plugin/conf/xsd/mzML1.1.1_idx.xsd

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
4304 20 Mar 12 fredrik 1 <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
4304 20 Mar 12 fredrik 2 <!-- Created with Liquid XML Studio 1.0.8.0 (http://www.liquid-technologies.com) -->
4304 20 Mar 12 fredrik 3 <xs:schema xmlns:dx="http://psi.hupo.org/ms/mzml" 
4304 20 Mar 12 fredrik 4        xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema"
4304 20 Mar 12 fredrik 5        targetNamespace="http://psi.hupo.org/ms/mzml" 
4304 20 Mar 12 fredrik 6        attributeFormDefault="unqualified" 
4304 20 Mar 12 fredrik 7        elementFormDefault="qualified" 
4304 20 Mar 12 fredrik 8        version="1.1.1">
4304 20 Mar 12 fredrik 9   <xs:include schemaLocation="mzML1.1.0.xsd" />
4304 20 Mar 12 fredrik 10   <xs:complexType name="IndexListType">
4304 20 Mar 12 fredrik 11     <xs:sequence>
4304 20 Mar 12 fredrik 12       <xs:element minOccurs="1" maxOccurs="unbounded" name="index" type="dx:IndexType">
4304 20 Mar 12 fredrik 13         <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 14           <xs:documentation>Index element containing one or more offsets for random data access for the entity described in the 'name' attribute.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 15         </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 16       </xs:element>
4304 20 Mar 12 fredrik 17     </xs:sequence>
4304 20 Mar 12 fredrik 18     <xs:attribute name="count" type="xs:nonNegativeInteger" use="required">
4304 20 Mar 12 fredrik 19       <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 20         <xs:documentation>Number of indices in this list.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 21       </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 22     </xs:attribute>
4304 20 Mar 12 fredrik 23   </xs:complexType>
4304 20 Mar 12 fredrik 24   <xs:complexType name="IndexType">
4304 20 Mar 12 fredrik 25     <xs:sequence>
4304 20 Mar 12 fredrik 26       <xs:element maxOccurs="unbounded" name="offset" type="dx:OffsetType">
4304 20 Mar 12 fredrik 27         <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 28           <xs:documentation>File pointer offset (in bytes) of the element identified by the 'id' attribute.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 29         </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 30       </xs:element>
4304 20 Mar 12 fredrik 31     </xs:sequence>
4304 20 Mar 12 fredrik 32     <xs:attribute name="name" use="required">
4304 20 Mar 12 fredrik 33       <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 34         <xs:documentation>The name of the entity the index entries are pointing to.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 35       </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 36       <xs:simpleType>
4304 20 Mar 12 fredrik 37         <xs:restriction base="xs:string">
4304 20 Mar 12 fredrik 38           <xs:enumeration value="spectrum" />
4304 20 Mar 12 fredrik 39           <xs:enumeration value="chromatogram" />
4304 20 Mar 12 fredrik 40         </xs:restriction>
4304 20 Mar 12 fredrik 41       </xs:simpleType>
4304 20 Mar 12 fredrik 42     </xs:attribute>
4304 20 Mar 12 fredrik 43   </xs:complexType>
4304 20 Mar 12 fredrik 44   <xs:complexType name="OffsetType">
4304 20 Mar 12 fredrik 45     <xs:simpleContent>
4304 20 Mar 12 fredrik 46       <xs:extension base="xs:long">
4304 20 Mar 12 fredrik 47         <xs:attribute name="idRef" type="xs:string" use="required">
4304 20 Mar 12 fredrik 48           <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 49             <xs:documentation>Reference to the 'id' attribute of the indexed element.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 50           </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 51         </xs:attribute>
4304 20 Mar 12 fredrik 52         <xs:attribute name="spotID" type="xs:string" use="optional">
4304 20 Mar 12 fredrik 53           <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 54             <xs:documentation>The identifier for the spot from which this spectrum was derived, if a MALDI or similar run.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 55           </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 56         </xs:attribute>
4304 20 Mar 12 fredrik 57         <xs:attribute name="scanTime" type="xs:double" use="optional">
4304 20 Mar 12 fredrik 58           <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 59             <xs:documentation>In the case of a spectrum representing a single scan, this attribute may be used to reference it by the time at which the scan was acquired (a.k.a. scan time or retention time).</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 60           </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 61         </xs:attribute>
4304 20 Mar 12 fredrik 62       </xs:extension>
4304 20 Mar 12 fredrik 63     </xs:simpleContent>
4304 20 Mar 12 fredrik 64   </xs:complexType>
4304 20 Mar 12 fredrik 65   <xs:element name="indexedmzML">
4304 20 Mar 12 fredrik 66     <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 67       <xs:documentation>Container element for mzML which allows the addition of an index.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 68     </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 69     <xs:complexType>
4304 20 Mar 12 fredrik 70       <xs:sequence>
4304 20 Mar 12 fredrik 71         <xs:element ref="dx:mzML" />
4304 20 Mar 12 fredrik 72         <xs:element minOccurs="1" name="indexList" type="dx:IndexListType">
4304 20 Mar 12 fredrik 73           <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 74             <xs:documentation>List of indices.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 75           </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 76         </xs:element>
4304 20 Mar 12 fredrik 77         <xs:element name="indexListOffset" nillable="true" type="xs:long">
4304 20 Mar 12 fredrik 78           <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 79             <xs:documentation>File pointer offset (in bytes) of the 'indexList' element.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 80           </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 81         </xs:element>
4304 20 Mar 12 fredrik 82         <xs:element name="fileChecksum" type="xs:string">
4304 20 Mar 12 fredrik 83           <xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 84             <xs:documentation>SHA-1 checksum from beginning of file to end of 'fileChecksum' open tag.</xs:documentation>
4304 20 Mar 12 fredrik 85           </xs:annotation>
4304 20 Mar 12 fredrik 86         </xs:element>
4304 20 Mar 12 fredrik 87       </xs:sequence>
4304 20 Mar 12 fredrik 88     </xs:complexType>
4304 20 Mar 12 fredrik 89     <xs:key name="KEY_ID_IDX">
4304 20 Mar 12 fredrik 90       <xs:selector xpath=".//dx:indexedmzML/dx:mzML/dx:run/dx:spectrumList/dx:spectrum | .//dx:indexedmzML/dx:mzML/dx:run/dx:chromatogramList/dx:chromatogram" />
4304 20 Mar 12 fredrik 91       <xs:field xpath="@id" />
4304 20 Mar 12 fredrik 92     </xs:key>
4304 20 Mar 12 fredrik 93     <xs:keyref name="FKNID" refer="dx:KEY_ID_IDX">
4304 20 Mar 12 fredrik 94       <xs:selector xpath=".//dx:indexedmzML/dx:indexList/dx:index/dx:offset" />
4304 20 Mar 12 fredrik 95       <xs:field xpath="@id" />
4304 20 Mar 12 fredrik 96     </xs:keyref>
4304 20 Mar 12 fredrik 97   </xs:element>
4304 20 Mar 12 fredrik 98 </xs:schema>

Generated on Thu Jul 20 09:48:45 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)