yat/utility/Makefile.am

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
1326 24 May 08 peter 1 ## $Id$
295 29 Apr 05 peter 2
2119 12 Dec 09 peter 3 # Copyright (C) 2005, 2006, 2007, 2008 Jari Häkkinen, Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 4 # Copyright (C) 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, 2014, 2015, 2016, 2017, 2020, 2021, 2022, 2023 Peter Johansson
570 05 Apr 06 jari 5 #
1437 25 Aug 08 peter 6 # This file is part of the yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
570 05 Apr 06 jari 7 #
675 10 Oct 06 jari 8 # The yat library is free software; you can redistribute it and/or
675 10 Oct 06 jari 9 # modify it under the terms of the GNU General Public License as
1486 09 Sep 08 jari 10 # published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
570 05 Apr 06 jari 11 # License, or (at your option) any later version.
570 05 Apr 06 jari 12 #
675 10 Oct 06 jari 13 # The yat library is distributed in the hope that it will be useful,
570 05 Apr 06 jari 14 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
675 10 Oct 06 jari 15 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
570 05 Apr 06 jari 16 # General Public License for more details.
570 05 Apr 06 jari 17 #
570 05 Apr 06 jari 18 # You should have received a copy of the GNU General Public License
1487 10 Sep 08 jari 19 # along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
295 29 Apr 05 peter 20
2824 31 Aug 12 peter 21 yat_libyat_la_SOURCES += \
2815 28 Aug 12 peter 22   yat/utility/Aligner.cc \
2739 07 Jun 12 peter 23   yat/utility/Alignment.cc \
3651 28 Jun 17 peter 24   yat/utility/BasicMatrix.cc \
4175 01 Jun 22 peter 25   yat/utility/BFGS.cc \
4175 01 Jun 22 peter 26   yat/utility/BFGS2.cc \
4252 18 Nov 22 peter 27   yat/utility/Bisection.cc \
4252 18 Nov 22 peter 28   yat/utility/Brent.cc \
4252 18 Nov 22 peter 29   yat/utility/BrentMinimizer.cc \
4280 27 Jan 23 peter 30   yat/utility/CholeskyDecomposer.cc \
4003 15 Oct 20 peter 31   yat/utility/Cigar.cc \
2739 07 Jun 12 peter 32   yat/utility/ColumnStream.cc \
2739 07 Jun 12 peter 33   yat/utility/CommandLine.cc \
2739 07 Jun 12 peter 34   yat/utility/DataWeight.cc \
2858 28 Sep 12 peter 35   yat/utility/Deleter.cc \
3655 13 Jul 17 peter 36   yat/utility/DiagonalMatrix.cc \
2739 07 Jun 12 peter 37   yat/utility/Exception.cc \
4252 18 Nov 22 peter 38   yat/utility/FalsePosition.cc \
2739 07 Jun 12 peter 39   yat/utility/FileUtil.cc \
4175 01 Jun 22 peter 40   yat/utility/FletcherReevesConjugate.cc \
2739 07 Jun 12 peter 41   yat/utility/GetlineIterator.cc \
4252 18 Nov 22 peter 42   yat/utility/GoldenSection.cc \
2739 07 Jun 12 peter 43   yat/utility/Index.cc \
2739 07 Jun 12 peter 44   yat/utility/KernelPCA.cc \
