NEWS

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2 19 Feb 03 jari 1 $Id$
675 10 Oct 06 jari 2
905 27 Sep 07 peter 3 See the end of this file for copyrights and conditions.
905 27 Sep 07 peter 4
4209 26 Aug 22 peter 5 version 0.21 (released NOT YET)
4339 15 Apr 23 peter 6   - A number of classes no longer inherit from std::unary_function (or
4339 15 Apr 23 peter 7     std::binary_function), but typedef argument_type
4339 15 Apr 23 peter 8     (first_argument_type or second_argument_type) and result_type
4339 15 Apr 23 peter 9     itself instead (ticket #998).
4276 25 Jan 23 peter 10   - htslib 1.10 (or newer) is now required (ticket #991)
4279 26 Jan 23 peter 11   - GSL 2.2 (or newer) is now required (ticket #983)
4326 12 Mar 23 peter 12   - YAT_AC_WRITE has been replaced by YAT_AC_WRITE_TO_FILE
4326 12 Mar 23 peter 13   - YAT_AC_WRITE_APPEND has been replaced by YAT_AC_APPEND_TO_FILE
4209 26 Aug 22 peter 14
4209 26 Aug 22 peter 15   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4209 26 Aug 22 peter 16   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.21
4209 26 Aug 22 peter 17
4206 26 Aug 22 peter 18 yat 0.20.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.20-stable
4206 26 Aug 22 peter 19
4316 17 Feb 23 peter 20 version 0.20.2 (released 17 February 2023)
4316 17 Feb 23 peter 21   - Fixed bug in VCF::Info::set(2) (bug #995)
4316 17 Feb 23 peter 22
4316 17 Feb 23 peter 23   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4316 17 Feb 23 peter 24   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.20.2
4316 17 Feb 23 peter 25
4308 10 Feb 23 peter 26 version 0.20.1 (released 10 February 2023)
4308 10 Feb 23 peter 27   - Aligner::needleman_wunsch and NeedlemanWunsch functions were
4308 10 Feb 23 peter 28     previously buggy for non-zero gap penalties (bug #993)
4308 10 Feb 23 peter 29   - VcfHeaer::add_program_command now outputs Date (bug #994)
4308 10 Feb 23 peter 30
4308 10 Feb 23 peter 31   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4308 10 Feb 23 peter 32   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.20.1
4308 10 Feb 23 peter 33
4252 18 Nov 22 peter 34 version 0.20 (released 18 November 2022)
4252 18 Nov 22 peter 35   - Boost 1.66 (or newer) is now required (see r4228)
4097 17 Sep 21 peter 36   - utility::replace(3) now takes const string& rather than string
4186 04 Jul 22 peter 37   - normalizer::QuantileNormalizer is deprecated; use
4186 04 Jul 22 peter 38     QuantileNormalizer2 instead (ticket #984)
4091 07 Sep 21 peter 39
4091 07 Sep 21 peter 40   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4091 07 Sep 21 peter 41   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.20
4091 07 Sep 21 peter 42
4088 07 Sep 21 peter 43 yat 0.19.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.19-stable
4088 07 Sep 21 peter 44
4204 26 Aug 22 peter 45 version 0.19.2 (released 26 August 2022)
4204 26 Aug 22 peter 46   - Bug fixed in Scheduler when two exception was thrown (see r4167)
4204 26 Aug 22 peter 47
4204 26 Aug 22 peter 48   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4204 26 Aug 22 peter 49   https://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.19.2
4204 26 Aug 22 peter 50
4164 13 Mar 22 peter 51 version 0.19.1 (released 13 March 2022)
4164 13 Mar 22 peter 52   - Several bugs in Scheduler have been fixed (#980, #981, #982)
4164 13 Mar 22 peter 53
4164 13 Mar 22 peter 54   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4164 13 Mar 22 peter 55   https://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.19.1
4164 13 Mar 22 peter 56
4110 27 Sep 21 peter 57 version 0.19 (released 27 September 2021)
4051 04 Mar 21 peter 58   - classifier::Target::labels(void) is now const (issue #972)
4054 26 Mar 21 peter 59   - statistics::correlation now takes a const Matrix& instead of Matrix
4001 08 Oct 20 peter 60
4001 08 Oct 20 peter 61   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4001 08 Oct 20 peter 62   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.19
4001 08 Oct 20 peter 63
3998 08 Oct 20 peter 64 yat 0.18.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.18-stable
3998 08 Oct 20 peter 65
4032 21 Jan 21 peter 66 version 0.18.1 (released 21 January 2021)
4032 21 Jan 21 peter 67   - SegmentTree::key_comp() and ::value_comp() now compile (bug #970).
4032 21 Jan 21 peter 68
4032 21 Jan 21 peter 69   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
4032 21 Jan 21 peter 70   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.18.1
4032 21 Jan 21 peter 71
4019 06 Nov 20 peter 72 version 0.18 (released 6 November 2020)
3980 24 Aug 20 peter 73   - regression::NegativeBinomial now inherits from
3980 24 Aug 20 peter 74     regression::Multivariate (ticket #957)
3938 16 Jul 20 peter 75   - yat now requires a c++11 compliant compiler (ticket #949)
3922 07 Jun 20 peter 76   - yat now requires GSL 1.13 or later (ticket #945)
3883 24 Mar 20 peter 77   - Building against libbam is no longer supported (ticket #939)
3960 01 Aug 20 peter 78   - libyat is no longer linked against libboost_system and
3960 01 Aug 20 peter 79     libboost_thread (ticket #953)
3960 01 Aug 20 peter 80   - macro YAT_HAVE_WORKING_BOOST_EXCEPTION_PTR is no longer #defined
3960 01 Aug 20 peter 81     in yat/utility/config_public.h (ticket #953)
3938 16 Jul 20 peter 82   - configure option --disable-cxx11 is no longer supported (ticket #949)
3911 17 May 20 peter 83   - configure option --without-samtools is no longer supported; use
3883 24 Mar 20 peter 84     --without-htslib
3883 24 Mar 20 peter 85   - Autoconf macro YAT_CHECK_HTSLIB is no longer looking for libbam or
3883 24 Mar 20 peter 86     header files from the samtools API (ticket #939)
3911 17 May 20 peter 87   - protected function BamFile::open_base(3) is deprecated, use open_base(2).
