NEWS

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 19 Feb 03 jari 1 $Id$
675 10 Oct 06 jari 2
905 27 Sep 07 peter 3 See the end of this file for copyrights and conditions.
905 27 Sep 07 peter 4
4361 23 Aug 23 peter 5 version 0.22 (released NOT YET)
4361 23 Aug 23 peter 6
4361 23 Aug 23 peter 7   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4361 23 Aug 23 peter 8   https://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.22
4361 23 Aug 23 peter 9
4358 23 Aug 23 peter 10 yat 0.21.x series from https://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.21-stable
4358 23 Aug 23 peter 11
4378 11 Oct 23 peter 12 version 0.21 (released 11 October 2023)
4339 15 Apr 23 peter 13   - A number of classes no longer inherit from std::unary_function (or
4339 15 Apr 23 peter 14     std::binary_function), but typedef argument_type
4339 15 Apr 23 peter 15     (first_argument_type or second_argument_type) and result_type
4339 15 Apr 23 peter 16     itself instead (ticket #998).
4276 25 Jan 23 peter 17   - htslib 1.10 (or newer) is now required (ticket #991)
4279 26 Jan 23 peter 18   - GSL 2.2 (or newer) is now required (ticket #983)
4326 12 Mar 23 peter 19   - YAT_AC_WRITE has been replaced by YAT_AC_WRITE_TO_FILE
4326 12 Mar 23 peter 20   - YAT_AC_WRITE_APPEND has been replaced by YAT_AC_APPEND_TO_FILE
4209 26 Aug 22 peter 21
4209 26 Aug 22 peter 22   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4209 26 Aug 22 peter 23   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.21
4209 26 Aug 22 peter 24
4206 26 Aug 22 peter 25 yat 0.20.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.20-stable
4206 26 Aug 22 peter 26
4316 17 Feb 23 peter 27 version 0.20.2 (released 17 February 2023)
4316 17 Feb 23 peter 28   - Fixed bug in VCF::Info::set(2) (bug #995)
4316 17 Feb 23 peter 29
4316 17 Feb 23 peter 30   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4316 17 Feb 23 peter 31   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.20.2
4316 17 Feb 23 peter 32
4308 10 Feb 23 peter 33 version 0.20.1 (released 10 February 2023)
4308 10 Feb 23 peter 34   - Aligner::needleman_wunsch and NeedlemanWunsch functions were
4308 10 Feb 23 peter 35     previously buggy for non-zero gap penalties (bug #993)
4308 10 Feb 23 peter 36   - VcfHeaer::add_program_command now outputs Date (bug #994)
4308 10 Feb 23 peter 37
4308 10 Feb 23 peter 38   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4308 10 Feb 23 peter 39   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.20.1
4308 10 Feb 23 peter 40
4252 18 Nov 22 peter 41 version 0.20 (released 18 November 2022)
4252 18 Nov 22 peter 42   - Boost 1.66 (or newer) is now required (see r4228)
4097 17 Sep 21 peter 43   - utility::replace(3) now takes const string& rather than string
4186 04 Jul 22 peter 44   - normalizer::QuantileNormalizer is deprecated; use
4186 04 Jul 22 peter 45     QuantileNormalizer2 instead (ticket #984)
4091 07 Sep 21 peter 46
4091 07 Sep 21 peter 47   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4091 07 Sep 21 peter 48   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.20
4091 07 Sep 21 peter 49
4088 07 Sep 21 peter 50 yat 0.19.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.19-stable
4088 07 Sep 21 peter 51
4204 26 Aug 22 peter 52 version 0.19.2 (released 26 August 2022)
4204 26 Aug 22 peter 53   - Bug fixed in Scheduler when two exception was thrown (see r4167)
4204 26 Aug 22 peter 54
4204 26 Aug 22 peter 55   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4204 26 Aug 22 peter 56   https://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.19.2
4204 26 Aug 22 peter 57
4164 13 Mar 22 peter 58 version 0.19.1 (released 13 March 2022)
4164 13 Mar 22 peter 59   - Several bugs in Scheduler have been fixed (#980, #981, #982)
4164 13 Mar 22 peter 60
4164 13 Mar 22 peter 61   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4164 13 Mar 22 peter 62   https://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.19.1
4164 13 Mar 22 peter 63
4110 27 Sep 21 peter 64 version 0.19 (released 27 September 2021)
4051 04 Mar 21 peter 65   - classifier::Target::labels(void) is now const (issue #972)
4054 26 Mar 21 peter 66   - statistics::correlation now takes a const Matrix& instead of Matrix
4001 08 Oct 20 peter 67
4001 08 Oct 20 peter 68   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4001 08 Oct 20 peter 69   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.19
4001 08 Oct 20 peter 70
3998 08 Oct 20 peter 71 yat 0.18.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.18-stable
3998 08 Oct 20 peter 72
4032 21 Jan 21 peter 73 version 0.18.1 (released 21 January 2021)
4032 21 Jan 21 peter 74   - SegmentTree::key_comp() and ::value_comp() now compile (bug #970).