2739 07 Jun 12 peter 45   yat/utility/kNNI.cc \
4353 23 Aug 23 peter 46   yat/utility/mAlignerBase.cc \
4340 16 Apr 23 peter 47   yat/utility/mNeedlemanWunsch.cc \
4340 16 Apr 23 peter 48   yat/utility/mSemiLocalAligner.cc \
4340 16 Apr 23 peter 49   yat/utility/mSmithWaterman.cc \
4353 23 Aug 23 peter 50   yat/utility/mSmithWaterman2.cc \
2739 07 Jun 12 peter 51   yat/utility/Matrix.cc \
4119 07 Nov 21 peter 52   yat/utility/MatrixBase.cc \
4129 19 Jan 22 peter 53   yat/utility/MatrixConstView.cc \
4119 07 Nov 21 peter 54   yat/utility/MatrixMutable.cc \
4129 19 Jan 22 peter 55   yat/utility/MatrixView.cc \
2739 07 Jun 12 peter 56   yat/utility/MatrixWeighted.cc \
4252 18 Nov 22 peter 57   yat/utility/Minimizer.cc \
4172 12 May 22 peter 58   yat/utility/MultiMinimizer.cc \
4175 01 Jun 22 peter 59   yat/utility/MultiMinimizerDerivative.cc \
4334 25 Mar 23 peter 60   yat/utility/NeedlemanWunsch.cc \
4172 12 May 22 peter 61   yat/utility/NelderMeadSimplex.cc \
4172 12 May 22 peter 62   yat/utility/NelderMeadSimplex2.cc \
4172 12 May 22 peter 63   yat/utility/NelderMeadSimplex2Rand.cc \
4252 18 Nov 22 peter 64   yat/utility/Newton.cc \
2739 07 Jun 12 peter 65   yat/utility/NNI.cc \
2739 07 Jun 12 peter 66   yat/utility/Option.cc \
2739 07 Jun 12 peter 67   yat/utility/OptionFile.cc \
2739 07 Jun 12 peter 68   yat/utility/OptionInFile.cc \
2739 07 Jun 12 peter 69   yat/utility/OptionOutFile.cc \
2739 07 Jun 12 peter 70   yat/utility/OptionHelp.cc \
2739 07 Jun 12 peter 71   yat/utility/OptionSwitch.cc \
4153 09 Mar 22 peter 72   yat/utility/OptionVersion.cc \
2739 07 Jun 12 peter 73   yat/utility/PCA.cc \
4175 01 Jun 22 peter 74   yat/utility/PolakRibiereConjugate.cc \
4252 18 Nov 22 peter 75   yat/utility/QuadGolden.cc \
4252 18 Nov 22 peter 76   yat/utility/RootFinder.cc \
4252 18 Nov 22 peter 77   yat/utility/RootFinderDerivative.cc \
4252 18 Nov 22 peter 78   yat/utility/Secant.cc \
2739 07 Jun 12 peter 79   yat/utility/split.cc \
2739 07 Jun 12 peter 80   yat/utility/stl_utility.cc \
3346 06 Nov 14 peter 81   yat/utility/Scheduler.cc \
3204 03 May 14 peter 82   yat/utility/SmithWaterman.cc \
4252 18 Nov 22 peter 83   yat/utility/Steffenson.cc \
4175 01 Jun 22 peter 84   yat/utility/SteepestDescent.cc \
2739 07 Jun 12 peter 85   yat/utility/SVD.cc \
2739 07 Jun 12 peter 86   yat/utility/TypeInfo.cc \
2739 07 Jun 12 peter 87   yat/utility/utility.cc \
2739 07 Jun 12 peter 88   yat/utility/Vector.cc \
2739 07 Jun 12 peter 89   yat/utility/VectorBase.cc \
2739 07 Jun 12 peter 90   yat/utility/VectorConstView.cc \
2739 07 Jun 12 peter 91   yat/utility/VectorMutable.cc \
2739 07 Jun 12 peter 92   yat/utility/VectorView.cc \
2739 07 Jun 12 peter 93   yat/utility/version.cc \
2739 07 Jun 12 peter 94   yat/utility/WeNNI.cc
