plugins/base2/net.sf.basedb.illumina/trunk/build.xml

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
546 18 Jan 08 nicklas 1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
703 23 May 08 jari 2
703 23 May 08 jari 3 <!-- $Id$ -->
703 23 May 08 jari 4
546 18 Jan 08 nicklas 5 <project 
546 18 Jan 08 nicklas 6   name="IlluminaPlugins" 
546 18 Jan 08 nicklas 7   default="dist" 
546 18 Jan 08 nicklas 8   basedir=".">
546 18 Jan 08 nicklas 9
807 21 Oct 08 nicklas 10   <!--create this file if you need to override values from properties below -->
807 21 Oct 08 nicklas 11   <property file="build.properties" />
807 21 Oct 08 nicklas 12
807 21 Oct 08 nicklas 13   
546 18 Jan 08 nicklas 14   <!-- variables used -->
546 18 Jan 08 nicklas 15   <property name="name" value="illumina-plugins" />
1448 02 Nov 11 nicklas 16   <property name="version" value="1.8-dev" />
546 18 Jan 08 nicklas 17   <property name="src" location="src" description="Location of source files" />
546 18 Jan 08 nicklas 18   <property name="build" location="build" description="Location of compiled files" />
546 18 Jan 08 nicklas 19   <property name="dist" location="dist" description="Directory where distribution should be created" />
546 18 Jan 08 nicklas 20   <property name="package" location="package" description="Directory where packaged distribution files are created"/>
1542 22 Feb 12 nicklas 21   <property name="jar.name" value="${name}.jar" description="Name of JAR file with the extensions." />
1542 22 Feb 12 nicklas 22   <property name="tar.prefix" value="${name}-${version}" description="Prefix of .tar.gz file for download." />
1542 22 Feb 12 nicklas 23   <property name="tar.name" value="${tar.prefix}.tar.gz" description="Full name of .tar.gz file for download." />
546 18 Jan 08 nicklas 24   <property name="javac.arg" value="-Xlint:unchecked" />
2283 13 Mar 14 nicklas 25   <property name="javac.source" value="1.7" />
2283 13 Mar 14 nicklas 26   <property name="javac.target" value="1.7" />
1032 07 Apr 09 nicklas 27   <property name="javac.encoding" value="UTF-8" />
1386 06 Sep 11 nicklas 28   <property name="depend.base-version" 
2283 13 Mar 14 nicklas 29     value="3.3.0" 
1386 06 Sep 11 nicklas 30     description="The BASE version that this project depends on."
1386 06 Sep 11 nicklas 31   />
807 21 Oct 08 nicklas 32   <property name="depend.jars" 
2756 08 Oct 14 nicklas 33     value="http://base.thep.lu.se/chrome/site/files/base/jars/${depend.base-version}" 
1386 06 Sep 11 nicklas 34     description="The location of the BASE core JARs that this project depends on."
807 21 Oct 08 nicklas 35   />
546 18 Jan 08 nicklas 36
546 18 Jan 08 nicklas 37   <!-- set up classpath for compiling -->
546 18 Jan 08 nicklas 38   <path id="classpath">
546 18 Jan 08 nicklas 39     <fileset dir="lib">
546 18 Jan 08 nicklas 40       <include name="**/*.jar" />
546 18 Jan 08 nicklas 41     </fileset>
546 18 Jan 08 nicklas 42   </path>
546 18 Jan 08 nicklas 43
546 18 Jan 08 nicklas 44   <target name="init">
546 18 Jan 08 nicklas 45     <mkdir dir="${build}" />
546 18 Jan 08 nicklas 46     <mkdir dir="${dist}" />
546 18 Jan 08 nicklas 47   </target>
546 18 Jan 08 nicklas 48     
546 18 Jan 08 nicklas 49   <target name="clean">