3857 02 Jan 20 peter 88
3857 02 Jan 20 peter 89   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3857 02 Jan 20 peter 90   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.18
3857 02 Jan 20 peter 91
3854 02 Jan 20 peter 92 yat 0.17.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.17-stable
3854 02 Jan 20 peter 93
3987 26 Aug 20 peter 94 version 0.17.2 (released 26 August 2020)
3987 26 Aug 20 peter 95   - Fixed bug in Kendall::p_value() that caused overstimation when
3987 26 Aug 20 peter 96     both variables contained triplets (see bug #955)
3987 26 Aug 20 peter 97   - VectorMutable::all(double) now works on zero-sized vector, which
3987 26 Aug 20 peter 98     means that Vector::resize(0) now works on a zero-sized vector (bug
3987 26 Aug 20 peter 99     #956)
3966 11 Aug 20 peter 100   - Generating documentation now works with Doxygen 1.8.19 (bug #954)
3966 11 Aug 20 peter 101   - GSL, HTSLIB, Boost.Thread and Boost.System are not declated private
3966 11 Aug 20 peter 102     in pkg-config file yat.pc (bug #952).
3966 11 Aug 20 peter 103
3966 11 Aug 20 peter 104   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3966 11 Aug 20 peter 105   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.17.2
3966 11 Aug 20 peter 106
3930 08 Jul 20 peter 107 version 0.17.1 (released 8 July 2020)
3930 08 Jul 20 peter 108   - getvector(istream& is, vector<double>& vec) now clears the passed
3930 08 Jul 20 peter 109     vector before populating it with values from istream. Same
3930 08 Jul 20 peter 110     behaviour as getvector(istream, vector<string>&> and
3930 08 Jul 20 peter 111     std::getline(istream&, string&) (Bug #947)
3893 27 Mar 20 peter 112   - Fixed ambiguous DiscreteUniform::result_type (bug #942)
3893 27 Mar 20 peter 113
3893 27 Mar 20 peter 114   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3893 27 Mar 20 peter 115   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.17.1
3893 27 Mar 20 peter 116
3875 05 Mar 20 peter 117 version 0.17 (released 5 March 2020)
3870 24 Feb 20 peter 118   - Class Percentiler and functions using the class (percentile2,
3870 24 Feb 20 peter 119     median, and mad) are now documented to require lvalue access (see
3870 24 Feb 20 peter 120     bug #935)
3804 12 May 19 peter 121   - cxx11 features are now available also when YAT_WITH_CXX11 is not
3804 12 May 19 peter 122     defined; user can still turn off cxx11 features with
3805 13 May 19 peter 123     YAT_WITHOUT_CXX11 (ticket #904)
3796 12 Apr 19 peter 124
3796 12 Apr 19 peter 125   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3796 12 Apr 19 peter 126   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.17
3796 12 Apr 19 peter 127
3793 12 Apr 19 peter 128 yat 0.16.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.16-stable
3793 12 Apr 19 peter 129
3851 12 Dec 19 peter 130 version 0.16.3 (released 12 December 2019)
3851 12 Dec 19 peter 131   - fixed a bug in Scheduler::Jobs (ticket #931)
3851 12 Dec 19 peter 132
3851 12 Dec 19 peter 133   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3851 12 Dec 19 peter 134   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.16.3
3851 12 Dec 19 peter 135
3840 13 Aug 19 peter 136 version 0.16.2 (released 13 August 2019)
3840 13 Aug 19 peter 137   - utility::Aligner::Cigar::begin(void) and ::end(void) are now
3840 13 Aug 19 peter 138     implemented (see bug #929)
3840 13 Aug 19 peter 139   - Fixed bug in GFF2 parser when attribute field had space after a
3840 13 Aug 19 peter 140     semicolon (bug #928)
3840 13 Aug 19 peter 141
3840 13 Aug 19 peter 142   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3840 13 Aug 19 peter 143   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.16.2
3840 13 Aug 19 peter 144
3832 06 Aug 19 peter 145 version 0.16.1 (released 6 August 2019)
3832 06 Aug 19 peter 146   - Fixed a bug that PriorityQueue could only store unique elements (see #927)
3832 06 Aug 19 peter 147
3832 06 Aug 19 peter 148   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3832 06 Aug 19 peter 149   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.16.1
3832 06 Aug 19 peter 150
3823 16 Jul 19 peter 151 version 0.16 (released 16 July 2019)
3748 14 Aug 18 peter 152   - Constructor SVD(const Matrix&) is now declared explicit
3784 09 Jan 19 peter 153   - Macros in yat_am_macros.m4 updated to match changes in
3784 09 Jan 19 peter 154     autoconf-archive-2019.01.06
3707 16 Oct 17 peter 155
3707 16 Oct 17 peter 156   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3707 16 Oct 17 peter 157   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.16
3707 16 Oct 17 peter 158
3705 15 Oct 17 peter 159 yat 0.15.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.15-stable
3705 15 Oct 17 peter 160
3743 12 Jul 18 peter 161 version 0.15.1 (released 12 July 2018)
3743 12 Jul 18 peter 162   - Fixed bug in calculation of exact p_value when one element was
3743 12 Jul 18 peter 163     zero (bug #908)
3743 12 Jul 18 peter 164   - Fixed usage of GSL_error, so 'status' is propagated correctly (see r3737)
3743 12 Jul 18 peter 165
3743 12 Jul 18 peter 166   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3743 12 Jul 18 peter 167   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.15.1
3743 12 Jul 18 peter 168
3713 09 Nov 17 peter 169 version 0.15 (released 9 November 2017)
3713 09 Nov 17 peter 170   - New configure option '--enable-cxx11' New public macros
3713 09 Nov 17 peter 171     YAT_WITH_CXX11 and YAT_WITHOUT_CXX11, which allow user to enable
3713 09 Nov 17 peter 172     or disable, respectively, certain c++11 features such as move
3713 09 Nov 17 peter 173     constructors (see ticket #878)
3688 06 Sep 17 peter 174   - Matrix*Vector now returns a MatrixExpression, which can be
3688 06 Sep 17 peter 175     converted to a Vector implicitely. The change causes, however,
3688 06 Sep 17 peter 176     problems with GCC4 as described in ticket #897.
