yat/statistics/SAMScore.cc

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
669 07 Oct 06 peter 1 // $Id$
669 07 Oct 06 peter 2
675 10 Oct 06 jari 3 /*
4359 23 Aug 23 peter 4   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 5   Copyright (C) 2007 Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 6   Copyright (C) 2008 Jari Häkkinen, Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 7   Copyright (C) 2012 Peter Johansson
669 07 Oct 06 peter 8
1437 25 Aug 08 peter 9   This file is part of the yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
675 10 Oct 06 jari 10
675 10 Oct 06 jari 11   The yat library is free software; you can redistribute it and/or
675 10 Oct 06 jari 12   modify it under the terms of the GNU General Public License as
1486 09 Sep 08 jari 13   published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
675 10 Oct 06 jari 14   License, or (at your option) any later version.
675 10 Oct 06 jari 15
675 10 Oct 06 jari 16   The yat library is distributed in the hope that it will be useful,
675 10 Oct 06 jari 17   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
675 10 Oct 06 jari 18   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
675 10 Oct 06 jari 19   General Public License for more details.
675 10 Oct 06 jari 20
675 10 Oct 06 jari 21   You should have received a copy of the GNU General Public License
1487 10 Sep 08 jari 22   along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
675 10 Oct 06 jari 23 */
675 10 Oct 06 jari 24
2881 18 Nov 12 peter 25 #include <config.h>
2881 18 Nov 12 peter 26
779 05 Mar 07 peter 27 #include "SAMScore.h"
680 11 Oct 06 jari 28 #include "Averager.h"
680 11 Oct 06 jari 29 #include "AveragerWeighted.h"
675 10 Oct 06 jari 30 #include "yat/classifier/DataLookupWeighted1D.h"
675 10 Oct 06 jari 31 #include "yat/classifier/Target.h"
1023 01 Feb 08 peter 32 #include "yat/utility/VectorBase.h"
675 10 Oct 06 jari 33
669 07 Oct 06 peter 34 #include <cmath>
669 07 Oct 06 peter 35
669 07 Oct 06 peter 36 namespace theplu {
680 11 Oct 06 jari 37 namespace yat {
4200 19 Aug 22 peter 38 namespace statistics {
669 07 Oct 06 peter 39
4200 19 Aug 22 peter 40   SAMScore::SAMScore(const double s0, bool b)
669 07 Oct 06 peter 41     : Score(b), s0_(s0)
669 07 Oct 06 peter 42   {
669 07 Oct 06 peter 43   }
669 07 Oct 06 peter 44
4200 19 Aug 22 peter 45   double SAMScore::score(const classifier::Target& target,
1023 01 Feb 08 peter 46                          const utility::VectorBase& value) const
669 07 Oct 06 peter 47   {
669 07 Oct 06 peter 48     statistics::Averager positive;
669 07 Oct 06 peter 49     statistics::Averager negative;
669 07 Oct 06 peter 50     for(size_t i=0; i<target.size(); i++){
669 07 Oct 06 peter 51       if (target.binary(i))
669 07 Oct 06 peter 52         positive.add(value(i));
669 07 Oct 06 peter 53       else
669 07 Oct 06 peter 54         negative.add(value(i));
669 07 Oct 06 peter 55     }
779 05 Mar 07 peter 56     return score(positive, negative);
669 07 Oct 06 peter 57   }
669 07 Oct 06 peter 58
4200 19 Aug 22 peter 59   double SAMScore::score(const classifier::Target& target,
779 05 Mar 07 peter 60                          const classifier::DataLookupWeighted1D& value) const
669 07 Oct 06 peter 61   {
669 07 Oct 06 peter 62     statistics::AveragerWeighted positive;
669 07 Oct 06 peter 63     statistics::AveragerWeighted negative;
669 07 Oct 06 peter 64     for(size_t i=0; i<target.size(); i++){
669 07 Oct 06 peter 65       if (target.binary(i))
669 07 Oct 06 peter 66         positive.add(value.data(i),value.weight(i));
669 07 Oct 06 peter 67       else
669 07 Oct 06 peter 68         negative.add(value.data(i),value.weight(i));
669 07 Oct 06 peter 69     }
779 05 Mar 07 peter 70     return score(positive, negative);
669 07 Oct 06 peter 71   }
669 07 Oct 06 peter 72
669 07 Oct 06 peter 73
669 07 Oct 06 peter 74
4200 19 Aug 22 peter 75   double SAMScore::score(const classifier::Target& target,
1023 01 Feb 08 peter 76                          const utility::VectorBase& value,
1023 01 Feb 08 peter 77                          const utility::VectorBase& weight) const
669 07 Oct 06 peter 78   {
669 07 Oct 06 peter 79     statistics::AveragerWeighted positive;
669 07 Oct 06 peter 80     statistics::AveragerWeighted negative;
669 07 Oct 06 peter 81     for(size_t i=0; i<target.size(); i++){
669 07 Oct 06 peter 82       if (target.binary(i))
669 07 Oct 06 peter 83         positive.add(value(i),weight(i));
669 07 Oct 06 peter 84       else
669 07 Oct 06 peter 85         negative.add(value(i),weight(i));
669 07 Oct 06 peter 86     }
779 05 Mar 07 peter 87     return score(positive, negative);
669 07 Oct 06 peter 88   }
669 07 Oct 06 peter 89
683 11 Oct 06 jari 90 }}} // of namespace statistics, yat, and theplu

Generated on Sat Oct 14 02:23:58 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)