4032 21 Jan 21 peter 75
4032 21 Jan 21 peter 76   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4032 21 Jan 21 peter 77   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.18.1
4032 21 Jan 21 peter 78
4019 06 Nov 20 peter 79 version 0.18 (released 6 November 2020)
3980 24 Aug 20 peter 80   - regression::NegativeBinomial now inherits from
3980 24 Aug 20 peter 81     regression::Multivariate (ticket #957)
3938 16 Jul 20 peter 82   - yat now requires a c++11 compliant compiler (ticket #949)
3922 07 Jun 20 peter 83   - yat now requires GSL 1.13 or later (ticket #945)
3883 24 Mar 20 peter 84   - Building against libbam is no longer supported (ticket #939)
3960 01 Aug 20 peter 85   - libyat is no longer linked against libboost_system and
3960 01 Aug 20 peter 86     libboost_thread (ticket #953)
3960 01 Aug 20 peter 87   - macro YAT_HAVE_WORKING_BOOST_EXCEPTION_PTR is no longer #defined
3960 01 Aug 20 peter 88     in yat/utility/config_public.h (ticket #953)
3938 16 Jul 20 peter 89   - configure option --disable-cxx11 is no longer supported (ticket #949)
3911 17 May 20 peter 90   - configure option --without-samtools is no longer supported; use
3883 24 Mar 20 peter 91     --without-htslib
3883 24 Mar 20 peter 92   - Autoconf macro YAT_CHECK_HTSLIB is no longer looking for libbam or
3883 24 Mar 20 peter 93     header files from the samtools API (ticket #939)
3911 17 May 20 peter 94   - protected function BamFile::open_base(3) is deprecated, use open_base(2).
3857 02 Jan 20 peter 95
3857 02 Jan 20 peter 96   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3857 02 Jan 20 peter 97   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.18
3857 02 Jan 20 peter 98
3854 02 Jan 20 peter 99 yat 0.17.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.17-stable
3854 02 Jan 20 peter 100
3987 26 Aug 20 peter 101 version 0.17.2 (released 26 August 2020)
3987 26 Aug 20 peter 102   - Fixed bug in Kendall::p_value() that caused overstimation when
3987 26 Aug 20 peter 103     both variables contained triplets (see bug #955)
3987 26 Aug 20 peter 104   - VectorMutable::all(double) now works on zero-sized vector, which
3987 26 Aug 20 peter 105     means that Vector::resize(0) now works on a zero-sized vector (bug
3987 26 Aug 20 peter 106     #956)
3966 11 Aug 20 peter 107   - Generating documentation now works with Doxygen 1.8.19 (bug #954)
3966 11 Aug 20 peter 108   - GSL, HTSLIB, Boost.Thread and Boost.System are not declated private
3966 11 Aug 20 peter 109     in pkg-config file yat.pc (bug #952).
3966 11 Aug 20 peter 110
3966 11 Aug 20 peter 111   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3966 11 Aug 20 peter 112   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.17.2
3966 11 Aug 20 peter 113
3930 08 Jul 20 peter 114 version 0.17.1 (released 8 July 2020)
3930 08 Jul 20 peter 115   - getvector(istream& is, vector<double>& vec) now clears the passed
3930 08 Jul 20 peter 116     vector before populating it with values from istream. Same
3930 08 Jul 20 peter 117     behaviour as getvector(istream, vector<string>&> and
3930 08 Jul 20 peter 118     std::getline(istream&, string&) (Bug #947)
3893 27 Mar 20 peter 119   - Fixed ambiguous DiscreteUniform::result_type (bug #942)
3893 27 Mar 20 peter 120
3893 27 Mar 20 peter 121   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3893 27 Mar 20 peter 122   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.17.1
3893 27 Mar 20 peter 123
3875 05 Mar 20 peter 124 version 0.17 (released 5 March 2020)
3870 24 Feb 20 peter 125   - Class Percentiler and functions using the class (percentile2,
3870 24 Feb 20 peter 126     median, and mad) are now documented to require lvalue access (see
3870 24 Feb 20 peter 127     bug #935)
3804 12 May 19 peter 128   - cxx11 features are now available also when YAT_WITH_CXX11 is not
3804 12 May 19 peter 129     defined; user can still turn off cxx11 features with
3805 13 May 19 peter 130     YAT_WITHOUT_CXX11 (ticket #904)
3796 12 Apr 19 peter 131
3796 12 Apr 19 peter 132   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3796 12 Apr 19 peter 133   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.17
3796 12 Apr 19 peter 134
3793 12 Apr 19 peter 135 yat 0.16.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.16-stable
3793 12 Apr 19 peter 136
3851 12 Dec 19 peter 137 version 0.16.3 (released 12 December 2019)
3851 12 Dec 19 peter 138   - fixed a bug in Scheduler::Jobs (ticket #931)
3851 12 Dec 19 peter 139
3851 12 Dec 19 peter 140   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3851 12 Dec 19 peter 141   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.16.3
3851 12 Dec 19 peter 142
3840 13 Aug 19 peter 143 version 0.16.2 (released 13 August 2019)
3840 13 Aug 19 peter 144   - utility::Aligner::Cigar::begin(void) and ::end(void) are now
3840 13 Aug 19 peter 145     implemented (see bug #929)
3840 13 Aug 19 peter 146   - Fixed bug in GFF2 parser when attribute field had space after a
3840 13 Aug 19 peter 147     semicolon (bug #928)
3840 13 Aug 19 peter 148
3840 13 Aug 19 peter 149   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3840 13 Aug 19 peter 150   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.16.2
3840 13 Aug 19 peter 151
3832 06 Aug 19 peter 152 version 0.16.1 (released 6 August 2019)
3832 06 Aug 19 peter 153   - Fixed a bug that PriorityQueue could only store unique elements (see #927)
3832 06 Aug 19 peter 154
3832 06 Aug 19 peter 155   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3832 06 Aug 19 peter 156   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.16.1
3832 06 Aug 19 peter 157
3823 16 Jul 19 peter 158 version 0.16 (released 16 July 2019)
3748 14 Aug 18 peter 159   - Constructor SVD(const Matrix&) is now declared explicit
3784 09 Jan 19 peter 160   - Macros in yat_am_macros.m4 updated to match changes in
3784 09 Jan 19 peter 161     autoconf-archive-2019.01.06
3707 16 Oct 17 peter 162
