plugins/base1/se.lu.onk/trunk/NullPlugin/src/base1null/Spot.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
116 26 Jun 06 enell 1 /*
116 26 Jun 06 enell 2   $Id$
116 26 Jun 06 enell 3
116 26 Jun 06 enell 4   Copyright (C) 2006 Johan Enell
116 26 Jun 06 enell 5
116 26 Jun 06 enell 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
116 26 Jun 06 enell 7   Available at http://base.thep.lu.se/
116 26 Jun 06 enell 8
116 26 Jun 06 enell 9   BASE is free software; you can redistribute it and/or modify it
116 26 Jun 06 enell 10   under the terms of the GNU General Public License as published by
116 26 Jun 06 enell 11   the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
116 26 Jun 06 enell 12   (at your option) any later version.
116 26 Jun 06 enell 13
116 26 Jun 06 enell 14   BASE is distributed in the hope that it will be useful, but
116 26 Jun 06 enell 15   WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
116 26 Jun 06 enell 16   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
116 26 Jun 06 enell 17   General Public License for more details.
116 26 Jun 06 enell 18
116 26 Jun 06 enell 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
116 26 Jun 06 enell 20   along with this program; if not, write to the Free Software
116 26 Jun 06 enell 21   Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA
116 26 Jun 06 enell 22   02111-1307, USA.
116 26 Jun 06 enell 23 */
118 26 Jun 06 enell 24 package base1null;
116 26 Jun 06 enell 25
116 26 Jun 06 enell 26 public class Spot
116 26 Jun 06 enell 27 {
116 26 Jun 06 enell 28
116 26 Jun 06 enell 29   private final float int1;
116 26 Jun 06 enell 30   private final float int2;
116 26 Jun 06 enell 31
116 26 Jun 06 enell 32   public Spot(float int1, float int2)
116 26 Jun 06 enell 33   {
116 26 Jun 06 enell 34     this.int1 = int1;
116 26 Jun 06 enell 35     // TODO Auto-generated constructor stub
116 26 Jun 06 enell 36     this.int2 = int2;
116 26 Jun 06 enell 37   }
116 26 Jun 06 enell 38
116 26 Jun 06 enell 39   public final float getInt1()
116 26 Jun 06 enell 40   {
116 26 Jun 06 enell 41     return int1;
116 26 Jun 06 enell 42   }
116 26 Jun 06 enell 43
116 26 Jun 06 enell 44   public final float getInt2()
116 26 Jun 06 enell 45   {
116 26 Jun 06 enell 46     return int2;
116 26 Jun 06 enell 47   }
116 26 Jun 06 enell 48   
116 26 Jun 06 enell 49   public final float getM()
116 26 Jun 06 enell 50   {
116 26 Jun 06 enell 51     return (float) (Math.log(getInt1()/getInt2())/Math.log(2));
116 26 Jun 06 enell 52   }
116 26 Jun 06 enell 53   
116 26 Jun 06 enell 54   public final float getA()
116 26 Jun 06 enell 55   {
116 26 Jun 06 enell 56     return (float) Math.log10(Math.sqrt(getInt1() * getInt2()));
116 26 Jun 06 enell 57   }
116 26 Jun 06 enell 58 }

Generated on Tue Nov 21 03:40:44 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)