295 29 Apr 05 peter 95
2739 07 Jun 12 peter 96 nobase_include_HEADERS += \
2815 28 Aug 12 peter 97   $(srcdir)/yat/utility/Aligner.h \
2773 12 Jul 12 peter 98   $(srcdir)/yat/utility/Alignment.h \
3605 27 Jan 17 peter 99   $(srcdir)/yat/utility/BasicMatrix.h \
3605 27 Jan 17 peter 100   $(srcdir)/yat/utility/BasicVector.h \
3717 20 Nov 17 peter 101   $(srcdir)/yat/utility/BasicQueue.h \
4175 01 Jun 22 peter 102   $(srcdir)/yat/utility/BFGS.h \
4175 01 Jun 22 peter 103   $(srcdir)/yat/utility/BFGS2.h \
3902 05 May 20 peter 104   $(srcdir)/yat/utility/BinaryIstreamIterator.h \
3902 05 May 20 peter 105   $(srcdir)/yat/utility/BinaryOstreamIterator.h \
3605 27 Jan 17 peter 106   $(srcdir)/yat/utility/BLAS_level1.h \
3605 27 Jan 17 peter 107   $(srcdir)/yat/utility/BLAS_level2.h \
3605 27 Jan 17 peter 108   $(srcdir)/yat/utility/BLAS_level3.h \
3605 27 Jan 17 peter 109   $(srcdir)/yat/utility/BLAS_utility.h \
3045 09 Jun 13 peter 110   $(srcdir)/yat/utility/boost_exception_ptr.h \
4252 18 Nov 22 peter 111   $(srcdir)/yat/utility/Bisection.h \
4252 18 Nov 22 peter 112   $(srcdir)/yat/utility/Brent.h \
4252 18 Nov 22 peter 113   $(srcdir)/yat/utility/BrentMinimizer.h \
4280 27 Jan 23 peter 114   $(srcdir)/yat/utility/CholeskyDecomposer.h \
3212 05 May 14 peter 115   $(srcdir)/yat/utility/Cigar.h \
3396 24 Mar 15 peter 116   $(srcdir)/yat/utility/CigarIterator.h \
2773 12 Jul 12 peter 117   $(srcdir)/yat/utility/ColumnStream.h \
2773 12 Jul 12 peter 118   $(srcdir)/yat/utility/CommandLine.h \
2773 12 Jul 12 peter 119   $(srcdir)/yat/utility/concept_check.h \
2773 12 Jul 12 peter 120   $(srcdir)/yat/utility/Container2DIterator.h \
2773 12 Jul 12 peter 121   $(srcdir)/yat/utility/DataIterator.h \
2773 12 Jul 12 peter 122   $(srcdir)/yat/utility/DataWeight.h \
2773 12 Jul 12 peter 123   $(srcdir)/yat/utility/DataWeightProxy.h \
2858 28 Sep 12 peter 124   $(srcdir)/yat/utility/Deleter.h \
2773 12 Jul 12 peter 125   $(srcdir)/yat/utility/deprecate.h \
3655 13 Jul 17 peter 126   $(srcdir)/yat/utility/DiagonalMatrix.h \
2773 12 Jul 12 peter 127   $(srcdir)/yat/utility/Exception.h \
4252 18 Nov 22 peter 128   $(srcdir)/yat/utility/FalsePosition.h \
2773 12 Jul 12 peter 129   $(srcdir)/yat/utility/FileUtil.h \
4175 01 Jun 22 peter 130   $(srcdir)/yat/utility/FletcherReevesConjugate.h \
2773 12 Jul 12 peter 131   $(srcdir)/yat/utility/GetlineIterator.h \
3639 26 Apr 17 peter 132   $(srcdir)/yat/utility/getvector.h \
4252 18 Nov 22 peter 133   $(srcdir)/yat/utility/GoldenSection.h \
2773 12 Jul 12 peter 134   $(srcdir)/yat/utility/Index.h \
2773 12 Jul 12 peter 135   $(srcdir)/yat/utility/iterator_traits.h \
3190 30 Mar 14 peter 136   $(srcdir)/yat/utility/KernelMatrix.h \