3707 16 Oct 17 peter 163   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3707 16 Oct 17 peter 164   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.16
3707 16 Oct 17 peter 165
3705 15 Oct 17 peter 166 yat 0.15.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.15-stable
3705 15 Oct 17 peter 167
3743 12 Jul 18 peter 168 version 0.15.1 (released 12 July 2018)
3743 12 Jul 18 peter 169   - Fixed bug in calculation of exact p_value when one element was
3743 12 Jul 18 peter 170     zero (bug #908)
3743 12 Jul 18 peter 171   - Fixed usage of GSL_error, so 'status' is propagated correctly (see r3737)
3743 12 Jul 18 peter 172
3743 12 Jul 18 peter 173   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3743 12 Jul 18 peter 174   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.15.1
3743 12 Jul 18 peter 175
3713 09 Nov 17 peter 176 version 0.15 (released 9 November 2017)
3713 09 Nov 17 peter 177   - New configure option '--enable-cxx11' New public macros
3713 09 Nov 17 peter 178     YAT_WITH_CXX11 and YAT_WITHOUT_CXX11, which allow user to enable
3713 09 Nov 17 peter 179     or disable, respectively, certain c++11 features such as move
3713 09 Nov 17 peter 180     constructors (see ticket #878)
3688 06 Sep 17 peter 181   - Matrix*Vector now returns a MatrixExpression, which can be
3688 06 Sep 17 peter 182     converted to a Vector implicitely. The change causes, however,
3688 06 Sep 17 peter 183     problems with GCC4 as described in ticket #897.
3688 06 Sep 17 peter 184
3566 04 Jan 17 peter 185   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3566 04 Jan 17 peter 186   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.15
3566 04 Jan 17 peter 187
3564 04 Jan 17 peter 188 yat 0.14.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.14-stable
3564 04 Jan 17 peter 189
3698 25 Sep 17 peter 190 version 0.14.4 (released 25 September 2017)
3698 25 Sep 17 peter 191   - BamWriteIterator default constructor is now implemented (bug #894)
3698 25 Sep 17 peter 192   - Fixed bug that InBamFile::n_mapped(tid) and
3698 25 Sep 17 peter 193     InBamFile::n_unmapped(tid) threw when tid contained no reads (#895)
3698 25 Sep 17 peter 194   - utility::basename("") now returns "." (bug #893)
3698 25 Sep 17 peter 195
3698 25 Sep 17 peter 196   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3698 25 Sep 17 peter 197   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14.4
3698 25 Sep 17 peter 198
3636 22 Mar 17 peter 199 version 0.14.3 (released 22 March 2017)
3636 22 Mar 17 peter 200   - Fixed code so it compiles against HTSlib 1.4 (see r3662)
3636 22 Mar 17 peter 201
3636 22 Mar 17 peter 202   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3636 22 Mar 17 peter 203   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14.3
3636 22 Mar 17 peter 204
3628 08 Mar 17 peter 205 version 0.14.2 (released 8 March 2017)
3628 08 Mar 17 peter 206   - Bug fixed in omic::dna_reverse_complement_copy (see bug #886)
3628 08 Mar 17 peter 207
3628 08 Mar 17 peter 208   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3628 08 Mar 17 peter 209   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14.2
3628 08 Mar 17 peter 210
3623 09 Feb 17 peter 211 version 0.14.1 (released 8 February 2017)
3623 09 Feb 17 peter 212   - Fixed bug in element-by-element operations in VectorMutable such
3623 09 Feb 17 peter 213     as operator+=, operator-=, ::mul(), and ::div(), when underlying
3623 09 Feb 17 peter 214     data structures of lhs and rhs overlap such that elements in rhs
3623 09 Feb 17 peter 215     are affected by the operation on lhs before they have been used on
3623 09 Feb 17 peter 216     rhs (bug #884).
3623 09 Feb 17 peter 217
3623 09 Feb 17 peter 218   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3623 09 Feb 17 peter 219   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14.1
3623 09 Feb 17 peter 220
3579 16 Jan 17 peter 221 version 0.14 (released 16 January 2017)
3548 01 Jan 17 peter 222   - The concept 'Distance' now requires that operator() works on
3548 01 Jan 17 peter 223     iterator that are readable and forward traversal, i.e., the
3548 01 Jan 17 peter 224     previously implicit requirement that iterator's reference type is
3548 01 Jan 17 peter 225     lvalue is dropped (ticket #873)
3485 23 Mar 16 peter 226   - libbam support is marked deprecated; use htslib.
3485 23 Mar 16 peter 227   - A new (private) pure virtual function assign(const VectorBase&)
3467 10 Feb 16 peter 228     was added in VectorMutable. (ticket #840)
3459 21 Jan 16 peter 229   - WeightedIterator is std::input_iterator_tag (ticket #803, r3459)
3442 24 Nov 15 peter 230   - Fisher::p_value exact is modified and the summation now runs over
3442 24 Nov 15 peter 231     i for which P(i)<=P(k). (#841)
3419 25 May 15 peter 232
3419 25 May 15 peter 233   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3419 25 May 15 peter 234   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14
3419 25 May 15 peter 235
3416 25 May 15 peter 236 yat 0.13.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.13-stable
3416 25 May 15 peter 237
3561 04 Jan 17 peter 238 version 0.13.1 (released 4 January 2017)
3561 04 Jan 17 peter 239   - fixed bug in pkg-config file 'yat.pc' (bug #850)
3561 04 Jan 17 peter 240   - improved detection of boost thread detection (bug #863)
3561 04 Jan 17 peter 241
3561 04 Jan 17 peter 242   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3561 04 Jan 17 peter 243   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.13
3561 04 Jan 17 peter 244
3439 20 Nov 15 peter 245 version 0.13 (released 20 November 2015)
3439 20 Nov 15 peter 246   - added support for htslib (see ticket #794)
3439 20 Nov 15 peter 247       - macro `YAT_HAVE_LIBBAM` is #defined if linking against either libbam
3439 20 Nov 15 peter 248         or libhts. Use #if defined YAT_HAVE_LIBBAM && !defined
3439 20 Nov 15 peter 249         (YAT_HAVE_HTSLIB) to check that building against libbam.
