yat/classifier/Kernel_MEV.h

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
680 11 Oct 06 jari 1 #ifndef _theplu_yat_classifier_kernel_mev_
680 11 Oct 06 jari 2 #define _theplu_yat_classifier_kernel_mev_
25 06 Aug 03 peter 3
616 31 Aug 06 jari 4 // $Id$
616 31 Aug 06 jari 5
675 10 Oct 06 jari 6 /*
831 27 Mar 07 peter 7   Copyright (C) 2003 Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 8   Copyright (C) 2004, 2005, 2006 Jari Häkkinen, Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 9   Copyright (C) 2007 Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 10   Copyright (C) 2008 Jari Häkkinen, Peter Johansson
25 06 Aug 03 peter 11
1437 25 Aug 08 peter 12   This file is part of the yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
675 10 Oct 06 jari 13
675 10 Oct 06 jari 14   The yat library is free software; you can redistribute it and/or
675 10 Oct 06 jari 15   modify it under the terms of the GNU General Public License as
1486 09 Sep 08 jari 16   published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
675 10 Oct 06 jari 17   License, or (at your option) any later version.
675 10 Oct 06 jari 18
675 10 Oct 06 jari 19   The yat library is distributed in the hope that it will be useful,
675 10 Oct 06 jari 20   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
675 10 Oct 06 jari 21   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
675 10 Oct 06 jari 22   General Public License for more details.
675 10 Oct 06 jari 23
675 10 Oct 06 jari 24   You should have received a copy of the GNU General Public License
1487 10 Sep 08 jari 25   along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
675 10 Oct 06 jari 26 */
675 10 Oct 06 jari 27
680 11 Oct 06 jari 28 #include "Kernel.h"
680 11 Oct 06 jari 29 #include "KernelFunction.h"
675 10 Oct 06 jari 30
42 26 Feb 04 jari 31 namespace theplu {
680 11 Oct 06 jari 32 namespace yat {
450 15 Dec 05 peter 33 namespace classifier {
628 05 Sep 06 peter 34   class MatrixLookup;
628 05 Sep 06 peter 35   class MatrixLookupWeighted;
25 06 Aug 03 peter 36
51 11 Mar 04 peter 37   ///
4200 19 Aug 22 peter 38   /// @brief Memory Efficient Kernel
651 21 Sep 06 peter 39   ///
651 21 Sep 06 peter 40   ///   Class taking care of the
597 28 Aug 06 markus 41   ///   \f$ NxN \f$ kernel matrix, where \f$ N \f$ is number of
592 24 Aug 06 peter 42   ///   samples. Type of Kernel is defined by a KernelFunction. This
592 24 Aug 06 peter 43   ///   Memory Efficient Version (MEV) does not store the kernel
592 24 Aug 06 peter 44   ///   matrix in memory, but calculates an element when it is
592 24 Aug 06 peter 45   ///   needed. When memory allows do always use Kernel_SEV
4200 19 Aug 22 peter 46   ///   instead.
51 11 Mar 04 peter 47   ///
4200 19 Aug 22 peter 48   class Kernel_MEV : public Kernel
25 06 Aug 03 peter 49   {
4200 19 Aug 22 peter 50
25 06 Aug 03 peter 51   public:
4200 19 Aug 22 peter 52
330 01 Jun 05 peter 53     ///
592 24 Aug 06 peter 54     /// Constructor taking the data matrix and KernelFunction as
749 11 Feb 07 peter 55     /// input. Each column in the data matrix corresponds to one
4200 19 Aug 22 peter 56     /// sample. @note Can not handle NaNs.
307 03 May 05 peter 57     ///
4200 19 Aug 22 peter 58     Kernel_MEV(const MatrixLookup& data, const KernelFunction& kf,
658 25 Sep 06 peter 59                const bool own=false);
420 02 Dec 05 jari 60
628 05 Sep 06 peter 61
545 06 Mar 06 peter 62     ///
628 05 Sep 06 peter 63     /// Constructor taking the data matrix and KernelFunction as
749 11 Feb 07 peter 64     /// input. Each column in the data matrix corresponds to one
4200 19 Aug 22 peter 65     /// sample. @note Can not handle NaNs.
