olle 40   /**
2839 20 Oct 14 olle 41     Flag value for the {@link Annotationtype#FLAG} annotation when an
2839 20 Oct 14 olle 42     item has been flagged to be connected to a retracted consent,
2839 20 Oct 14 olle 43     or having been erroneously included, without a consent.
2839 20 Oct 14 olle 44     @since 2.17
2839 20 Oct 14 olle 45    */
2839 20 Oct 14 olle 46   public static final String FLAG_RETRACTED = "Retracted";
2839 20 Oct 14 olle 47
1524 25 Jan 12 nicklas 48 }

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