3439 20 Nov 15 peter 250       - macro `YAT_BAM_HEADER` is only #defined when building against libbam
3254 09 Jun 14 peter 251   - utility::get separates types in map and passed key (ticket #799)
3259 09 Jun 14 peter 252   - utility::Range is deprecated (ticket #786)
3266 03 Jul 14 peter 253   - AveragerWeighted::n(void) now return 0, when object is empty (ticket #802)
3393 17 Mar 15 peter 254   - Container2DIterator is now tagged with
3393 17 Mar 15 peter 255     boost::random_access_traversal_tag (see ticket #803, r3393)
3393 17 Mar 15 peter 256   - StrideIterator is now tagged with use_default (see ticket #803, r3393)
3400 30 Mar 15 peter 257   - configure option --without-samtools is deprecated; use --without-htslib
3220 06 May 14 peter 258
3220 06 May 14 peter 259   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3220 06 May 14 peter 260   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.13
3220 06 May 14 peter 261
3215 06 May 14 peter 262 yat 0.12.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.12-stable
3215 06 May 14 peter 263
3342 06 Nov 14 peter 264 version 0.12.2 (released 6 November 2014)
3342 06 Nov 14 peter 265   - Fixed bug in Aligner that internal data was not cleared between
3342 06 Nov 14 peter 266     alignments resulting in incorrect CIGAR (see bug #820)
3342 06 Nov 14 peter 267   - Fixed QuantileNormalizer seqfault when input had more columns than
3342 06 Nov 14 peter 268     rows (see bug #815)
3342 06 Nov 14 peter 269
3342 06 Nov 14 peter 270   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3342 06 Nov 14 peter 271   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.12.2
3342 06 Nov 14 peter 272
3306 21 Aug 14 peter 273 version 0.12.1 (released 21 August 2014)
3306 21 Aug 14 peter 274   - bam_calend is buggy in older versions of samtools; configure
3306 21 Aug 14 peter 275     script checks that bam_calend works as expected; if not use its
3306 21 Aug 14 peter 276     own implementation (see bug #810)
3306 21 Aug 14 peter 277
3306 21 Aug 14 peter 278   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3306 21 Aug 14 peter 279   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.12.1
3306 21 Aug 14 peter 280
3295 25 Jul 14 peter 281 version 0.12 (released 25 July 2014)
3295 25 Jul 14 peter 282   - BamRead::cigar(const std::vector<uint32_t>&) is deprecated
3208 04 May 14 peter 283   - Aligner(double, double) is now explicit (see r3207)
3157 05 Jan 14 peter 284   - GetlineIterator(istream&, char) is now explicit (see r3148)
3295 25 Jul 14 peter 285   - rename(2) and remove(1) are now implemented (bug #804)
3117 11 Nov 13 peter 286
3117 11 Nov 13 peter 287   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3117 11 Nov 13 peter 288   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.12
3117 11 Nov 13 peter 289
3115 11 Nov 13 peter 290 yat 0.11.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.11-stable
3115 11 Nov 13 peter 291
3188 25 Mar 14 peter 292 version 0.11.2 (released 25 March 2014)
3188 25 Mar 14 peter 293   - Fixed bug that error in OutBamFile::write was not detected (see r3163)
3188 25 Mar 14 peter 294   - Fixed bug that `-lgsl` was not included in `yat-config --libs` (bug #788)
3188 25 Mar 14 peter 295
3188 25 Mar 14 peter 296   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3188 25 Mar 14 peter 297   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.11.2
3188 25 Mar 14 peter 298
3144 18 Dec 13 peter 299 version 0.11.1 (released 18 December 2013)
3144 18 Dec 13 peter 300   - Fixed bug in BamHeader::tid(const std::string&) (see bug #776)
3144 18 Dec 13 peter 301
3144 18 Dec 13 peter 302   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3144 18 Dec 13 peter 303   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.11.1
3144 18 Dec 13 peter 304
3130 18 Nov 13 peter 305 version 0.11 (released 18 November 2013)
3004 24 Mar 13 peter 306   - Fisher::one_sided_p(void) is now deprecated (ticket #689)
3005 24 Mar 13 peter 307   - PearsonCorrelation::one_sided_p(void) is now deprecated (ticket #689)
3006 01 Apr 13 peter 308   - PearsonCorrelation::one_sided_p(void) is now deprecated (ticket #689)
3006 01 Apr 13 peter 309   - ROC::p_value_one_sided(void is now deprecated (ticket #689)
3023 06 Apr 13 peter 310   - ROC::area(void) is now declared const (ticket #754)
3024 06 Apr 13 peter 311   - tTest::score(void) is now declared const (ticket #755)
3056 24 Jun 13 peter 312   - BamReadIterator(4) will now throw if region is invalid (ticket #764)
3068 01 Aug 13 peter 313   - #defines HAVE_BAM_H, HAVE_BAM_BAM_H, and HAVE_SAMTOOLS_BAM_H have been
3068 01 Aug 13 peter 314     replaced with corresponding macros with prefix 'YAT_' (see ticket #766)
3130 18 Nov 13 peter 315   - Bam interface is now more complete (see tickets #746 and #739)
2921 19 Dec 12 peter 316
2921 19 Dec 12 peter 317   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2921 19 Dec 12 peter 318   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.11
2921 19 Dec 12 peter 319