2773 12 Jul 12 peter 137   $(srcdir)/yat/utility/KernelPCA.h \
2773 12 Jul 12 peter 138   $(srcdir)/yat/utility/kNNI.h \
2773 12 Jul 12 peter 139   $(srcdir)/yat/utility/Matrix.h \
4119 07 Nov 21 peter 140   $(srcdir)/yat/utility/MatrixBase.h \
4129 19 Jan 22 peter 141   $(srcdir)/yat/utility/MatrixConstView.h \
4129 19 Jan 22 peter 142   $(srcdir)/yat/utility/MatrixExpression.h \
4119 07 Nov 21 peter 143   $(srcdir)/yat/utility/MatrixMutable.h \
4129 19 Jan 22 peter 144   $(srcdir)/yat/utility/MatrixView.h \
2773 12 Jul 12 peter 145   $(srcdir)/yat/utility/MatrixWeighted.h \
4344 17 Apr 23 peter 146   $(srcdir)/yat/utility/mAligner.h \
4353 23 Aug 23 peter 147   $(srcdir)/yat/utility/mAlignerBase.h \
2773 12 Jul 12 peter 148   $(srcdir)/yat/utility/merge.h \
4344 17 Apr 23 peter 149   $(srcdir)/yat/utility/mNeedlemanWunsch.h \
4344 17 Apr 23 peter 150   $(srcdir)/yat/utility/mSemiLocalAligner.h \
4344 17 Apr 23 peter 151   $(srcdir)/yat/utility/mSmithWaterman.h \
4353 23 Aug 23 peter 152   $(srcdir)/yat/utility/mSmithWaterman2.h \
2995 13 Mar 13 peter 153   $(srcdir)/yat/utility/MergeIterator.h \
4252 18 Nov 22 peter 154   $(srcdir)/yat/utility/Minimizer.h \
4172 12 May 22 peter 155   $(srcdir)/yat/utility/MultiMinimizer.h \
4175 01 Jun 22 peter 156   $(srcdir)/yat/utility/MultiMinimizerDerivative.h \
4044 01 Mar 21 peter 157   $(srcdir)/yat/utility/multiprocess.h \
4334 25 Mar 23 peter 158   $(srcdir)/yat/utility/NeedlemanWunsch.h \
4172 12 May 22 peter 159   $(srcdir)/yat/utility/NelderMeadSimplex.h \
4172 12 May 22 peter 160   $(srcdir)/yat/utility/NelderMeadSimplex2.h \
4172 12 May 22 peter 161   $(srcdir)/yat/utility/NelderMeadSimplex2Rand.h \
4252 18 Nov 22 peter 162   $(srcdir)/yat/utility/Newton.h \
2773 12 Jul 12 peter 163   $(srcdir)/yat/utility/NNI.h \
2773 12 Jul 12 peter 164   $(srcdir)/yat/utility/Option.h \
2773 12 Jul 12 peter 165   $(srcdir)/yat/utility/OptionArg.h \
2773 12 Jul 12 peter 166   $(srcdir)/yat/utility/OptionFile.h \
2773 12 Jul 12 peter 167   $(srcdir)/yat/utility/OptionInFile.h \
2773 12 Jul 12 peter 168   $(srcdir)/yat/utility/OptionOutFile.h \
2773 12 Jul 12 peter 169   $(srcdir)/yat/utility/OptionHelp.h \
2773 12 Jul 12 peter 170   $(srcdir)/yat/utility/OptionSwitch.h \
4153 09 Mar 22 peter 171   $(srcdir)/yat/utility/OptionVersion.h \
3151 23 Dec 13 peter 172   $(srcdir)/yat/utility/OstreamIterator.h \
2773 12 Jul 12 peter 173   $(srcdir)/yat/utility/PCA.h \
4175 01 Jun 22 peter 174   $(srcdir)/yat/utility/PolakRibiereConjugate.h \
3399 30 Mar 15 peter 175   $(srcdir)/yat/utility/PriorityQueue.h \
4252 18 Nov 22 peter 176   $(srcdir)/yat/utility/QuadGolden.h \
3057 01 Jul 13 peter 177   $(srcdir)/yat/utility/Queue.h \
4252 18 Nov 22 peter 178   $(srcdir)/yat/utility/RootFinder.h \
