test/genomic_position.cc

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2366 06 Dec 10 peter 1 // $Id$
2366 06 Dec 10 peter 2
2366 06 Dec 10 peter 3 /*
4359 23 Aug 23 peter 4   Copyright (C) 2010, 2012 Peter Johansson
2366 06 Dec 10 peter 5
2366 06 Dec 10 peter 6   This file is part of the yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
2366 06 Dec 10 peter 7
2366 06 Dec 10 peter 8   The yat library is free software; you can redistribute it and/or
2366 06 Dec 10 peter 9   modify it under the terms of the GNU General Public License as
2366 06 Dec 10 peter 10   published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
2366 06 Dec 10 peter 11   License, or (at your option) any later version.
2366 06 Dec 10 peter 12
2366 06 Dec 10 peter 13   The yat library is distributed in the hope that it will be useful,
2366 06 Dec 10 peter 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
2366 06 Dec 10 peter 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
2366 06 Dec 10 peter 16   General Public License for more details.
2366 06 Dec 10 peter 17
2366 06 Dec 10 peter 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
2366 06 Dec 10 peter 19   along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
2366 06 Dec 10 peter 20 */
2366 06 Dec 10 peter 21
2881 18 Nov 12 peter 22 #include <config.h>
2881 18 Nov 12 peter 23
2366 06 Dec 10 peter 24 #include "Suite.h"
2366 06 Dec 10 peter 25
2366 06 Dec 10 peter 26 #include "yat/omic/GenomicPosition.h"
2366 06 Dec 10 peter 27
2366 06 Dec 10 peter 28 using namespace theplu::yat;
2366 06 Dec 10 peter 29
2366 06 Dec 10 peter 30 int main(int argc,char* argv[])
4200 19 Aug 22 peter 31 {
2366 06 Dec 10 peter 32   test::Suite suite(argc, argv);
2366 06 Dec 10 peter 33   using omic::GenomicPosition;
4200 19 Aug 22 peter 34
2366 06 Dec 10 peter 35   GenomicPosition p1;
2366 06 Dec 10 peter 36   GenomicPosition p2("chrX","12345");
2366 06 Dec 10 peter 37   GenomicPosition p3(1,123);
2366 06 Dec 10 peter 38   suite.add(p3.chromosome()==1);
2366 06 Dec 10 peter 39   suite.add(p3.position()==123);
2366 06 Dec 10 peter 40
2366 06 Dec 10 peter 41   suite.add(p3==p3);
2366 06 Dec 10 peter 42   suite.add(p2!=p3);
2366 06 Dec 10 peter 43   suite.add(p2>p3);
2366 06 Dec 10 peter 44   suite.add(p2>=p3);
2366 06 Dec 10 peter 45   suite.add(p3>=p3);
2366 06 Dec 10 peter 46   suite.add(p3<p2);
2366 06 Dec 10 peter 47   suite.add(p3<=p2);
2366 06 Dec 10 peter 48   suite.add(p3<=p3);
4200 19 Aug 22 peter 49
2366 06 Dec 10 peter 50   p3.position() = 1234;
2366 06 Dec 10 peter 51   suite.add(p3.position()==1234);
2366 06 Dec 10 peter 52   p3.chromosome() = 2;
2366 06 Dec 10 peter 53   suite.add(p3.chromosome()==2);
2366 06 Dec 10 peter 54
2366 06 Dec 10 peter 55   return suite.return_value();
2366 06 Dec 10 peter 56 }

Generated on Sat Oct 14 02:20:57 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)