2918 19 Dec 12 peter 320 yat 0.10.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.10-stable
2918 19 Dec 12 peter 321
3098 28 Oct 13 peter 322 version 0.10.3 (released 28 October 2013)
3098 28 Oct 13 peter 323   - utility::replace(string&, string, string) is now implemented (bug #768)
3098 28 Oct 13 peter 324
3098 28 Oct 13 peter 325   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3098 28 Oct 13 peter 326   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.10.3
3098 28 Oct 13 peter 327
3018 04 Apr 13 peter 328 version 0.10.2 (released 4 April 2013)
3018 04 Apr 13 peter 329   - On OSX yat is built using flat_namespace (see bug #745)
3018 04 Apr 13 peter 330   - BamRead::mtid(void) is now implemented (see bug #743)
3018 04 Apr 13 peter 331   - Fixed bug in KolmogorovSmirnov::remove (see bug #753)
3018 04 Apr 13 peter 332
3018 04 Apr 13 peter 333   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3018 04 Apr 13 peter 334   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.10.2
3018 04 Apr 13 peter 335
2960 17 Jan 13 peter 336 version 0.10.1 (released 17 January 2013)
2960 17 Jan 13 peter 337   - libyat is no longer linked against -lbam (bug #733)
2960 17 Jan 13 peter 338   - yat.pc now mentions -lbam and -lz (bug #736)
2960 17 Jan 13 peter 339   - include style <samtools/bam.h> now supported (bug #735)
2960 17 Jan 13 peter 340   - BamHeader::target_length(1) is now implemented (bug #740)
2960 17 Jan 13 peter 341
2960 17 Jan 13 peter 342   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2960 17 Jan 13 peter 343   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.10.1
2960 17 Jan 13 peter 344
2943 04 Jan 13 peter 345 version 0.10 (released 4 January 2013)
2943 04 Jan 13 peter 346   - samtools wrapper classes (ticket #729)
2943 04 Jan 13 peter 347   - new utility functions (ticket #717)
2823 30 Aug 12 peter 348
2823 30 Aug 12 peter 349   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2823 30 Aug 12 peter 350   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.10
2823 30 Aug 12 peter 351
2838 16 Sep 12 peter 352 yat 0.9.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.9-stable
2821 30 Aug 12 peter 353
2916 19 Dec 12 peter 354 version 0.9.2 (released 19 December 2012)
2916 19 Dec 12 peter 355   - fixed bug how inclusion path is displayed in documentation (bug #728)
2916 19 Dec 12 peter 356
2916 19 Dec 12 peter 357   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2916 19 Dec 12 peter 358   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.9.2
2916 19 Dec 12 peter 359
2853 23 Sep 12 peter 360 version 0.9.1 (released 23 September 2012)
2853 23 Sep 12 peter 361   - bug in Aligner fixed (see bug #724)
2853 23 Sep 12 peter 362   - Commandline::parse now throws when finding '--no-foo' (bug #723)
2853 23 Sep 12 peter 363   - yat.pc now mentions Boost::System and Boost::Thread in Libs.private (#722)
2853 23 Sep 12 peter 364   - documentations is now installed again (bug #721)
2853 23 Sep 12 peter 365
2853 23 Sep 12 peter 366   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2853 23 Sep 12 peter 367   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.9.1
2853 23 Sep 12 peter 368
2838 16 Sep 12 peter 369 version 0.9 (released 16 September 2012)
2815 28 Aug 12 peter 370   - utility::SmithWaterman is deprecated (ticket #706)
2783 21 Jul 12 jari 371   - yat now depends on boost thread and system library (ticket #568 and #714)
2779 19 Jul 12 peter 372   - utility::SmartPtr was marked internal (see r2778)
2793 27 Jul 12 peter 373   - ssearch now takes parameter setting mismatch (r2792)
3018 04 Apr 13 peter 374   - RNG class is now multithread safe (ticket #568)
2838 16 Sep 12 peter 375   - The build system now uses a non-recursive Makefile (ticket #703)
2617 05 Nov 11 peter 376
2617 05 Nov 11 peter 377   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2617 05 Nov 11 peter 378   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.9
2617 05 Nov 11 peter 379
2615 05 Nov 11 peter 380 yat 0.8.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.8-stable
2615 05 Nov 11 peter 381
2798 27 Jul 12 peter 382 version 0.8.2 (released 27 July 2012)
2798 27 Jul 12 peter 383   - Fixed bug in operator+= in Averager and AveragerWeighted (bug #709)
2798 27 Jul 12 peter 384
2798 27 Jul 12 peter 385   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2798 27 Jul 12 peter 386   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.8.2
2798 27 Jul 12 peter 387
2798 27 Jul 12 peter 388
2703 12 Mar 12 peter 389 version 0.8.1 (released 12 March 2012)
2703 12 Mar 12 peter 390   - Fixed bug that GFF::attribute was only loaded first time (see bug #697)
2703 12 Mar 12 peter 391
2703 12 Mar 12 peter 392   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2703 12 Mar 12 peter 393   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.8.1
2703 12 Mar 12 peter 394
2703 12 Mar 12 peter 395
2673 03 Dec 11 peter 396 version 0.8 (released 2 December 2011)
2612 04 Nov 11 peter 397   - Rule for when to use approximation in ROC::p_value modified (ticket #677)
