plugins/base1/se.lu.thep.wenni/trunk/lib/weight.h

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
69 11 Feb 06 jari 1 // $Id$
69 11 Feb 06 jari 2
95 05 Apr 06 jari 3 /*
95 05 Apr 06 jari 4   Copyright (C) 2005, 2006 Jari Häkkinen, Peter Johansson
95 05 Apr 06 jari 5
95 05 Apr 06 jari 6   This file is part of WeNNI,
825 26 Nov 08 jari 7   http://baseplugins.thep.lu.se/wiki/se.lu.thep.WeNNI
95 05 Apr 06 jari 8
95 05 Apr 06 jari 9   WeNNI is free software; you can redistribute it and/or modify it
95 05 Apr 06 jari 10   under the terms of the GNU General Public License as published by
824 26 Nov 08 jari 11   the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or
95 05 Apr 06 jari 12   (at your option) any later version.
95 05 Apr 06 jari 13
95 05 Apr 06 jari 14   WeNNI is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
95 05 Apr 06 jari 15   ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
95 05 Apr 06 jari 16   or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public
95 05 Apr 06 jari 17   License for more details.
95 05 Apr 06 jari 18
95 05 Apr 06 jari 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
824 26 Nov 08 jari 20   along with WeNNI. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
95 05 Apr 06 jari 21 */
95 05 Apr 06 jari 22
69 11 Feb 06 jari 23 #ifndef _thep_lu_se_wenni_weight_ 
69 11 Feb 06 jari 24 #define _thep_lu_se_wenni_weight_ 
69 11 Feb 06 jari 25
69 11 Feb 06 jari 26 #include <c++_tools/gslapi/matrix.h>
69 11 Feb 06 jari 27
69 11 Feb 06 jari 28 namespace theplu {
69 11 Feb 06 jari 29 namespace wenni {  
69 11 Feb 06 jari 30 namespace weight {
69 11 Feb 06 jari 31
69 11 Feb 06 jari 32   ///
69 11 Feb 06 jari 33   /// The snr is defined using the foreground, background, and
69 11 Feb 06 jari 34   /// standard deviation of the background as \f$ (fg-bg)/bgstd \f$ if
69 11 Feb 06 jari 35   /// \a fg is larger than \a bg, 0 otherwise.
69 11 Feb 06 jari 36   ///
69 11 Feb 06 jari 37   inline double get_snr(const double fg, const double bg, const double bgstd)
69 11 Feb 06 jari 38   { return ((fg>bg) ? (fg-bg)/bgstd : 0.0); }
69 11 Feb 06 jari 39
69 11 Feb 06 jari 40   ///
73 14 Feb 06 jari 41   /// @return A non-zero weight if \a snr is a non-zero positive
73 14 Feb 06 jari 42   /// number, zero otherwise.
69 11 Feb 06 jari 43   ///
73 14 Feb 06 jari 44   inline const double weight_SNR(const double snr, const double beta=0.6)
74 15 Feb 06 jari 45   { return (snr>0) ? 1.0/(1.0+beta*beta/snr/snr) : 0.0;}
69 11 Feb 06 jari 46
69 11 Feb 06 jari 47   ///
73 14 Feb 06 jari 48   /// @return The weight matrix from a \a snr matrix. Indivividual
73 14 Feb 06 jari 49   /// weight elements are computed with function weight_SNR(const
73 14 Feb 06 jari 50   /// double snr, const double beta=0.6).
69 11 Feb 06 jari 51   ///
69 11 Feb 06 jari 52   inline gslapi::matrix weight_SNR(const theplu::gslapi::matrix& snr, 
73 14 Feb 06 jari 53                                    const double beta=0.6)
69 11 Feb 06 jari 54   {
69 11 Feb 06 jari 55     gslapi::matrix w(snr.rows(), snr.columns());
69 11 Feb 06 jari 56     for (size_t i=0; i<w.rows(); i++) 
69 11 Feb 06 jari 57       for (size_t j=0; j<w.columns(); j++) 
73 14 Feb 06 jari 58         w(i,j)=weight_SNR(snr(i,j),beta);
69 11 Feb 06 jari 59     return w;
69 11 Feb 06 jari 60   }
69 11 Feb 06 jari 61
69 11 Feb 06 jari 62   ///
73 14 Feb 06 jari 63   /// @return A non-zero weight if \a snr1 and \a snr2 are both
73 14 Feb 06 jari 64   /// non-zero positive numbers, zero otherwise.
69 11 Feb 06 jari 65   ///
69 11 Feb 06 jari 66   inline double weight_SNR2(const double snr1, const double snr2,
73 14 Feb 06 jari 67                             const double beta=0.6)
73 14 Feb 06 jari 68   { return (((snr1>0) && (snr2>0)) ?
73 14 Feb 06 jari 69             1.0/(1+beta*beta/snr1/snr1+beta*beta/snr2/snr2) : 0.0); }
69 11 Feb 06 jari 70
69 11 Feb 06 jari 71 }}} // of namespace weight, wenni, and theplu
69 11 Feb 06 jari 72
69 11 Feb 06 jari 73 #endif
69 11 Feb 06 jari 74

Generated on Tue Nov 21 03:42:31 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)