test/yat_m4_with_bam_test.sh

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
3053 13 Jun 13 peter 1 #! /bin/sh
3053 13 Jun 13 peter 2 # $Id$
3053 13 Jun 13 peter 3 #
3855 02 Jan 20 peter 4 # Copyright (C) 2013, 2015, 2017, 2019 Peter Johansson
3053 13 Jun 13 peter 5 #
3053 13 Jun 13 peter 6 # This file is part of the yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
3053 13 Jun 13 peter 7 #
3053 13 Jun 13 peter 8 # The yat library is free software; you can redistribute it
3053 13 Jun 13 peter 9 # and/or modify it under the terms of the GNU General Public License as
3053 13 Jun 13 peter 10 # published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
3053 13 Jun 13 peter 11 # License, or (at your option) any later version.
3053 13 Jun 13 peter 12 #
3053 13 Jun 13 peter 13 # The yat library is distributed in the hope that it will be useful,
3053 13 Jun 13 peter 14 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
3053 13 Jun 13 peter 15 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
3053 13 Jun 13 peter 16 # General Public License for more details.
3053 13 Jun 13 peter 17 #
3053 13 Jun 13 peter 18 # You should have received a copy of the GNU General Public License
3053 13 Jun 13 peter 19 # along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
3053 13 Jun 13 peter 20
3400 30 Mar 15 peter 21 required="autoconf automake libtool htslib"
3053 13 Jun 13 peter 22
3053 13 Jun 13 peter 23 set -e
3053 13 Jun 13 peter 24
3053 13 Jun 13 peter 25 . test/init.sh || exit 99
3053 13 Jun 13 peter 26
3053 13 Jun 13 peter 27 cat >> configure.ac <<EOF
3053 13 Jun 13 peter 28 YAT_CHECK_HEADER([], [AC_MSG_ERROR])
3588 19 Jan 17 peter 29 CPPFLAGS="\$YAT_CPPFLAGS"
3053 13 Jun 13 peter 30 LDFLAGS="\$LDFLAGS \`\$yat_config --ldflags\`"
3108 09 Nov 13 peter 31 LIBS="\$LIBS \`\$yat_config --link-libtool\`"
3053 13 Jun 13 peter 32 AC_MSG_NOTICE(["LDFLAGS: \$LDFLAGS"])
3053 13 Jun 13 peter 33 AC_MSG_NOTICE(["LIBS: \$LIBS"])
3053 13 Jun 13 peter 34 YAT_USE_LIBTOOL_PUSH
3053 13 Jun 13 peter 35 YAT_CHECK_LIB_WITH_BAM([], [AC_MSG_ERROR])
3053 13 Jun 13 peter 36 AC_CONFIG_FILES([Makefile])
3053 13 Jun 13 peter 37 AC_OUTPUT
3053 13 Jun 13 peter 38 EOF
3053 13 Jun 13 peter 39
3053 13 Jun 13 peter 40 bootstrap
3053 13 Jun 13 peter 41 grep '^YAT_CHECK_LIB_WITH_BAM' configure && exit_fail
3825 18 Jul 19 peter 42 if ./configure CXX="$CXX" $configure_opts --with-yat=$YAT_CONFIG; then :;
3108 09 Nov 13 peter 43 else
3108 09 Nov 13 peter 44 warn_ configure failed unexpectedly
3108 09 Nov 13 peter 45 tail -n 1000 config.log
3108 09 Nov 13 peter 46 exit_fail
3108 09 Nov 13 peter 47 fi
3053 13 Jun 13 peter 48
3053 13 Jun 13 peter 49 exit_success

Generated on Sat Oct 14 02:21:53 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)