2578 04 Oct 11 peter 398   - Discrete::seed, Continuous::seed, Discrete::seed_from_devurandom,
2578 04 Oct 11 peter 399     and Continuous::seed_from_devurandom are deprecated (issue #674)
2575 02 Oct 11 peter 400   - configure supports --enable-silent-rules (#654)
2531 28 Jul 11 peter 401   - Macros YAT_CPP_ADD_FLAG, YAT_CXX_ADD_FLAG and YAT_LD_ADD_FLAG now require
2531 28 Jul 11 peter 402     macros provided in ax_check*flag.m4 and ax_append*flags.m4(r2524)
2460 03 Apr 11 peter 403   - Exception classes inherit from yat::utility::runtime_error (r2459)
2463 11 Apr 11 peter 404   - deprecated configure option `--with-gsl-prefix` is removed
2463 11 Apr 11 peter 405   - deprecated configure option `--with-gsl-exec-prefix` is removed
2489 27 May 11 peter 406   - changed behavior of configure option `--htmldir` (r2487)
2393 06 Jan 11 peter 407
2393 06 Jan 11 peter 408   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2393 06 Jan 11 peter 409   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.8
2393 06 Jan 11 peter 410
2393 06 Jan 11 peter 411
2390 06 Jan 11 peter 412 yat 0.7.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.7-stable
2390 06 Jan 11 peter 413
2601 30 Oct 11 peter 414 version 0.7.3 (released 30 October 2011)
2601 30 Oct 11 peter 415   - ROC::area no longer crashes when no data have been added (bug #669)
2601 30 Oct 11 peter 416   - namespace classifier is no included in doxygen input again (bug #667)
2601 30 Oct 11 peter 417
2601 30 Oct 11 peter 418   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2601 30 Oct 11 peter 419   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.7.3
2601 30 Oct 11 peter 420
2601 30 Oct 11 peter 421
2470 12 Apr 11 peter 422 version 0.7.2 (released 12 April 2011)
2470 12 Apr 11 peter 423   - omic::Codon("ATG").amino_acid() now return 'M' (bug #664)
2470 12 Apr 11 peter 424   - median now works on empty ranges (bug #660)
2470 12 Apr 11 peter 425   - fixed bug percentiler sometimes zero weight elements (r2466)
2470 12 Apr 11 peter 426
2470 12 Apr 11 peter 427   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2470 12 Apr 11 peter 428   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.7.2
2470 12 Apr 11 peter 429
2470 12 Apr 11 peter 430
2411 13 Jan 11 peter 431 version 0.7.1 (released 13 January 2011)
2411 13 Jan 11 peter 432   - Fixed compiler (gcc 3) error in Histogram.cc (issue #649)
2411 13 Jan 11 peter 433   - Fixed compiler warning in concept_check.h (issue #648)
2411 13 Jan 11 peter 434
2411 13 Jan 11 peter 435   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2411 13 Jan 11 peter 436   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.7.1
2411 13 Jan 11 peter 437
2411 13 Jan 11 peter 438
2400 08 Jan 11 peter 439 version 0.7 (released 8 January 2011)
2383 22 Dec 10 peter 440   - new namespace theplu::yat::omic
2383 22 Dec 10 peter 441   - Constructors *Lookup(Matrix, Index, bool) are deprecated (#543)
2297 12 Jul 10 peter 442   - dvi, ps and pdf docs are no longer generated
2248 22 Apr 10 peter 443   - utility::load functions now work with std::string as well.
2163 20 Jan 10 peter 444
2163 20 Jan 10 peter 445   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2163 20 Jan 10 peter 446   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.7
2163 20 Jan 10 peter 447
2163 20 Jan 10 peter 448
2160 19 Jan 10 peter 449 yat 0.6.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.6-stable
2160 19 Jan 10 peter 450
2382 21 Dec 10 peter 451 Version 0.6.3 (released 21 December 2010)
2382 21 Dec 10 peter 452
2382 21 Dec 10 peter 453   - fixed overflow in statistics::Fisher (#638)
2382 21 Dec 10 peter 454   - fixed bug that double was hard-coded in function load<T>(6) (r2271)
2382 21 Dec 10 peter 455
2382 21 Dec 10 peter 456   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2382 21 Dec 10 peter 457   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.6.3
2382 21 Dec 10 peter 458
2257 18 May 10 peter 459 Version 0.6.2 (released 18 May 2010)
2257 18 May 10 peter 460
2257 18 May 10 peter 461   - fixed bug with merge when result is weighted (r2251)
2257 18 May 10 peter 462
2257 18 May 10 peter 463   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2257 18 May 10 peter 464   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.6.2
2257 18 May 10 peter 465
2217 14 Mar 10 peter 466 Version 0.6.1 (released 14 March 2010)
2217 14 Mar 10 peter 467
2217 14 Mar 10 peter 468   - fixed bug with `yat-config --ldflags` (#615)
2217 14 Mar 10 peter 469   - fixed bug in FileUtil::permission when file does not exist (#617)
2217 14 Mar 10 peter 470
2217 14 Mar 10 peter 471   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2217 14 Mar 10 peter 472   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.6.1
2217 14 Mar 10 peter 473
2202 21 Feb 10 peter 474 Version 0.6 (released 21 February 2010)
1826 24 Feb 09 peter 475
2153 17 Jan 10 peter 476   - Boost 1.35 is now required (#603)
2129 23 Dec 09 peter 477   - new configure option `--with-gsl` (#544)
2129 23 Dec 09 peter 478   - configure option `--with-gsl-prefix` is deprecated (#544)