3688 06 Sep 17 peter 177
3566 04 Jan 17 peter 178   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3566 04 Jan 17 peter 179   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.15
3566 04 Jan 17 peter 180
3564 04 Jan 17 peter 181 yat 0.14.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.14-stable
3564 04 Jan 17 peter 182
3698 25 Sep 17 peter 183 version 0.14.4 (released 25 September 2017)
3698 25 Sep 17 peter 184   - BamWriteIterator default constructor is now implemented (bug #894)
3698 25 Sep 17 peter 185   - Fixed bug that InBamFile::n_mapped(tid) and
3698 25 Sep 17 peter 186     InBamFile::n_unmapped(tid) threw when tid contained no reads (#895)
3698 25 Sep 17 peter 187   - utility::basename("") now returns "." (bug #893)
3698 25 Sep 17 peter 188
3698 25 Sep 17 peter 189   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3698 25 Sep 17 peter 190   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14.4
3698 25 Sep 17 peter 191
3636 22 Mar 17 peter 192 version 0.14.3 (released 22 March 2017)
3636 22 Mar 17 peter 193   - Fixed code so it compiles against HTSlib 1.4 (see r3662)
3636 22 Mar 17 peter 194
3636 22 Mar 17 peter 195   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3636 22 Mar 17 peter 196   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14.3
3636 22 Mar 17 peter 197
3628 08 Mar 17 peter 198 version 0.14.2 (released 8 March 2017)
3628 08 Mar 17 peter 199   - Bug fixed in omic::dna_reverse_complement_copy (see bug #886)
3628 08 Mar 17 peter 200
3628 08 Mar 17 peter 201   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3628 08 Mar 17 peter 202   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14.2
3628 08 Mar 17 peter 203
3623 09 Feb 17 peter 204 version 0.14.1 (released 8 February 2017)
3623 09 Feb 17 peter 205   - Fixed bug in element-by-element operations in VectorMutable such
3623 09 Feb 17 peter 206     as operator+=, operator-=, ::mul(), and ::div(), when underlying
3623 09 Feb 17 peter 207     data structures of lhs and rhs overlap such that elements in rhs
3623 09 Feb 17 peter 208     are affected by the operation on lhs before they have been used on
3623 09 Feb 17 peter 209     rhs (bug #884).
3623 09 Feb 17 peter 210
3623 09 Feb 17 peter 211   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3623 09 Feb 17 peter 212   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14.1
3623 09 Feb 17 peter 213
3579 16 Jan 17 peter 214 version 0.14 (released 16 January 2017)
3548 01 Jan 17 peter 215   - The concept 'Distance' now requires that operator() works on
3548 01 Jan 17 peter 216     iterator that are readable and forward traversal, i.e., the
3548 01 Jan 17 peter 217     previously implicit requirement that iterator's reference type is
3548 01 Jan 17 peter 218     lvalue is dropped (ticket #873)
3485 23 Mar 16 peter 219   - libbam support is marked deprecated; use htslib.
3485 23 Mar 16 peter 220   - A new (private) pure virtual function assign(const VectorBase&)
3467 10 Feb 16 peter 221     was added in VectorMutable. (ticket #840)
3459 21 Jan 16 peter 222   - WeightedIterator is std::input_iterator_tag (ticket #803, r3459)
3442 24 Nov 15 peter 223   - Fisher::p_value exact is modified and the summation now runs over
3442 24 Nov 15 peter 224     i for which P(i)<=P(k). (#841)
3419 25 May 15 peter 225
3419 25 May 15 peter 226   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3419 25 May 15 peter 227   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.14
3419 25 May 15 peter 228
3416 25 May 15 peter 229 yat 0.13.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.13-stable
3416 25 May 15 peter 230
3561 04 Jan 17 peter 231 version 0.13.1 (released 4 January 2017)
3561 04 Jan 17 peter 232   - fixed bug in pkg-config file 'yat.pc' (bug #850)
3561 04 Jan 17 peter 233   - improved detection of boost thread detection (bug #863)
3561 04 Jan 17 peter 234
3561 04 Jan 17 peter 235   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3561 04 Jan 17 peter 236   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.13
3561 04 Jan 17 peter 237
3439 20 Nov 15 peter 238 version 0.13 (released 20 November 2015)
3439 20 Nov 15 peter 239   - added support for htslib (see ticket #794)
3439 20 Nov 15 peter 240       - macro `YAT_HAVE_LIBBAM` is #defined if linking against either libbam
3439 20 Nov 15 peter 241         or libhts. Use #if defined YAT_HAVE_LIBBAM && !defined
3439 20 Nov 15 peter 242         (YAT_HAVE_HTSLIB) to check that building against libbam.
