yat/omic/Makefile.am

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2342 17 Oct 10 peter 1 ## $Id$
2342 17 Oct 10 peter 2
4359 23 Aug 23 peter 3 # Copyright (C) 2010, 2011, 2012, 2013, 2014, 2015, 2016, 2018, 2020, 2021, 2023 Peter Johansson
2342 17 Oct 10 peter 4 #
2342 17 Oct 10 peter 5 # This file is part of the yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
2342 17 Oct 10 peter 6 #
2342 17 Oct 10 peter 7 # The yat library is free software; you can redistribute it and/or
2342 17 Oct 10 peter 8 # modify it under the terms of the GNU General Public License as
2342 17 Oct 10 peter 9 # published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
2342 17 Oct 10 peter 10 # License, or (at your option) any later version.
2342 17 Oct 10 peter 11 #
2342 17 Oct 10 peter 12 # The yat library is distributed in the hope that it will be useful,
2342 17 Oct 10 peter 13 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
2342 17 Oct 10 peter 14 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
2342 17 Oct 10 peter 15 # General Public License for more details.
2342 17 Oct 10 peter 16 #
2342 17 Oct 10 peter 17 # You should have received a copy of the GNU General Public License
2342 17 Oct 10 peter 18 # along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
2342 17 Oct 10 peter 19
3400 30 Mar 15 peter 20 if HAVE_HTSLIB
2883 03 Dec 12 peter 21 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamFile.cc
2883 03 Dec 12 peter 22 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamHeader.cc
3175 15 Mar 14 peter 23 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamPair.cc
2883 03 Dec 12 peter 24 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamRead.cc
2994 10 Mar 13 peter 25 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamReadFilter.cc
2883 03 Dec 12 peter 26 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamReadIterator.cc
4345 19 Apr 23 peter 27 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamReadSequenceIterator.cc
4272 24 Jan 23 peter 28 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamRegion.cc
2883 03 Dec 12 peter 29 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/BamWriteIterator.cc
3475 08 Mar 16 peter 30 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/Fasta.cc
4278 26 Jan 23 peter 31 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/hts.cc
2883 03 Dec 12 peter 32 endif
2824 31 Aug 12 peter 33 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/Codon.cc
2824 31 Aug 12 peter 34 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/DNA.cc
3475 08 Mar 16 peter 35 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/DnaComplementer.cc
2824 31 Aug 12 peter 36 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/GenomicPosition.cc
2824 31 Aug 12 peter 37 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/GFF.cc
2824 31 Aug 12 peter 38 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/GFF2.cc
2824 31 Aug 12 peter 39 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/GFF3.cc
3325 07 Oct 14 peter 40 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/phred.cc
3747 14 Aug 18 peter 41 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/VCF.cc
3759 17 Oct 18 peter 42 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/VcfCompare.cc
3762 19 Oct 18 peter 43 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/VcfFile.cc
3750 17 Oct 18 peter 44 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/VcfHeader.cc
3774 26 Oct 18 peter 45 yat_libyat_la_SOURCES += yat/omic/VcfIterator.cc
2342 17 Oct 10 peter 46
2899 13 Dec 12 peter 47 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/algorithm.h
2883 03 Dec 12 peter 48 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamFile.h
2883 03 Dec 12 peter 49 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamHeader.h
3175 15 Mar 14 peter 50 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamPair.h
4057 31 Mar 21 peter 51 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamPairBuffer.h
3173 08 Mar 14 peter 52 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamPairIterator.h
3878 12 Mar 20 peter 53 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamPairIterator2.h
2883 03 Dec 12 peter 54 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamRead.h
2994 10 Mar 13 peter 55 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamReadFilter.h
2883 03 Dec 12 peter 56 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamReadIterator.h
4345 19 Apr 23 peter 57 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamReadSequenceIterator.h
4272 24 Jan 23 peter 58 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamRegion.h
2883 03 Dec 12 peter 59 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/BamWriteIterator.h
2943 04 Jan 13 peter 60 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/config_bam.h
2773 12 Jul 12 peter 61 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/Codon.h
2773 12 Jul 12 peter 62 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/DNA.h
3475 08 Mar 16 peter 63 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/DnaComplementer.h
3475 08 Mar 16 peter 64 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/Fasta.h
2773 12 Jul 12 peter 65 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/GenomicPosition.h
2773 12 Jul 12 peter 66 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/GFF.h
2773 12 Jul 12 peter 67 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/GFF2.h
2773 12 Jul 12 peter 68 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/GFF3.h
3317 19 Sep 14 peter 69 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/Pileup.h
3325 07 Oct 14 peter 70 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/phred.h
3747 14 Aug 18 peter 71 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/VCF.h
3759 17 Oct 18 peter 72 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/VcfCompare.h
3762 19 Oct 18 peter 73 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/VcfFile.h
3750 17 Oct 18 peter 74 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/VcfHeader.h
3774 26 Oct 18 peter 75 nobase_include_HEADERS += $(srcdir)/yat/omic/VcfIterator.h

Generated on Sat Oct 14 02:22:53 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)