2129 23 Dec 09 peter 479   - configure option `--with-gsl-exec-prefix` is deprecated (#544)
2129 23 Dec 09 peter 480   - Behavior of operator==(DataWeightProxy, DataWeightProxy) is modified (#578)
2089 21 Oct 09 peter 481   - several constructors in namespace random are now declared explicit (#571)
2068 17 Sep 09 peter 482   - pair_first_iterator and pair_second_iterator now work with
2068 17 Sep 09 peter 483     const_iterator (ticket:562)
2065 16 Sep 09 peter 484   - Passing by const& in KolmogorovSmirnov::Element::operator< (r2064)
2059 11 Sep 09 peter 485   - classes OptionInFile and OptionOutFile are deprecated (ticket:521)
2003 13 Jun 09 peter 486   - DataWeight comparison operators were changed in case of NaN (ticket:536)
1940 04 May 09 peter 487   - new option --libs-without-cblas in yat-config (ticket:523)
1937 01 May 09 peter 488   - blas is no longer hard-coded into libyat.so and libyat.la (ticket:518)
1863 13 Mar 09 peter 489   - using unsigned long int (rather than signed) in SVN::max_epoch (ticket:506)
1863 13 Mar 09 peter 490
1826 24 Feb 09 peter 491   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1826 24 Feb 09 peter 492   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.6
1826 24 Feb 09 peter 493
2138 24 Dec 09 peter 494 Version 0.5.6 (released 24 December 2009)
2138 24 Dec 09 peter 495
2138 24 Dec 09 peter 496   - Fixed bugs in EnsembleBuilder::predict (bugs #567 and #579)
2138 24 Dec 09 peter 497   - Corrected dependency libs in libyat.la (bug #573)
2138 24 Dec 09 peter 498
2138 24 Dec 09 peter 499   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2138 24 Dec 09 peter 500   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.6
2138 24 Dec 09 peter 501
2103 06 Nov 09 peter 502 Version 0.5.5 (released 5 November 2009)
2103 06 Nov 09 peter 503
2103 06 Nov 09 peter 504   - SVM::predict is calculated as geometric distance (issue #542)
2103 06 Nov 09 peter 505   - detection of GSL is improved (issue #558)
2103 06 Nov 09 peter 506
2103 06 Nov 09 peter 507   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2103 06 Nov 09 peter 508   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.5
2103 06 Nov 09 peter 509
1998 13 Jun 09 peter 510 Version 0.5.4 (released 12 June 2009)
1998 13 Jun 09 peter 511
1998 13 Jun 09 peter 512   - Disable dvi ps and pdf documentation in case of doxygen 1.5.8 (issue #548)
1998 13 Jun 09 peter 513   - improved uninstalled yat-config so it works in VPATH build (issue #539)
1998 13 Jun 09 peter 514   - improved documentation
1998 13 Jun 09 peter 515
1998 13 Jun 09 peter 516   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1998 13 Jun 09 peter 517   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.4
1998 13 Jun 09 peter 518
1954 07 May 09 jari 519 Version 0.5.3 (released 7 May 2009)
1954 07 May 09 jari 520
1954 07 May 09 jari 521   - fixed serious bug in qQuantileNormalization related to sorting
1954 07 May 09 jari 522     with NaNs in vectors (issue #535). VectorMutable and Percentiler
1954 07 May 09 jari 523     classes were affected with the same issue.
1954 07 May 09 jari 524   - fixed problem with running configure on 64-bit CentOS (issue #527)
1954 07 May 09 jari 525   - make check works again (issue #528)
1954 07 May 09 jari 526
1954 07 May 09 jari 527   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1954 07 May 09 jari 528   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.3
1954 07 May 09 jari 529
1874 17 Mar 09 peter 530 Version 0.5.2 (released 17 March 2009)
1874 17 Mar 09 peter 531
1874 17 Mar 09 peter 532   - fixed compilation error in IGP (issue #503)
1874 17 Mar 09 peter 533   - fixed incorrect error message from CommandLine (issue #508)
1874 17 Mar 09 peter 534
1874 17 Mar 09 peter 535   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1874 17 Mar 09 peter 536   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.2
1874 17 Mar 09 peter 537
1839 26 Feb 09 peter 538 Version 0.5.1 (released 26 February 2009)
1839 26 Feb 09 peter 539
1839 26 Feb 09 peter 540   - libtool version number was corrected (see r1833)
1839 26 Feb 09 peter 541
1832 24 Feb 09 peter 542 Version 0.5 (released 24 February 2009)
905 27 Sep 07 peter 543
1818 21 Feb 09 peter 544   - Upgraded to GLPv3
1818 21 Feb 09 peter 545   - yat now requires GSL 1.8 or later
1818 21 Feb 09 peter 546   - yat now requires Boost 1.33 or later
1651 15 Dec 08 peter 547   - Imlicit conversion between Vector and its Views disabled (ticket:467)
1818 21 Feb 09 peter 548   - Averager::add and AveragerPair::add take a _signed_ long (ticket:361)
1611 04 Nov 08 peter 549   - IteratorPolicy removed (ticket:398)
1587 17 Oct 08 peter 550   - MatrixLookupWeighted(const MatrixLookup&) modified (ticket:396)
1465 02 Sep 08 peter 551   - Option::parse and OptionArg::do_parse takes references (ticket:418)
1312 19 May 08 peter 552   - is_int now depends on numerical_limits for inf and NaN treatment
1312 19 May 08 peter 553   - Similar for is_float. See revision [1312] for details.