3439 20 Nov 15 peter 243       - macro `YAT_BAM_HEADER` is only #defined when building against libbam
3254 09 Jun 14 peter 244   - utility::get separates types in map and passed key (ticket #799)
3259 09 Jun 14 peter 245   - utility::Range is deprecated (ticket #786)
3266 03 Jul 14 peter 246   - AveragerWeighted::n(void) now return 0, when object is empty (ticket #802)
3393 17 Mar 15 peter 247   - Container2DIterator is now tagged with
3393 17 Mar 15 peter 248     boost::random_access_traversal_tag (see ticket #803, r3393)
3393 17 Mar 15 peter 249   - StrideIterator is now tagged with use_default (see ticket #803, r3393)
3400 30 Mar 15 peter 250   - configure option --without-samtools is deprecated; use --without-htslib
3220 06 May 14 peter 251
3220 06 May 14 peter 252   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3220 06 May 14 peter 253   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.13
3220 06 May 14 peter 254
3215 06 May 14 peter 255 yat 0.12.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.12-stable
3215 06 May 14 peter 256
3342 06 Nov 14 peter 257 version 0.12.2 (released 6 November 2014)
3342 06 Nov 14 peter 258   - Fixed bug in Aligner that internal data was not cleared between
3342 06 Nov 14 peter 259     alignments resulting in incorrect CIGAR (see bug #820)
3342 06 Nov 14 peter 260   - Fixed QuantileNormalizer seqfault when input had more columns than
3342 06 Nov 14 peter 261     rows (see bug #815)
3342 06 Nov 14 peter 262
3342 06 Nov 14 peter 263   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3342 06 Nov 14 peter 264   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.12.2
3342 06 Nov 14 peter 265
3306 21 Aug 14 peter 266 version 0.12.1 (released 21 August 2014)
3306 21 Aug 14 peter 267   - bam_calend is buggy in older versions of samtools; configure
3306 21 Aug 14 peter 268     script checks that bam_calend works as expected; if not use its
3306 21 Aug 14 peter 269     own implementation (see bug #810)
3306 21 Aug 14 peter 270
3306 21 Aug 14 peter 271   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3306 21 Aug 14 peter 272   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.12.1
3306 21 Aug 14 peter 273
3295 25 Jul 14 peter 274 version 0.12 (released 25 July 2014)
3295 25 Jul 14 peter 275   - BamRead::cigar(const std::vector<uint32_t>&) is deprecated
3208 04 May 14 peter 276   - Aligner(double, double) is now explicit (see r3207)
3157 05 Jan 14 peter 277   - GetlineIterator(istream&, char) is now explicit (see r3148)
3295 25 Jul 14 peter 278   - rename(2) and remove(1) are now implemented (bug #804)
3117 11 Nov 13 peter 279
3117 11 Nov 13 peter 280   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3117 11 Nov 13 peter 281   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.12
3117 11 Nov 13 peter 282
3115 11 Nov 13 peter 283 yat 0.11.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.11-stable
3115 11 Nov 13 peter 284
3188 25 Mar 14 peter 285 version 0.11.2 (released 25 March 2014)
3188 25 Mar 14 peter 286   - Fixed bug that error in OutBamFile::write was not detected (see r3163)
3188 25 Mar 14 peter 287   - Fixed bug that `-lgsl` was not included in `yat-config --libs` (bug #788)
3188 25 Mar 14 peter 288
3188 25 Mar 14 peter 289   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3188 25 Mar 14 peter 290   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.11.2
3188 25 Mar 14 peter 291
3144 18 Dec 13 peter 292 version 0.11.1 (released 18 December 2013)
3144 18 Dec 13 peter 293   - Fixed bug in BamHeader::tid(const std::string&) (see bug #776)
3144 18 Dec 13 peter 294
3144 18 Dec 13 peter 295   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3144 18 Dec 13 peter 296   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.11.1
3144 18 Dec 13 peter 297
3130 18 Nov 13 peter 298 version 0.11 (released 18 November 2013)
3004 24 Mar 13 peter 299   - Fisher::one_sided_p(void) is now deprecated (ticket #689)
3005 24 Mar 13 peter 300   - PearsonCorrelation::one_sided_p(void) is now deprecated (ticket #689)
3006 01 Apr 13 peter 301   - PearsonCorrelation::one_sided_p(void) is now deprecated (ticket #689)
3006 01 Apr 13 peter 302   - ROC::p_value_one_sided(void is now deprecated (ticket #689)
3023 06 Apr 13 peter 303   - ROC::area(void) is now declared const (ticket #754)
3024 06 Apr 13 peter 304   - tTest::score(void) is now declared const (ticket #755)
3056 24 Jun 13 peter 305   - BamReadIterator(4) will now throw if region is invalid (ticket #764)
3068 01 Aug 13 peter 306   - #defines HAVE_BAM_H, HAVE_BAM_BAM_H, and HAVE_SAMTOOLS_BAM_H have been
3068 01 Aug 13 peter 307     replaced with corresponding macros with prefix 'YAT_' (see ticket #766)
3130 18 Nov 13 peter 308   - Bam interface is now more complete (see tickets #746 and #739)
2921 19 Dec 12 peter 309
2921 19 Dec 12 peter 310   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2921 19 Dec 12 peter 311   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.11
2921 19 Dec 12 peter 312
