test/libbam.cc

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
3883 24 Mar 20 peter 1 // $Id$
3883 24 Mar 20 peter 2 //
3883 24 Mar 20 peter 3 // Copyright (C) 2020 Peter Johansson
3883 24 Mar 20 peter 4 //
3883 24 Mar 20 peter 5 // This program is free software; you can redistribute it and/or modify
3883 24 Mar 20 peter 6 // it under the terms of the GNU General Public License as published by
3883 24 Mar 20 peter 7 // the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or
3883 24 Mar 20 peter 8 // (at your option) any later version.
3883 24 Mar 20 peter 9 //
3883 24 Mar 20 peter 10 // This program is distributed in the hope that it will be useful, but
3883 24 Mar 20 peter 11 // WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
3883 24 Mar 20 peter 12 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
3883 24 Mar 20 peter 13 // General Public License for more details.
3883 24 Mar 20 peter 14 //
3883 24 Mar 20 peter 15 // You should have received a copy of the GNU General Public License
3883 24 Mar 20 peter 16 // along with this program. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
3883 24 Mar 20 peter 17
3883 24 Mar 20 peter 18 // testing that some #defines that are needed for backward
3883 24 Mar 20 peter 19 // combatibility are still present.
3883 24 Mar 20 peter 20
3883 24 Mar 20 peter 21 #include <config.h>
3883 24 Mar 20 peter 22
3888 25 Mar 20 peter 23 #ifdef YAT_HAVE_HTSLIB
3883 24 Mar 20 peter 24 #include <yat/omic/config_bam.h>
3883 24 Mar 20 peter 25 #include <yat/utility/config_public.h>
3888 25 Mar 20 peter 26 #endif
3883 24 Mar 20 peter 27
3883 24 Mar 20 peter 28 #include "Suite.h"
3883 24 Mar 20 peter 29
3883 24 Mar 20 peter 30 using namespace theplu::yat;
3883 24 Mar 20 peter 31
3883 24 Mar 20 peter 32 int main(int argc, char* argv[])
3883 24 Mar 20 peter 33 {
3888 25 Mar 20 peter 34   test::Suite suite(argc, argv);
3883 24 Mar 20 peter 35 #ifdef YAT_HAVE_HTSLIB
3883 24 Mar 20 peter 36   #ifndef YAT_HAVE_LIBBAM
3883 24 Mar 20 peter 37     suite.add(false);
3883 24 Mar 20 peter 38     suite.err() << "YAT_HAVE_LIBBAM not defined\n";
3883 24 Mar 20 peter 39   #endif
3883 24 Mar 20 peter 40   #ifndef YAT_SAM_HEADER
3883 24 Mar 20 peter 41     suite.add(false);
3883 24 Mar 20 peter 42     suite.err() << "YAT_SAM_HEADER not defined\n";
3883 24 Mar 20 peter 43   #endif
3883 24 Mar 20 peter 44   #ifndef YAT_FAIDX_HEADER
3883 24 Mar 20 peter 45     suite.add(false);
3883 24 Mar 20 peter 46     suite.err() << "YAT_FAIDX_HEADER not defined\n";
3883 24 Mar 20 peter 47   #endif
3883 24 Mar 20 peter 48 #else
3883 24 Mar 20 peter 49 #endif
3883 24 Mar 20 peter 50   return suite.return_value();
3883 24 Mar 20 peter 51 }

Generated on Sat Oct 14 02:21:06 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)