1321 23 May 08 peter 554   - config.h is no longer installed
1818 21 Feb 09 peter 555   - Copy and assignment are now allowed for KolmogorovSmirnov
1818 21 Feb 09 peter 556   - is_int(1), is_float(1), is_float(1) are deprecated use is<T>
1818 21 Feb 09 peter 557   - percentile(3) is deprecated, use percentile2(3) 
1818 21 Feb 09 peter 558   - Target::operator[] is deprecated, use Target::operator()
1287 24 Apr 08 peter 559
1619 06 Nov 08 peter 560   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1619 06 Nov 08 peter 561   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5
1619 06 Nov 08 peter 562
1746 23 Jan 09 peter 563 Version 0.4.3 (released 23 January 2009)
1746 23 Jan 09 peter 564
1746 23 Jan 09 peter 565   - Fisher::p_value is now correct (bug #461)
1746 23 Jan 09 peter 566   - Fisher::oddsratio is now correct (bug #460)
1746 23 Jan 09 peter 567
1746 23 Jan 09 peter 568   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1746 23 Jan 09 peter 569   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.4.3
1746 23 Jan 09 peter 570
1437 25 Aug 08 peter 571 Version 0.4.2 (released 25 August 2008)
1437 25 Aug 08 peter 572
1437 25 Aug 08 peter 573   - FileUtil can now handle large files (#378)
1437 25 Aug 08 peter 574   - x variable is trained in regression::Local::fit() (#423)
1437 25 Aug 08 peter 575
1437 25 Aug 08 peter 576   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 577   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.4.2
1437 25 Aug 08 peter 578
1303 14 May 08 peter 579 Version 0.4.1 (released 14 May 2008)
1303 14 May 08 peter 580
1303 14 May 08 peter 581   - Files needed for build of documentation is included in distribution (#365)
1303 14 May 08 peter 582
1303 14 May 08 peter 583   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 584   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.4.1
1303 14 May 08 peter 585
1277 11 Apr 08 jari 586 Version 0.4 (released 11 April 2008)
1277 11 Apr 08 jari 587
1270 09 Apr 08 peter 588   - Class vector was split into Vector, VectorView and VectorConstView
1270 09 Apr 08 peter 589   - Class matrix was renamed to Matrix
1270 09 Apr 08 peter 590   - Containers, e.g. Vector, now have iterators.
1270 09 Apr 08 peter 591   - EnsembleBuilder and SubSetGenerator were refactored and are now templates
1270 09 Apr 08 peter 592   - SupervisedClassifier is now a pure interface class
1270 09 Apr 08 peter 593   - SVM is not inherited from SupervisedClassifier
1270 09 Apr 08 peter 594   - NCC was refactored and is now a template
1270 09 Apr 08 peter 595   - Distance interfaces against iterators
933 05 Oct 07 peter 596   - interface of median, percentile, and mad functions are
933 05 Oct 07 peter 597     modified. They now take iterators rather than containers.
917 30 Sep 07 peter 598   - is_double(), is_int(), and is_float() return true also when string
1488 10 Sep 08 peter 599     is a nan or inf.
917 30 Sep 07 peter 600   - add_values function in Averagers replaced by iterator interface
917 30 Sep 07 peter 601
905 27 Sep 07 peter 602   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 603   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.4
905 27 Sep 07 peter 604
905 27 Sep 07 peter 605 Version 0.3.1 (released 28 April 2007)
905 27 Sep 07 peter 606
905 27 Sep 07 peter 607   - Bugfix release
905 27 Sep 07 peter 608
905 27 Sep 07 peter 609   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 610   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.3.1
905 27 Sep 07 peter 611
905 27 Sep 07 peter 612 Version 0.3 (released 9 April 2007)
905 27 Sep 07 peter 613
905 27 Sep 07 peter 614   - First public release
905 27 Sep 07 peter 615
905 27 Sep 07 peter 616   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 617   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.3+%28Public+release%29
905 27 Sep 07 peter 618
905 27 Sep 07 peter 619
905 27 Sep 07 peter 620
905 27 Sep 07 peter 621 ----------------------------------------------------------------------
905 27 Sep 07 peter 622 {{{
2119 12 Dec 09 peter 623 Copyright (C) 2003, 2006 Jari Häkkinen
4359 23 Aug 23 peter 624 Copyright (C) 2007 Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 625 Copyright (C) 2008, 2009 Jari Häkkinen, Peter Johansson
2787 23 Jul 12 peter 626 Copyright (C) 2010, 2011 Peter Johansson
2787 23 Jul 12 peter 627 Copyright (C) 2012 Jari Häkkinen, Peter Johansson
4308 10 Feb 23 peter 628 Copyright (C) 2013, 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019, 2020, 2021, 2022, 2023 Peter Johansson
675 10 Oct 06 jari 629
1437 25 Aug 08 peter 630 This file is part of yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
675 10 Oct 06 jari 631
675 10 Oct 06 jari 632 The yat library is free software; you can redistribute it and/or
675 10 Oct 06 jari 633 modify it under the terms of the GNU General Public License as
1486 09 Sep 08 jari 634 published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
675 10 Oct 06 jari 635 License, or (at your option) any later version.
675 10 Oct 06 jari 636
675 10 Oct 06 jari 637 The yat library is distributed in the hope that it will be useful, but
675 10 Oct 06 jari 638 WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
675 10 Oct 06 jari 639 MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
675 10 Oct 06 jari 640 General Public License for more details.
675 10 Oct 06 jari 641
675 10 Oct 06 jari 642 You should have received a copy of the GNU General Public License
1487 10 Sep 08 jari 643 along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
905 27 Sep 07 peter 644 }}}
905 27 Sep 07 peter 645 ----------------------------------------------------------------------