client/servlet/conf/dinosaur.properties.in

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
4567 28 Apr 15 fredrik 1 # $Id: dinosaur.properties.in 2597 2010-12-13 12:57:41Z olle $
4567 28 Apr 15 fredrik 2
4567 28 Apr 15 fredrik 3 # Copyright (C) 2010 Olle Mansson
4567 28 Apr 15 fredrik 4
4567 28 Apr 15 fredrik 5 # This file is part of Proteios
4567 28 Apr 15 fredrik 6 # Available at http://www.proteios.org/
4567 28 Apr 15 fredrik 7
4567 28 Apr 15 fredrik 8 # Proteios is free software; you can redistribute it and/or modify it
4567 28 Apr 15 fredrik 9 # under the terms of the GNU General Public License as published by
4567 28 Apr 15 fredrik 10 # the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
4567 28 Apr 15 fredrik 11 # (at your option) any later version.
4567 28 Apr 15 fredrik 12
4567 28 Apr 15 fredrik 13 # Proteios is distributed in the hope that it will be useful, but
4567 28 Apr 15 fredrik 14 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
4567 28 Apr 15 fredrik 15 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
4567 28 Apr 15 fredrik 16 # General Public License for more details.
4567 28 Apr 15 fredrik 17
4567 28 Apr 15 fredrik 18 # You should have received a copy of the GNU General Public License
4567 28 Apr 15 fredrik 19 # along with this program; if not, write to the Free Software
4567 28 Apr 15 fredrik 20 # Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA
4567 28 Apr 15 fredrik 21 # 02111-1307, USA.
4567 28 Apr 15 fredrik 22
4567 28 Apr 15 fredrik 23 # Copy this file to dinosaur.properties and make necessary configuration 
4567 28 Apr 15 fredrik 24 # before running Dinosaur-related jobs from Proteios.
4567 28 Apr 15 fredrik 25  
4567 28 Apr 15 fredrik 26 #
4567 28 Apr 15 fredrik 27 # Settings for accessing locally installed dinosaur program - required
4567 28 Apr 15 fredrik 28 #
4567 28 Apr 15 fredrik 29 # Program dinosaur is part of the Computational Proteomics Laboratory,
4567 28 Apr 15 fredrik 30 # at url http://proteomics.fhcrc.org/CPL/dinosaur/index.html.
4567 28 Apr 15 fredrik 31 #
4567 28 Apr 15 fredrik 32 # The dinosaur program name for a nightly build might include
4567 28 Apr 15 fredrik 33 # a date and extra number, e.g. viewerApp_2010_12_08_0006.jar.
4567 28 Apr 15 fredrik 34 #
4567 28 Apr 15 fredrik 35 # Default settings for dinosaur installed on the same system
4567 28 Apr 15 fredrik 36 # as the Proteios SE server are:
4567 28 Apr 15 fredrik 37 #
4567 28 Apr 15 fredrik 38 # dinosaur.local.install.path = /local/Dinosaur/
4567 28 Apr 15 fredrik 39 # dinosaur.local.program.name = viewerApp.jar
4567 28 Apr 15 fredrik 40 # dinosaur.local.disabled = no
4567 28 Apr 15 fredrik 41 # dinosaur.memory_in_megabytes = 512
4567 28 Apr 15 fredrik 42 #
4567 28 Apr 15 fredrik 43 # When dinosaur has been installed locally and the properties
4567 28 Apr 15 fredrik 44 # file updated, the "disabled" flag should be set to
4567 28 Apr 15 fredrik 45 # "dinosaur.local.disabled = no", in order to make
4567 28 Apr 15 fredrik 46 # the functionality accessible from Proteios SE.
4567 28 Apr 15 fredrik 47 #
4567 28 Apr 15 fredrik 48 dinosaur.local.install.path = /local/Dinosaur/
4567 28 Apr 15 fredrik 49 dinosaur.local.program.name = viewerApp.jar
4567 28 Apr 15 fredrik 50 dinosaur.local.disabled = yes
4567 28 Apr 15 fredrik 51 dinosaur.memory_in_megabytes = 512
4567 28 Apr 15 fredrik 52