extensions/net.sf.basedb.reggie/trunk/src/net/sf/basedb/reggie/plugins/release/CohortAnnotationType.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
4379 06 Mar 17 nicklas 1 package net.sf.basedb.reggie.plugins.release;
4379 06 Mar 17 nicklas 2
4437 31 Mar 17 nicklas 3 import java.util.Arrays;
4379 06 Mar 17 nicklas 4 import java.util.List;
4379 06 Mar 17 nicklas 5
4379 06 Mar 17 nicklas 6 import org.json.simple.JSONArray;
4379 06 Mar 17 nicklas 7 import org.json.simple.JSONObject;
4379 06 Mar 17 nicklas 8
4379 06 Mar 17 nicklas 9 import net.sf.basedb.core.Item;
4379 06 Mar 17 nicklas 10 import net.sf.basedb.core.Type;
4462 21 Apr 17 nicklas 11 import net.sf.basedb.core.Unit;
4379 06 Mar 17 nicklas 12
4379 06 Mar 17 nicklas 13 /**
4408 20 Mar 17 nicklas 14   Basic type-def implementation of an annotation type used
4408 20 Mar 17 nicklas 15   in the cohort data. Required properties are set by the constructor. 
4408 20 Mar 17 nicklas 16   Other properties can be set by setter methods.
4379 06 Mar 17 nicklas 17
4379 06 Mar 17 nicklas 18   @author nicklas
4379 06 Mar 17 nicklas 19   @since 4.10
4379 06 Mar 17 nicklas 20 */
4469 26 Apr 17 nicklas 21 public class CohortAnnotationType 
4408 20 Mar 17 nicklas 22   implements CohortTypeDef
4379 06 Mar 17 nicklas 23 {
4379 06 Mar 17 nicklas 24
4513 31 May 17 nicklas 25   private String name;
4379 06 Mar 17 nicklas 26   private final Type valueType;
4379 06 Mar 17 nicklas 27   private final Item itemType;
4379 06 Mar 17 nicklas 28   private final String subtype;
4379 06 Mar 17 nicklas 29   private List<?> enumeration;
4389 09 Mar 17 nicklas 30   private boolean projectSpecificValues;
4462 21 Apr 17 nicklas 31   private Unit unit;
4379 06 Mar 17 nicklas 32   
4469 26 Apr 17 nicklas 33   public CohortAnnotationType(String name, Type valueType, Item itemType, String subtype)
4379 06 Mar 17 nicklas 34   {
4379 06 Mar 17 nicklas 35     this.name = name;
4379 06 Mar 17 nicklas 36     this.valueType = valueType;
4379 06 Mar 17 nicklas 37     this.itemType = itemType;
4379 06 Mar 17 nicklas 38     this.subtype = subtype;
4379 06 Mar 17 nicklas 39   }
4379 06 Mar 17 nicklas 40   
4379 06 Mar 17 nicklas 41   @Override
4379 06 Mar 17 nicklas 42   public String getName() 
4379 06 Mar 17 nicklas 43   {
4379 06 Mar 17 nicklas 44     return name;
4379 06 Mar 17 nicklas 45   }
4513 31 May 17 nicklas 46   
4513 31 May 17 nicklas 47   public CohortAnnotationType rename(String name)
4513 31 May 17 nicklas 48   {
4513 31 May 17 nicklas 49     this.name = name;
4513 31 May 17 nicklas 50     return this;
4513 31 May 17 nicklas 51   }
4379 06 Mar 17 nicklas 52
4469 26 Apr 17 nicklas 53   public CohortAnnotationType setEnumeration(List<?> values)
4379 06 Mar 17 nicklas 54   {
4379 06 Mar 17 nicklas 55     this.enumeration = values;
4469 26 Apr 17 nicklas 56     return this;
4379 06 Mar 17 nicklas 57   }
4379 06 Mar 17 nicklas 58   
4469 26 Apr 17 nicklas 59   public CohortAnnotationType setEnumeration(String... values)
4437 31 Mar 17 nicklas 60   {
4437 31 Mar 17 nicklas 61     this.enumeration = Arrays.asList(values);
4469 26 Apr 17 nicklas 62     return this;
4437 31 Mar 17 nicklas 63   }
4437 31 Mar 17 nicklas 64   
4469 26 Apr 17 nicklas 65   public CohortAnnotationType setProjectSpecificValues(boolean projectSpecificValues)
4389 09 Mar 17 nicklas 66   {
4389 09 Mar 17 nicklas 67     this.projectSpecificValues = projectSpecificValues;
4469 26 Apr 17 nicklas 68     return this;
4389 09 Mar 17 nicklas 69   }
4389 09 Mar 17 nicklas 70   
4469 26 Apr 17 nicklas 71   public CohortAnnotationType setUnit(Unit unit)
4462 21 Apr 17 nicklas 72   {
4462 21 Apr 17 nicklas 73     this.unit = unit;
4469 26 Apr 17 nicklas 74     return this;
4462 21 Apr 17 nicklas 75   }
4462 21 Apr 17 nicklas 76   
4379 06 Mar 17 nicklas 77   @Override
4379 06 Mar 17 nicklas 78   public JSONObject toJSONObject()
4379 06 Mar 17 nicklas 79   {
4379 06 Mar 17 nicklas 80     JSONObject json = new JSONObject();
4379 06 Mar 17 nicklas 81     
4407 20 Mar 17 nicklas 82     json.put("type", Item.ANNOTATIONTYPE.name());
4379 06 Mar 17 nicklas 83     json.put("name", name);
4379 06 Mar 17 nicklas 84     json.put("valueType", valueType.name());
4379 06 Mar 17 nicklas 85     json.put("itemType", itemType.name());
4402 17 Mar 17 nicklas 86     if (subtype != null)
4402 17 Mar 17 nicklas 87     {
4402 17 Mar 17 nicklas 88       json.put("subtype", subtype);
4402 17 Mar 17 nicklas 89     }
4389 09 Mar 17 nicklas 90     if (projectSpecificValues)
4389 09 Mar 17 nicklas 91     {
4389 09 Mar 17 nicklas 92       json.put("projectSpecificValues", true);
4389 09 Mar 17 nicklas 93     }
4379 06 Mar 17 nicklas 94     
4379 06 Mar 17 nicklas 95     if (enumeration != null && enumeration.size() > 0)
4379 06 Mar 17 nicklas 96     {
4379 06 Mar 17 nicklas 97       JSONArray jsonEnum = new JSONArray();
4379 06 Mar 17 nicklas 98       jsonEnum.addAll(enumeration);
4379 06 Mar 17 nicklas 99       json.put("enumeration", jsonEnum);
4379 06 Mar 17 nicklas 100     }
4379 06 Mar 17 nicklas 101     
4462 21 Apr 17 nicklas 102     if (unit != null)
4462 21 Apr 17 nicklas 103     {
4462 21 Apr 17 nicklas 104       JSONObject jsonUnit = new JSONObject();
4462 21 Apr 17 nicklas 105       jsonUnit.put("symbol", unit.getDisplaySymbol());
4462 21 Apr 17 nicklas 106       jsonUnit.put("quantity", unit.getQuantity().getSystemId());
4462 21 Apr 17 nicklas 107       json.put("unit", jsonUnit);
4462 21 Apr 17 nicklas 108     }
4462 21 Apr 17 nicklas 109     
4379 06 Mar 17 nicklas 110     return json;
4379 06 Mar 17 nicklas 111   }
4379 06 Mar 17 nicklas 112
4379 06 Mar 17 nicklas 113 }

Generated on Tue Nov 21 03:34:30 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)