2918 19 Dec 12 peter 313 yat 0.10.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.10-stable
2918 19 Dec 12 peter 314
3098 28 Oct 13 peter 315 version 0.10.3 (released 28 October 2013)
3098 28 Oct 13 peter 316   - utility::replace(string&, string, string) is now implemented (bug #768)
3098 28 Oct 13 peter 317
3098 28 Oct 13 peter 318   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3098 28 Oct 13 peter 319   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.10.3
3098 28 Oct 13 peter 320
3018 04 Apr 13 peter 321 version 0.10.2 (released 4 April 2013)
3018 04 Apr 13 peter 322   - On OSX yat is built using flat_namespace (see bug #745)
3018 04 Apr 13 peter 323   - BamRead::mtid(void) is now implemented (see bug #743)
3018 04 Apr 13 peter 324   - Fixed bug in KolmogorovSmirnov::remove (see bug #753)
3018 04 Apr 13 peter 325
3018 04 Apr 13 peter 326   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
3018 04 Apr 13 peter 327   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.10.2
3018 04 Apr 13 peter 328
2960 17 Jan 13 peter 329 version 0.10.1 (released 17 January 2013)
2960 17 Jan 13 peter 330   - libyat is no longer linked against -lbam (bug #733)
2960 17 Jan 13 peter 331   - yat.pc now mentions -lbam and -lz (bug #736)
2960 17 Jan 13 peter 332   - include style <samtools/bam.h> now supported (bug #735)
2960 17 Jan 13 peter 333   - BamHeader::target_length(1) is now implemented (bug #740)
2960 17 Jan 13 peter 334
2960 17 Jan 13 peter 335   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2960 17 Jan 13 peter 336   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.10.1
2960 17 Jan 13 peter 337
2943 04 Jan 13 peter 338 version 0.10 (released 4 January 2013)
2943 04 Jan 13 peter 339   - samtools wrapper classes (ticket #729)
2943 04 Jan 13 peter 340   - new utility functions (ticket #717)
2823 30 Aug 12 peter 341
2823 30 Aug 12 peter 342   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2823 30 Aug 12 peter 343   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.10
2823 30 Aug 12 peter 344
2838 16 Sep 12 peter 345 yat 0.9.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.9-stable
2821 30 Aug 12 peter 346
2916 19 Dec 12 peter 347 version 0.9.2 (released 19 December 2012)
2916 19 Dec 12 peter 348   - fixed bug how inclusion path is displayed in documentation (bug #728)
2916 19 Dec 12 peter 349
2916 19 Dec 12 peter 350   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2916 19 Dec 12 peter 351   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.9.2
2916 19 Dec 12 peter 352
2853 23 Sep 12 peter 353 version 0.9.1 (released 23 September 2012)
2853 23 Sep 12 peter 354   - bug in Aligner fixed (see bug #724)
2853 23 Sep 12 peter 355   - Commandline::parse now throws when finding '--no-foo' (bug #723)
2853 23 Sep 12 peter 356   - yat.pc now mentions Boost::System and Boost::Thread in Libs.private (#722)
2853 23 Sep 12 peter 357   - documentations is now installed again (bug #721)
2853 23 Sep 12 peter 358
2853 23 Sep 12 peter 359   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2853 23 Sep 12 peter 360   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.9.1
2853 23 Sep 12 peter 361
2838 16 Sep 12 peter 362 version 0.9 (released 16 September 2012)
2815 28 Aug 12 peter 363   - utility::SmithWaterman is deprecated (ticket #706)
2783 21 Jul 12 jari 364   - yat now depends on boost thread and system library (ticket #568 and #714)
2779 19 Jul 12 peter 365   - utility::SmartPtr was marked internal (see r2778)
2793 27 Jul 12 peter 366   - ssearch now takes parameter setting mismatch (r2792)
3018 04 Apr 13 peter 367   - RNG class is now multithread safe (ticket #568)
2838 16 Sep 12 peter 368   - The build system now uses a non-recursive Makefile (ticket #703)
2617 05 Nov 11 peter 369
2617 05 Nov 11 peter 370   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2617 05 Nov 11 peter 371   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.9
2617 05 Nov 11 peter 372
2615 05 Nov 11 peter 373 yat 0.8.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.8-stable
2615 05 Nov 11 peter 374
2798 27 Jul 12 peter 375 version 0.8.2 (released 27 July 2012)
2798 27 Jul 12 peter 376   - Fixed bug in operator+= in Averager and AveragerWeighted (bug #709)
2798 27 Jul 12 peter 377
2798 27 Jul 12 peter 378   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2798 27 Jul 12 peter 379   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.8.2
2798 27 Jul 12 peter 380
2798 27 Jul 12 peter 381
2703 12 Mar 12 peter 382 version 0.8.1 (released 12 March 2012)
2703 12 Mar 12 peter 383   - Fixed bug that GFF::attribute was only loaded first time (see bug #697)
2703 12 Mar 12 peter 384
2703 12 Mar 12 peter 385   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2703 12 Mar 12 peter 386   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.8.1
2703 12 Mar 12 peter 387
2703 12 Mar 12 peter 388
2673 03 Dec 11 peter 389 version 0.8 (released 2 December 2011)
2612 04 Nov 11 peter 390   - Rule for when to use approximation in ROC::p_value modified (ticket #677)