4252 18 Nov 22 peter 179   $(srcdir)/yat/utility/RootFinderDerivative.h \
4059 20 Apr 21 peter 180   $(srcdir)/yat/utility/round.h \
3346 06 Nov 14 peter 181   $(srcdir)/yat/utility/Scheduler.h \
4252 18 Nov 22 peter 182   $(srcdir)/yat/utility/Secant.h \
2773 12 Jul 12 peter 183   $(srcdir)/yat/utility/Segment.h \
2773 12 Jul 12 peter 184   $(srcdir)/yat/utility/SegmentMap.h \
2773 12 Jul 12 peter 185   $(srcdir)/yat/utility/SegmentSet.h \
2773 12 Jul 12 peter 186   $(srcdir)/yat/utility/SegmentTree.h \
2773 12 Jul 12 peter 187   $(srcdir)/yat/utility/SmartPtr.h \
3204 03 May 14 peter 188   $(srcdir)/yat/utility/SmithWaterman.h \
4057 31 Mar 21 peter 189   $(srcdir)/yat/utility/SortedBuffer.h \
2773 12 Jul 12 peter 190   $(srcdir)/yat/utility/sort_index.h \
2773 12 Jul 12 peter 191   $(srcdir)/yat/utility/split.h \
4175 01 Jun 22 peter 192   $(srcdir)/yat/utility/SteepestDescent.h \
4252 18 Nov 22 peter 193   $(srcdir)/yat/utility/Steffenson.h \
2773 12 Jul 12 peter 194   $(srcdir)/yat/utility/StreamRedirect.h \
2773 12 Jul 12 peter 195   $(srcdir)/yat/utility/Range.h \
4083 27 Aug 21 peter 196   $(srcdir)/yat/utility/Ranking.h \
2773 12 Jul 12 peter 197   $(srcdir)/yat/utility/stl_utility.h \
2773 12 Jul 12 peter 198   $(srcdir)/yat/utility/StrideIterator.h \
2773 12 Jul 12 peter 199   $(srcdir)/yat/utility/SVD.h \
2773 12 Jul 12 peter 200   $(srcdir)/yat/utility/TypeInfo.h \
2773 12 Jul 12 peter 201   $(srcdir)/yat/utility/utility.h \
2773 12 Jul 12 peter 202   $(srcdir)/yat/utility/Vector.h \
2773 12 Jul 12 peter 203   $(srcdir)/yat/utility/VectorBase.h \
2773 12 Jul 12 peter 204   $(srcdir)/yat/utility/VectorConstView.h \
3605 27 Jan 17 peter 205   $(srcdir)/yat/utility/VectorExpression.h \
2773 12 Jul 12 peter 206   $(srcdir)/yat/utility/VectorMutable.h \
2773 12 Jul 12 peter 207   $(srcdir)/yat/utility/VectorView.h \
2773 12 Jul 12 peter 208   $(srcdir)/yat/utility/version.h \
3534 21 Dec 16 peter 209   $(srcdir)/yat/utility/WeightedIteratorArchetype.h \
2773 12 Jul 12 peter 210   $(srcdir)/yat/utility/WeightedIterator.h \
2773 12 Jul 12 peter 211   $(srcdir)/yat/utility/WeightIterator.h \
2773 12 Jul 12 peter 212   $(srcdir)/yat/utility/WeNNI.h \
2773 12 Jul 12 peter 213   $(srcdir)/yat/utility/yat_assert.h
295 29 Apr 05 peter 214
2739 07 Jun 12 peter 215 nobase_nodist_include_HEADERS = yat/utility/config_public.h
3908 13 May 20 peter 216
3908 13 May 20 peter 217 include yat/utility/expression/Makefile.am
4252 18 Nov 22 peter 218 include yat/utility/multivariable/Makefile.am
4086 30 Aug 21 peter 219 include yat/utility/ranking/Makefile.am
4252 18 Nov 22 peter 220 include yat/utility/univariable/Makefile.am

Generated on Sat Oct 14 02:24:44 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)