plugins/base1/se.lu.onk.MergeBioAssay/trunk/doc/run

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
60 12 Jan 06 enell 1 #!/bin/bash -
787 18 Sep 08 jari 2 #
783 18 Sep 08 jari 3 #  $Id$
783 18 Sep 08 jari 4 #
787 18 Sep 08 jari 5 # Copyright (C) 2006 Johan Enell
783 18 Sep 08 jari 6 # Copyright (C) 2008 Jari Häkkinen
783 18 Sep 08 jari 7 #
783 18 Sep 08 jari 8 # This file is part of the se.lu.onk.MergeBioAssay plug-in for
783 18 Sep 08 jari 9 # BASE. Available at http://baseplugins.thep.lu.se/ and BASE web site
783 18 Sep 08 jari 10 # is http://base.thep.lu.se
783 18 Sep 08 jari 11 #
783 18 Sep 08 jari 12 # This is free software; you can redistribute it and/or modify it
783 18 Sep 08 jari 13 # under the terms of the GNU General Public License as published by
783 18 Sep 08 jari 14 # the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or
783 18 Sep 08 jari 15 # (at your option) any later version.
783 18 Sep 08 jari 16 #
783 18 Sep 08 jari 17 # The software is distributed in the hope that it will be useful, but
783 18 Sep 08 jari 18 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
783 18 Sep 08 jari 19 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
783 18 Sep 08 jari 20 # General Public License for more details.
783 18 Sep 08 jari 21 #
783 18 Sep 08 jari 22 # You should have received a copy of the GNU General Public License
783 18 Sep 08 jari 23 # along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
783 18 Sep 08 jari 24 #
60 12 Jan 06 enell 25
60 12 Jan 06 enell 26 progdir="`dirname \"$0\"`"
779 18 Sep 08 jari 27 java -cp "$CLASSPATH:$progdir/BaseFile/BaseFile.jar:$progdir/MergeBioAssay.jar" mergebioassay/MergeBioAssay stdin.txt