546 18 Jan 08 nicklas 50     <delete failonerror="false" includeemptydirs="true">
546 18 Jan 08 nicklas 51       <fileset dir="${build}" defaultexcludes="no" />
546 18 Jan 08 nicklas 52       <fileset dir="${dist}" defaultexcludes="no" />
546 18 Jan 08 nicklas 53       <fileset dir="${package}" defaultexcludes="no" />
546 18 Jan 08 nicklas 54     </delete>
546 18 Jan 08 nicklas 55   </target>
546 18 Jan 08 nicklas 56   
546 18 Jan 08 nicklas 57   <target 
546 18 Jan 08 nicklas 58     name="dist" 
629 13 Mar 08 nicklas 59     depends="clean,build"
546 18 Jan 08 nicklas 60     >
546 18 Jan 08 nicklas 61     <copy todir="${dist}">
629 13 Mar 08 nicklas 62       <fileset dir="." includes="README*,LICENSE,INSTALL" />
549 22 Jan 08 nicklas 63       <fileset dir="." includes="config/*" />
957 09 Feb 09 nicklas 64       <fileset dir="." includes="contrib/*" />
546 18 Jan 08 nicklas 65     </copy>
546 18 Jan 08 nicklas 66   </target>
546 18 Jan 08 nicklas 67   
546 18 Jan 08 nicklas 68   <target
546 18 Jan 08 nicklas 69     name="package"
629 13 Mar 08 nicklas 70     depends="dist"
546 18 Jan 08 nicklas 71     description="Create binary distribution package"
546 18 Jan 08 nicklas 72     >
546 18 Jan 08 nicklas 73     <mkdir dir="${package}" />
546 18 Jan 08 nicklas 74     <tar
1542 22 Feb 12 nicklas 75       destfile="${package}/${tar.name}"
546 18 Jan 08 nicklas 76       longfile="gnu"
546 18 Jan 08 nicklas 77       compression="gzip"
546 18 Jan 08 nicklas 78       >
546 18 Jan 08 nicklas 79       <tarfileset
546 18 Jan 08 nicklas 80         dir="${dist}"
546 18 Jan 08 nicklas 81         mode="755"
546 18 Jan 08 nicklas 82         prefix="${tar.prefix}"
546 18 Jan 08 nicklas 83         preserveLeadingSlashes="true"
546 18 Jan 08 nicklas 84         >
546 18 Jan 08 nicklas 85         <include name="**/*.sh" />
546 18 Jan 08 nicklas 86       </tarfileset>
546 18 Jan 08 nicklas 87       <tarfileset
546 18 Jan 08 nicklas 88         dir="${dist}"
546 18 Jan 08 nicklas 89         prefix="${tar.prefix}"
546 18 Jan 08 nicklas 90         preserveLeadingSlashes="true"
546 18 Jan 08 nicklas 91         >
546 18 Jan 08 nicklas 92         <exclude name="**/*.sh" />
546 18 Jan 08 nicklas 93       </tarfileset>
546 18 Jan 08 nicklas 94     </tar>
546 18 Jan 08 nicklas 95   </target>
546 18 Jan 08 nicklas 96   
546 18 Jan 08 nicklas 97   <target 
546 18 Jan 08 nicklas 98     name="build"
585 13 Feb 08 nicklas 99     depends="init,checkjar"
546 18 Jan 08 nicklas 100     description="Compiles the plugin and put in jar"
546 18 Jan 08 nicklas 101     >
629 13 Mar 08 nicklas 102     <property name="jar" value="${name}.jar" />
546 18 Jan 08 nicklas 103     <mkdir dir="${build}" />
546 18 Jan 08 nicklas 104     <javac 
546 18 Jan 08 nicklas 105       encoding="${javac.encoding}" 
546 18 Jan 08 nicklas 106       srcdir="${src}" 
546 18 Jan 08 nicklas 107       destdir="${build}" 
546 18 Jan 08 nicklas 108       debug="true" 
1386 06 Sep 11 nicklas 109       deprecation="true"
546 18 Jan 08 nicklas 110       classpathref="classpath"
546 18 Jan 08 nicklas 111       source="${javac.source}"
546 18 Jan 08 nicklas 112       target="${javac.target}"
1238 07 Sep 10 nicklas 113       includeantruntime="false"
