client/servlet/conf/openms.properties.in

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
4144 03 Mar 11 olle 1 # $Id: openms.properties.in 2597 2011-02-25 11:06:41Z olle $
4144 03 Mar 11 olle 2
4144 03 Mar 11 olle 3 # Copyright (C) 2011 Olle Mansson
4144 03 Mar 11 olle 4
4144 03 Mar 11 olle 5 # This file is part of Proteios
4144 03 Mar 11 olle 6 # Available at http://www.proteios.org/
4144 03 Mar 11 olle 7
4144 03 Mar 11 olle 8 # Proteios is free software; you can redistribute it and/or modify it
4144 03 Mar 11 olle 9 # under the terms of the GNU General Public License as published by
4144 03 Mar 11 olle 10 # the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
4144 03 Mar 11 olle 11 # (at your option) any later version.
4144 03 Mar 11 olle 12
4144 03 Mar 11 olle 13 # Proteios is distributed in the hope that it will be useful, but
4144 03 Mar 11 olle 14 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
4144 03 Mar 11 olle 15 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
4144 03 Mar 11 olle 16 # General Public License for more details.
4144 03 Mar 11 olle 17
4144 03 Mar 11 olle 18 # You should have received a copy of the GNU General Public License
4144 03 Mar 11 olle 19 # along with this program; if not, write to the Free Software
4144 03 Mar 11 olle 20 # Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA
4144 03 Mar 11 olle 21 # 02111-1307, USA.
4144 03 Mar 11 olle 22
4144 03 Mar 11 olle 23 # Copy this file to openms.properties and make necessary configuration 
4144 03 Mar 11 olle 24 # before running OpenMS-related jobs from Proteios.
4144 03 Mar 11 olle 25  
4144 03 Mar 11 olle 26 #
4144 03 Mar 11 olle 27 # Settings for accessing locally installed OpenMS programs - required
4144 03 Mar 11 olle 28 #
4144 03 Mar 11 olle 29 # Program package OpenMS is available
4144 03 Mar 11 olle 30 # at url http://open-ms.sourceforge.net/OpenMS.php.
4144 03 Mar 11 olle 31 #
4144 03 Mar 11 olle 32 # Default settings for OpenMS installed on the same
4144 03 Mar 11 olle 33 # Unix/Linux system as the Proteios SE server are:
4144 03 Mar 11 olle 34 #
4144 03 Mar 11 olle 35 # openms.local.install.path = /usr/bin/
4144 03 Mar 11 olle 36 # openms.local.program.peak_picker.name = PeakPicker
4144 03 Mar 11 olle 37 # openms.local.program.feature_finder.name = FeatureFinder
4177 22 Mar 11 olle 38 # openms.local.disabled = no
4144 03 Mar 11 olle 39 #
4144 03 Mar 11 olle 40 # On a Microsoft Windows system, the program names typically
4145 03 Mar 11 olle 41 # have an ".exe" file extension, e.g. PeakPicker.exe and
4144 03 Mar 11 olle 42 # FeatureFinder.exe.
4144 03 Mar 11 olle 43 #
4177 22 Mar 11 olle 44 # When OpenMS has been installed locally and the properties
4177 22 Mar 11 olle 45 # file updated, the "disabled" flag should be set to
4177 22 Mar 11 olle 46 # "openms.local.disabled = no", in order to make
4177 22 Mar 11 olle 47 # the functionality accessible from Proteios SE.
4177 22 Mar 11 olle 48 #
4144 03 Mar 11 olle 49 openms.local.install.path = /usr/bin/
4144 03 Mar 11 olle 50 openms.local.program.peak_picker.name = PeakPicker
4144 03 Mar 11 olle 51 openms.local.program.feature_finder.name = FeatureFinder
4177 22 Mar 11 olle 52 openms.local.disabled = yes
4144 03 Mar 11 olle 53