545 06 Mar 06 peter 66     ///
658 25 Sep 06 peter 67     Kernel_MEV(const MatrixLookupWeighted& data, const KernelFunction& kf,
658 25 Sep 06 peter 68                const bool own=false);
628 05 Sep 06 peter 69
628 05 Sep 06 peter 70
628 05 Sep 06 peter 71     ///
648 14 Sep 06 peter 72     /// Constructing a new Kernel based on selected features @a
648 14 Sep 06 peter 73     /// index. All other seeting are the same.
628 05 Sep 06 peter 74     ///
545 06 Mar 06 peter 75     Kernel_MEV(const Kernel_MEV& kernel, const std::vector<size_t>& index);
545 06 Mar 06 peter 76
545 06 Mar 06 peter 77
307 03 May 05 peter 78     ///
420 02 Dec 05 jari 79     /// @return Element at position (\a row, \a column) of the Kernel
307 03 May 05 peter 80     /// matrix
51 11 Mar 04 peter 81     ///
527 01 Mar 06 peter 82     double operator()(const size_t row, const size_t column) const;
4200 19 Aug 22 peter 83
658 25 Sep 06 peter 84     ///
658 25 Sep 06 peter 85     /// An interface for making new classifier objects. This function
658 25 Sep 06 peter 86     /// allows for specification at run-time of which kernel to
658 25 Sep 06 peter 87     /// instatiate (see 'Prototype' in Design Patterns).
658 25 Sep 06 peter 88     ///
1125 22 Feb 08 peter 89     /// @note Returns a dynamically allocated Kernel, which has
658 25 Sep 06 peter 90     /// to be deleted by the caller to avoid memory leaks.
658 25 Sep 06 peter 91     ///
4200 19 Aug 22 peter 92     const Kernel_MEV* make_kernel(const MatrixLookup&,
658 25 Sep 06 peter 93                                   const bool own=false) const;
658 25 Sep 06 peter 94
658 25 Sep 06 peter 95
658 25 Sep 06 peter 96     ///
658 25 Sep 06 peter 97     /// An interface for making new classifier objects. This function
658 25 Sep 06 peter 98     /// allows for specification at run-time of which kernel to
658 25 Sep 06 peter 99     /// instatiate (see 'Prototype' in Design Patterns).
658 25 Sep 06 peter 100     ///
1125 22 Feb 08 peter 101     /// @note Returns a dynamically allocated Kernel, which has
658 25 Sep 06 peter 102     /// to be deleted by the caller to avoid memory leaks.
658 25 Sep 06 peter 103     ///
4200 19 Aug 22 peter 104     const Kernel_MEV* make_kernel(const MatrixLookupWeighted&,
658 25 Sep 06 peter 105                                   const bool own=false) const;
658 25 Sep 06 peter 106
658 25 Sep 06 peter 107
513 18 Feb 06 peter 108   private:
336 03 Jun 05 peter 109     ///
513 18 Feb 06 peter 110     /// Copy constructor (not implemented)
336 03 Jun 05 peter 111     ///
513 18 Feb 06 peter 112     Kernel_MEV(const Kernel_MEV&);
555 08 Mar 06 peter 113     const Kernel_MEV& operator=(const Kernel_MEV&);
25 06 Aug 03 peter 114
307 03 May 05 peter 115   }; // class Kernel_MEV
25 06 Aug 03 peter 116
680 11 Oct 06 jari 117 }}} // of namespace classifier, yat, and theplu
25 06 Aug 03 peter 118
25 06 Aug 03 peter 119 #endif

Generated on Sat Oct 14 02:22:15 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)