546 18 Jan 08 nicklas 114       >
546 18 Jan 08 nicklas 115       <compilerarg value="${javac.arg}" />
546 18 Jan 08 nicklas 116     </javac>
546 18 Jan 08 nicklas 117     <copy todir="${build}">
1097 28 May 09 martin 118       <fileset dir="." includes="META-INF/*"/>
1385 02 Sep 11 martin 119     </copy>    
546 18 Jan 08 nicklas 120     <jar 
1542 22 Feb 12 nicklas 121       jarfile="${dist}/${jar.name}" 
1097 28 May 09 martin 122       basedir="${build}"
546 18 Jan 08 nicklas 123       >
1097 28 May 09 martin 124     </jar>      
546 18 Jan 08 nicklas 125   </target>
546 18 Jan 08 nicklas 126   
1542 22 Feb 12 nicklas 127   <target 
1542 22 Feb 12 nicklas 128     name="install"
1542 22 Feb 12 nicklas 129     depends="build"
1542 22 Feb 12 nicklas 130     >
1542 22 Feb 12 nicklas 131     <fail unless="base.plugins" message="base.plugins is not set to the path of BASE plug-ins directory." />
1542 22 Feb 12 nicklas 132     <copy todir="${base.plugins}">
1542 22 Feb 12 nicklas 133       <fileset file="${dist}/${jar.name}" />
1542 22 Feb 12 nicklas 134     </copy>
1542 22 Feb 12 nicklas 135     <echo>Copied '${jar.name}' to '${base.plugins}'.</echo>
1542 22 Feb 12 nicklas 136   </target>
1542 22 Feb 12 nicklas 137   
1238 07 Sep 10 nicklas 138   <target name="update-version">
1238 07 Sep 10 nicklas 139     <echo>Setting version to: ${version}</echo>
1238 07 Sep 10 nicklas 140     
1238 07 Sep 10 nicklas 141     <echo>Illumina.java</echo>
1238 07 Sep 10 nicklas 142     <replaceregexp 
1238 07 Sep 10 nicklas 143       file="${src}/net/sf/basedb/illumina/Illumina.java"
1238 07 Sep 10 nicklas 144       match="public static final String VERSION = &#34;.*&#34;;"
1238 07 Sep 10 nicklas 145       replace="public static final String VERSION = &#34;${version}&#34;;"
1238 07 Sep 10 nicklas 146       encoding="UTF-8"
1238 07 Sep 10 nicklas 147     />
1238 07 Sep 10 nicklas 148     
1238 07 Sep 10 nicklas 149     <echo>extensions.xml</echo>
1238 07 Sep 10 nicklas 150     <replaceregexp 
1238 07 Sep 10 nicklas 151       file="META-INF/extensions.xml"
1238 07 Sep 10 nicklas 152       match="&lt;version&gt;.*&lt;/version&gt;"
1238 07 Sep 10 nicklas 153       replace="&lt;version&gt;${version}&lt;/version&gt;"
1238 07 Sep 10 nicklas 154       encoding="UTF-8"
1238 07 Sep 10 nicklas 155     />
1386 06 Sep 11 nicklas 156     <replaceregexp 
1386 06 Sep 11 nicklas 157       file="META-INF/extensions.xml"
1386 06 Sep 11 nicklas 158       match="&lt;min-base-version&gt;.*&lt;/min-base-version&gt;"
1386 06 Sep 11 nicklas 159       replace="&lt;min-base-version&gt;${depend.base-version}&lt;/min-base-version&gt;"
1386 06 Sep 11 nicklas 160       encoding="UTF-8"
1386 06 Sep 11 nicklas 161     />
1238 07 Sep 10 nicklas 162     <echo>Don't forget to commit the changes to the subversion repository!</echo>
1238 07 Sep 10 nicklas 163   </target>
1238 07 Sep 10 nicklas 164   
585 13 Feb 08 nicklas 165   <target 
585 13 Feb 08 nicklas 166     name="checkjar"
1386 06 Sep 11 nicklas 167     description="Checks that the base-core-${depend.base-version}.jar, base-webclient-${depend.base-version}.jar, base-coreplugins-${depend.base-version}.jar and base-wsclient-${depend.base-version}.jar exists."