2578 04 Oct 11 peter 391   - Discrete::seed, Continuous::seed, Discrete::seed_from_devurandom,
2578 04 Oct 11 peter 392     and Continuous::seed_from_devurandom are deprecated (issue #674)
2575 02 Oct 11 peter 393   - configure supports --enable-silent-rules (#654)
2531 28 Jul 11 peter 394   - Macros YAT_CPP_ADD_FLAG, YAT_CXX_ADD_FLAG and YAT_LD_ADD_FLAG now require
2531 28 Jul 11 peter 395     macros provided in ax_check*flag.m4 and ax_append*flags.m4(r2524)
2460 03 Apr 11 peter 396   - Exception classes inherit from yat::utility::runtime_error (r2459)
2463 11 Apr 11 peter 397   - deprecated configure option `--with-gsl-prefix` is removed
2463 11 Apr 11 peter 398   - deprecated configure option `--with-gsl-exec-prefix` is removed
2489 27 May 11 peter 399   - changed behavior of configure option `--htmldir` (r2487)
2393 06 Jan 11 peter 400
2393 06 Jan 11 peter 401   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2393 06 Jan 11 peter 402   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.8
2393 06 Jan 11 peter 403
2393 06 Jan 11 peter 404
2390 06 Jan 11 peter 405 yat 0.7.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.7-stable
2390 06 Jan 11 peter 406
2601 30 Oct 11 peter 407 version 0.7.3 (released 30 October 2011)
2601 30 Oct 11 peter 408   - ROC::area no longer crashes when no data have been added (bug #669)
2601 30 Oct 11 peter 409   - namespace classifier is no included in doxygen input again (bug #667)
2601 30 Oct 11 peter 410
2601 30 Oct 11 peter 411   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2601 30 Oct 11 peter 412   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.7.3
2601 30 Oct 11 peter 413
2601 30 Oct 11 peter 414
2470 12 Apr 11 peter 415 version 0.7.2 (released 12 April 2011)
2470 12 Apr 11 peter 416   - omic::Codon("ATG").amino_acid() now return 'M' (bug #664)
2470 12 Apr 11 peter 417   - median now works on empty ranges (bug #660)
2470 12 Apr 11 peter 418   - fixed bug percentiler sometimes zero weight elements (r2466)
2470 12 Apr 11 peter 419
2470 12 Apr 11 peter 420   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2470 12 Apr 11 peter 421   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.7.2
2470 12 Apr 11 peter 422
2470 12 Apr 11 peter 423
2411 13 Jan 11 peter 424 version 0.7.1 (released 13 January 2011)
2411 13 Jan 11 peter 425   - Fixed compiler (gcc 3) error in Histogram.cc (issue #649)
2411 13 Jan 11 peter 426   - Fixed compiler warning in concept_check.h (issue #648)
2411 13 Jan 11 peter 427
2411 13 Jan 11 peter 428   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2411 13 Jan 11 peter 429   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.7.1
2411 13 Jan 11 peter 430
2411 13 Jan 11 peter 431
2400 08 Jan 11 peter 432 version 0.7 (released 8 January 2011)
2383 22 Dec 10 peter 433   - new namespace theplu::yat::omic
2383 22 Dec 10 peter 434   - Constructors *Lookup(Matrix, Index, bool) are deprecated (#543)
2297 12 Jul 10 peter 435   - dvi, ps and pdf docs are no longer generated
2248 22 Apr 10 peter 436   - utility::load functions now work with std::string as well.
2163 20 Jan 10 peter 437
2163 20 Jan 10 peter 438   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2163 20 Jan 10 peter 439   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.7
2163 20 Jan 10 peter 440
2163 20 Jan 10 peter 441
2160 19 Jan 10 peter 442 yat 0.6.x series from http://dev.thep.lu.se/yat/svn/branches/0.6-stable
2160 19 Jan 10 peter 443
2382 21 Dec 10 peter 444 Version 0.6.3 (released 21 December 2010)
2382 21 Dec 10 peter 445
2382 21 Dec 10 peter 446   - fixed overflow in statistics::Fisher (#638)
2382 21 Dec 10 peter 447   - fixed bug that double was hard-coded in function load<T>(6) (r2271)
2382 21 Dec 10 peter 448
2382 21 Dec 10 peter 449   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2382 21 Dec 10 peter 450   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.6.3
2382 21 Dec 10 peter 451
2257 18 May 10 peter 452 Version 0.6.2 (released 18 May 2010)
2257 18 May 10 peter 453
2257 18 May 10 peter 454   - fixed bug with merge when result is weighted (r2251)
2257 18 May 10 peter 455
2257 18 May 10 peter 456   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2257 18 May 10 peter 457   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.6.2
2257 18 May 10 peter 458
2217 14 Mar 10 peter 459 Version 0.6.1 (released 14 March 2010)
2217 14 Mar 10 peter 460
2217 14 Mar 10 peter 461   - fixed bug with `yat-config --ldflags` (#615)
2217 14 Mar 10 peter 462   - fixed bug in FileUtil::permission when file does not exist (#617)
2217 14 Mar 10 peter 463
2217 14 Mar 10 peter 464   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2217 14 Mar 10 peter 465   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.6.1
2217 14 Mar 10 peter 466
2202 21 Feb 10 peter 467 Version 0.6 (released 21 February 2010)
1826 24 Feb 09 peter 468
2153 17 Jan 10 peter 469   - Boost 1.35 is now required (#603)
2129 23 Dec 09 peter 470   - new configure option `--with-gsl` (#544)
2129 23 Dec 09 peter 471   - configure option `--with-gsl-prefix` is deprecated (#544)
