client/servlet/conf/mascot.properties.in

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2896 07 Oct 08 olle 1 # $Id: mascot.properties.in 2597 2008-10-02 14:07:41Z olle $
2896 07 Oct 08 olle 2
2896 07 Oct 08 olle 3 # Copyright (C) 2008 Olle Mansson
2896 07 Oct 08 olle 4
2896 07 Oct 08 olle 5 # This file is part of Proteios
2896 07 Oct 08 olle 6 # Available at http://www.proteios.org/
2896 07 Oct 08 olle 7
2896 07 Oct 08 olle 8 # Proteios is free software; you can redistribute it and/or modify it
2896 07 Oct 08 olle 9 # under the terms of the GNU General Public License as published by
2896 07 Oct 08 olle 10 # the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
2896 07 Oct 08 olle 11 # (at your option) any later version.
2896 07 Oct 08 olle 12
2896 07 Oct 08 olle 13 # Proteios is distributed in the hope that it will be useful, but
2896 07 Oct 08 olle 14 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
2896 07 Oct 08 olle 15 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
2896 07 Oct 08 olle 16 # General Public License for more details.
2896 07 Oct 08 olle 17
2896 07 Oct 08 olle 18 # You should have received a copy of the GNU General Public License
2896 07 Oct 08 olle 19 # along with this program; if not, write to the Free Software
2896 07 Oct 08 olle 20 # Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA
2896 07 Oct 08 olle 21 # 02111-1307, USA.
2896 07 Oct 08 olle 22
2896 07 Oct 08 olle 23 # Copy this file to mascot.properties and make necessary configuration 
2896 07 Oct 08 olle 24 # before running Mascot-related jobs from Proteios.
2896 07 Oct 08 olle 25  
2896 07 Oct 08 olle 26 #
2896 07 Oct 08 olle 27 # Settings for accessing Mascot web interface - required
2896 07 Oct 08 olle 28 #
2896 07 Oct 08 olle 29 # Default settings for Mascot installed on the same system
2896 07 Oct 08 olle 30 # as the Proteios server are:
2896 07 Oct 08 olle 31 #
2896 07 Oct 08 olle 32 # mascot.server.url = http://localhost/mascot
3296 05 Jun 09 olle 33 # mascot.input.script.path = /cgi/search_form.pl
3296 05 Jun 09 olle 34 # mascot.search.script.path = /cgi/nph-mascot.exe
3296 05 Jun 09 olle 35 # mascot.result.script.path = /cgi/master_results.pl
3296 05 Jun 09 olle 36 # mascot.export.script.path = /cgi/export_dat_2.pl
2896 07 Oct 08 olle 37 # mascot.archive.path = /data
2896 07 Oct 08 olle 38 # mascot.result.filename.prefix = F
2896 07 Oct 08 olle 39 #
2896 07 Oct 08 olle 40 # Notes:
2896 07 Oct 08 olle 41 #
2896 07 Oct 08 olle 42 # mascot.server.url is the part of the url
2897 07 Oct 08 olle 43 # of a Mascot search site before the Mascot home page "/home.html".
2896 07 Oct 08 olle 44 # For search site http://example.com/mascot/home.html
2896 07 Oct 08 olle 45 # the following setting should be used:
2896 07 Oct 08 olle 46 #
2896 07 Oct 08 olle 47 # mascot.server.url = http://example.com/mascot
2896 07 Oct 08 olle 48 #
2896 07 Oct 08 olle 49 # Mascot result filenames normally consist of
2896 07 Oct 08 olle 50 # a prefix plus a six-digit number,
2896 07 Oct 08 olle 51 # e.g. "F009765.dat" for prefix "F" and search number 9765
2896 07 Oct 08 olle 52 # a certain date. The result files are stored in
2896 07 Oct 08 olle 53 # a sub-directory to the Mascot archive path
2896 07 Oct 08 olle 54 # with a name equal to the date in YYYYMMDD format,
2896 07 Oct 08 olle 55 # e.g. for date 2008-09-24, the file above has path
2896 07 Oct 08 olle 56 # "data/20080924/F009765.dat" relative to the Mascot directory.
2896 07 Oct 08 olle 57 #
2896 07 Oct 08 olle 58 mascot.server.url = http://localhost/mascot
3296 05 Jun 09 olle 59 mascot.input.script.path = /cgi/search_form.pl
3296 05 Jun 09 olle 60 mascot.search.script.path = /cgi/nph-mascot.exe
2896 07 Oct 08 olle 61 mascot.export.script.path = /cgi/export_dat_2.pl
2896 07 Oct 08 olle 62 mascot.archive.path = /data
2896 07 Oct 08 olle 63 mascot.result.filename.prefix = F
4190 25 Mar 11 olle 64 #
4190 25 Mar 11 olle 65 # mascot.local.disabled = no
4190 25 Mar 11 olle 66 #
4190 25 Mar 11 olle 67 # When the Mascot properties file has been updated,
4190 25 Mar 11 olle 68 # the "disabled" flag should be set to
4190 25 Mar 11 olle 69 # "mascot.local.disabled = no", in order to make
4190 25 Mar 11 olle 70 # the functionality accessible from Proteios SE.
4190 25 Mar 11 olle 71 #
4190 25 Mar 11 olle 72 mascot.local.disabled = yes
2896 07 Oct 08 olle 73