plugins/base2/net.sf.basedb.illumina/trunk/config/illumina-extended-properties.xml

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1032 07 Apr 09 nicklas 1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
546 18 Jan 08 nicklas 2 <!DOCTYPE extended-properties SYSTEM "extended-properties.dtd" >
546 18 Jan 08 nicklas 3 <!--
546 18 Jan 08 nicklas 4   Extended properties file with definitions for reporter annotations
589 20 Feb 08 martin 5   that are specific to the Illumina platform. You should manually 
589 20 Feb 08 martin 6   add/remove wanted columns and copy this file into your
589 20 Feb 08 martin 7   [base2home]/www/WEB-INF/classes/extended-properties/ directory
546 18 Jan 08 nicklas 8 -->
546 18 Jan 08 nicklas 9 <extended-properties>
546 18 Jan 08 nicklas 10   <class name="ReporterData">
573 06 Feb 08 martin 11     <property
573 06 Feb 08 martin 12       name="source"
573 06 Feb 08 martin 13       title="Source"
573 06 Feb 08 martin 14       description=""
573 06 Feb 08 martin 15       column="source"
573 06 Feb 08 martin 16       type="string"
573 06 Feb 08 martin 17       length="255"
573 06 Feb 08 martin 18     />
573 06 Feb 08 martin 19     <property
573 06 Feb 08 martin 20       name="searchKey"
573 06 Feb 08 martin 21       title="Search key"
573 06 Feb 08 martin 22       description=""
573 06 Feb 08 martin 23       column="searchKey"
573 06 Feb 08 martin 24       type="string"
573 06 Feb 08 martin 25       length="255"
573 06 Feb 08 martin 26     />
573 06 Feb 08 martin 27     <property
573 06 Feb 08 martin 28       name="ilmnGene"
573 06 Feb 08 martin 29       title="ILMN Gene"
573 06 Feb 08 martin 30       description=""
573 06 Feb 08 martin 31       column="ilmnGene"
573 06 Feb 08 martin 32       type="string"
573 06 Feb 08 martin 33       length="255"
573 06 Feb 08 martin 34     />
573 06 Feb 08 martin 35     <property
573 06 Feb 08 martin 36       name="sourceReferenceId"
573 06 Feb 08 martin 37       title="Source reference id"
573 06 Feb 08 martin 38       description=""
573 06 Feb 08 martin 39       column="sourceReferenceId"
573 06 Feb 08 martin 40       type="string"
573 06 Feb 08 martin 41       length="255"
573 06 Feb 08 martin 42     />
573 06 Feb 08 martin 43     <property
573 06 Feb 08 martin 44       name="isoformType"
573 06 Feb 08 martin 45       title="Isoform type"
573 06 Feb 08 martin 46       description=""
573 06 Feb 08 martin 47       column="isoformType"
573 06 Feb 08 martin 48       type="string"
573 06 Feb 08 martin 49       length="255"
573 06 Feb 08 martin 50     />
573 06 Feb 08 martin 51     <property
573 06 Feb 08 martin 52       name="probeChrOrientation"
573 06 Feb 08 martin 53       title="Probe chr orientation"
573 06 Feb 08 martin 54       description=""
573 06 Feb 08 martin 55       column="probeChrOrientation"
573 06 Feb 08 martin 56       type="string"
573 06 Feb 08 martin 57       length="255"
573 06 Feb 08 martin 58     />
573 06 Feb 08 martin 59     <property
580 11 Feb 08 nicklas 60       name="probeCoordinates"
580 11 Feb 08 nicklas 61       title="Probe coordinates"
573 06 Feb 08 martin 62       description=""
580 11 Feb 08 nicklas 63       column="probeCoordinates"
573 06 Feb 08 martin 64       type="string"
573 06 Feb 08 martin 65       length="255"
573 06 Feb 08 martin 66     />
573 06 Feb 08 martin 67     <property
573 06 Feb 08 martin 68       name="synonyms"
573 06 Feb 08 martin 69       title="Synonyms"
573 06 Feb 08 martin 70       description=""
573 06 Feb 08 martin 71       column="synonyms"
573 06 Feb 08 martin 72       type="string"
573 06 Feb 08 martin 73       length="65535"
573 06 Feb 08 martin 74     />
575 07 Feb 08 martin 75     <property
575 07 Feb 08 martin 76       name="controlGroupName"
575 07 Feb 08 martin 77       title="Control group name"
575 07 Feb 08 martin 78       description=""
575 07 Feb 08 martin 79       column="controlGroupName"
575 07 Feb 08 martin 80       type="string"
575 07 Feb 08 martin 81       length="255"
575 07 Feb 08 martin 82     />
575 07 Feb 08 martin 83     <property
575 07 Feb 08 martin 84       name="controlGroupId"
575 07 Feb 08 martin 85       title="Control group id"
575 07 Feb 08 martin 86       description=""
575 07 Feb 08 martin 87       column="controlGroupId"
575 07 Feb 08 martin 88       type="string"
575 07 Feb 08 martin 89       length="255"
575 07 Feb 08 martin 90     />
575 07 Feb 08 martin 91     <property
575 07 Feb 08 martin 92       name="controlCompositeMap"
575 07 Feb 08 martin 93       title="Control composite map"
575 07 Feb 08 martin 94       description=""
575 07 Feb 08 martin 95       column="controlCompositeMap"
575 07 Feb 08 martin 96       type="string"
575 07 Feb 08 martin 97       length="255"
575 07 Feb 08 martin 98     />
589 20 Feb 08 martin 99     <property 
589 20 Feb 08 martin 100       name="ilmnStrand"
589 20 Feb 08 martin 101       title="Ilmn strand"
589 20 Feb 08 martin 102       description="Strand definition of the SNP"
589 20 Feb 08 martin 103       column="ilmnStrand"
589 20 Feb 08 martin 104       type="string"
589 20 Feb 08 martin 105       length="255"
589 20 Feb 08 martin 106     />
589 20 Feb 08 martin 107     <property 
589 20 Feb 08 martin 108       name="snp"
589 20 Feb 08 martin 109       title="SNP"
589 20 Feb 08 martin 110       description="Type of SNP"
589 20 Feb 08 martin 111       column="snp"
589 20 Feb 08 martin 112       type="string"
589 20 Feb 08 martin 113       length="255"
589 20 Feb 08 martin 114     />
624 10 Mar 08 nicklas 115     <property 
624 10 Mar 08 nicklas 116       name="startPosition"
624 10 Mar 08 nicklas 117       title="Start position"
624 10 Mar 08 nicklas 118       column="startPosition"
624 10 Mar 08 nicklas 119       type="int"
624 10 Mar 08 nicklas 120     />
546 18 Jan 08 nicklas 121   </class>
573 06 Feb 08 martin 122 </extended-properties>

Generated on Tue Nov 21 03:43:02 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)