585 13 Feb 08 nicklas 168     >
585 13 Feb 08 nicklas 169     <available classname="net.sf.basedb.core.Application" 
1386 06 Sep 11 nicklas 170       classpathref="classpath" property="base-core" />
585 13 Feb 08 nicklas 171     <available classname="net.sf.basedb.plugins.ReporterFlatFileImporter" 
1386 06 Sep 11 nicklas 172       classpathref="classpath" property="base-coreplugins" />
684 30 Apr 08 jari 173     <available classname="net.sf.basedb.ws.client.SessionClient"
1386 06 Sep 11 nicklas 174       classpathref="classpath" property="base-webservices-client" />
1097 28 May 09 martin 175     <available classname="net.sf.basedb.clients.web.extensions.menu.FixedMenuItemFactory" 
1386 06 Sep 11 nicklas 176       classpathref="classpath" property="base-webclient" />
1386 06 Sep 11 nicklas 177     <fail unless="base-core" message="Can't find base-core-${depend.base-version}.jar in ./lib/compile. Try 'ant download-lib' to download the missing file." />
1386 06 Sep 11 nicklas 178     <fail unless="base-coreplugins" message="Can't find base-coreplugins-${depend.base-version}.jar in ./lib/compile. Try 'ant download-lib' to download the missing file." />
1386 06 Sep 11 nicklas 179     <fail unless="base-webservices-client" message="Can't find base-webservices-client-${depend.base-version}.jar in ./lib/compile. Try 'ant download-lib' to download the missing file." />
1386 06 Sep 11 nicklas 180     <fail unless="base-webclient" message="Can't find base-webclient-${depend.base-version}.jar in ./lib/compile. Try 'ant download-lib' to download the missing file." />
1386 06 Sep 11 nicklas 181     <echo>
1386 06 Sep 11 nicklas 182 Found base-core-${depend.base-version}.jar, 
1386 06 Sep 11 nicklas 183       base-coreplugins-${depend.base-version}.jar, 
1386 06 Sep 11 nicklas 184       base-webservices-client-${depend.base-version}.jar and 
1386 06 Sep 11 nicklas 185       base-webclient-${depend.base-version}.jar.</echo>
585 13 Feb 08 nicklas 186   </target>
807 21 Oct 08 nicklas 187
1386 06 Sep 11 nicklas 188   <target 
807 21 Oct 08 nicklas 189     name="download-lib"
1386 06 Sep 11 nicklas 190     description="Download BASE JAR files that are needed for compilation"
807 21 Oct 08 nicklas 191     >
807 21 Oct 08 nicklas 192     <echo>
807 21 Oct 08 nicklas 193 -------------------------------------------------------    
817 21 Nov 08 jari 194 NOTE! You may specify a different download location by 
807 21 Oct 08 nicklas 195 creating the file './build.properties' and
807 21 Oct 08 nicklas 196 setting 'depend.jars' to the URL to download from.
807 21 Oct 08 nicklas 197 -------------------------------------------------------
807 21 Oct 08 nicklas 198     </echo>
1386 06 Sep 11 nicklas 199     <download-lib file="base-core-${depend.base-version}.jar" />
1386 06 Sep 11 nicklas 200     <download-lib file="base-coreplugins-${depend.base-version}.jar" />
1386 06 Sep 11 nicklas 201     <download-lib file="base-webservices-client-${depend.base-version}.jar" />
1386 06 Sep 11 nicklas 202     <download-lib file="base-webclient-${depend.base-version}.jar" />
807 21 Oct 08 nicklas 203   </target>
807 21 Oct 08 nicklas 204   
807 21 Oct 08 nicklas 205   <macrodef name="download-lib" description="Download BASE core JAR files">
807 21 Oct 08 nicklas 206     <attribute name="file" />
807 21 Oct 08 nicklas 207     <sequential>
807 21 Oct 08 nicklas 208       <get 
807 21 Oct 08 nicklas 209         dest="lib/compile/@{file}" 
807 21 Oct 08 nicklas 210         src="${depend.jars}/@{file}" 
807 21 Oct 08 nicklas 211         usetimestamp="true" 
807 21 Oct 08 nicklas 212         verbose="true"
807 21 Oct 08 nicklas 213         ignoreerrors="true"
807 21 Oct 08 nicklas 214       />
807 21 Oct 08 nicklas 215     </sequential>
807 21 Oct 08 nicklas 216   </macrodef>  
807 21 Oct 08 nicklas 217
546 18 Jan 08 nicklas 218 </project>

Generated on Tue Nov 21 03:43:30 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)