2129 23 Dec 09 peter 472   - configure option `--with-gsl-exec-prefix` is deprecated (#544)
2129 23 Dec 09 peter 473   - Behavior of operator==(DataWeightProxy, DataWeightProxy) is modified (#578)
2089 21 Oct 09 peter 474   - several constructors in namespace random are now declared explicit (#571)
2068 17 Sep 09 peter 475   - pair_first_iterator and pair_second_iterator now work with
2068 17 Sep 09 peter 476     const_iterator (ticket:562)
2065 16 Sep 09 peter 477   - Passing by const& in KolmogorovSmirnov::Element::operator< (r2064)
2059 11 Sep 09 peter 478   - classes OptionInFile and OptionOutFile are deprecated (ticket:521)
2003 13 Jun 09 peter 479   - DataWeight comparison operators were changed in case of NaN (ticket:536)
1940 04 May 09 peter 480   - new option --libs-without-cblas in yat-config (ticket:523)
1937 01 May 09 peter 481   - blas is no longer hard-coded into libyat.so and libyat.la (ticket:518)
1863 13 Mar 09 peter 482   - using unsigned long int (rather than signed) in SVN::max_epoch (ticket:506)
1863 13 Mar 09 peter 483
1826 24 Feb 09 peter 484   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1826 24 Feb 09 peter 485   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.6
1826 24 Feb 09 peter 486
2138 24 Dec 09 peter 487 Version 0.5.6 (released 24 December 2009)
2138 24 Dec 09 peter 488
2138 24 Dec 09 peter 489   - Fixed bugs in EnsembleBuilder::predict (bugs #567 and #579)
2138 24 Dec 09 peter 490   - Corrected dependency libs in libyat.la (bug #573)
2138 24 Dec 09 peter 491
2138 24 Dec 09 peter 492   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2138 24 Dec 09 peter 493   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.6
2138 24 Dec 09 peter 494
2103 06 Nov 09 peter 495 Version 0.5.5 (released 5 November 2009)
2103 06 Nov 09 peter 496
2103 06 Nov 09 peter 497   - SVM::predict is calculated as geometric distance (issue #542)
2103 06 Nov 09 peter 498   - detection of GSL is improved (issue #558)
2103 06 Nov 09 peter 499
2103 06 Nov 09 peter 500   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
2103 06 Nov 09 peter 501   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.5
2103 06 Nov 09 peter 502
1998 13 Jun 09 peter 503 Version 0.5.4 (released 12 June 2009)
1998 13 Jun 09 peter 504
1998 13 Jun 09 peter 505   - Disable dvi ps and pdf documentation in case of doxygen 1.5.8 (issue #548)
1998 13 Jun 09 peter 506   - improved uninstalled yat-config so it works in VPATH build (issue #539)
1998 13 Jun 09 peter 507   - improved documentation
1998 13 Jun 09 peter 508
1998 13 Jun 09 peter 509   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1998 13 Jun 09 peter 510   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.4
1998 13 Jun 09 peter 511
1954 07 May 09 jari 512 Version 0.5.3 (released 7 May 2009)
1954 07 May 09 jari 513
1954 07 May 09 jari 514   - fixed serious bug in qQuantileNormalization related to sorting
1954 07 May 09 jari 515     with NaNs in vectors (issue #535). VectorMutable and Percentiler
1954 07 May 09 jari 516     classes were affected with the same issue.
1954 07 May 09 jari 517   - fixed problem with running configure on 64-bit CentOS (issue #527)
1954 07 May 09 jari 518   - make check works again (issue #528)
1954 07 May 09 jari 519
1954 07 May 09 jari 520   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1954 07 May 09 jari 521   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.3
1954 07 May 09 jari 522
1874 17 Mar 09 peter 523 Version 0.5.2 (released 17 March 2009)
1874 17 Mar 09 peter 524
1874 17 Mar 09 peter 525   - fixed compilation error in IGP (issue #503)
1874 17 Mar 09 peter 526   - fixed incorrect error message from CommandLine (issue #508)
1874 17 Mar 09 peter 527
1874 17 Mar 09 peter 528   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1874 17 Mar 09 peter 529   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5.2
1874 17 Mar 09 peter 530
1839 26 Feb 09 peter 531 Version 0.5.1 (released 26 February 2009)
1839 26 Feb 09 peter 532
1839 26 Feb 09 peter 533   - libtool version number was corrected (see r1833)
1839 26 Feb 09 peter 534
1832 24 Feb 09 peter 535 Version 0.5 (released 24 February 2009)
905 27 Sep 07 peter 536
1818 21 Feb 09 peter 537   - Upgraded to GLPv3
1818 21 Feb 09 peter 538   - yat now requires GSL 1.8 or later
1818 21 Feb 09 peter 539   - yat now requires Boost 1.33 or later
1651 15 Dec 08 peter 540   - Imlicit conversion between Vector and its Views disabled (ticket:467)
1818 21 Feb 09 peter 541   - Averager::add and AveragerPair::add take a _signed_ long (ticket:361)
1611 04 Nov 08 peter 542   - IteratorPolicy removed (ticket:398)
1587 17 Oct 08 peter 543   - MatrixLookupWeighted(const MatrixLookup&) modified (ticket:396)
1465 02 Sep 08 peter 544   - Option::parse and OptionArg::do_parse takes references (ticket:418)
1312 19 May 08 peter 545   - is_int now depends on numerical_limits for inf and NaN treatment
1312 19 May 08 peter 546   - Similar for is_float. See revision [1312] for details.
