plugins/base2/uk.ac.ebi.tab2mage/trunk/Tab2MageImporter/README-KnownIssuesandFeatures.txt

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491 28 Nov 07 dominic 2 Limitations and Known Issues
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491 28 Nov 07 dominic 4 i. Only one raw data importer plugin configuration can be used at any one time during an experiment import.
491 28 Nov 07 dominic 5 This means that all raw  data files in a tab2mage.zip archive should have the same data header. For Raw datafile from Genepix (or .gpr files) and Agilent, there is a certain level of polymorphism that may occur should scanner models used in a experiment run different versions of the software. Users will have to harmonize the files to one layout in order to upload the Experiment in BASE2 using the current plugin.
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491 28 Nov 07 dominic 8 Email alert:
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491 28 Nov 07 dominic 10 To receive an email alert on the success or failure of your experiment loading,
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491 28 Nov 07 dominic 12 Windows users:
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491 28 Nov 07 dominic 14   Your antivirus server and anti spam software may prevent you from sending email messages. This is because they must have been configured to block all application requiring connection to your email sever on port 25 (smtp).
491 28 Nov 07 dominic 15   If this happens, you can simply ask your administrator to allow your machine to connect to the email server using port 25.
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491 28 Nov 07 dominic 17   The email alert works on a linux / unix and may be mac machines.
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491 28 Nov 07 dominic 19 AnnotationTypes and Cv Importer
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491 28 Nov 07 dominic 21   --the annotation type and cv loader plugin; uk.ac.ebi. nugo.plugins.CvAnnotationTypeImporter must be defined and configured. Both the plugin and it's configured object must be shared to the user running the Tab2MageImporter.  Defining and configuring the plugin should be done preferably by the administrator. The administrator should share the configuration to the users as well. Otherwise suitable plugin configurations cannot be found and the import would fail. 
491 28 Nov 07 dominic 22   --A naming comparism of the annotation type in the flat file to the annotation type in base2 is actualized. Only non-existing annotation types are created.
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