plugins/base2/se.lu.thep.affymetrix/trunk/ChangeLog

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
124 18 Jul 06 jari 1 $Id$
124 18 Jul 06 jari 2
124 18 Jul 06 jari 3 ======================================================================
348 27 Jun 07 jari 4 Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen
348 27 Jun 07 jari 5 Copyright (C) 2007 Jari Häkkinen, Peter Johansson
124 18 Jul 06 jari 6
309 25 May 07 peter 7 This file is part of BASEPlugIns - Non-core plug-ins for BASE,
309 25 May 07 peter 8 BioArray Software Environment.
309 25 May 07 peter 9 BASEPlugIns is available at http://baseplugins.thep.lu.se/
309 25 May 07 peter 10 BASE is available at http://base.thep.lu.se/
124 18 Jul 06 jari 11
309 25 May 07 peter 12 BASEPlugIns is free software; you can redistribute it and/or modify
309 25 May 07 peter 13 it under the terms of the GNU General Public License as published by
309 25 May 07 peter 14 the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
309 25 May 07 peter 15 (at your option) any later version.
124 18 Jul 06 jari 16
309 25 May 07 peter 17 BASEPlugIns is distributed in the hope that it will be useful, but
309 25 May 07 peter 18 WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
309 25 May 07 peter 19 MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
124 18 Jul 06 jari 20 General Public License for more details.
124 18 Jul 06 jari 21
124 18 Jul 06 jari 22 You should have received a copy of the GNU General Public License
124 18 Jul 06 jari 23 along with this program; if not, write to the Free Software
309 25 May 07 peter 24 Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330,
309 25 May 07 peter 25 Boston, MA  02111-1307, USA.
124 18 Jul 06 jari 26 ======================================================================
124 18 Jul 06 jari 27
309 25 May 07 peter 28
348 27 Jun 07 jari 29 version 0.7:
346 27 Jun 07 jari 30   - Added information on how to install in Microsoft Windows
346 27 Jun 07 jari 31   - Improved installation document.
344 25 Jun 07 jari 32   - Improved DBControl usage.
344 25 Jun 07 jari 33   - Improved the make process.
344 25 Jun 07 jari 34   - Refactoring of Plier and RMAExpress. The classes inherit shared
344 25 Jun 07 jari 35     code froma super class.
344 25 Jun 07 jari 36
348 27 Jun 07 jari 37 version 0.6:
305 24 May 07 jari 38   - Improved documentation.
305 24 May 07 jari 39   - Added PLieR algorithm.
305 24 May 07 jari 40   - Fixed all packages and install modes to work.
344 25 Jun 07 jari 41   - Renamed the package to se.lu.thep.affymetrix
190 27 Oct 06 jari 42
193 31 Oct 06 jari 43 version 0.5 (revision 193):
191 31 Oct 06 jari 44   - Changed starting position to 1 from 0 (zero) when expression
191 31 Oct 06 jari 45     values are store into the database. This is more consistent with
191 31 Oct 06 jari 46     the BASE treatment of positions.
191 31 Oct 06 jari 47
190 27 Oct 06 jari 48 version 0.4 (revision 190):
190 27 Oct 06 jari 49   - Fixed installation glitches.
190 27 Oct 06 jari 50   - Changed default installation path.
190 27 Oct 06 jari 51
173 09 Sep 06 jari 52 version 0.3 (revision 173):
172 09 Sep 06 jari 53   - Removed disclaimer in README.
172 09 Sep 06 jari 54   - Removed non-existing email adress.
172 09 Sep 06 jari 55   
163 12 Aug 06 jari 56 version 0.2 (revision 163):
162 12 Aug 06 jari 57   - Changed URL to point to RMAExpress wiki pages at
162 12 Aug 06 jari 58     http://baseplugins.thep.lu.se
162 12 Aug 06 jari 59   - Fixed clean up to work even if exceptions occur.
153 10 Aug 06 jari 60   - BASE API for plugins was slightly changed. This version of the
153 10 Aug 06 jari 61     plug-in will not run on BASE revision 2511 or earlier.
153 10 Aug 06 jari 62   - Removed the need to configure the plug-in within BASE - but
153 10 Aug 06 jari 63     added some restrictions on how to install the RMAExpressConsole
153 10 Aug 06 jari 64     binary (see INSTALL for more informaion).
129 08 Aug 06 jari 65   - Added optimizations suggested by Nicklas Nordborg.
128 22 Jul 06 jari 66   - Fixed spelling error Changelog -> ChangeLog in Makefile.
128 22 Jul 06 jari 67
127 22 Jul 06 jari 68 version 0.1 (revision 127):
124 18 Jul 06 jari 69   - First public release of RMAExpress plug-in for BASE.