1321 23 May 08 peter 547   - config.h is no longer installed
1818 21 Feb 09 peter 548   - Copy and assignment are now allowed for KolmogorovSmirnov
1818 21 Feb 09 peter 549   - is_int(1), is_float(1), is_float(1) are deprecated use is<T>
1818 21 Feb 09 peter 550   - percentile(3) is deprecated, use percentile2(3) 
1818 21 Feb 09 peter 551   - Target::operator[] is deprecated, use Target::operator()
1287 24 Apr 08 peter 552
1619 06 Nov 08 peter 553   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1619 06 Nov 08 peter 554   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.5
1619 06 Nov 08 peter 555
1746 23 Jan 09 peter 556 Version 0.4.3 (released 23 January 2009)
1746 23 Jan 09 peter 557
1746 23 Jan 09 peter 558   - Fisher::p_value is now correct (bug #461)
1746 23 Jan 09 peter 559   - Fisher::oddsratio is now correct (bug #460)
1746 23 Jan 09 peter 560
1746 23 Jan 09 peter 561   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1746 23 Jan 09 peter 562   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.4.3
1746 23 Jan 09 peter 563
1437 25 Aug 08 peter 564 Version 0.4.2 (released 25 August 2008)
1437 25 Aug 08 peter 565
1437 25 Aug 08 peter 566   - FileUtil can now handle large files (#378)
1437 25 Aug 08 peter 567   - x variable is trained in regression::Local::fit() (#423)
1437 25 Aug 08 peter 568
1437 25 Aug 08 peter 569   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 570   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.4.2
1437 25 Aug 08 peter 571
1303 14 May 08 peter 572 Version 0.4.1 (released 14 May 2008)
1303 14 May 08 peter 573
1303 14 May 08 peter 574   - Files needed for build of documentation is included in distribution (#365)
1303 14 May 08 peter 575
1303 14 May 08 peter 576   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 577   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.4.1
1303 14 May 08 peter 578
1277 11 Apr 08 jari 579 Version 0.4 (released 11 April 2008)
1277 11 Apr 08 jari 580
1270 09 Apr 08 peter 581   - Class vector was split into Vector, VectorView and VectorConstView
1270 09 Apr 08 peter 582   - Class matrix was renamed to Matrix
1270 09 Apr 08 peter 583   - Containers, e.g. Vector, now have iterators.
1270 09 Apr 08 peter 584   - EnsembleBuilder and SubSetGenerator were refactored and are now templates
1270 09 Apr 08 peter 585   - SupervisedClassifier is now a pure interface class
1270 09 Apr 08 peter 586   - SVM is not inherited from SupervisedClassifier
1270 09 Apr 08 peter 587   - NCC was refactored and is now a template
1270 09 Apr 08 peter 588   - Distance interfaces against iterators
933 05 Oct 07 peter 589   - interface of median, percentile, and mad functions are
933 05 Oct 07 peter 590     modified. They now take iterators rather than containers.
917 30 Sep 07 peter 591   - is_double(), is_int(), and is_float() return true also when string
1488 10 Sep 08 peter 592     is a nan or inf.
917 30 Sep 07 peter 593   - add_values function in Averagers replaced by iterator interface
917 30 Sep 07 peter 594
905 27 Sep 07 peter 595   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 596   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.4
905 27 Sep 07 peter 597
905 27 Sep 07 peter 598 Version 0.3.1 (released 28 April 2007)
905 27 Sep 07 peter 599
905 27 Sep 07 peter 600   - Bugfix release
905 27 Sep 07 peter 601
905 27 Sep 07 peter 602   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 603   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.3.1
905 27 Sep 07 peter 604
905 27 Sep 07 peter 605 Version 0.3 (released 9 April 2007)
905 27 Sep 07 peter 606
905 27 Sep 07 peter 607   - First public release
905 27 Sep 07 peter 608
905 27 Sep 07 peter 609   A complete list of closed tickets can be found here [[br]]
1437 25 Aug 08 peter 610   http://dev.thep.lu.se/yat/query?status=closed&milestone=yat+0.3+%28Public+release%29
905 27 Sep 07 peter 611
905 27 Sep 07 peter 612
905 27 Sep 07 peter 613
905 27 Sep 07 peter 614 ----------------------------------------------------------------------
905 27 Sep 07 peter 615 {{{
2119 12 Dec 09 peter 616 Copyright (C) 2003, 2006 Jari Häkkinen
2119 12 Dec 09 peter 617 Copyright (C) 2007, 2008, 2009 Jari Häkkinen, Peter Johansson
2787 23 Jul 12 peter 618 Copyright (C) 2010, 2011 Peter Johansson
2787 23 Jul 12 peter 619 Copyright (C) 2012 Jari Häkkinen, Peter Johansson
4308 10 Feb 23 peter 620 Copyright (C) 2013, 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019, 2020, 2021, 2022, 2023 Peter Johansson
675 10 Oct 06 jari 621
1437 25 Aug 08 peter 622 This file is part of yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
675 10 Oct 06 jari 623
675 10 Oct 06 jari 624 The yat library is free software; you can redistribute it and/or
675 10 Oct 06 jari 625 modify it under the terms of the GNU General Public License as
1486 09 Sep 08 jari 626 published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
675 10 Oct 06 jari 627 License, or (at your option) any later version.
675 10 Oct 06 jari 628
675 10 Oct 06 jari 629 The yat library is distributed in the hope that it will be useful, but
675 10 Oct 06 jari 630 WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
675 10 Oct 06 jari 631 MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
675 10 Oct 06 jari 632 General Public License for more details.
675 10 Oct 06 jari 633
675 10 Oct 06 jari 634 You should have received a copy of the GNU General Public License
1487 10 Sep 08 jari 635 along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
905 27 Sep 07 peter 636 }}}
905 27 Sep 07 peter 637 ----------------------------------------------------------------------

Generated on Tue Apr 25 01:22:56 2023 (UTC) by svndigest 0.10.4pre (dev build 1607)